MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Blattabacterium sp. (Blattella germanica) str. Bge plasmid pBge

Total Repeats: 57

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015679	TAA	2	6	22	27	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015679	TGT	2	6	61	66	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015679	AAT	2	6	67	72	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015679	CTT	2	6	186	191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_015679	ATT	2	6	272	277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015679	AGA	2	6	312	317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015679	AGA	2	6	320	325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015679	TTA	2	6	346	351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015679	TCA	2	6	368	373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_015679	ATA	4	12	379	390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015679	GAA	2	6	536	541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015679	AGA	2	6	558	563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015679	GTT	2	6	598	603	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015679	GTT	2	6	625	630	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015679	ATT	2	6	658	663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015679	ATC	2	6	684	689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_015679	ATG	2	6	695	700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015679	ATC	2	6	873	878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336478155
19	NC_015679	TCA	2	6	1017	1022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336478155
20	NC_015679	TAT	2	6	1085	1090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336478155
21	NC_015679	CTT	2	6	1109	1114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336478155
22	NC_015679	TTG	2	6	1115	1120	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336478155
23	NC_015679	ACA	2	6	1163	1168	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336478155
24	NC_015679	TCT	2	6	1203	1208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336478156
25	NC_015679	AAT	2	6	1234	1239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336478156
26	NC_015679	TCT	2	6	1455	1460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336478156
27	NC_015679	AAT	2	6	1553	1558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336478156
28	NC_015679	TTA	2	6	1569	1574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336478156
29	NC_015679	AGA	2	6	1587	1592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336478156
30	NC_015679	ATA	2	6	1632	1637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336478156
31	NC_015679	GTA	2	6	1653	1658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336478156
32	NC_015679	TCA	2	6	1666	1671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336478156
33	NC_015679	CTT	2	6	1704	1709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336478157
34	NC_015679	AGA	2	6	1714	1719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336478157
35	NC_015679	TAA	2	6	1887	1892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336478157
36	NC_015679	TTC	2	6	1911	1916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336478157
37	NC_015679	AAT	2	6	1968	1973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336478157
38	NC_015679	CAA	2	6	1990	1995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336478157
39	NC_015679	GAA	2	6	2183	2188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336478158
40	NC_015679	TGT	2	6	2258	2263	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336478158
41	NC_015679	TCT	2	6	2390	2395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336478158
42	NC_015679	TAG	2	6	2403	2408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336478158
43	NC_015679	TTC	2	6	2488	2493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336478158
44	NC_015679	TCA	2	6	2519	2524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336478158
45	NC_015679	TGT	2	6	2594	2599	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336478158
46	NC_015679	AGA	2	6	2650	2655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336478158
47	NC_015679	GCA	3	9	2675	2683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336478158
48	NC_015679	TTG	2	6	2775	2780	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336478158
49	NC_015679	TCT	2	6	2786	2791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336478158
50	NC_015679	ATC	2	6	2806	2811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336478158
51	NC_015679	CAT	2	6	2884	2889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336478158
52	NC_015679	GAA	2	6	3005	3010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336478158
53	NC_015679	TGT	2	6	3077	3082	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336478158
54	NC_015679	AAT	2	6	3090	3095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336478158
55	NC_015679	TAA	2	6	3715	3720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015679	ATT	2	6	3757	3762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015679	TTC	2	6	3806	3811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.