MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Corynebacterium ulcerans BR-AD22 chromosome

Total Repeats: 258

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015683	CAGTA	2	10	14699	14708	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_015683	GGTAC	2	10	26564	26573	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3	NC_015683	CTCTT	2	10	44621	44630	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
4	NC_015683	CCCGG	2	10	59745	59754	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
5	NC_015683	AAAAG	2	10	60274	60283	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015683	TGGTG	2	10	96558	96567	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015683	CATGT	2	10	121817	121826	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
8	NC_015683	AAAAT	2	10	124801	124810	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015683	TAATT	2	10	126585	126594	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015683	TGGGG	2	10	141227	141236	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015683	ACAGA	2	10	181069	181078	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_015683	TGTCG	2	10	185157	185166	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
13	NC_015683	AGTTC	2	10	185258	185267	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
14	NC_015683	TTAGA	2	10	186317	186326	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015683	CAGTG	2	10	201581	201590	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
16	NC_015683	GAAGT	2	10	206749	206758	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015683	GTACC	2	10	212512	212521	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
18	NC_015683	GCATA	2	10	222676	222685	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_015683	ATTTT	2	10	231009	231018	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015683	TAATA	2	10	248476	248485	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015683	TGCGC	2	10	278787	278796	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
22	NC_015683	GAGCC	2	10	280497	280506	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
23	NC_015683	GAAAA	2	10	288623	288632	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015683	ATAAA	2	10	289100	289109	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015683	AGTTC	2	10	289582	289591	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_015683	CGAGA	2	10	289946	289955	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
27	NC_015683	TGCGT	2	10	305912	305921	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
28	NC_015683	TGCGT	2	10	309223	309232	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
29	NC_015683	AAATA	2	10	345672	345681	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015683	CACAC	2	10	390023	390032	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
31	NC_015683	GTTTT	2	10	396101	396110	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015683	AAAAG	2	10	413377	413386	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015683	TTCAC	2	10	427473	427482	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
34	NC_015683	CGTGG	2	10	427538	427547	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
35	NC_015683	AGGGG	2	10	437178	437187	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015683	GGAAA	2	10	451087	451096	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015683	TTTGG	2	10	451574	451583	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015683	GAAAA	2	10	455882	455891	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015683	TGCTT	2	10	456750	456759	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
40	NC_015683	GCGTT	2	10	471713	471722	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
41	NC_015683	AGGAA	2	10	479474	479483	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015683	AGGAA	2	10	484383	484392	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015683	TCAAC	2	10	500852	500861	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
44	NC_015683	CGTAG	2	10	513619	513628	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
45	NC_015683	TGGGG	2	10	525312	525321	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015683	TGCCT	2	10	542659	542668	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
47	NC_015683	ATTTT	2	10	551074	551083	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015683	ACGCA	2	10	565959	565968	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
49	NC_015683	AGGGG	2	10	576331	576340	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015683	CGCGG	2	10	582352	582361	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
51	NC_015683	AATAA	2	10	588261	588270	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015683	AAAAT	2	10	611765	611774	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015683	CGTTG	2	10	624328	624337	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
54	NC_015683	AATGC	2	10	632191	632200	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
55	NC_015683	CTCAT	2	10	657538	657547	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
56	NC_015683	TTGGG	2	10	665649	665658	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015683	CATTT	2	10	667641	667650	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_015683	TTTCC	2	10	685437	685446	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
59	NC_015683	TGTGG	2	10	690314	690323	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015683	TCGTG	2	10	691593	691602	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
61	NC_015683	CGTCA	2	10	691929	691938	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
62	NC_015683	GTTGT	2	10	692358	692367	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015683	GGGAG	2	10	693024	693033	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015683	TGACA	2	10	695623	695632	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
65	NC_015683	GCGAA	2	10	695962	695971	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
66	NC_015683	TGGGG	2	10	712781	712790	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015683	TTTCG	2	10	717678	717687	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
68	NC_015683	CTCTT	2	10	717828	717837	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
69	NC_015683	GTGAA	2	10	717874	717883	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015683	GGGGT	2	10	720024	720033	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015683	TCAAA	2	10	732621	732630	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_015683	AAAAC	2	10	759806	759815	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_015683	GTTTT	2	10	764857	764866	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015683	TGCGC	2	10	772571	772580	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
75	NC_015683	GCCTC	2	10	777459	777468	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
76	NC_015683	GGGAA	2	10	809427	809436	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015683	TTTTC	2	10	809728	809737	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_015683	AAAAG	2	10	832322	832331	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015683	TAGGT	2	10	837201	837210	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015683	GGCTG	2	10	877577	877586	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
81	NC_015683	GAATC	2	10	897660	897669	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
82	NC_015683	CAGCG	2	10	930623	930632	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
83	NC_015683	TTTCC	2	10	934800	934809	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
