MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Clostridium acetobutylicum DSM 1731 plasmid pSMBb

Total Repeats: 38

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015688	ATAA	2	8	92	99	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015688	AATT	2	8	312	319	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015688	TACA	2	8	401	408	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_015688	ATAA	2	8	506	513	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015688	CATA	2	8	556	563	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_015688	TTGG	2	8	791	798	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015688	TAAT	2	8	814	821	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015688	ATTT	2	8	1547	1554	25 %	75 %	0 %	0 %	337738949
9	NC_015688	ATTA	2	8	1572	1579	50 %	50 %	0 %	0 %	337738949
10	NC_015688	CATA	2	8	1598	1605	50 %	25 %	0 %	25 %	337738949
11	NC_015688	ATCT	2	8	1650	1657	25 %	50 %	0 %	25 %	337738949
12	NC_015688	GTTG	2	8	2020	2027	0 %	50 %	50 %	0 %	337738949
13	NC_015688	AGTA	2	8	2043	2050	50 %	25 %	25 %	0 %	337738949
14	NC_015688	ACTA	2	8	2162	2169	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_015688	AATT	2	8	2573	2580	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015688	ATAA	2	8	2624	2631	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015688	TTAA	2	8	2744	2751	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015688	AAAT	2	8	4776	4783	75 %	25 %	0 %	0 %	337738951
19	NC_015688	ATAA	2	8	5038	5045	75 %	25 %	0 %	0 %	337738952
20	NC_015688	TAAA	2	8	5753	5760	75 %	25 %	0 %	0 %	337738952
21	NC_015688	CTCA	2	8	5903	5910	25 %	25 %	0 %	50 %	337738952
22	NC_015688	TAAA	2	8	6151	6158	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015688	TATT	2	8	6269	6276	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015688	ATCT	2	8	7699	7706	25 %	50 %	0 %	25 %	337738954
25	NC_015688	CTTG	2	8	7928	7935	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_015688	ATAG	2	8	8121	8128	50 %	25 %	25 %	0 %	337738955
27	NC_015688	TTAT	2	8	8222	8229	25 %	75 %	0 %	0 %	337738955
28	NC_015688	CAAT	2	8	8553	8560	50 %	25 %	0 %	25 %	337738955
29	NC_015688	ATTA	2	8	8575	8582	50 %	50 %	0 %	0 %	337738955
30	NC_015688	TACT	2	8	8648	8655	25 %	50 %	0 %	25 %	337738955
31	NC_015688	AATT	2	8	8874	8881	50 %	50 %	0 %	0 %	337738955
32	NC_015688	ACTA	2	8	9100	9107	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_015688	TAGT	2	8	9247	9254	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015688	AATA	2	8	9405	9412	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015688	CCAA	2	8	9791	9798	50 %	0 %	0 %	50 %	337738956
36	NC_015688	TAAA	2	8	10625	10632	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015688	TGGC	2	8	10912	10919	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
38	NC_015688	ATTT	2	8	10959	10966	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.