MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Runella slithyformis DSM 19594 plasmid pRUNSL01

Total Repeats: 302

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015693	TTTC	2	8	212	219	0 %	75 %	0 %	25 %	338209373
2	NC_015693	AAAT	2	8	603	610	75 %	25 %	0 %	0 %	338209373
3	NC_015693	CGGC	2	8	1445	1452	0 %	0 %	50 %	50 %	338209373
4	NC_015693	ATTC	2	8	1506	1513	25 %	50 %	0 %	25 %	338209373
5	NC_015693	TAGG	2	8	2568	2575	25 %	25 %	50 %	0 %	338209373
6	NC_015693	CAAT	2	8	2579	2586	50 %	25 %	0 %	25 %	338209373
7	NC_015693	TATT	2	8	2843	2850	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015693	GTTT	2	8	3089	3096	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015693	CCGT	2	8	3116	3123	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10	NC_015693	GGAA	2	8	3908	3915	50 %	0 %	50 %	0 %	338209374
11	NC_015693	CAAT	2	8	4148	4155	50 %	25 %	0 %	25 %	338209374
12	NC_015693	GACC	2	8	4249	4256	25 %	0 %	25 %	50 %	338209374
13	NC_015693	AATT	2	8	4540	4547	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015693	AAGA	2	8	4679	4686	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015693	CTAT	2	8	4717	4724	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_015693	ACTT	2	8	4742	4749	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_015693	ATTC	2	8	4971	4978	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_015693	TCAT	2	8	5683	5690	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_015693	AACA	2	8	6000	6007	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_015693	TGAA	2	8	6254	6261	50 %	25 %	25 %	0 %	338209375
21	NC_015693	ACGC	2	8	6696	6703	25 %	0 %	25 %	50 %	338209375
22	NC_015693	ATCA	2	8	6976	6983	50 %	25 %	0 %	25 %	338209375
23	NC_015693	GGGT	2	8	7321	7328	0 %	25 %	75 %	0 %	338209375
24	NC_015693	GAAA	2	8	7344	7351	75 %	0 %	25 %	0 %	338209375
25	NC_015693	ATTT	2	8	8378	8385	25 %	75 %	0 %	0 %	338209375
26	NC_015693	GGGT	2	8	8408	8415	0 %	25 %	75 %	0 %	338209375
27	NC_015693	CGGG	2	8	8669	8676	0 %	0 %	75 %	25 %	338209375
28	NC_015693	TTAT	2	8	8836	8843	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015693	ACTA	2	8	9091	9098	50 %	25 %	0 %	25 %	338209376
30	NC_015693	CTGT	2	8	9391	9398	0 %	50 %	25 %	25 %	338209377
31	NC_015693	ATCA	2	8	9871	9878	50 %	25 %	0 %	25 %	338209377
32	NC_015693	TGAG	2	8	10214	10221	25 %	25 %	50 %	0 %	338209377
33	NC_015693	AGGT	2	8	10465	10472	25 %	25 %	50 %	0 %	338209377
34	NC_015693	CAAT	2	8	10493	10500	50 %	25 %	0 %	25 %	338209377
35	NC_015693	GACA	2	8	10576	10583	50 %	0 %	25 %	25 %	338209377
36	NC_015693	GCCT	2	8	11077	11084	0 %	25 %	25 %	50 %	338209379
37	NC_015693	TTCC	2	8	11731	11738	0 %	50 %	0 %	50 %	338209380
38	NC_015693	GTAC	2	8	11968	11975	25 %	25 %	25 %	25 %	338209380
