MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Clostridium acetobutylicum DSM 1731 plasmid pSMBb

Total Repeats: 164

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015688	AAT	2	6	7	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015688	AAT	2	6	28	33	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015688	TAT	2	6	151	156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015688	CTC	2	6	533	538	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_015688	ATT	2	6	583	588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015688	ATT	2	6	684	689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015688	TAG	2	6	691	696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015688	TAT	2	6	733	738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015688	TAA	2	6	859	864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015688	ATA	2	6	905	910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015688	TAT	2	6	917	922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015688	ATT	2	6	966	971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337738948
13	NC_015688	TAA	2	6	1119	1124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337738949
14	NC_015688	GTT	2	6	1167	1172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	337738949
15	NC_015688	ATC	2	6	1176	1181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337738949
16	NC_015688	CAA	2	6	1244	1249	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337738949
17	NC_015688	ATG	2	6	1343	1348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337738949
18	NC_015688	TCT	2	6	1402	1407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337738949
19	NC_015688	TAA	2	6	1626	1631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337738949
20	NC_015688	TCT	2	6	1642	1647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337738949
21	NC_015688	ATT	2	6	1767	1772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337738949
22	NC_015688	TAA	2	6	1965	1970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337738949
23	NC_015688	TTC	2	6	2010	2015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337738949
24	NC_015688	TCT	2	6	2054	2059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337738949
25	NC_015688	TTC	2	6	2061	2066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337738949
26	NC_015688	ATA	2	6	2092	2097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337738949
27	NC_015688	ACA	2	6	2382	2387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_015688	TTG	2	6	2395	2400	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015688	TAT	2	6	2437	2442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015688	AGG	2	6	2498	2503	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015688	TAT	2	6	2508	2513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015688	ATG	2	6	2567	2572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015688	TTA	2	6	2658	2663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015688	ATA	3	9	2769	2777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015688	AAG	2	6	2818	2823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337738950
36	NC_015688	ACC	2	6	2874	2879	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	337738950
37	NC_015688	CCA	2	6	2920	2925	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	337738950
38	NC_015688	CAT	2	6	2930	2935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337738950
39	NC_015688	AAG	2	6	3001	3006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337738950
40	NC_015688	GAG	2	6	3128	3133	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337738950
41	NC_015688	ATA	2	6	3138	3143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337738950
42	NC_015688	ATT	2	6	3157	3162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337738950
43	NC_015688	TGC	2	6	3258	3263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337738950
44	NC_015688	ATT	2	6	3319	3324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337738950
45	NC_015688	ACC	2	6	3348	3353	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_015688	AAT	2	6	3367	3372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015688	ATG	2	6	3397	3402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015688	TAT	3	9	3428	3436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015688	TGT	2	6	3481	3486	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015688	TAA	3	9	3502	3510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015688	GTA	2	6	3530	3535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015688	AAT	2	6	3655	3660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015688	TAA	3	9	3673	3681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015688	TAT	2	6	3711	3716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015688	TTC	2	6	3738	3743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_015688	TAT	2	6	3748	3753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015688	TAG	2	6	3773	3778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015688	ATT	2	6	3807	3812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015688	ATG	2	6	3909	3914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015688	ATT	2	6	3925	3930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337738951
61	NC_015688	GAT	2	6	4070	4075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337738951
62	NC_015688	TAA	3	9	4111	4119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337738951
63	NC_015688	ATA	2	6	4149	4154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337738951
64	NC_015688	GAT	2	6	4199	4204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337738951
65	NC_015688	ACA	2	6	4242	4247	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337738951
66	NC_015688	ATT	3	9	4290	4298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337738951
67	NC_015688	ACT	2	6	4337	4342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337738951
68	NC_015688	ATT	2	6	4358	4363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337738951
69	NC_015688	TAA	2	6	4411	4416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337738951
70	NC_015688	AAT	2	6	4430	4435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337738951
71	NC_015688	TAA	2	6	4453	4458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337738951
72	NC_015688	TAC	2	6	4468	4473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337738951
73	NC_015688	TGA	2	6	4510	4515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337738951
74	NC_015688	TGA	2	6	4606	4611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337738951
75	NC_015688	ACA	2	6	4649	4654	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337738951
