MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Clostridium acetobutylicum DSM 1731 chromosome

Total Repeats: 50853

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015687	ATA	2	6	509	514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337735210
2	NC_015687	TAA	3	9	651	659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337735210
3	NC_015687	ATA	2	6	671	676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337735210
4	NC_015687	ACT	2	6	677	682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337735210
5	NC_015687	GAA	2	6	716	721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337735210
6	NC_015687	TTC	2	6	781	786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337735210
7	NC_015687	TGC	2	6	850	855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337735210
8	NC_015687	ATT	2	6	898	903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337735210
9	NC_015687	GGA	2	6	911	916	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337735210
10	NC_015687	ATA	2	6	969	974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337735210
11	NC_015687	TCT	2	6	1001	1006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337735210
12	NC_015687	GAC	2	6	1043	1048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337735210
13	NC_015687	TGA	2	6	1099	1104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337735210
14	NC_015687	AAG	2	6	1137	1142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337735210
15	NC_015687	ACC	2	6	1207	1212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	337735210
16	NC_015687	GGA	2	6	1231	1236	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337735210
17	NC_015687	GGA	2	6	1688	1693	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337735210
18	NC_015687	TCT	2	6	1733	1738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337735210
19	NC_015687	AGA	2	6	1747	1752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337735210
20	NC_015687	TGA	2	6	1753	1758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337735210
21	NC_015687	ATA	2	6	1804	1809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337735210
22	NC_015687	AAG	2	6	2095	2100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337735211
23	NC_015687	ATT	2	6	2103	2108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337735211
24	NC_015687	CAA	2	6	2137	2142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337735211
25	NC_015687	AGA	2	6	2249	2254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337735211
26	NC_015687	GTT	2	6	2262	2267	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	337735211
27	NC_015687	AAT	2	6	2291	2296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337735211
28	NC_015687	AAT	2	6	2340	2345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337735211
29	NC_015687	TAA	2	6	2363	2368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337735211
30	NC_015687	AAG	2	6	2597	2602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337735211
31	NC_015687	TTA	2	6	2665	2670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337735211
32	NC_015687	GAT	2	6	2682	2687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337735211
33	NC_015687	ATA	2	6	2748	2753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337735211
34	NC_015687	ACT	2	6	2759	2764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337735211
35	NC_015687	AAT	2	6	2792	2797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337735211
36	NC_015687	GAA	2	6	2802	2807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337735211
37	NC_015687	AGA	2	6	2834	2839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337735211
38	NC_015687	GAT	2	6	2916	2921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337735211
39	NC_015687	AGA	2	6	2963	2968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337735211
40	NC_015687	GAA	2	6	3054	3059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337735211
41	NC_015687	ATT	2	6	3096	3101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337735211
42	NC_015687	ATG	2	6	3115	3120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337735211
43	NC_015687	AGA	2	6	3333	3338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337735212
44	NC_015687	TTA	2	6	3442	3447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337735213
45	NC_015687	ATA	2	6	3490	3495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337735213
46	NC_015687	TAA	2	6	3509	3514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337735213
47	NC_015687	AAT	2	6	3537	3542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337735213
48	NC_015687	TTA	2	6	3625	3630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337735213
49	NC_015687	GTT	2	6	3767	3772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	337735213
50	NC_015687	AGA	2	6	3803	3808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337735213
51	NC_015687	ATT	2	6	3886	3891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337735213
52	NC_015687	ATA	2	6	3907	3912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337735213
53	NC_015687	ATG	2	6	3982	3987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337735213
54	NC_015687	AGC	2	6	3988	3993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337735213
55	NC_015687	AGA	2	6	4148	4153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337735213
56	NC_015687	ATT	2	6	4154	4159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337735213
57	NC_015687	TGA	2	6	4370	4375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337735213
58	NC_015687	TAA	2	6	4444	4449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337735213
59	NC_015687	AGG	2	6	4546	4551	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337735214
60	NC_015687	GTT	2	6	4585	4590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	337735214
61	NC_015687	AGA	2	6	4671	4676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337735214
62	NC_015687	TTG	2	6	4685	4690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	337735214
63	NC_015687	GTT	2	6	4801	4806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	337735214
64	NC_015687	ATG	2	6	4866	4871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337735215
65	NC_015687	ATA	2	6	4983	4988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337735215
