MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Runella slithyformis DSM 19594 plasmid pRUNSL01

Total Repeats: 1059

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015693	TTC	2	6	270	275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338209373
2	NC_015693	CCG	2	6	325	330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338209373
3	NC_015693	ACC	2	6	444	449	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338209373
4	NC_015693	TAT	2	6	611	616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338209373
5	NC_015693	CCG	2	6	622	627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338209373
6	NC_015693	CCA	2	6	705	710	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338209373
7	NC_015693	GTG	2	6	766	771	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338209373
8	NC_015693	TGA	2	6	856	861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338209373
9	NC_015693	TCG	2	6	862	867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338209373
10	NC_015693	TGC	2	6	907	912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338209373
11	NC_015693	GTA	2	6	1042	1047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338209373
12	NC_015693	CGA	2	6	1059	1064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338209373
13	NC_015693	TGA	2	6	1109	1114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338209373
14	NC_015693	CCA	2	6	1139	1144	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338209373
15	NC_015693	GCC	4	12	1254	1265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338209373
16	NC_015693	TAT	2	6	1322	1327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338209373
17	NC_015693	CGG	2	6	1500	1505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338209373
18	NC_015693	GAA	2	6	1564	1569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338209373
19	NC_015693	ATA	2	6	1593	1598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338209373
20	NC_015693	CGC	2	6	1665	1670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338209373
21	NC_015693	GGT	2	6	1674	1679	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338209373
22	NC_015693	GCC	2	6	1720	1725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338209373
23	NC_015693	TGC	2	6	1743	1748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338209373
24	NC_015693	TGG	2	6	1832	1837	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338209373
25	NC_015693	TGC	2	6	2035	2040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338209373
26	NC_015693	CGG	2	6	2081	2086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338209373
27	NC_015693	AAG	2	6	2117	2122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338209373
28	NC_015693	TAA	2	6	2203	2208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338209373
29	NC_015693	TTG	2	6	2299	2304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338209373
30	NC_015693	CGC	2	6	2364	2369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338209373
31	NC_015693	CCT	2	6	2552	2557	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338209373
32	NC_015693	ACT	2	6	2562	2567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338209373
33	NC_015693	TCA	2	6	2609	2614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338209373
34	NC_015693	GGC	2	6	3773	3778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338209374
35	NC_015693	AGC	2	6	3833	3838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338209374
36	NC_015693	CCA	2	6	3877	3882	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338209374
37	NC_015693	TTG	2	6	3984	3989	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338209374
38	NC_015693	ACC	2	6	4002	4007	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338209374
39	NC_015693	TCT	2	6	4031	4036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338209374
40	NC_015693	CGG	2	6	4062	4067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338209374
41	NC_015693	ACG	3	9	4108	4116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338209374
42	NC_015693	GGA	2	6	4298	4303	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338209374
43	NC_015693	GAT	2	6	4416	4421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338209374
44	NC_015693	GCA	2	6	4506	4511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338209374
45	NC_015693	CAC	2	6	6183	6188	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338209375
46	NC_015693	CGA	2	6	6282	6287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338209375
47	NC_015693	TAT	2	6	6298	6303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338209375
48	NC_015693	CCG	2	6	6386	6391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338209375
49	NC_015693	CTG	2	6	6400	6405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338209375
50	NC_015693	TAC	2	6	6454	6459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338209375
51	NC_015693	ATG	2	6	6479	6484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338209375
52	NC_015693	TGC	2	6	6548	6553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338209375
53	NC_015693	GCT	2	6	6561	6566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338209375
54	NC_015693	CGG	2	6	6587	6592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338209375
55	NC_015693	ACA	2	6	6641	6646	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338209375
56	NC_015693	TCC	2	6	6721	6726	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338209375
57	NC_015693	CAA	3	9	7026	7034	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338209375
58	NC_015693	CAA	2	6	7113	7118	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338209375
59	NC_015693	CGG	2	6	7206	7211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338209375
60	NC_015693	TAC	2	6	7240	7245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338209375
61	NC_015693	GAT	2	6	7246	7251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338209375
62	NC_015693	TCT	2	6	7888	7893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338209375
63	NC_015693	ATT	2	6	7922	7927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338209375
64	NC_015693	CGG	2	6	7946	7951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338209375
65	NC_015693	ATG	2	6	7954	7959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338209375
66	NC_015693	CAA	2	6	8031	8036	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338209375
67	NC_015693	ATC	2	6	8113	8118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338209375
68	NC_015693	CGG	2	6	8121	8126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338209375
69	NC_015693	AGG	2	6	8127	8132	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338209375
70	NC_015693	CTG	2	6	8173	8178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338209375
71	NC_015693	CAA	2	6	8220	8225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338209375
72	NC_015693	ATT	2	6	8282	8287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338209375
73	NC_015693	GCG	2	6	8312	8317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338209375
74	NC_015693	CCA	2	6	8420	8425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338209375
75	NC_015693	AGA	2	6	8598	8603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338209375
76	NC_015693	ACC	2	6	8605	8610	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338209375
77	NC_015693	AGG	2	6	8627	8632	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338209375
78	NC_015693	ACA	2	6	9080	9085	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338209376
79	NC_015693	TTC	2	6	9265	9270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338209377
80	NC_015693	GTT	3	9	9276	9284	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338209377
81	NC_015693	TCG	2	6	9365	9370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338209377
