MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Clostridium acetobutylicum DSM 1731 plasmid pSMBb

Total Repeats: 98

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015688	ATT	2	6	966	971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337738948
2	NC_015688	TAA	2	6	1119	1124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337738949
3	NC_015688	GTT	2	6	1167	1172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	337738949
4	NC_015688	ATC	2	6	1176	1181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337738949
5	NC_015688	CAA	2	6	1244	1249	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337738949
6	NC_015688	ATG	2	6	1343	1348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337738949
7	NC_015688	TCT	2	6	1402	1407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337738949
8	NC_015688	TAA	2	6	1626	1631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337738949
9	NC_015688	TCT	2	6	1642	1647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337738949
10	NC_015688	ATT	2	6	1767	1772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337738949
11	NC_015688	TAA	2	6	1965	1970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337738949
12	NC_015688	TTC	2	6	2010	2015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337738949
13	NC_015688	TCT	2	6	2054	2059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337738949
14	NC_015688	TTC	2	6	2061	2066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337738949
15	NC_015688	ATA	2	6	2092	2097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337738949
16	NC_015688	AAG	2	6	2818	2823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337738950
17	NC_015688	ACC	2	6	2874	2879	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	337738950
18	NC_015688	CCA	2	6	2920	2925	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	337738950
19	NC_015688	CAT	2	6	2930	2935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337738950
20	NC_015688	AAG	2	6	3001	3006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337738950
21	NC_015688	GAG	2	6	3128	3133	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337738950
22	NC_015688	ATA	2	6	3138	3143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337738950
23	NC_015688	ATT	2	6	3157	3162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337738950
24	NC_015688	TGC	2	6	3258	3263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337738950
25	NC_015688	ATT	2	6	3319	3324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337738950
26	NC_015688	ATT	2	6	3925	3930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337738951
27	NC_015688	GAT	2	6	4070	4075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337738951
28	NC_015688	TAA	3	9	4111	4119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337738951
29	NC_015688	ATA	2	6	4149	4154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337738951
30	NC_015688	GAT	2	6	4199	4204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337738951
31	NC_015688	ACA	2	6	4242	4247	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337738951
32	NC_015688	ATT	3	9	4290	4298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337738951
33	NC_015688	ACT	2	6	4337	4342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337738951
34	NC_015688	ATT	2	6	4358	4363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337738951
35	NC_015688	TAA	2	6	4411	4416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337738951
36	NC_015688	AAT	2	6	4430	4435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337738951
37	NC_015688	TAA	2	6	4453	4458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337738951
38	NC_015688	TAC	2	6	4468	4473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337738951
39	NC_015688	TGA	2	6	4510	4515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337738951
40	NC_015688	TGA	2	6	4606	4611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337738951
41	NC_015688	ACA	2	6	4649	4654	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337738951
42	NC_015688	GAT	2	6	4658	4663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337738951
43	NC_015688	AAT	2	6	4709	4714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337738951
44	NC_015688	AAT	3	9	4781	4789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337738951
45	NC_015688	TGT	3	9	4795	4803	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	337738951
46	NC_015688	ATG	3	9	4917	4925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337738951
47	NC_015688	GAT	2	6	4931	4936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337738951
48	NC_015688	ATT	2	6	5116	5121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337738952
49	NC_015688	GCT	2	6	5125	5130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337738952
50	NC_015688	TAA	2	6	5178	5183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337738952
51	NC_015688	TCT	2	6	5185	5190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337738952
52	NC_015688	ATA	2	6	5282	5287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337738952
53	NC_015688	CTC	2	6	5397	5402	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337738952
54	NC_015688	ATA	3	9	5441	5449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337738952
55	NC_015688	CAC	2	6	5585	5590	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	337738952
56	NC_015688	TAT	2	6	5656	5661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337738952
57	NC_015688	GTA	2	6	5671	5676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337738952
58	NC_015688	TAT	2	6	5680	5685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337738952
59	NC_015688	TAG	2	6	5709	5714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337738952
60	NC_015688	AAT	2	6	5740	5745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337738952
61	NC_015688	TAA	2	6	5793	5798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337738952
62	NC_015688	TAG	2	6	5964	5969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337738952
63	NC_015688	AAC	2	6	6037	6042	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337738952
64	NC_015688	GAA	2	6	6631	6636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337738953
65	NC_015688	AAT	2	6	6666	6671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337738953
66	NC_015688	ATT	2	6	7285	7290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337738954
67	NC_015688	GTT	2	6	7410	7415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	337738954
68	NC_015688	ACA	2	6	7470	7475	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337738954
69	NC_015688	ATC	2	6	7553	7558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337738954
70	NC_015688	TTA	2	6	7812	7817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337738954
71	NC_015688	CTG	2	6	8208	8213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337738955
72	NC_015688	ATT	2	6	8233	8238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337738955
73	NC_015688	AGT	2	6	8242	8247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337738955
74	NC_015688	ATT	2	6	8248	8253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337738955
75	NC_015688	TTA	2	6	8307	8312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337738955
76	NC_015688	TTA	2	6	8315	8320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337738955
77	NC_015688	ATT	2	6	8326	8331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337738955
78	NC_015688	TAA	2	6	8375	8380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337738955
79	NC_015688	AAT	2	6	8421	8426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337738955
80	NC_015688	AAT	2	6	8445	8450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337738955
81	NC_015688	ATA	2	6	8488	8493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337738955
82	NC_015688	GTA	2	6	8629	8634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337738955
83	NC_015688	ACT	2	6	8683	8688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337738955
84	NC_015688	TTA	2	6	8727	8732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337738955
85	NC_015688	AAT	2	6	8861	8866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337738955
86	NC_015688	AAT	2	6	8940	8945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337738955
87	NC_015688	ATC	2	6	9001	9006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337738955
88	NC_015688	TAA	2	6	9849	9854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337738956
89	NC_015688	CTT	2	6	9877	9882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337738956
90	NC_015688	AGT	2	6	9883	9888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337738956
91	NC_015688	CTT	2	6	9948	9953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337738956
92	NC_015688	CTT	2	6	9978	9983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337738956
93	NC_015688	TAT	3	9	10003	10011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337738956
94	NC_015688	CTT	2	6	10194	10199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337738956
95	NC_015688	TAA	2	6	10264	10269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337738956
96	NC_015688	TTA	2	6	10271	10276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337738956
97	NC_015688	TAT	2	6	10321	10326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337738956
98	NC_015688	CTG	2	6	10329	10334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337738956

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.