MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Clostridium acetobutylicum DSM 1731 chromosome

Total Repeats: 2038

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015687	GTAATA	2	12	828	839	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	337735210
2	NC_015687	TTGCTG	2	12	861	872	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	337735210
3	NC_015687	ATAAGG	2	12	3610	3621	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	337735213
4	NC_015687	ATAAAT	2	12	3729	3740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337735213
5	NC_015687	GAAGTA	2	12	5240	5251	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	337735215
6	NC_015687	TATGAT	2	12	5390	5401	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	337735215
7	NC_015687	CCGATG	2	12	6336	6347	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	337735215
8	NC_015687	TGATAT	2	12	8252	8263	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	337735216
9	NC_015687	GCTTAT	2	12	9056	9067	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	337735216
10	NC_015687	TCTAGC	2	12	9173	9184	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	337735216
11	NC_015687	TAATTC	2	12	15473	15484	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	337735218
12	NC_015687	CAAGTG	2	12	16942	16953	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	337735219
13	NC_015687	TAGTAA	2	12	17421	17432	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	337735219
14	NC_015687	AAAGAT	2	12	17983	17994	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	337735219
15	NC_015687	TGGAGT	2	12	22936	22947	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	337735224
16	NC_015687	TTAGAT	2	12	24979	24990	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	337735226
17	NC_015687	AATTTG	2	12	25367	25378	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	337735226
18	NC_015687	GAAGGT	2	12	25645	25656	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	337735226
19	NC_015687	TGAATA	2	12	26358	26369	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	337735227
20	NC_015687	ATCCAA	2	12	26388	26399	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	337735227
21	NC_015687	TTGGAA	2	12	28796	28807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337735229
22	NC_015687	AGATAA	2	12	34095	34106	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	337735232
23	NC_015687	AGTAAA	2	12	36177	36188	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015687	GCTTTT	2	12	39494	39505	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	337735237
25	NC_015687	TCTACC	2	12	39692	39703	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	337735237
26	NC_015687	TTATAA	2	12	42811	42822	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015687	TATAGC	2	12	48011	48022	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	337735245
28	NC_015687	CTATAG	2	12	48973	48984	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	337735246
29	NC_015687	ATTGAA	2	12	55161	55172	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015687	TAATAG	2	12	57505	57516	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	337735253
31	NC_015687	TAAAAA	2	12	57566	57577	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	337735253
32	NC_015687	TAGAAA	2	12	57926	57937	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015687	GAAAAG	2	12	58652	58663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337735254
34	NC_015687	TAAATA	2	12	59374	59385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337735255
35	NC_015687	AGGAAA	2	12	60206	60217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337735257
36	NC_015687	TAAAAA	2	12	61867	61878	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015687	TAAAAA	2	12	68317	68328	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	337735269
38	NC_015687	GTAAAT	2	12	75406	75417	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	337735271
39	NC_015687	TAAAAA	2	12	78119	78130	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	337735276
40	NC_015687	AGTTTT	2	12	80370	80381	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	337735278
41	NC_015687	TATTAG	2	12	83700	83711	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	337735283
42	NC_015687	ATTGTA	2	12	85204	85215	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	337735285
43	NC_015687	ATATAA	2	12	86464	86475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337735286
44	NC_015687	TAAGGT	2	12	86689	86700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015687	TTAAAT	2	12	87523	87534	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015687	GATATA	2	12	91141	91152	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	337735291
47	NC_015687	AAAAAT	2	12	92118	92129	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015687	TAAAGA	2	12	96250	96261	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	337735297
49	NC_015687	GCTGGA	2	12	97199	97210	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	337735298
50	NC_015687	TTATGA	2	12	98525	98536	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	337735299
51	NC_015687	AAACAA	2	12	99651	99662	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	337735300
52	NC_015687	GAAACT	2	12	99957	99968	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	337735300
53	NC_015687	TAGAAA	2	12	107405	107416	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	337735307
54	NC_015687	TAATAT	2	12	110531	110542	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015687	TCAGGT	2	12	113854	113865	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	337735312
56	NC_015687	ATAACA	2	12	114049	114060	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	337735312
57	NC_015687	AATGGT	2	12	115217	115228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337735313
58	NC_015687	ATAGAA	2	12	115358	115369	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	337735313
59	NC_015687	GGACCA	2	12	116629	116640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337735315
60	NC_015687	ATAAAT	2	12	119334	119345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337735318
61	NC_015687	ATAGAT	2	12	121942	121953	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	337735320
62	NC_015687	TTCAGG	2	12	123344	123355	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	337735321
63	NC_015687	CAAAAG	2	12	128324	128335	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	337735326
64	NC_015687	TAACCT	2	12	131775	131786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337735329
65	NC_015687	AAAAGG	2	12	132543	132554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337735329
66	NC_015687	AGTTAT	2	12	134088	134099	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015687	AGAGTT	2	12	137927	137938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337735334
68	NC_015687	TAAAAT	2	12	138478	138489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337735335
69	NC_015687	ATATCT	2	12	141483	141494	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_015687	CTTTAT	2	12	144510	144521	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_015687	AAAAAG	2	12	144791	144802	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	337735346