82	NC_015693	CTT	2	6	9528	9533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338209377
83	NC_015693	GCC	2	6	9554	9559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338209377
84	NC_015693	ATG	2	6	9613	9618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338209377
85	NC_015693	CTG	2	6	9673	9678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338209377
86	NC_015693	CCA	2	6	9768	9773	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338209377
87	NC_015693	CAA	2	6	10069	10074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338209377
88	NC_015693	GCA	2	6	10082	10087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338209377
89	NC_015693	TCG	2	6	10094	10099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338209377
90	NC_015693	AGC	3	9	10106	10114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338209377
91	NC_015693	TCG	2	6	10148	10153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338209377
92	NC_015693	ATA	2	6	10180	10185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338209377
93	NC_015693	GCA	2	6	10244	10249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338209377
94	NC_015693	TCA	2	6	10268	10273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338209377
95	NC_015693	GGA	2	6	10366	10371	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338209377
96	NC_015693	TTG	2	6	10403	10408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338209377
97	NC_015693	ATT	2	6	10606	10611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338209377
98	NC_015693	ATA	2	6	10749	10754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338209378
99	NC_015693	GTT	2	6	10758	10763	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338209378
100	NC_015693	GTC	2	6	10793	10798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338209378
101	NC_015693	CAA	2	6	10811	10816	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338209378
102	NC_015693	ATA	2	6	10946	10951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338209378
103	NC_015693	TTC	2	6	10967	10972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338209378
104	NC_015693	CAG	2	6	10999	11004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338209378
105	NC_015693	AAT	3	9	11006	11014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338209378
106	NC_015693	ACT	2	6	11066	11071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338209379
107	NC_015693	ATC	2	6	11152	11157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338209379
108	NC_015693	GTC	2	6	11236	11241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338209379
109	NC_015693	CAA	2	6	11319	11324	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338209379
110	NC_015693	AGC	2	6	11442	11447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338209379
111	NC_015693	TCG	2	6	11456	11461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338209379
112	NC_015693	TCG	2	6	11772	11777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338209380
113	NC_015693	TGA	2	6	11824	11829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338209380
114	NC_015693	TTC	2	6	11906	11911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338209380
115	NC_015693	TCA	2	6	11958	11963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338209380
116	NC_015693	TCA	2	6	12100	12105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338209380
117	NC_015693	GCT	2	6	12249	12254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338209380
118	NC_015693	AGT	2	6	12313	12318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338209380
119	NC_015693	TGA	2	6	12346	12351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338209380
120	NC_015693	TCG	2	6	12537	12542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338209380
121	NC_015693	TCC	2	6	12707	12712	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338209380
122	NC_015693	CTG	2	6	12758	12763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338209380
123	NC_015693	ACG	2	6	12791	12796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338209380
124	NC_015693	TAC	2	6	12797	12802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338209380
125	NC_015693	TCG	2	6	12804	12809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338209380
126	NC_015693	GGC	2	6	12933	12938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338209380
127	NC_015693	CGA	2	6	12968	12973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338209380
128	NC_015693	TCC	2	6	13116	13121	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338209380
129	NC_015693	ATA	2	6	13330	13335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338209381
130	NC_015693	GAT	2	6	13461	13466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338209381
131	NC_015693	CCG	2	6	13583	13588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338209381
132	NC_015693	TTA	2	6	13595	13600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338209381
133	NC_015693	TTA	2	6	13761	13766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338209381
134	NC_015693	AGT	2	6	13968	13973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338209381
135	NC_015693	AAT	2	6	14002	14007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338209381
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137	NC_015693	CCT	2	6	14201	14206	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338209381
138	NC_015693	TGG	2	6	14418	14423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338209382
139	NC_015693	CTG	2	6	14434	14439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338209382
140	NC_015693	ATC	2	6	14651	14656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338209382
141	NC_015693	GCG	2	6	14691	14696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338209382
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143	NC_015693	CTT	2	6	14871	14876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338209382
144	NC_015693	CTT	2	6	14919	14924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338209382
145	NC_015693	TTG	2	6	14932	14937	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338209382
146	NC_015693	ATG	2	6	14990	14995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338209382
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149	NC_015693	CGT	2	6	15228	15233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338209383
150	NC_015693	TAA	2	6	15269	15274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338209383
151	NC_015693	CTG	2	6	15316	15321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338209383
152	NC_015693	TGA	2	6	15493	15498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338209384
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154	NC_015693	TGT	2	6	15814	15819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338209384
155	NC_015693	GTC	2	6	15936	15941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338209384
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158	NC_015693	TTC	2	6	16097	16102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338209385
159	NC_015693	TCT	2	6	16141	16146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338209385
160	NC_015693	TTC	2	6	16170	16175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338209385
161	NC_015693	GCA	2	6	16444	16449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338209385
162	NC_015693	AAT	2	6	16527	16532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338209385
163	NC_015693	CCG	2	6	16542	16547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338209385
164	NC_015693	TCT	2	6	16561	16566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338209385
165	NC_015693	ACT	2	6	16844	16849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338209386
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