MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Clostridium acetobutylicum DSM 1731 plasmid pSMBa

Total Repeats: 466

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015686	TAGA	2	8	743	750	50 %	25 %	25 %	0 %	337735033
2	NC_015686	CATA	2	8	2910	2917	50 %	25 %	0 %	25 %	337735034
3	NC_015686	AAAT	2	8	3143	3150	75 %	25 %	0 %	0 %	337735034
4	NC_015686	AATT	2	8	3683	3690	50 %	50 %	0 %	0 %	337735034
5	NC_015686	TAAA	2	8	4621	4628	75 %	25 %	0 %	0 %	337735035
6	NC_015686	GACA	2	8	4651	4658	50 %	0 %	25 %	25 %	337735035
7	NC_015686	TACA	2	8	5003	5010	50 %	25 %	0 %	25 %	337735035
8	NC_015686	TAAA	2	8	5281	5288	75 %	25 %	0 %	0 %	337735035
9	NC_015686	CATG	2	8	5805	5812	25 %	25 %	25 %	25 %	337735035
10	NC_015686	ATTA	2	8	6129	6136	50 %	50 %	0 %	0 %	337735035
11	NC_015686	AGTT	2	8	6295	6302	25 %	50 %	25 %	0 %	337735035
12	NC_015686	ATGG	2	8	7558	7565	25 %	25 %	50 %	0 %	337735036
13	NC_015686	CAAC	2	8	7572	7579	50 %	0 %	0 %	50 %	337735036
14	NC_015686	TAAT	2	8	8205	8212	50 %	50 %	0 %	0 %	337735037
15	NC_015686	ATTA	2	8	8356	8363	50 %	50 %	0 %	0 %	337735037
16	NC_015686	GAAG	2	8	9091	9098	50 %	0 %	50 %	0 %	337735038
17	NC_015686	AAAT	2	8	10223	10230	75 %	25 %	0 %	0 %	337735041
18	NC_015686	AAAG	2	8	11027	11034	75 %	0 %	25 %	0 %	337735041
19	NC_015686	AATT	2	8	11447	11454	50 %	50 %	0 %	0 %	337735042
20	NC_015686	TTTG	2	8	11586	11593	0 %	75 %	25 %	0 %	337735042
21	NC_015686	GGAA	2	8	11702	11709	50 %	0 %	50 %	0 %	337735042
22	NC_015686	TGGG	2	8	12165	12172	0 %	25 %	75 %	0 %	337735042
23	NC_015686	TAAT	2	8	13342	13349	50 %	50 %	0 %	0 %	337735043
24	NC_015686	ATTA	2	8	13517	13524	50 %	50 %	0 %	0 %	337735044
25	NC_015686	ATCC	2	8	13525	13532	25 %	25 %	0 %	50 %	337735044
26	NC_015686	CAAC	2	8	13973	13980	50 %	0 %	0 %	50 %	337735044
27	NC_015686	AACT	2	8	14306	14313	50 %	25 %	0 %	25 %	337735044
28	NC_015686	AATT	2	8	14739	14746	50 %	50 %	0 %	0 %	337735045
29	NC_015686	CTTT	2	8	14777	14784	0 %	75 %	0 %	25 %	337735045
30	NC_015686	AATT	2	8	14900	14907	50 %	50 %	0 %	0 %	337735045
31	NC_015686	TAAT	2	8	14953	14960	50 %	50 %	0 %	0 %	337735045
32	NC_015686	AAAC	2	8	16054	16061	75 %	0 %	0 %	25 %	337735046
33	NC_015686	TAAA	2	8	16114	16121	75 %	25 %	0 %	0 %	337735046
34	NC_015686	ATTC	2	8	16509	16516	25 %	50 %	0 %	25 %	337735046
35	NC_015686	TAAT	2	8	16665	16672	50 %	50 %	0 %	0 %	337735046
36	NC_015686	TTTA	2	8	17012	17019	25 %	75 %	0 %	0 %	337735047
37	NC_015686	TAAA	2	8	17742	17749	75 %	25 %	0 %	0 %	337735048
38	NC_015686	ATTA	2	8	17995	18002	50 %	50 %	0 %	0 %	337735048
39	NC_015686	GGCT	2	8	18019	18026	0 %	25 %	50 %	25 %	337735048
40	NC_015686	TTTG	2	8	18134	18141	0 %	75 %	25 %	0 %	337735048
41	NC_015686	TAAG	2	8	18433	18440	50 %	25 %	25 %	0 %	337735048
42	NC_015686	ATAC	2	8	18594	18601	50 %	25 %	0 %	25 %	337735048
43	NC_015686	TGAC	2	8	18671	18678	25 %	25 %	25 %	25 %	337735048
44	NC_015686	TGCT	2	8	18734	18741	0 %	50 %	25 %	25 %	337735048
45	NC_015686	ACAT	2	8	18765	18772	50 %	25 %	0 %	25 %	337735048
