MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Clostridium acetobutylicum DSM 1731 chromosome

Total Repeats: 249

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015687	AGTAAA	2	12	36177	36188	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015687	TTATAA	2	12	42811	42822	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015687	ATTGAA	2	12	55161	55172	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015687	TAGAAA	2	12	57926	57937	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015687	TAAAAA	2	12	61867	61878	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015687	TAAGGT	2	12	86689	86700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015687	TTAAAT	2	12	87523	87534	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015687	AAAAAT	2	12	92118	92129	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015687	TAATAT	2	12	110531	110542	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015687	AGTTAT	2	12	134088	134099	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015687	ATATCT	2	12	141483	141494	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_015687	CTTTAT	2	12	144510	144521	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_015687	ACTATT	2	12	153025	153036	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_015687	TAAAAA	2	12	163265	163276	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015687	TAAAAA	2	12	168403	168414	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015687	TTTTAA	2	12	187084	187095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015687	TATAAA	2	12	187243	187254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015687	TAAAAG	2	12	221881	221892	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015687	TAGTTA	2	12	315809	315820	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015687	TAAAAA	2	12	335969	335980	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015687	TAAAAA	2	12	341107	341118	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015687	TTATAG	2	12	351228	351239	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015687	TTAAAA	2	12	352478	352489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015687	CAAAAT	2	12	368101	368112	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_015687	GGTAAA	2	12	385620	385631	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015687	TATAAT	2	12	397589	397600	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015687	AAAATA	2	12	402760	402771	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015687	ACGTTA	2	12	419463	419474	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_015687	GTTAAC	2	12	420765	420776	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_015687	TACAAA	2	12	425142	425153	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_015687	TACAAA	2	12	439375	439386	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_015687	ATTTTT	2	12	443479	443490	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015687	ATGCAA	2	12	444625	444636	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_015687	AACATA	2	12	461574	461585	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_015687	GATTTA	2	12	462200	462211	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015687	ATAAAA	2	12	481076	481087	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015687	AAATAT	2	12	531675	531686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015687	TAAGTA	2	12	536413	536424	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015687	ATTTAA	2	12	563047	563058	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015687	TAAATT	2	12	567776	567787	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015687	TATATT	2	12	575158	575169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015687	TTTTTG	2	12	598881	598892	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015687	AACTTG	2	12	601214	601225	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_015687	ATGATT	2	12	612260	612271	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015687	ATATTT	2	12	617031	617042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015687	CAAATG	2	12	638764	638775	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_015687	AATTAA	2	12	645890	645901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015687	TGATTT	2	12	646008	646019	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015687	TAAATA	2	12	648835	648846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015687	TGATAA	2	12	676105	676116	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015687	TAAATA	2	12	728082	728093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015687	TAATTA	2	12	746522	746533	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015687	ATTTAT	2	12	772418	772429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015687	TATTAA	2	12	772447	772458	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015687	TTATAT	2	12	784021	784032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015687	GTTTTT	2	12	785413	785424	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015687	TTTTAA	2	12	789203	789214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015687	AAAATA	2	12	797063	797074	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015687	AAATTA	2	12	815860	815871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015687	TTTTAA	2	12	832903	832914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015687	TTTAGC	2	12	833073	833084	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_015687	AAAAAT	2	12	884846	884857	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015687	TAAGAG	2	12	896237	896248	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015687	ATTATA	2	12	928232	928243	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015687	ATATTT	2	12	928252	928263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015687	TAAAAA	2	12	933385	933396	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015687	TAAAAA	2	12	938905	938916	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015687	TTTAAA	2	12	958948	958959	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015687	TAACTT	2	12	972388	972399	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_015687	ATATAA	2	12	975015	975026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015687	AAAAAT	2	12	981027	981038	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015687	TTAAAT	2	12	1004371	1004382	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015687	TTAAGT	2	12	1007857	1007868	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015687	AATATA	2	12	1010982	1010993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015687	AGATTA	2	12	1070389	1070400	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015687	TAAGAT	2	12	1089918	1089929	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015687	TAAAAA	2	12	1104900	1104911	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015687	TAAAAT	2	12	1115612	1115623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015687	TAAAAA	2	12	1115831	1115842	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015687	ATATTT	2	12	1123013	1123024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015687	AATATT	2	12	1134190	1134201	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015687	CATAAA	2	12	1159631	1159642	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_015687	TTAATA	2	12	1171800	1171811	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015687	ATCATT	2	12	1181274	1181285	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_015687	CATATA	2	12	1195228	1195239	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_015687	ATTTAA	2	12	1198720	1198731	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015687	TTTATT	2	12	1199794	1199805	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015687	ATATTA	2	12	1210572	1210583	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015687	ATATTA	2	12	1213454	1213465	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015687	ATATAG	2	12	1243260	1243271	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015687	CTATAT	2	12	1243280	1243291	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_015687	TTGTGC	2	12	1262417	1262428	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_015687	TAAAAA	2	12	1299434	1299445	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015687	TTCTTT	2	12	1313228	1313239	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_015687	ATAACA	2	12	1315576	1315587	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_015687	ATATTT	2	12	1316266	1316277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015687	CAAGGA	2	12	1331818	1331829	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_015687	ACAATT	2	12	1332063	1332074	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_015687	TTTTAT	2	12	1338936	1338947	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015687	TAGTAA	2	12	1354586	1354597	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015687	TATAAA	2	12	1359685	1359696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015687	TAAAAA	2	12	1376819	1376830	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015687	TATGAA	2	12	1377330	1377341	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015687	ATATGG	2	12	1378485	1378496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015687	TTTAAG	2	12	1378648	1378659	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015687	CTTTTT	2	12	1397145	1397156	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_015687	CTTTTA	2	12	1398550	1398561	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_015687	ATATAA	2	12	1413160	1413171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015687	AAATGA	2	12	1440641	1440652	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015687	TTTTTA	2	12	1446385	1446396	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015687	ATATAA	2	12	1462361	1462372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015687	TATTAA	2	12	1469046	1469057	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015687	AGAAAA	2	12	1481778	1481789	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015687	TTTTAT	2	12	1481798	1481809	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015687	TTTTTA	2	12	1551871	1551882	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015687	TATAAA	2	12	1571784	1571795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015687	GTTATG	2	12	1574976	1574987	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015687	ATTTTT	2	12	1578743	1578754	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015687	TATTAA	2	12	1593128	1593139	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015687	AAATAT	2	12	1595488	1595499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015687	TAATTA	2	12	1599834	1599845	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015687	CTGAAG	2	12	1629117	1629128	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_015687	ATTAGA	2	12	1645061	1645072	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015687	AATAAA	2	12	1704998	1705009	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015687	CAAAGT	2	12	1710588	1710599	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_015687	ATAATC	2	12	1748387	1748398	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_015687	AGTTTC	2	12	1754585	1754596	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_015687	CTTAAA	2	12	1815507	1815518	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_015687	TAAAAG	2	12	1826791	1826802	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015687	TCAATT	3	18	1891657	1891674	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_015687	TATTTT	2	12	1905639	1905650	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015687	ATAATT	2	12	1910157	1910168	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015687	GAAAAA	2	12	1916135	1916146	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.