66	NC_015687	GAT	2	6	5066	5071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337735215
67	NC_015687	TAA	2	6	5127	5132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337735215
68	NC_015687	AGG	2	6	5185	5190	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337735215
69	NC_015687	TGT	2	6	5212	5217	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	337735215
70	NC_015687	TGA	2	6	5329	5334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337735215
71	NC_015687	TGA	2	6	5464	5469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337735215
72	NC_015687	ATT	2	6	5595	5600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337735215
73	NC_015687	ATG	2	6	5625	5630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337735215
74	NC_015687	TAA	2	6	5659	5664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337735215
75	NC_015687	CAG	2	6	5808	5813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337735215
76	NC_015687	TTG	2	6	5892	5897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	337735215
77	NC_015687	ATA	2	6	5903	5908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337735215
78	NC_015687	GAA	2	6	5933	5938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337735215
79	NC_015687	TAG	2	6	5976	5981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337735215
80	NC_015687	GCT	2	6	5999	6004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337735215
81	NC_015687	AGA	2	6	6026	6031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337735215
82	NC_015687	TCA	2	6	6080	6085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337735215
83	NC_015687	GAA	2	6	6153	6158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337735215
84	NC_015687	AAT	2	6	6196	6201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337735215
85	NC_015687	TGG	2	6	6271	6276	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337735215
86	NC_015687	ATT	2	6	6323	6328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337735215
87	NC_015687	TTC	2	6	6383	6388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337735215
88	NC_015687	GCC	2	6	6439	6444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337735215
89	NC_015687	AGA	2	6	6502	6507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337735215
90	NC_015687	TGG	2	6	6523	6528	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337735215
91	NC_015687	TAA	2	6	6627	6632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337735215
92	NC_015687	GCA	2	6	6656	6661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337735215
93	NC_015687	AAG	2	6	6703	6708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337735215
94	NC_015687	AGA	2	6	6718	6723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337735215
95	NC_015687	CTA	2	6	6729	6734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337735215
96	NC_015687	ATC	2	6	7009	7014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337735216
97	NC_015687	TTC	2	6	7025	7030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337735216
98	NC_015687	GTT	2	6	7083	7088	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	337735216
99	NC_015687	CTG	3	9	7126	7134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337735216
100	NC_015687	GAA	2	6	7233	7238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337735216
101	NC_015687	GTT	2	6	7248	7253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	337735216
102	NC_015687	ACC	2	6	7325	7330	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	337735216
103	NC_015687	CAA	2	6	7387	7392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337735216
104	NC_015687	CAG	2	6	7435	7440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337735216
105	NC_015687	AAT	3	9	7442	7450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337735216
106	NC_015687	TAG	2	6	7594	7599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337735216
107	NC_015687	ATA	2	6	7719	7724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337735216
108	NC_015687	GCA	2	6	7829	7834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337735216
109	NC_015687	AAG	3	9	7862	7870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337735216
110	NC_015687	TAA	2	6	7954	7959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337735216
111	NC_015687	TAA	2	6	7963	7968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337735216
112	NC_015687	AGA	2	6	8096	8101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337735216
113	NC_015687	TGA	2	6	8153	8158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337735216
114	NC_015687	AAT	2	6	8174	8179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337735216
115	NC_015687	TGA	2	6	8216	8221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337735216
116	NC_015687	GAA	2	6	8280	8285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337735216
117	NC_015687	TGT	2	6	8288	8293	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	337735216
118	NC_015687	ACA	2	6	8385	8390	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337735216
119	NC_015687	AGA	2	6	8393	8398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337735216
120	NC_015687	TTG	2	6	8404	8409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	337735216
121	NC_015687	ATA	3	9	8434	8442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337735216
122	NC_015687	GAA	2	6	8464	8469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337735216
123	NC_015687	AGC	2	6	8510	8515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337735216
124	NC_015687	TGT	2	6	8528	8533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	337735216
125	NC_015687	TGA	2	6	8594	8599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337735216
126	NC_015687	CTT	2	6	8606	8611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337735216
127	NC_015687	AAT	2	6	8633	8638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337735216
128	NC_015687	AGA	2	6	8641	8646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337735216
129	NC_015687	TGT	2	6	8648	8653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	337735216
130	NC_015687	ATG	4	12	8704	8715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337735216
131	NC_015687	TGA	3	9	8744	8752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337735216
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