MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus parasanguinis ATCC 15912 chromosome

Total Repeats: 76

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015678	AAGGAA	2	12	6204	6215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015678	ACTAAT	2	12	9320	9331	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_015678	TTTTTC	2	12	28567	28578	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_015678	TTGATT	2	12	32941	32952	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015678	GGAAAT	2	12	76007	76018	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015678	AGGATA	2	12	84497	84508	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015678	TTGTTT	2	12	103647	103658	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015678	CGTATT	2	12	163317	163328	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_015678	TGAAAA	2	12	188736	188747	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015678	CGCTTC	2	12	268988	268999	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
11	NC_015678	TGGTAT	2	12	360263	360274	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015678	TACAAT	2	12	369189	369200	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_015678	TTTTAA	2	12	370503	370514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015678	ATTAAG	2	12	374687	374698	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015678	AAGTCA	2	12	433666	433677	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_015678	CATCAG	2	12	456775	456786	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_015678	ATATTT	2	12	482035	482046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015678	TTGCCT	2	12	541127	541138	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_015678	AAATTA	2	12	567668	567679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015678	TTAGAT	2	12	593795	593806	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015678	TCTATT	2	12	598867	598878	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_015678	AAAAGA	2	12	613924	613935	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015678	ACCTCC	2	12	621679	621690	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_015678	TTTTTA	2	12	697879	697890	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015678	AGACAA	2	12	712901	712912	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_015678	CTATTT	2	12	782161	782172	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_015678	CGTCTG	2	12	808822	808833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_015678	AAAATA	2	12	956723	956734	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015678	TCATTT	2	12	995847	995858	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_015678	CTGTTC	2	12	1037393	1037404	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_015678	TAGTGT	2	12	1040343	1040354	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015678	AAAAGA	2	12	1060875	1060886	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015678	AAAGAA	2	12	1074385	1074396	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015678	TTGGTT	2	12	1122021	1122032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015678	CTTTAC	2	12	1131818	1131829	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_015678	CTTTTT	2	12	1225501	1225512	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_015678	TAGAAC	2	12	1225603	1225614	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_015678	TCATTA	2	12	1228897	1228908	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_015678	TTTCTA	2	12	1314816	1314827	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_015678	CTATCC	2	12	1353177	1353188	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_015678	CCAAAT	2	12	1381128	1381139	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_015678	AAGAAA	2	12	1381480	1381491	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015678	CGACCT	2	12	1395061	1395072	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
44	NC_015678	ACAAAA	2	12	1399795	1399806	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_015678	TTTCCT	2	12	1465547	1465558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_015678	AAAAAT	2	12	1496092	1496103	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015678	TCTTTT	2	12	1506850	1506861	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_015678	AGGTTT	2	12	1550797	1550808	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015678	TTATTT	2	12	1587366	1587377	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015678	AAGGAA	2	12	1606224	1606235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015678	ACTAAT	2	12	1609340	1609351	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_015678	TAATAG	2	12	1647141	1647152	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015678	AAGGAG	2	12	1656382	1656393	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015678	ACAAGA	2	12	1657154	1657165	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_015678	GAAGGA	2	12	1676980	1676991	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015678	GAAAAT	2	12	1705135	1705146	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015678	AAGGAA	2	12	1729003	1729014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015678	ACTAAT	2	12	1732119	1732130	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_015678	TTCGGG	2	12	1733041	1733052	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_015678	TTTTAT	2	12	1755745	1755756	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015678	TATTTT	2	12	1776761	1776772	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015678	TATATG	2	12	1812678	1812689	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015678	TAAAAA	2	12	1855296	1855307	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015678	AAAAGG	2	12	1877331	1877342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015678	ATCAAG	2	12	1894092	1894103	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_015678	TTTCTA	2	12	1905445	1905456	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_015678	AGAGGG	2	12	1915759	1915770	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015678	CTTTTT	2	12	1925838	1925849	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_015678	TAGAAA	2	12	1944566	1944577	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015678	AAAAAG	2	12	1956994	1957005	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015678	CTATAT	2	12	1974729	1974740	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_015678	AATGTT	2	12	1982379	1982390	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015678	AAGGAA	2	12	2063622	2063633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015678	ACTAAT	2	12	2066738	2066749	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_015678	CAAACT	2	12	2071567	2071578	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_015678	AATAAA	2	12	2104949	2104960	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.