84	NC_015683	GAAAG	2	10	935621	935630	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015683	AAGGA	2	10	941019	941028	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015683	ATAAG	2	10	956753	956762	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015683	GGGCT	2	10	979249	979258	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
88	NC_015683	AGTGC	2	10	999591	999600	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
89	NC_015683	CTCAT	2	10	1028243	1028252	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
90	NC_015683	CGTAA	2	10	1030764	1030773	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
91	NC_015683	GAAAA	2	10	1043123	1043132	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015683	CGTGA	2	10	1043170	1043179	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
93	NC_015683	GCACG	2	10	1047033	1047042	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
94	NC_015683	CGATG	2	10	1054916	1054925	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
95	NC_015683	CTAGC	2	10	1067966	1067975	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
96	NC_015683	CTTTG	2	10	1070426	1070435	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
97	NC_015683	TGGTG	2	10	1087345	1087354	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015683	GAACA	2	10	1091240	1091249	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
99	NC_015683	GGTGC	2	10	1095402	1095411	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
100	NC_015683	CGAGT	2	10	1101882	1101891	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
101	NC_015683	GGAAT	2	10	1102923	1102932	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015683	AAACA	2	10	1107338	1107347	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_015683	TGAAT	2	10	1108146	1108155	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015683	ATTCA	2	10	1119343	1119352	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_015683	TGTGG	2	10	1124245	1124254	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015683	TCGTG	2	10	1125526	1125535	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
107	NC_015683	CGTCA	2	10	1125862	1125871	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
108	NC_015683	GTTGT	2	10	1126291	1126300	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015683	GGGAG	2	10	1126957	1126966	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015683	TGACA	2	10	1129556	1129565	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
111	NC_015683	TCACA	2	10	1153161	1153170	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
112	NC_015683	GTTTT	2	10	1168705	1168714	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015683	GGAAG	2	10	1184598	1184607	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015683	AAAGT	2	10	1191750	1191759	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015683	TTACT	2	10	1201395	1201404	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
116	NC_015683	CTGTG	2	10	1205371	1205380	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
117	NC_015683	TAACG	2	10	1223343	1223352	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
118	NC_015683	CTTAC	2	10	1226498	1226507	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
119	NC_015683	TTAGC	2	10	1226662	1226671	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
120	NC_015683	CGGGG	2	10	1232173	1232182	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
121	NC_015683	CAATG	2	10	1251329	1251338	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
122	NC_015683	GTTGT	2	10	1251374	1251383	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015683	CCCGG	2	10	1251621	1251630	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
124	NC_015683	TGATC	2	10	1251908	1251917	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
125	NC_015683	AGCTG	2	10	1251925	1251934	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
126	NC_015683	ACCCC	2	10	1270468	1270477	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
127	NC_015683	AAAAT	2	10	1280991	1281000	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015683	CAACC	2	10	1295860	1295869	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
129	NC_015683	CTGTG	2	10	1306978	1306987	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
130	NC_015683	TCTTT	2	10	1309239	1309248	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_015683	GGTTT	2	10	1316719	1316728	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015683	TTCTT	2	10	1318851	1318860	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_015683	ACCCC	2	10	1352091	1352100	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
134	NC_015683	ACAAG	2	10	1369294	1369303	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
135	NC_015683	AAAAT	2	10	1381180	1381189	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015683	CCATG	2	10	1381373	1381382	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
137	NC_015683	TACCG	2	10	1413025	1413034	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
138	NC_015683	AAAAG	2	10	1414939	1414948	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015683	GACTA	2	10	1414965	1414974	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
140	NC_015683	GAACG	2	10	1442861	1442870	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
141	NC_015683	CCCCA	2	10	1444703	1444712	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
142	NC_015683	AGCAC	2	10	1463640	1463649	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
143	NC_015683	CGATG	2	10	1477977	1477986	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
144	NC_015683	GGGGC	2	10	1485102	1485111	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
145	NC_015683	GCCCC	2	10	1485130	1485139	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
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147	NC_015683	TTTCA	2	10	1511730	1511739	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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149	NC_015683	TTTTA	2	10	1534384	1534393	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_015683	GTTTT	2	10	1566925	1566934	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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164	NC_015683	AGCAA	2	10	1716155	1716164	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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173	NC_015683	GTTCT	2	10	1817432	1817441	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
174	NC_015683	ATATA	2	10	1820620	1820629	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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197	NC_015683	TTTCA	2	10	2025706	2025715	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
198	NC_015683	ACCCC	2	10	2046713	2046722	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
199	NC_015683	CTCCC	2	10	2049526	2049535	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
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202	NC_015683	TGACG	2	10	2050621	2050630	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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250	NC_015683	GGGAG	2	10	2545771	2545780	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
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256	NC_015683	ACCCC	2	10	2605763	2605772	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
257	NC_015683	GAATT	2	10	2606023	2606032	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
258	NC_015683	CGTTG	2	10	2606249	2606258	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.