MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Clostridium acetobutylicum DSM 1731 plasmid pSMBa

Total Repeats: 453

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015686	AGG	2	6	29	34	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015686	TTA	2	6	870	875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015686	ATT	2	6	899	904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015686	GAA	2	6	930	935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015686	ATT	2	6	981	986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015686	ATT	2	6	1032	1037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015686	AAT	2	6	1048	1053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015686	TAT	2	6	1130	1135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015686	TAA	2	6	1139	1144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015686	TAA	2	6	1162	1167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015686	TTA	2	6	1203	1208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015686	GGA	2	6	4096	4101	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015686	AAG	2	6	6682	6687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015686	TTA	2	6	6722	6727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015686	AAT	2	6	6748	6753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015686	ATT	2	6	6765	6770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015686	TAA	2	6	6866	6871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015686	CTC	2	6	7989	7994	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_015686	TTA	2	6	8020	8025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015686	AAT	2	6	8457	8462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015686	CAT	2	6	9299	9304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_015686	TCT	2	6	9711	9716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_015686	TGG	2	6	10003	10008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015686	ATA	2	6	12648	12653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015686	GGA	2	6	12676	12681	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015686	TAT	2	6	12796	12801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015686	TGG	2	6	12862	12867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015686	TTA	2	6	12880	12885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015686	AAG	2	6	13379	13384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015686	ACG	2	6	13410	13415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_015686	CCT	2	6	14548	14553	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_015686	TCC	2	6	15534	15539	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_015686	TAA	2	6	15711	15716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015686	TAT	2	6	15752	15757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015686	ATA	2	6	15787	15792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015686	GAG	2	6	15806	15811	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015686	ATA	2	6	17264	17269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015686	ATG	2	6	17378	17383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015686	TAG	2	6	17470	17475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015686	CTA	2	6	17495	17500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_015686	ATT	2	6	17509	17514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015686	CTT	2	6	21862	21867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_015686	CCT	2	6	22100	22105	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_015686	ATA	2	6	22112	22117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015686	TAT	2	6	22136	22141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015686	TTA	2	6	22205	22210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015686	TAT	2	6	23412	23417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015686	ATT	3	9	23435	23443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015686	TAT	2	6	23995	24000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015686	ATT	2	6	24052	24057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015686	TTG	2	6	24109	24114	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015686	ATT	2	6	24119	24124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015686	GTA	2	6	24152	24157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015686	ATA	2	6	24904	24909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015686	TAT	2	6	26713	26718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015686	TAG	2	6	26749	26754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015686	ATA	2	6	27389	27394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015686	AAG	2	6	27406	27411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015686	TAA	2	6	27478	27483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015686	GGA	2	6	27504	27509	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015686	ATT	2	6	31954	31959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015686	AGG	2	6	31986	31991	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015686	AGA	2	6	32369	32374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015686	GGA	2	6	32389	32394	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015686	GGA	2	6	32771	32776	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015686	GTA	2	6	33268	33273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015686	TAT	2	6	33289	33294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015686	AGG	2	6	33303	33308	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015686	TAT	2	6	36323	36328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015686	TAT	2	6	36370	36375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015686	ATT	2	6	36423	36428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015686	ATT	2	6	36518	36523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015686	AAT	2	6	36559	36564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015686	TAT	2	6	36620	36625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015686	CCT	2	6	36702	36707	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_015686	TCC	2	6	38157	38162	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_015686	TAT	2	6	38377	38382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015686	ATA	2	6	38389	38394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015686	GGA	2	6	38397	38402	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015686	TAT	2	6	39253	39258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015686	TTA	2	6	39266	39271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015686	TTC	2	6	39309	39314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_015686	ATA	2	6	39360	39365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015686	TTA	2	6	39425	39430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015686	AAT	2	6	39452	39457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015686	TAC	2	6	40892	40897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_015686	TAA	2	6	41004	41009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015686	AGT	2	6	41602	41607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015686	TGA	2	6	41610	41615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015686	AAT	2	6	41646	41651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015686	ATT	2	6	43580	