MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Runella slithyformis DSM 19594 plasmid pRUNSL01

Total Repeats: 84

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015693	GC	3	6	355	360	0 %	0 %	50 %	50 %	338209373
2	NC_015693	AT	3	6	2630	2635	50 %	50 %	0 %	0 %	338209373
3	NC_015693	TA	4	8	3323	3330	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015693	AC	3	6	3345	3350	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_015693	TA	3	6	4690	4695	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015693	TG	3	6	6014	6019	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015693	TA	3	6	8206	8211	50 %	50 %	0 %	0 %	338209375
8	NC_015693	CG	3	6	9020	9025	0 %	0 %	50 %	50 %	338209376
9	NC_015693	TA	3	6	9817	9822	50 %	50 %	0 %	0 %	338209377
10	NC_015693	GT	3	6	10341	10346	0 %	50 %	50 %	0 %	338209377
11	NC_015693	TC	3	6	10821	10826	0 %	50 %	0 %	50 %	338209378
12	NC_015693	AT	3	6	12062	12067	50 %	50 %	0 %	0 %	338209380
13	NC_015693	AT	3	6	13168	13173	50 %	50 %	0 %	0 %	338209380
14	NC_015693	AG	3	6	13295	13300	50 %	0 %	50 %	0 %	338209381
15	NC_015693	TA	3	6	14277	14282	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015693	AC	3	6	16274	16279	50 %	0 %	0 %	50 %	338209385
17	NC_015693	CA	3	6	17919	17924	50 %	0 %	0 %	50 %	338209387
18	NC_015693	AT	3	6	18495	18500	50 %	50 %	0 %	0 %	338209388
19	NC_015693	TC	3	6	19471	19476	0 %	50 %	0 %	50 %	338209389
20	NC_015693	AT	4	8	20324	20331	50 %	50 %	0 %	0 %	338209389
21	NC_015693	AT	3	6	21528	21533	50 %	50 %	0 %	0 %	338209391
22	NC_015693	AC	3	6	22275	22280	50 %	0 %	0 %	50 %	338209391
23	NC_015693	GT	3	6	23093	23098	0 %	50 %	50 %	0 %	338209391
24	NC_015693	GT	3	6	26186	26191	0 %	50 %	50 %	0 %	338209394
25	NC_015693	TA	3	6	26211	26216	50 %	50 %	0 %	0 %	338209394
26	NC_015693	TA	3	6	27965	27970	50 %	50 %	0 %	0 %	338209395
27	NC_015693	AG	3	6	28588	28593	50 %	0 %	50 %	0 %	338209395
28	NC_015693	TC	3	6	31698	31703	0 %	50 %	0 %	50 %	338209397
29	NC_015693	AC	3	6	32074	32079	50 %	0 %	0 %	50 %	338209398
30	NC_015693	CT	3	6	32502	32507	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_015693	AC	3	6	34231	34236	50 %	0 %	0 %	50 %	338209400
32	NC_015693	TA	3	6	35107	35112	50 %	50 %	0 %	0 %	338209401
33	NC_015693	TC	3	6	35478	35483	0 %	50 %	0 %	50 %	338209401
34	NC_015693	GT	3	6	35767	35772	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015693	TG	3	6	35996	36001	0 %	50 %	50 %	0 %	338209402
36	NC_015693	AT	3	6	38459	38464	50 %	50 %	0 %	0 %	338209404
37	NC_015693	TA	3	6	41139	41144	50 %	50 %	0 %	0 %	338209406
38	NC_015693	CT	3	6	41307	41312	0 %	50 %	0 %	50 %	338209406
39	NC_015693	TA	3	6	41625	41630	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015693	TG	3	6	41906	41911	0 %	50 %	50 %	0 %	338209407
41	NC_015693	CA	3	6	42913	42918	50 %	0 %	0 %	50 %	338209408
