MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Clostridium acetobutylicum DSM 1731 plasmid pSMBa

Total Repeats: 383

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015686	TA	3	6	251	256	50 %	50 %	0 %	0 %	337735033
2	NC_015686	TA	3	6	495	500	50 %	50 %	0 %	0 %	337735033
3	NC_015686	CA	3	6	676	681	50 %	0 %	0 %	50 %	337735033
4	NC_015686	TA	3	6	2871	2876	50 %	50 %	0 %	0 %	337735034
5	NC_015686	AT	3	6	2902	2907	50 %	50 %	0 %	0 %	337735034
6	NC_015686	TA	3	6	3128	3133	50 %	50 %	0 %	0 %	337735034
7	NC_015686	AT	3	6	3414	3419	50 %	50 %	0 %	0 %	337735034
8	NC_015686	TA	3	6	3420	3425	50 %	50 %	0 %	0 %	337735034
9	NC_015686	AT	3	6	3438	3443	50 %	50 %	0 %	0 %	337735034
10	NC_015686	TA	5	10	3501	3510	50 %	50 %	0 %	0 %	337735034
11	NC_015686	TA	4	8	3756	3763	50 %	50 %	0 %	0 %	337735034
12	NC_015686	AT	4	8	3852	3859	50 %	50 %	0 %	0 %	337735034
13	NC_015686	TA	4	8	3864	3871	50 %	50 %	0 %	0 %	337735034
14	NC_015686	TA	3	6	5616	5621	50 %	50 %	0 %	0 %	337735035
15	NC_015686	TA	3	6	5678	5683	50 %	50 %	0 %	0 %	337735035
16	NC_015686	AT	3	6	6174	6179	50 %	50 %	0 %	0 %	337735035
17	NC_015686	AT	3	6	6586	6591	50 %	50 %	0 %	0 %	337735035
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19	NC_015686	TA	3	6	8325	8330	50 %	50 %	0 %	0 %	337735037
20	NC_015686	TA	3	6	8673	8678	50 %	50 %	0 %	0 %	337735038
21	NC_015686	TA	3	6	8754	8759	50 %	50 %	0 %	0 %	337735038
22	NC_015686	TA	3	6	9006	9011	50 %	50 %	0 %	0 %	337735038
23	NC_015686	AG	3	6	9164	9169	50 %	0 %	50 %	0 %	337735038
24	NC_015686	TA	3	6	10526	10531	50 %	50 %	0 %	0 %	337735041
25	NC_015686	AT	3	6	11696	11701	50 %	50 %	0 %	0 %	337735042
26	NC_015686	AT	3	6	11818	11823	50 %	50 %	0 %	0 %	337735042
27	NC_015686	TA	3	6	12441	12446	50 %	50 %	0 %	0 %	337735042
28	NC_015686	AT	3	6	13672	13677	50 %	50 %	0 %	0 %	337735044
29	NC_015686	AT	3	6	13806	13811	50 %	50 %	0 %	0 %	337735044
30	NC_015686	TA	3	6	15965	15970	50 %	50 %	0 %	0 %	337735046
31	NC_015686	AT	3	6	16162	16167	50 %	50 %	0 %	0 %	337735046
32	NC_015686	AT	3	6	16412	16417	50 %	50 %	0 %	0 %	337735046
33	NC_015686	AT	3	6	17755	17760	50 %	50 %	0 %	0 %	337735048
34	NC_015686	AT	4	8	17764	17771	50 %	50 %	0 %	0 %	337735048
35	NC_015686	TA	4	8	17779	17786	50 %	50 %	0 %	0 %	337735048
36	NC_015686	AT	3	6	18877	18882	50 %	50 %	0 %	0 %	337735049
37	NC_015686	AG	3	6	18974	18979	50 %	0 %	50 %	0 %	337735049
38	NC_015686	AT	3	6	19170	19175	50 %	50 %	0 %	0 %	337735050
39	NC_015686	AT	3	6	19193	19198	50 %	50 %	0 %	0 %	337735050
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41	NC_015686	AT	3	6	20481	20486	50 %	50 %	0 %	0 %	337735051
42	NC_015686	AT	3	6	21091	21096	50 %	50 %	0 %	0 %	337735051
43	NC_015686	AT	3	6	21103	21108	50 %	50 %	0 %	0 %	337735051
44	NC_015686	AT	3	6	21206	21211	50 %	50 %	0 %	0 %	337735051
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47	NC_015686	AT	3	6	21955	21960	50 %	50 %	0 %	0 %	337735052
48	NC_015686	AT	3	6	22337	22342	50 %	50 %	0 %	0 %	337735053
49	NC_015686	AT	3	6	23751	23756	50 %	50 %	0 %	0 %	337735054
50	NC_015686	TA	3	6	23964	23969	50 %	50 %	0 %	0 %	337735054
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64	NC_015686	AT	3	6	32573	32578	50 %	50 %	0 %	0 %	337735063
65	NC_015686	TA	3	6	32697	32702	50 %	50 %	0 %	0 %	337735063
66	NC_015686	AG	3	6	32711	32716	50 %	0 %	50 %	0 %	337735063
67	NC_015686	AG	3	6	33002	33007	50 %	0 %	50 %	0 %	337735064
68	NC_015686	TA	3	6	33133	33138	50 %	50 %	0 %	0 %	337735064
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71	NC_015686	AT	3	6	34922	34927	50 %	50 %	0 %	0 %	337735066
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75	NC_015686	TA	3	6	35486	35491	50 %	50 %	0 %	0 %	337735066
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87	NC_015686	AT	4	8	39723	39730	50 %	50 %	0 %	0 %	337735071
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104	NC_015686	AT	3	6	43521	43526	50 %	50 %	0 %	0 %	337735074
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113	NC_015686	TA	3	6	46674	46679	50 %	50 %	0 %	0 %	337735077
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.