39	NC_015693	GTAC	2	8	12006	12013	25 %	25 %	25 %	25 %	338209380
40	NC_015693	GAAT	2	8	12475	12482	50 %	25 %	25 %	0 %	338209380
41	NC_015693	TTCT	2	8	13178	13185	0 %	75 %	0 %	25 %	338209380
42	NC_015693	GAAG	2	8	13233	13240	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015693	AAAC	2	8	13552	13559	75 %	0 %	0 %	25 %	338209381
44	NC_015693	GGTC	2	8	13955	13962	0 %	25 %	50 %	25 %	338209381
45	NC_015693	CTTC	2	8	14009	14016	0 %	50 %	0 %	50 %	338209381
46	NC_015693	GGTT	2	8	14152	14159	0 %	50 %	50 %	0 %	338209381
47	NC_015693	TTTC	2	8	15430	15437	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_015693	GGTC	2	8	15878	15885	0 %	25 %	50 %	25 %	338209384
49	NC_015693	ACGT	2	8	16008	16015	25 %	25 %	25 %	25 %	338209384
50	NC_015693	GGGC	2	8	16318	16325	0 %	0 %	75 %	25 %	338209385
51	NC_015693	ATCT	2	8	16326	16333	25 %	50 %	0 %	25 %	338209385
52	NC_015693	TTGG	2	8	16581	16588	0 %	50 %	50 %	0 %	338209385
53	NC_015693	TTGA	2	8	16592	16599	25 %	50 %	25 %	0 %	338209385
54	NC_015693	TTCA	2	8	16626	16633	25 %	50 %	0 %	25 %	338209385
55	NC_015693	GGTT	2	8	17080	17087	0 %	50 %	50 %	0 %	338209387
56	NC_015693	TTTG	2	8	17206	17213	0 %	75 %	25 %	0 %	338209387
57	NC_015693	GTTT	2	8	17902	17909	0 %	75 %	25 %	0 %	338209387
58	NC_015693	CGTG	2	8	18588	18595	0 %	25 %	50 %	25 %	338209388
59	NC_015693	ACTG	2	8	19346	19353	25 %	25 %	25 %	25 %	338209389
60	NC_015693	GGCT	2	8	20542	20549	0 %	25 %	50 %	25 %	338209390
61	NC_015693	GCTT	2	8	20943	20950	0 %	50 %	25 %	25 %	338209391
62	NC_015693	TTGG	2	8	20951	20958	0 %	50 %	50 %	0 %	338209391
63	NC_015693	GACT	2	8	20961	20968	25 %	25 %	25 %	25 %	338209391
64	NC_015693	CGCT	2	8	21145	21152	0 %	25 %	25 %	50 %	338209391
65	NC_015693	TCTT	2	8	21258	21265	0 %	75 %	0 %	25 %	338209391
66	NC_015693	TTCG	2	8	24073	24080	0 %	50 %	25 %	25 %	338209391
67	NC_015693	CGGT	2	8	24651	24658	0 %	25 %	50 %	25 %	338209391
68	NC_015693	ACAA	2	8	24696	24703	75 %	0 %	0 %	25 %	338209391
69	NC_015693	TTTC	2	8	25221	25228	0 %	75 %	0 %	25 %	338209393
70	NC_015693	TGCC	2	8	25429	25436	0 %	25 %	25 %	50 %	338209393
71	NC_015693	AACC	2	8	26031	26038	50 %	0 %	0 %	50 %	338209394
72	NC_015693	CTGC	2	8	26114	26121	0 %	25 %	25 %	50 %	338209394
73	NC_015693	AACC	2	8	26131	26138	50 %	0 %	0 %	50 %	338209394
74	NC_015693	GCGT	2	8	26450	26457	0 %	25 %	50 %	25 %	338209394
75	NC_015693	CACG	2	8	26792	26799	25 %	0 %	25 %	50 %	338209395
76	NC_015693	TCCA	2	8	27099	27106	25 %	25 %	0 %	50 %	338209395
77	NC_015693	TTGG	2	8	27336	27343	0 %	50 %	50 %	0 %	338209395
78	NC_015693	CGCC	2	8	27360	27367	0 %	0 %	25 %	75 %	338209395
79	NC_015693	AGCC	2	8	27702	27709	25 %	0 %	25 %	50 %	338209395
80	NC_015693	ACCT	2	8	27879	27886	25 %	25 %	0 %	50 %	338209395
81	NC_015693	GCCA	2	8	28151	28158	25 %	0 %	25 %	50 %	338209395
