MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Clostridium acetobutylicum DSM 1731 plasmid pSMBa

Total Repeats: 122

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015686	ACGA	2	8	1290	1297	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_015686	TAAA	2	8	1332	1339	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015686	AATA	2	8	9533	9540	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015686	AGAA	2	8	9901	9908	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015686	TTAA	2	8	15655	15662	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015686	ATTA	2	8	15762	15769	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015686	GTAG	2	8	22197	22204	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015686	CTGG	2	8	22261	22268	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9	NC_015686	TAAA	2	8	24165	24172	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015686	ATCT	2	8	26699	26706	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_015686	TATT	2	8	27418	27425	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015686	TAAA	2	8	27460	27467	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015686	AGAA	2	8	30093	30100	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015686	GTTT	2	8	36655	36662	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015686	TTAC	2	8	41010	41017	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_015686	ATTT	2	8	41089	41096	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015686	TATG	2	8	43640	43647	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015686	GAAT	2	8	44770	44777	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015686	CCCT	2	8	47555	47562	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
20	NC_015686	CATA	2	8	49133	49140	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_015686	AATG	2	8	55405	55412	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015686	TACA	2	8	55572	55579	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_015686	ATTA	2	8	55693	55700	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015686	TAAA	2	8	56687	56694	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015686	TGTA	2	8	59908	59915	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015686	TGTA	2	8	59947	59954	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015686	TTTA	2	8	60107	60114	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015686	CTTT	2	8	61321	61328	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_015686	AATT	2	8	62194	62201	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015686	ATAA	2	8	62245	62252	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015686	CATA	2	8	62782	62789	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_015686	ATTT	2	8	63386	63393	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015686	TAAA	2	8	65183	65190	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015686	TCCT	2	8	66198	66205	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_015686	TAAT	2	8	66336	66343	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015686	ATTA	2	8	66527	66534	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015686	TGTT	2	8	68793	68800	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015686	TAAA	2	8	69056	69063	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015686	GGAA	2	8	69305	69312	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015686	AGAA	2	8	69446	69453	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015686	CTTA	2	8	72295	72302	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_015686	ATTT	2	8	73025	73032	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015686	TTAT	2	8	73043	73050	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015686	TTTA	2	8	73924	73931	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015686	ATTA	2	8	75560	75567	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015686	ATTC	2	8	75781	75788	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_015686	ATTG	2	8	75812	75819	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015686	GTAT	2	8	75859	75866	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015686	TTAT	2	8	75894	75901	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015686	ATTA	2	8	76336	76343	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015686	TAAT	2	8	79185	79192	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015686	TAAT	2	8	79930	79937	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015686	AATT	2	8	79971	79978	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015686	GATA	2	8	80942	80949	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015686	GTTT	2	8	83259	83266	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015686	AATT	2	8	84043	84050	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015686	TAAT	2	8	85744	85751	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015686	TAAT	2	8	85823	85830	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015686	ACTA	2	8	87410	87417	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_015686	GGAT	2	8	87511	87518	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015686	AAAT	2	8	87555	87562	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015686	CAAA	2	8	89849	89856	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_015686	ATGA	2	8	90048	90055	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015686	CATA	2	8	90459	90466	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_015686	ACTT	2	8	90670	90677	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_015686	AGTA	2	8	90681	90688	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015686	CTTG	2	8	92856	92863	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_015686	TAAA	2	8	98159	98166	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015686	GATT	2	8	98475	98482	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015686	TTTG	2	8	98497	98504	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015686	AGAT	2	8	98653	98660	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015686	TTAG	2	8	98756	98763	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015686	TAAC	2	8	98789	98796	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_015686	ATTA	2	8	100774	100781	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015686	CCTT	2	8	102492	102499	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_015686	AATA	2	8	102694	102701	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015686	TTCC	2	8	104805	104812	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_015686	CTTT	2	8	105148	105155	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_015686	CTTT	2	8	105857	105864	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_015686	AAAT	2	8	106193	106200	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015686	ACTT	2	8	106279	106286	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_015686	TAAG	2	8	109704	109711	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015686	AATC	2	8	117742	117749	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_015686	TAAT	2	8	118339	118346	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015686	TAAT	2	8	118386	118393	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015686	AAAT	2	8	118471	118478	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015686	ACTA	2	8	118502	118509	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_015686	TTAA	2	8	118538	118545	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015686	ACTC	2	8	121154	121161	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_015686	CCCT	2	8	126860	126867	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
91	NC_015686	ACTT	2	8	133680	133687	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_015686	AATT	2	8	134259	134266	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015686	AACT	2	8	137320	137327	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_015686	TAAA	2	8	137396	137403	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015686	ATCT	2	8	139926	139933	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_015686	ATTA	2	8	141595	141602	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015686	AATA	2	8	150275	150282	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015686	CTTA	2	8	150441	150448	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_015686	TCAT	2	8	158740	158747	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_015686	AATA	2	8	158860	158867	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015686	TAAT	2	8	160234	160241	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015686	TTAT	2	8	165497	165504	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015686	TTTA	2	8	168836	168843	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015686	AATT	2	8	168983	168990	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015686	ATTA	2	8	175271	175278	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015686	TAAT	2	8	175576	175583	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015686	TTTA	2	8	175634	175641	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015686	ATCT	2	8	175709	175716	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_015686	AGAA	2	8	175792	175799	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015686	TATT	2	8	180662	180669	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015686	TACT	2	8	183902	183909	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_015686	TTTA	2	8	185709	185716	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015686	TAAA	2	8	185770	185777	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015686	CATT	2	8	188723	188730	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_015686	CATT	2	8	188745	188752	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_015686	CATT	2	8	189877	189884	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_015686	CATT	2	8	189909	189916	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_015686	CATT	2	8	189931	189938	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_015686	CATT	2	8	190062	190069	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_015686	TAAA	2	8	190118	190125	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015686	TTAA	2	8	191368	191375	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015686	TATT	2	8	191432	191439	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.