42	NC_015693	CG	4	8	48467	48474	0 %	0 %	50 %	50 %	338209412
43	NC_015693	GC	3	6	50764	50769	0 %	0 %	50 %	50 %	338209413
44	NC_015693	GT	3	6	51847	51852	0 %	50 %	50 %	0 %	338209414
45	NC_015693	TC	3	6	53320	53325	0 %	50 %	0 %	50 %	338209416
46	NC_015693	AT	3	6	53589	53594	50 %	50 %	0 %	0 %	338209416
47	NC_015693	AT	3	6	54644	54649	50 %	50 %	0 %	0 %	338209416
48	NC_015693	GT	3	6	55104	55109	0 %	50 %	50 %	0 %	338209417
49	NC_015693	TG	3	6	56255	56260	0 %	50 %	50 %	0 %	338209417
50	NC_015693	AT	3	6	59034	59039	50 %	50 %	0 %	0 %	338209420
51	NC_015693	TA	3	6	61919	61924	50 %	50 %	0 %	0 %	338209424
52	NC_015693	TC	3	6	62680	62685	0 %	50 %	0 %	50 %	338209424
53	NC_015693	GA	3	6	62700	62705	50 %	0 %	50 %	0 %	338209424
54	NC_015693	AT	3	6	63837	63842	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015693	TA	3	6	64337	64342	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015693	GA	3	6	64517	64522	50 %	0 %	50 %	0 %	338209426
57	NC_015693	TC	3	6	65158	65163	0 %	50 %	0 %	50 %	338209426
58	NC_015693	AT	3	6	66256	66261	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015693	AT	3	6	66864	66869	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015693	AT	4	8	71055	71062	50 %	50 %	0 %	0 %	338209432
61	NC_015693	CA	3	6	71759	71764	50 %	0 %	0 %	50 %	338209433
62	NC_015693	TG	4	8	72632	72639	0 %	50 %	50 %	0 %	338209434
63	NC_015693	CG	3	6	74641	74646	0 %	0 %	50 %	50 %	338209436
64	NC_015693	AC	3	6	75648	75653	50 %	0 %	0 %	50 %	338209436
65	NC_015693	TA	3	6	77193	77198	50 %	50 %	0 %	0 %	338209438
66	NC_015693	GA	3	6	79323	79328	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015693	TG	3	6	80358	80363	0 %	50 %	50 %	0 %	338209440
68	NC_015693	CA	3	6	80419	80424	50 %	0 %	0 %	50 %	338209440
69	NC_015693	TG	3	6	81284	81289	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015693	CT	3	6	81718	81723	0 %	50 %	0 %	50 %	338209441
71	NC_015693	GC	3	6	82155	82160	0 %	0 %	50 %	50 %	338209441
72	NC_015693	AT	3	6	82323	82328	50 %	50 %	0 %	0 %	338209441
73	NC_015693	AG	3	6	83427	83432	50 %	0 %	50 %	0 %	338209442
74	NC_015693	CA	3	6	85665	85670	50 %	0 %	0 %	50 %	338209442
75	NC_015693	AT	3	6	90207	90212	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015693	GA	3	6	95399	95404	50 %	0 %	50 %	0 %	338209450
77	NC_015693	GA	3	6	96801	96806	50 %	0 %	50 %	0 %	338209451
78	NC_015693	CG	3	6	97554	97559	0 %	0 %	50 %	50 %	338209451
79	NC_015693	GT	3	6	97724	97729	0 %	50 %	50 %	0 %	338209452
80	NC_015693	AT	3	6	97784	97789	50 %	50 %	0 %	0 %	338209452
81	NC_015693	AT	3	6	99456	99461	50 %	50 %	0 %	0 %	338209453
82	NC_015693	CA	3	6	99724	99729	50 %	0 %	0 %	50 %	338209453
83	NC_015693	GC	3	6	104366	104371	0 %	0 %	50 %	50 %	338209455
84	NC_015693	TG	3	6	106266	106271	0 %	50 %	50 %	0 %	338209456

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.