46	NC_015686	TATT	2	8	18943	18950	25 %	75 %	0 %	0 %	337735049
47	NC_015686	TGAA	2	8	19401	19408	50 %	25 %	25 %	0 %	337735050
48	NC_015686	TAAT	2	8	19703	19710	50 %	50 %	0 %	0 %	337735050
49	NC_015686	TCTA	2	8	19911	19918	25 %	50 %	0 %	25 %	337735050
50	NC_015686	AGCA	2	8	20106	20113	50 %	0 %	25 %	25 %	337735050
51	NC_015686	TTTA	2	8	20124	20131	25 %	75 %	0 %	0 %	337735050
52	NC_015686	GTTT	2	8	20279	20286	0 %	75 %	25 %	0 %	337735051
53	NC_015686	CTGT	2	8	21124	21131	0 %	50 %	25 %	25 %	337735051
54	NC_015686	TGTT	2	8	21219	21226	0 %	75 %	25 %	0 %	337735051
55	NC_015686	AAAT	2	8	22416	22423	75 %	25 %	0 %	0 %	337735053
56	NC_015686	ATTA	2	8	22601	22608	50 %	50 %	0 %	0 %	337735053
57	NC_015686	TGCT	2	8	23349	23356	0 %	50 %	25 %	25 %	337735053
58	NC_015686	TAAA	2	8	23870	23877	75 %	25 %	0 %	0 %	337735054
59	NC_015686	ATTA	2	8	24536	24543	50 %	50 %	0 %	0 %	337735055
60	NC_015686	GCTT	2	8	24567	24574	0 %	50 %	25 %	25 %	337735055
61	NC_015686	CATT	2	8	27007	27014	25 %	50 %	0 %	25 %	337735057
62	NC_015686	TATT	2	8	27968	27975	25 %	75 %	0 %	0 %	337735058
63	NC_015686	GTAA	2	8	28222	28229	50 %	25 %	25 %	0 %	337735058
64	NC_015686	TATG	2	8	28494	28501	25 %	50 %	25 %	0 %	337735058
65	NC_015686	GGAT	2	8	28512	28519	25 %	25 %	50 %	0 %	337735058
66	NC_015686	AAAG	2	8	28717	28724	75 %	0 %	25 %	0 %	337735058
67	NC_015686	TAAA	2	8	28985	28992	75 %	25 %	0 %	0 %	337735058
68	NC_015686	TCTT	2	8	29285	29292	0 %	75 %	0 %	25 %	337735058
69	NC_015686	TATT	2	8	30641	30648	25 %	75 %	0 %	0 %	337735060
70	NC_015686	GAAG	2	8	30666	30673	50 %	0 %	50 %	0 %	337735060
71	NC_015686	AGGA	2	8	31851	31858	50 %	0 %	50 %	0 %	337735061
72	NC_015686	TGAT	2	8	32000	32007	25 %	50 %	25 %	0 %	337735062
73	NC_015686	TTGT	2	8	32066	32073	0 %	75 %	25 %	0 %	337735062
74	NC_015686	AAGG	2	8	32807	32814	50 %	0 %	50 %	0 %	337735064
75	NC_015686	TAAT	2	8	33021	33028	50 %	50 %	0 %	0 %	337735064
76	NC_015686	TAAT	2	8	33585	33592	50 %	50 %	0 %	0 %	337735065
77	NC_015686	AAGC	2	8	33802	33809	50 %	0 %	25 %	25 %	337735066
78	NC_015686	ATCT	2	8	33887	33894	25 %	50 %	0 %	25 %	337735066
79	NC_015686	TCTT	2	8	34570	34577	0 %	75 %	0 %	25 %	337735066
80	NC_015686	ATCT	2	8	34784	34791	25 %	50 %	0 %	25 %	337735066
81	NC_015686	ATTG	2	8	35550	35557	25 %	50 %	25 %	0 %	337735066
82	NC_015686	TATT	2	8	36060	36067	25 %	75 %	0 %	0 %	337735066
83	NC_015686	TTCT	2	8	36160	36167	0 %	75 %	0 %	25 %	337735066
84	NC_015686	CATA	2	8	37053	37060	50 %	25 %	0 %	25 %	337735067
85	NC_015686	ATTT	2	8	37402	37409	25 %	75 %	0 %	0 %	337735067
86	NC_015686	AAAG	2	8	37889	37896	75 %	0 %	25 %	0 %	337735068
87	NC_015686	TCTA	2	8	37975	37982	25 %	50 %	0 %	25 %	337735068
88	NC_015686	TTTC	2	8	38059	38066	0 %	75 %	0 %	25 %	337735068
89	NC_015686	AATA	2	8	38489	38496	75 %	25 %	0 %	0 %	337735069
90	NC_015686	ATTT	2	8	38512	38519	25 %	75 %	0 %	0 %	337735069
91	NC_015686	ACCA	2	8	38897	38904	50 %	0 %	0 %	50 %	337735070
92	NC_015686	TTCT	2	8	39029	39036	0 %	75 %	0 %	25 %	337735070
93	NC_015686	TTCA	2	8	39870	39877	25 %	50 %	0 %	25 %	337735071
