MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Runella slithyformis DSM 19594 plasmid pRUNSL01

Total Repeats: 69

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015693	GC	3	6	355	360	0 %	0 %	50 %	50 %	338209373
2	NC_015693	AT	3	6	2630	2635	50 %	50 %	0 %	0 %	338209373
3	NC_015693	TA	3	6	8206	8211	50 %	50 %	0 %	0 %	338209375
4	NC_015693	CG	3	6	9020	9025	0 %	0 %	50 %	50 %	338209376
5	NC_015693	TA	3	6	9817	9822	50 %	50 %	0 %	0 %	338209377
6	NC_015693	GT	3	6	10341	10346	0 %	50 %	50 %	0 %	338209377
7	NC_015693	TC	3	6	10821	10826	0 %	50 %	0 %	50 %	338209378
8	NC_015693	AT	3	6	12062	12067	50 %	50 %	0 %	0 %	338209380
9	NC_015693	AT	3	6	13168	13173	50 %	50 %	0 %	0 %	338209380
10	NC_015693	AG	3	6	13295	13300	50 %	0 %	50 %	0 %	338209381
11	NC_015693	AC	3	6	16274	16279	50 %	0 %	0 %	50 %	338209385
12	NC_015693	CA	3	6	17919	17924	50 %	0 %	0 %	50 %	338209387
13	NC_015693	AT	3	6	18495	18500	50 %	50 %	0 %	0 %	338209388
14	NC_015693	TC	3	6	19471	19476	0 %	50 %	0 %	50 %	338209389
15	NC_015693	AT	4	8	20324	20331	50 %	50 %	0 %	0 %	338209389
16	NC_015693	AT	3	6	21528	21533	50 %	50 %	0 %	0 %	338209391
17	NC_015693	AC	3	6	22275	22280	50 %	0 %	0 %	50 %	338209391
18	NC_015693	GT	3	6	23093	23098	0 %	50 %	50 %	0 %	338209391
19	NC_015693	GT	3	6	26186	26191	0 %	50 %	50 %	0 %	338209394
20	NC_015693	TA	3	6	26211	26216	50 %	50 %	0 %	0 %	338209394
21	NC_015693	TA	3	6	27965	27970	50 %	50 %	0 %	0 %	338209395
22	NC_015693	AG	3	6	28588	28593	50 %	0 %	50 %	0 %	338209395
23	NC_015693	TC	3	6	31698	31703	0 %	50 %	0 %	50 %	338209397
24	NC_015693	AC	3	6	32074	32079	50 %	0 %	0 %	50 %	338209398
25	NC_015693	AC	3	6	34231	34236	50 %	0 %	0 %	50 %	338209400
26	NC_015693	TA	3	6	35107	35112	50 %	50 %	0 %	0 %	338209401
27	NC_015693	TC	3	6	35478	35483	0 %	50 %	0 %	50 %	338209401
28	NC_015693	TG	3	6	35996	36001	0 %	50 %	50 %	0 %	338209402
29	NC_015693	AT	3	6	38459	38464	50 %	50 %	0 %	0 %	338209404
30	NC_015693	TA	3	6	41139	41144	50 %	50 %	0 %	0 %	338209406
31	NC_015693	CT	3	6	41307	41312	0 %	50 %	0 %	50 %	338209406
32	NC_015693	TG	3	6	41906	41911	0 %	50 %	50 %	0 %	338209407
33	NC_015693	CA	3	6	42913	42918	50 %	0 %	0 %	50 %	338209408
34	NC_015693	CG	4	8	48467	48474	0 %	0 %	50 %	50 %	338209412
35	NC_015693	GC	3	6	50764	50769	0 %	0 %	50 %	50 %	338209413
36	NC_015693	GT	3	6	51847	51852	0 %	50 %	50 %	0 %	338209414
37	NC_015693	TC	3	6	53320	53325	0 %	50 %	0 %	50 %	338209416
38	NC_015693	AT	3	6	53589	53594	50 %	50 %	0 %	0 %	338209416
39	NC_015693	AT	3	6	54644	54649	50 %	50 %	0 %	0 %	338209416
40	NC_015693	GT	3	6	55104	55109	0 %	50 %	50 %	0 %	338209417
41	NC_015693	TG	3	6	56255	56260	0 %	50 %	50 %	0 %	338209417
42	NC_015693	AT	3	6	59034	59039	50 %	50 %	0 %	0 %	338209420
43	NC_015693	TA	3	6	61919	61924	50 %	50 %	0 %	0 %	338209424
44	NC_015693	TC	3	6	62680	62685	0 %	50 %	0 %	50 %	338209424
45	NC_015693	GA	3	6	62700	62705	50 %	0 %	50 %	0 %	338209424
46	NC_015693	GA	3	6	64517	64522	50 %	0 %	50 %	0 %	338209426
47	NC_015693	TC	3	6	65158	65163	0 %	50 %	0 %	50 %	338209426
48	NC_015693	AT	4	8	71055	71062	50 %	50 %	0 %	0 %	338209432
49	NC_015693	CA	3	6	71759	71764	50 %	0 %	0 %	50 %	338209433
50	NC_015693	TG	4	8	72632	72639	0 %	50 %	50 %	0 %	338209434
51	NC_015693	CG	3	6	74641	74646	0 %	0 %	50 %	50 %	338209436
52	NC_015693	AC	3	6	75648	75653	50 %	0 %	0 %	50 %	338209436
53	NC_015693	TA	3	6	77193	77198	50 %	50 %	0 %	0 %	338209438
54	NC_015693	TG	3	6	80358	80363	0 %	50 %	50 %	0 %	338209440
55	NC_015693	CA	3	6	80419	80424	50 %	0 %	0 %	50 %	338209440
56	NC_015693	CT	3	6	81718	81723	0 %	50 %	0 %	50 %	338209441
57	NC_015693	GC	3	6	82155	82160	0 %	0 %	50 %	50 %	338209441
58	NC_015693	AT	3	6	82323	82328	50 %	50 %	0 %	0 %	338209441
59	NC_015693	AG	3	6	83427	83432	50 %	0 %	50 %	0 %	338209442
60	NC_015693	CA	3	6	85665	85670	50 %	0 %	0 %	50 %	338209442
61	NC_015693	GA	3	6	95399	95404	50 %	0 %	50 %	0 %	338209450
62	NC_015693	GA	3	6	96801	96806	50 %	0 %	50 %	0 %	338209451
63	NC_015693	CG	3	6	97554	97559	0 %	0 %	50 %	50 %	338209451
64	NC_015693	GT	3	6	97724	97729	0 %	50 %	50 %	0 %	338209452
65	NC_015693	AT	3	6	97784	97789	50 %	50 %	0 %	0 %	338209452
66	NC_015693	AT	3	6	99456	99461	50 %	50 %	0 %	0 %	338209453
67	NC_015693	CA	3	6	99724	99729	50 %	0 %	0 %	50 %	338209453
68	NC_015693	GC	3	6	104366	104371	0 %	0 %	50 %	50 %	338209455
69	NC_015693	TG	3	6	106266	106271	0 %	50 %	50 %	0 %	338209456

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.