MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Thermodesulfobacterium sp. OPB45 chromosome

Total Repeats: 198

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015682	TA	3	6	4273	4278	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015682	AT	3	6	48481	48486	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015682	TA	4	8	49664	49671	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015682	AC	3	6	49702	49707	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_015682	AT	3	6	50081	50086	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015682	AG	3	6	57921	57926	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015682	TC	3	6	97028	97033	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_015682	AG	3	6	143865	143870	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015682	TC	3	6	143980	143985	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_015682	CT	3	6	144412	144417	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_015682	TA	3	6	144830	144835	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015682	CT	3	6	150291	150296	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_015682	TA	3	6	150339	150344	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015682	CT	3	6	168697	168702	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_015682	TA	3	6	184808	184813	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015682	TC	3	6	219671	219676	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_015682	TC	3	6	234027	234032	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_015682	CT	3	6	234970	234975	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_015682	AG	3	6	235003	235008	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015682	TG	3	6	235280	235285	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015682	CA	3	6	235531	235536	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_015682	GT	3	6	235834	235839	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015682	GT	3	6	236003	236008	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015682	AG	3	6	236399	236404	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015682	GC	3	6	237216	237221	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_015682	AC	3	6	237367	237372	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_015682	AC	3	6	259600	259605	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_015682	AT	3	6	261422	261427	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015682	GA	3	6	264528	264533	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015682	TA	3	6	273177	273182	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015682	AT	3	6	297811	297816	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015682	TA	3	6	301498	301503	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015682	AT	3	6	301602	301607	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015682	TA	3	6	302211	302216	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015682	AT	3	6	302251	302256	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015682	AG	3	6	302380	302385	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015682	CA	3	6	302504	302509	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_015682	GT	3	6	302568	302573	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015682	AG	3	6	303677	303682	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015682	CA	3	6	308851	308856	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_015682	AT	3	6	315587	315592	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015682	AG	3	6	315685	315690	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015682	CT	3	6	317699	317704	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_015682	TA	3	6	321543	321548	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015682	AG	3	6	321557	321562	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015682	TA	3	6	324916	324921	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015682	AT	3	6	325258	325263	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015682	AT	4	8	325285	325292	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015682	GA	3	6	325646	325651	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015682	TA	3	6	331639	331644	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015682	TA	3	6	331752	331757	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015682	AG	3	6	333907	333912	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015682	TA	3	6	334810	334815	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015682	TA	3	6	335261	335266	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015682	TA	3	6	337551	337556	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015682	CT	3	6	355134	355139	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_015682	AT	3	6	381519	381524	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015682	TA	3	6	381582	381587	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015682	AT	3	6	382399	382404	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015682	CT	3	6	382816	382821	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_015682	TC	3	6	461390	461395	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_015682	AT	3	6	469287	469292	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015682	AG	3	6	485112	485117	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015682	AG	3	6	485239	485244	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015682	AG	3	6	485517	485522	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015682	AT	3	6	508878	508883	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015682	AT	3	6	527527	527532	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015682	AT	3	6	527842	527847	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015682	AT	3	6	552969	552974	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015682	AG	3	6	553202	553207	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015682	TC	3	6	553215	553220	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_015682	AG	3	6	561764	561769	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015682	AT	3	6	618779	618784	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015682	AT	3	6	625852	625857	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015682	GA	3	6	669103	669108	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015682	CT	3	6	698810	698815	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_015682	AG	3	6	705817	705822	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015682	AT	3	6	724940	724945	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015682	CA	3	6	730743	730748	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_015682	AT	3	6	731019	731024	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015682	TA	3	6	737707	737712	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015682	TA	3	6	752662	752667	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015682	GA	3	6	755242	755247	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015682	TC	3	6	769898	769903	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_015682	TA	4	8	786566	786573	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015682	TA	3	6	787268	787273	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015682	TA	3	6	788006	788011	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015682	AT	3	6	788146	788151	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015682	AT	3	6	804685	804690	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015682	CA	3	6	804823	804828	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_015682	GT	4	8	804886	804893	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015682	TA	3	6	805686	805691	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015682	AT	3	6	814354	814359	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015682	AG	3	6	823004	823009	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015682	GA	3	6	833279	833284	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015682	TC	3	6	834248	834253	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_015682	TA	3	6	848689	848694	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015682	TA	3	6	851132	851137	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015682	AT	3	6	873779	873784	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015682	AG	3	6	877069	877074	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015682	AT	3	6	894009	894014	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015682	AG	3	6	894272	894277	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015682	GA	3	6	899112	899117	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015682	TA	3	6	903231	903236	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015682	TA	3	6	920379	920384	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015682	AT	3	6	920821	920826	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015682	TA	3	6	949749	949754	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015682	TA	3	6	953614	953619	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015682	AT	3	6	967543	967548	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015682	TC	3	6	976351	976356	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_015682	CT	3	6	976592	976597	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_015682	TA	3	6	976708	976713	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015682	AG	4	8	976790	976797	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015682	AT	3	6	976812	976817	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015682	AT	3	6	997113	997118	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015682	TA	3	6	1001523	1001528	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015682	AT	3	6	1016721	1016726	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015682	TA	3	6	1019686	1019691	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015682	TA	3	6	1031190	1031195	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015682	TA	3	6	1031252	1031257	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015682	TA	3	6	1036098	1036103	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015682	CA	3	6	1036298	1036303	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_015682	AT	3	6	1036641	1036646	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015682	TA	4	8	1044959	1044966	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015682	CT	3	6	1049983	1049988	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_015682	TA	3	6	1050529	1050534	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015682	TA	4	8	1050917	1050924	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015682	AT	3	6	1051786	1051791	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015682	AT	3	6	1053055	1053060	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015682	TA	3	6	1053462	1053467	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015682	AT	3	6	1079437	1079442	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015682	CA	3	6	1079523	1079528	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_015682	GA	3	6	1079757	1079762	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015682	AT	3	6	1079863	1079868	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015682	CT	3	6	1088546	1088551	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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137	NC_015682	CT	3	6	1091136	1091141	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_015682	TA	3	6	1091955	1091960	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015682	TA	3	6	1099100	1099105	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015682	TC	3	6	1099501	1099506	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_015682	TA	3	6	1099566	1099571	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015682	AG	3	6	1104837	1104842	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015682	AG	3	6	1116209	1116214	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_015682	AT	3	6	1121285	1121290	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_015682	GA	3	6	1169949	1169954	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_015682	AT	3	6	1171421	1171426	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_015682	TA	3	6	1174871	1174876	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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150	NC_015682	AT	3	6	1187904	1187909	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_015682	TA	3	6	1193715	1193720	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.