76	NC_015688	GAT	2	6	4658	4663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337738951
77	NC_015688	AAT	2	6	4709	4714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337738951
78	NC_015688	AAT	3	9	4781	4789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337738951
79	NC_015688	TGT	3	9	4795	4803	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	337738951
80	NC_015688	ATG	3	9	4917	4925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337738951
81	NC_015688	GAT	2	6	4931	4936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337738951
82	NC_015688	ATT	2	6	5116	5121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337738952
83	NC_015688	GCT	2	6	5125	5130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337738952
84	NC_015688	TAA	2	6	5178	5183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337738952
85	NC_015688	TCT	2	6	5185	5190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337738952
86	NC_015688	ATA	2	6	5282	5287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337738952
87	NC_015688	CTC	2	6	5397	5402	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337738952
88	NC_015688	ATA	3	9	5441	5449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337738952
89	NC_015688	CAC	2	6	5585	5590	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	337738952
90	NC_015688	TAT	2	6	5656	5661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337738952
91	NC_015688	GTA	2	6	5671	5676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337738952
92	NC_015688	TAT	2	6	5680	5685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337738952
93	NC_015688	TAG	2	6	5709	5714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337738952
94	NC_015688	AAT	2	6	5740	5745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337738952
95	NC_015688	TAA	2	6	5793	5798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337738952
96	NC_015688	TAG	2	6	5964	5969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337738952
97	NC_015688	AAC	2	6	6037	6042	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337738952
98	NC_015688	ATA	2	6	6063	6068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015688	TAA	2	6	6084	6089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015688	GTA	2	6	6137	6142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015688	TCT	2	6	6201	6206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_015688	TGT	2	6	6344	6349	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015688	AAT	2	6	6375	6380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015688	GTT	2	6	6416	6421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015688	GAA	2	6	6631	6636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337738953
106	NC_015688	AAT	2	6	6666	6671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337738953
107	NC_015688	AGA	2	6	6715	6720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015688	TGC	2	6	7009	7014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_015688	TAA	2	6	7058	7063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015688	ACA	3	9	7156	7164	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_015688	TTG	3	9	7222	7230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015688	TAA	2	6	7231	7236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015688	ATT	2	6	7285	7290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337738954
114	NC_015688	GTT	2	6	7410	7415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	337738954
115	NC_015688	ACA	2	6	7470	7475	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337738954
116	NC_015688	ATC	2	6	7553	7558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337738954
117	NC_015688	TTA	2	6	7812	7817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337738954
118	NC_015688	AAT	2	6	7907	7912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015688	CTG	2	6	8208	8213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337738955
120	NC_015688	ATT	2	6	8233	8238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337738955
121	NC_015688	AGT	2	6	8242	8247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337738955
122	NC_015688	ATT	2	6	8248	8253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337738955
123	NC_015688	TTA	2	6	8307	8312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337738955
124	NC_015688	TTA	2	6	8315	8320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337738955
125	NC_015688	ATT	2	6	8326	8331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337738955
126	NC_015688	TAA	2	6	8375	8380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337738955
127	NC_015688	AAT	2	6	8421	8426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337738955
128	NC_015688	AAT	2	6	8445	8450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337738955
129	NC_015688	ATA	2	6	8488	8493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337738955
130	NC_015688	GTA	2	6	8629	8634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337738955
131	NC_015688	ACT	2	6	8683	8688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337738955
132	NC_015688	TTA	2	6	8727	8732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337738955
133	NC_015688	AAT	2	6	8861	8866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337738955
134	NC_015688	AAT	2	6	8940	8945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337738955
135	NC_015688	ATC	2	6	9001	9006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337738955
136	NC_015688	TCC	2	6	9056	9061	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_015688	AAT	2	6	9238	9243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015688	TAT	2	6	9293	9298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015688	TAG	2	6	9375	9380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015688	TAA	2	6	9447	9452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015688	TAA	2	6	9524	9529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015688	ATT	2	6	9569	9574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015688	ATT	2	6	9636	9641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_015688	TAA	3	9	9652	9660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_015688	ATA	2	6	9662	9667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_015688	TAA	2	6	9849	9854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337738956
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162	NC_015688	TAA	2	6	10924	10929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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164	NC_015688	AAT	2	6	11109	11114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.