82	NC_015693	AGTC	2	8	29967	29974	25 %	25 %	25 %	25 %	338209396
83	NC_015693	AATA	2	8	30548	30555	75 %	25 %	0 %	0 %	338209396
84	NC_015693	ACGG	2	8	30801	30808	25 %	0 %	50 %	25 %	338209396
85	NC_015693	CTCG	2	8	31291	31298	0 %	25 %	25 %	50 %	338209397
86	NC_015693	AAGT	2	8	31424	31431	50 %	25 %	25 %	0 %	338209397
87	NC_015693	CATT	2	8	32114	32121	25 %	50 %	0 %	25 %	338209398
88	NC_015693	TCAT	2	8	32397	32404	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_015693	ATGA	2	8	32423	32430	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015693	TTAA	2	8	32843	32850	50 %	50 %	0 %	0 %	338209399
91	NC_015693	TTTA	2	8	32869	32876	25 %	75 %	0 %	0 %	338209399
92	NC_015693	GTAC	2	8	32907	32914	25 %	25 %	25 %	25 %	338209399
93	NC_015693	TTGG	2	8	33251	33258	0 %	50 %	50 %	0 %	338209399
94	NC_015693	GAAA	2	8	33397	33404	75 %	0 %	25 %	0 %	338209399
95	NC_015693	CAAA	2	8	33502	33509	75 %	0 %	0 %	25 %	338209399
96	NC_015693	GACT	2	8	33550	33557	25 %	25 %	25 %	25 %	338209399
97	NC_015693	ACTG	2	8	33560	33567	25 %	25 %	25 %	25 %	338209399
98	NC_015693	ACAA	2	8	33950	33957	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_015693	CATG	2	8	34070	34077	25 %	25 %	25 %	25 %	338209400
100	NC_015693	AAAC	2	8	35256	35263	75 %	0 %	0 %	25 %	338209401
101	NC_015693	CACC	2	8	35416	35423	25 %	0 %	0 %	75 %	338209401
102	NC_015693	CTAC	2	8	35426	35433	25 %	25 %	0 %	50 %	338209401
103	NC_015693	CGCC	2	8	35693	35700	0 %	0 %	25 %	75 %	338209401
104	NC_015693	TCAT	2	8	36018	36025	25 %	50 %	0 %	25 %	338209402
105	NC_015693	TCGG	2	8	36253	36260	0 %	25 %	50 %	25 %	338209402
106	NC_015693	TTGA	2	8	36338	36345	25 %	50 %	25 %	0 %	338209402
107	NC_015693	CAAA	2	8	36676	36683	75 %	0 %	0 %	25 %	338209402
108	NC_015693	CATT	2	8	37323	37330	25 %	50 %	0 %	25 %	338209402
109	NC_015693	ACCC	2	8	37416	37423	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
110	NC_015693	TTTA	2	8	37797	37804	25 %	75 %	0 %	0 %	338209403
111	NC_015693	AACC	2	8	38866	38873	50 %	0 %	0 %	50 %	338209404
112	NC_015693	ACTT	2	8	39002	39009	25 %	50 %	0 %	25 %	338209404
113	NC_015693	ATTT	2	8	39075	39082	25 %	75 %	0 %	0 %	338209404
114	NC_015693	GAGT	2	8	39185	39192	25 %	25 %	50 %	0 %	338209404
115	NC_015693	TTTA	2	8	39621	39628	25 %	75 %	0 %	0 %	338209405
116	NC_015693	TTTA	2	8	40386	40393	25 %	75 %	0 %	0 %	338209406
117	NC_015693	CCGC	2	8	40743	40750	0 %	0 %	25 %	75 %	338209406
118	NC_015693	AATC	2	8	40798	40805	50 %	25 %	0 %	25 %	338209406
119	NC_015693	TCGA	2	8	40850	40857	25 %	25 %	25 %	25 %	338209406
120	NC_015693	GCCT	2	8	41036	41043	0 %	25 %	25 %	50 %	338209406
121	NC_015693	TGCC	2	8	41321	41328	0 %	25 %	25 %	50 %	338209406