94	NC_015686	TATT	2	8	40096	40103	25 %	75 %	0 %	0 %	337735071
95	NC_015686	TTAT	2	8	40501	40508	25 %	75 %	0 %	0 %	337735071
96	NC_015686	TTGC	2	8	40574	40581	0 %	50 %	25 %	25 %	337735071
97	NC_015686	TTGA	2	8	41145	41152	25 %	50 %	25 %	0 %	337735072
98	NC_015686	AAAT	2	8	42035	42042	75 %	25 %	0 %	0 %	337735073
99	NC_015686	TTTA	2	8	42058	42065	25 %	75 %	0 %	0 %	337735073
100	NC_015686	TTAT	2	8	42167	42174	25 %	75 %	0 %	0 %	337735073
101	NC_015686	TTTA	2	8	42273	42280	25 %	75 %	0 %	0 %	337735074
102	NC_015686	AAAT	2	8	42541	42548	75 %	25 %	0 %	0 %	337735074
103	NC_015686	GAAG	2	8	42563	42570	50 %	0 %	50 %	0 %	337735074
104	NC_015686	AAAG	2	8	43533	43540	75 %	0 %	25 %	0 %	337735074
105	NC_015686	TTTA	2	8	43837	43844	25 %	75 %	0 %	0 %	337735075
106	NC_015686	GATA	2	8	44213	44220	50 %	25 %	25 %	0 %	337735075
107	NC_015686	ACAA	2	8	44656	44663	75 %	0 %	0 %	25 %	337735075
108	NC_015686	TTCT	2	8	45869	45876	0 %	75 %	0 %	25 %	337735076
109	NC_015686	ATTA	2	8	47270	47277	50 %	50 %	0 %	0 %	337735078
110	NC_015686	ACCA	2	8	47512	47519	50 %	0 %	0 %	50 %	337735078
111	NC_015686	TAAA	2	8	48305	48312	75 %	25 %	0 %	0 %	337735079
112	NC_015686	ACAT	2	8	48635	48642	50 %	25 %	0 %	25 %	337735079
113	NC_015686	AGAT	2	8	49029	49036	50 %	25 %	25 %	0 %	337735079
114	NC_015686	CTTC	2	8	49373	49380	0 %	50 %	0 %	50 %	337735080
115	NC_015686	GTAA	2	8	49766	49773	50 %	25 %	25 %	0 %	337735080
116	NC_015686	ATAG	2	8	49858	49865	50 %	25 %	25 %	0 %	337735080
117	NC_015686	CAAA	2	8	49899	49906	75 %	0 %	0 %	25 %	337735080
118	NC_015686	TCTT	2	8	49996	50003	0 %	75 %	0 %	25 %	337735080
119	NC_015686	TTTC	2	8	50177	50184	0 %	75 %	0 %	25 %	337735080
120	NC_015686	CTTT	2	8	50267	50274	0 %	75 %	0 %	25 %	337735080
121	NC_015686	ATCT	2	8	50367	50374	25 %	50 %	0 %	25 %	337735080
122	NC_015686	CCAA	2	8	50476	50483	50 %	0 %	0 %	50 %	337735080
123	NC_015686	ATAA	2	8	50822	50829	75 %	25 %	0 %	0 %	337735081
124	NC_015686	TTTA	2	8	51682	51689	25 %	75 %	0 %	0 %	337735081
125	NC_015686	GAAT	2	8	51747	51754	50 %	25 %	25 %	0 %	337735081
126	NC_015686	GCTT	2	8	52465	52472	0 %	50 %	25 %	25 %	337735082
127	NC_015686	CCAG	2	8	52491	52498	25 %	0 %	25 %	50 %	337735082
128	NC_015686	TGCT	2	8	52526	52533	0 %	50 %	25 %	25 %	337735082
129	NC_015686	TTAG	2	8	52534	52541	25 %	50 %	25 %	0 %	337735082
130	NC_015686	TTTA	2	8	53212	53219	25 %	75 %	0 %	0 %	337735083
131	NC_015686	TAAG	2	8	53638	53645	50 %	25 %	25 %	0 %	337735084
132	NC_015686	ATTA	2	8	54028	54035	50 %	50 %	0 %	0 %	337735084
133	NC_015686	ATTT	2	8	55816	55823	25 %	75 %	0 %	0 %	337735086
134	NC_015686	AGAA	2	8	55932	55939	75 %	0 %	25 %	0 %	337735086
135	NC_015686	ATTT	2	8	56103	56110	25 %	75 %	0 %	0 %	337735086
136	NC_015686	TTGC	2	8	56290	56297	0 %	50 %	25 %	25 %	337735086
137	NC_015686	TTTA	2	8	56303	56310	25 %	75 %	0 %	0 %	337735086
138	NC_015686	GAAA	2	8	56484	56491	75 %	0 %	25 %	0 %	337735086
139	NC_015686	GAAA	2	8	56496	56503	75 %	0 %	25 %	0 %	337735086
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