MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Corynebacterium ulcerans BR-AD22 chromosome

Total Repeats: 62

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015683	TTGTAT	2	12	19941	19952	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015683	TTAAAG	2	12	34035	34046	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015683	GGAATT	2	12	55269	55280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015683	TTCCTG	2	12	88521	88532	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_015683	CTCACT	2	12	174325	174336	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_015683	TGTTGG	2	12	176792	176803	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015683	TTTCCT	2	12	182943	182954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_015683	TTCGCG	2	12	190483	190494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_015683	GTCTAT	2	12	197508	197519	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_015683	GTCCAC	2	12	437663	437674	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
11	NC_015683	GCAATG	2	12	455821	455832	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_015683	ATTTTT	2	12	551229	551240	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015683	GTGCCT	2	12	555945	555956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_015683	GATAAG	2	12	685872	685883	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015683	AGCGAA	2	12	693164	693175	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_015683	TGCCTG	2	12	708254	708265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_015683	TGCGCG	2	12	717565	717576	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_015683	CAAGCT	2	12	804879	804890	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_015683	GAAGGT	2	12	809745	809756	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015683	CGTGGC	2	12	809926	809937	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_015683	ACGAAA	2	12	824452	824463	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_015683	AATGAC	2	12	1007746	1007757	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_015683	GTGGTT	2	12	1051816	1051827	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015683	TAGCGT	2	12	1068019	1068030	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_015683	GGACGT	2	12	1087378	1087389	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_015683	GATTGT	2	12	1091178	1091189	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015683	TTTCCC	2	12	1097545	1097556	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_015683	AGCGAA	2	12	1127097	1127108	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_015683	TCAACT	2	12	1173287	1173298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_015683	ATTGCA	2	12	1305047	1305058	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_015683	GCAATA	2	12	1409347	1409358	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_015683	GCTAAT	2	12	1455881	1455892	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_015683	TTCCTT	2	12	1523791	1523802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_015683	TGTGCT	2	12	1538044	1538055	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_015683	AAAAAT	2	12	1538212	1538223	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015683	TATTTC	2	12	1570518	1570529	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_015683	GACGGT	2	12	1595995	1596006	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_015683	CAAAGA	2	12	1629391	1629402	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_015683	GTCCCC	2	12	1713961	1713972	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_015683	TTCCCA	2	12	1781855	1781866	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_015683	TCATGG	2	12	1873109	1873120	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_015683	GTAATG	2	12	1922532	1922543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015683	CCTTAT	2	12	1963814	1963825	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_015683	CCAAAC	2	12	1967756	1967767	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_015683	AAAAGA	2	12	2003823	2003834	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015683	ACCTTT	2	12	2028563	2028574	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_015683	TTCGCT	2	12	2049384	2049395	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_015683	AAAACA	2	12	2060336	2060347	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_015683	CATTTC	2	12	2094021	2094032	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_015683	TGCGCT	2	12	2115888	2115899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_015683	TCCCCC	2	12	2157217	2157228	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
52	NC_015683	CCACAC	2	12	2209036	2209047	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_015683	AGAAAA	2	12	2283220	2283231	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015683	AAAAGA	2	12	2303970	2303981	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015683	TTCAAT	2	12	2312368	2312379	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_015683	TTTAGT	2	12	2338850	2338861	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015683	CAAAAG	2	12	2405091	2405102	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_015683	CTTGAA	2	12	2460186	2460197	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_015683	TTCGCT	2	12	2483385	2483396	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_015683	CGTCCC	2	12	2491742	2491753	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_015683	CCATTA	2	12	2587872	2587883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_015683	TTTTCT	2	12	2595935	2595946	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.