43585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015686	GAA	2	6	43658	43663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015686	TCC	2	6	44704	44709	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_015686	ACT	2	6	44758	44763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_015686	TAA	2	6	46141	46146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015686	GTT	2	6	46179	46184	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015686	TGT	2	6	46208	46213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015686	GGA	2	6	46221	46226	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015686	ATT	2	6	47566	47571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015686	TTA	2	6	47583	47588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015686	TAA	2	6	47592	47597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015686	GAA	2	6	47662	47667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015686	GAT	2	6	47805	47810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015686	TTG	2	6	49050	49055	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015686	AGA	2	6	49068	49073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015686	ATT	2	6	49087	49092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015686	AGT	2	6	49188	49193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015686	TTC	2	6	49215	49220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_015686	ATA	2	6	49225	49230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015686	TAG	2	6	49356	49361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015686	TAA	2	6	50616	50621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015686	ATT	2	6	50691	50696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015686	ATT	2	6	50699	50704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015686	TTA	2	6	50706	50711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015686	AGA	2	6	52261	52266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015686	TAT	2	6	53500	53505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015686	ATA	2	6	53534	53539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015686	ATT	2	6	53566	53571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015686	TAA	2	6	54604	54609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015686	ATC	2	6	55369	55374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_015686	GTT	2	6	55484	55489	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015686	TAT	2	6	55512	55517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015686	TTA	2	6	55545	55550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015686	TGT	2	6	56549	56554	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015686	GAT	2	6	56650	56655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015686	ATT	2	6	56758	56763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015686	TAT	2	6	57966	57971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015686	TAA	2	6	57981	57986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015686	CAA	2	6	57996	58001	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_015686	TCC	2	6	59735	59740	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_015686	TAC	2	6	59758	59763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_015686	TAT	2	6	59800	59805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015686	ATA	2	6	59813	59818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015686	AGC	2	6	60017	60022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_015686	AAT	2	6	60069	60074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015686	TTA	2	6	61407	61412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015686	TAT	2	6	61444	61449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015686	GTA	2	6	62257	62262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015686	ATC	2	6	62303	62308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_015686	TTG	2	6	62832	62837	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015686	TAT	3	9	63347	63355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015686	ATA	2	6	63398	63403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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416	NC_015686	GTA	2	6	184861	184866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
417	NC_015686	ATA	2	6	185081	185086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
418	NC_015686	GAT	2	6	185118	185123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
419	NC_015686	ATT	2	6	185619	185624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
420	NC_015686	TAT	3	9	185799	185807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
421	NC_015686	ATT	2	6	187457	187462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
422	NC_015686	TTA	2	6	187567	187572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
423	NC_015686	TAC	2	6	187573	187578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
424	NC_015686	ATA	2	6	187748	187753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
425	NC_015686	TTA	2	6	187762	187767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
426	NC_015686	ATA	2	6	187804	187809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
427	NC_015686	GCT	2	6	187847	187852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
428	NC_015686	ATG	2	6	187911	187916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
429	NC_015686	AAT	2	6	188018	188023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
430	NC_015686	TTA	2	6	188028	188033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
431	NC_015686	CTC	2	6	188196	188201	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
432	NC_015686	TCC	2	6	188344	188349	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
433	NC_015686	TGT	2	6	188403	188408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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436	NC_015686	TAT	2	6	188535	188540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
437	NC_015686	ATT	2	6	188550	188555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
438	NC_015686	TAA	2	6	188594	188599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
439	NC_015686	ACA	2	6	188605	188610	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
440	NC_015686	ACC	2	6	189782	189787	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
441	NC_015686	TAT	2	6	189814	189819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
442	NC_015686	TAC	2	6	189832	189837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
443	NC_015686	CTA	2	6	189991	189996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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445	NC_015686	TAT	2	6	190021	190026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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447	NC_015686	TGT	2	6	190046	190051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
448	NC_015686	TTA	2	6	190483	190488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
449	NC_015686	TAC	2	6	190569	190574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
450	NC_015686	GAT	2	6	191444	191449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
451	NC_015686	ATA	2	6	191493	191498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
452	NC_015686	TAT	2	6	191554	191559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
453	NC_015686	CCT	2	6	191962	191967	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.