72	NC_015687	AAAAAG	2	12	145544	145555	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	337735347
73	NC_015687	TGGGCA	2	12	146628	146639	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	337735347
74	NC_015687	AGATCA	2	12	148333	148344	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	337735349
75	NC_015687	TAAGTA	2	12	148809	148820	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	337735349
76	NC_015687	TTTTGC	2	12	152105	152116	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	337735355
77	NC_015687	TCTTTT	2	12	152202	152213	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	337735355
78	NC_015687	ACTATT	2	12	153025	153036	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_015687	ATAAGA	2	12	153423	153434	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	337735356
80	NC_015687	TTTTGT	2	12	155334	155345	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	337735359
81	NC_015687	GATTTT	2	12	156035	156046	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	337735360
82	NC_015687	ATTAAA	2	12	156541	156552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337735360
83	NC_015687	TAAAAA	2	12	163265	163276	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015687	TAAAAA	2	12	168403	168414	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015687	AAGCAA	2	12	177629	177640	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	337735364
86	NC_015687	AAAATT	2	12	179586	179597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337735366
87	NC_015687	ATTGGA	2	12	180362	180373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337735367
88	NC_015687	CAATTA	2	12	181898	181909	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	337735367
89	NC_015687	ATATTG	2	12	183074	183085	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	337735369
90	NC_015687	TTTTAA	2	12	187084	187095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015687	TATAAA	2	12	187243	187254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015687	GATAAG	2	12	187461	187472	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	337735374
93	NC_015687	ATCAGG	2	12	187538	187549	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	337735374
94	NC_015687	AAAATT	2	12	188845	188856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337735375
95	NC_015687	ACATCA	2	12	193736	193747	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	337735380
96	NC_015687	GATATT	2	12	196566	196577	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	337735383
97	NC_015687	GTAAAA	2	12	196935	196946	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	337735383
98	NC_015687	AGAAAA	2	12	198913	198924	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	337735385
99	NC_015687	ACTCAA	2	12	200606	200617	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	337735386
100	NC_015687	GGATAA	2	12	200655	200666	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	337735386
101	NC_015687	AAAGAA	2	12	202969	202980	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	337735389
102	NC_015687	GTATTT	2	12	211495	211506	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	337735397
103	NC_015687	TTCTAC	2	12	212001	212012	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	337735397
104	NC_015687	GATGAA	2	12	213572	213583	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	337735399
105	NC_015687	ATATTT	2	12	214351	214362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337735400
106	NC_015687	GAAGAG	2	12	215028	215039	50 %	0 %	50 %	0 %	337735400
107	NC_015687	ATAGCT	2	12	216319	216330	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	337735402
108	NC_015687	TAAAAG	2	12	221881	221892	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015687	TAAAGA	2	12	221943	221954	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	337735407
110	NC_015687	ACTTTT	2	12	223744	223755	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	337735409
111	NC_015687	TTTTAT	2	12	225652	225663	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	337735411
112	NC_015687	TTACAC	2	12	230130	230141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337735416
113	NC_015687	GAATAA	2	12	231628	231639	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	337735417
114	NC_015687	GCAATA	2	12	231651	231662	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	337735417
115	NC_015687	AATAGA	2	12	231938	231949	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	337735417
116	NC_015687	ATTTAT	2	12	232016	232027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337735417
117	NC_015687	GCAGTT	2	12	233040	233051	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	337735418
118	NC_015687	TTTAAA	2	12	234468	234479	50 %	50 %	0 %	0 %	337735419
119	NC_015687	AAGGAA	2	12	239058	239069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337735425
120	NC_015687	AGTTGA	2	12	239528	239539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337735425
121	NC_015687	AAAAAT	2	12	241602	241613	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	337735427
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123	NC_015687	TTTTTA	2	12	243964	243975	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	337735430
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125	NC_015687	TAAAAA	2	12	244829	244840	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	337735431
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226	NC_015687	GATTTA	2	12	462200	462211	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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231	NC_015687	ATTATA	2	12	475615	475626	50 %	50 %	0 %	0 %	337735621
232	NC_015687	GTTAAG	2	12	476031	476042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337735621
233	NC_015687	AAATGA	2	12	478061	478072	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	337735625
234	NC_015687	GATAAG	2	12	478562	478573	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	337735625
235	NC_015687	ACACTT	2	12	480390	480401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337735627
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237	NC_015687	ATTGAT	2	12	481519	481530	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	337735628
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240	NC_015687	TGCTAT	2	12	490610	490621	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	337735637
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346	NC_015687	GGTAAA	2	12	730665	730676	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	337735845
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352	NC_015687	CACCAA	2	12	739076	739087	50 %	0 %	0 %	50 %	337735851
353	NC_015687	CTTATG	2	12	741212	741223	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	337735854
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471	NC_015687	ATATGA	2	12	959107	959118	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	337736044
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