122	NC_015693	GGTT	2	8	41679	41686	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015693	TTAT	2	8	42462	42469	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015693	CGGG	2	8	42553	42560	0 %	0 %	75 %	25 %	338209408
125	NC_015693	TCCG	2	8	42696	42703	0 %	25 %	25 %	50 %	338209408
126	NC_015693	ACAT	2	8	43374	43381	50 %	25 %	0 %	25 %	338209409
127	NC_015693	CGGT	2	8	43927	43934	0 %	25 %	50 %	25 %	338209409
128	NC_015693	CAAT	2	8	44089	44096	50 %	25 %	0 %	25 %	338209409
129	NC_015693	CTCA	2	8	44171	44178	25 %	25 %	0 %	50 %	338209409
130	NC_015693	GCCA	2	8	44496	44503	25 %	0 %	25 %	50 %	338209409
131	NC_015693	TGCG	2	8	44536	44543	0 %	25 %	50 %	25 %	338209409
132	NC_015693	GCCA	2	8	44690	44697	25 %	0 %	25 %	50 %	338209410
133	NC_015693	ATCT	2	8	44815	44822	25 %	50 %	0 %	25 %	338209410
134	NC_015693	GGTC	2	8	45498	45505	0 %	25 %	50 %	25 %	338209410
135	NC_015693	CGTA	2	8	46284	46291	25 %	25 %	25 %	25 %	338209410
136	NC_015693	TGTT	2	8	46450	46457	0 %	75 %	25 %	0 %	338209410
137	NC_015693	CCCG	2	8	46647	46654	0 %	0 %	25 %	75 %	338209410
138	NC_015693	GAAC	2	8	47089	47096	50 %	0 %	25 %	25 %	338209410
139	NC_015693	CCTT	2	8	47418	47425	0 %	50 %	0 %	50 %	338209410
140	NC_015693	GATT	2	8	48350	48357	25 %	50 %	25 %	0 %	338209412
141	NC_015693	GTTG	2	8	48569	48576	0 %	50 %	50 %	0 %	338209412
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143	NC_015693	CATC	2	8	48893	48900	25 %	25 %	0 %	50 %	338209412
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284	NC_015693	TCCG	2	8	99041	99048	0 %	25 %	25 %	50 %	338209453
285	NC_015693	GCCA	2	8	99232	99239	25 %	0 %	25 %	50 %	338209453
286	NC_015693	ATCC	2	8	99481	99488	25 %	25 %	0 %	50 %	338209453
287	NC_015693	CGGC	2	8	99535	99542	0 %	0 %	50 %	50 %	338209453
288	NC_015693	TTGA	2	8	99914	99921	25 %	50 %	25 %	0 %	338209453
289	NC_015693	CACC	2	8	100207	100214	25 %	0 %	0 %	75 %	338209453
290	NC_015693	GCGG	2	8	100302	100309	0 %	0 %	75 %	25 %	338209453
291	NC_015693	TTTC	2	8	100337	100344	0 %	75 %	0 %	25 %	338209453
292	NC_015693	TCGT	2	8	100715	100722	0 %	50 %	25 %	25 %	338209453
293	NC_015693	ATTG	2	8	100738	100745	25 %	50 %	25 %	0 %	338209453
294	NC_015693	TCTT	2	8	100766	100773	0 %	75 %	0 %	25 %	338209453
295	NC_015693	CCGC	2	8	101345	101352	0 %	0 %	25 %	75 %	338209454
296	NC_015693	CGTC	2	8	102065	102072	0 %	25 %	25 %	50 %	338209454
297	NC_015693	TCAA	2	8	102080	102087	50 %	25 %	0 %	25 %	338209454
298	NC_015693	CGGC	2	8	102249	102256	0 %	0 %	50 %	50 %	338209454
299	NC_015693	ATTT	2	8	102902	102909	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
300	NC_015693	ACCG	2	8	103466	103473	25 %	0 %	25 %	50 %	338209455
301	NC_015693	ATGG	2	8	106469	106476	25 %	25 %	50 %	0 %	338209456
302	NC_015693	CGGT	2	8	106666	106673	0 %	25 %	50 %	25 %	338209456

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.