MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Ramlibacter tataouinensis TTB310 chromosome

Total Repeats: 132

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015677	GGTGAA	2	12	10714	10725	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015677	AGGACG	2	12	21777	21788	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_015677	CGAGCT	2	12	40215	40226	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_015677	CAGGCC	2	12	72107	72118	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
5	NC_015677	GGCAGG	2	12	98734	98745	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_015677	TGGATT	2	12	107428	107439	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015677	GCATCG	2	12	111767	111778	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_015677	TGTCCA	2	12	115932	115943	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_015677	TGAGCT	2	12	138568	138579	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_015677	CGGGGC	2	12	248356	248367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_015677	CGGGCT	2	12	328978	328989	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_015677	CTCGGT	2	12	390570	390581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_015677	CCAGGG	2	12	390650	390661	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_015677	GGGCCT	2	12	390770	390781	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_015677	AGCCTG	2	12	405323	405334	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_015677	GCCGGC	2	12	481570	481581	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_015677	CGGGCA	2	12	522353	522364	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_015677	AAGCGA	2	12	565668	565679	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_015677	CTTTTG	2	12	571320	571331	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_015677	ACGTCA	2	12	592568	592579	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_015677	CGAGGA	2	12	610348	610359	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_015677	GCAGCG	2	12	635091	635102	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_015677	GGCAAA	2	12	637439	637450	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_015677	GCCGGA	2	12	677845	677856	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_015677	TGGTGA	2	12	677961	677972	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015677	GGGAGA	2	12	695931	695942	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015677	TCTCCC	2	12	708393	708404	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_015677	GGGTGA	2	12	708420	708431	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015677	GCCTGC	2	12	753654	753665	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
30	NC_015677	AGGCCG	2	12	804119	804130	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_015677	GCCCGC	2	12	809033	809044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_015677	GGGTGA	2	12	810203	810214	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015677	CCGGGC	2	12	865087	865098	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_015677	AGGAAG	2	12	895000	895011	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015677	CGTGCT	2	12	921188	921199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_015677	GGAGGG	2	12	951052	951063	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015677	CTTTTG	2	12	984550	984561	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_015677	ACGTCA	2	12	1044603	1044614	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_015677	AAGGGA	2	12	1054055	1054066	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015677	GCGCCT	2	12	1070160	1070171	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
41	NC_015677	GAAAAG	2	12	1074462	1074473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015677	GGGCCT	2	12	1079261	1079272	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_015677	CGGTGC	2	12	1110670	1110681	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_015677	CGAGCC	2	12	1110887	1110898	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
45	NC_015677	GAACAC	2	12	1134390	1134401	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_015677	GCCTGC	2	12	1212346	1212357	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
47	NC_015677	TCGAGC	2	12	1222775	1222786	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_015677	GGCGCC	2	12	1287511	1287522	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_015677	GCCAAC	2	12	1326331	1326342	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
50	NC_015677	CGGTGG	2	12	1339440	1339451	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_015677	AGGCAA	2	12	1346173	1346184	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_015677	CCGGCA	2	12	1352777	1352788	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
53	NC_015677	CGGCGC	2	12	1435845	1435856	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_015677	GCCTTC	2	12	1456516	1456527	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
55	NC_015677	CCGGCC	2	12	1485440	1485451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_015677	AGTCAA	2	12	1604889	1604900	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_015677	CCTTGG	2	12	1632103	1632114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_015677	CCAGCG	2	12	1707824	1707835	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
59	NC_015677	CCCGCT	2	12	1734332	1734343	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_015677	GAACGG	2	12	1774960	1774971	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_015677	CGGCGC	2	12	1787967	1787978	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_015677	CGCCTC	2	12	1791315	1791326	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_015677	GGCCGG	2	12	1792803	1792814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_015677	GCGCCG	2	12	1877211	1877222	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_015677	GTTTCA	2	12	1899953	1899964	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_015677	GGGCCT	2	12	1989937	1989948	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_015677	CTGAAC	2	12	2032439	2032450	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_015677	CGGCGC	2	12	2104302	2104313	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_015677	CTTGCG	2	12	2110234	2110245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_015677	GGCCCC	2	12	2183073	2183084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_015677	CGAGCC	2	12	2207865	2207876	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
72	NC_015677	CGCTGC	2	12	2287710	2287721	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
73	NC_015677	GGGCCG	2	12	2300367	2300378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_015677	CTGACT	2	12	2310286	2310297	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_015677	CGGCGC	2	12	2325981	2325992	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_015677	GCGCCG	2	12	2342249	2342260	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
77	NC_015677	CCGCGC	2	12	2349067	2349078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_015677	CGCGGC	2	12	2349242	2349253	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
79	NC_015677	GCGGCC	2	12	2349949	2349960	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_015677	GTTAGA	2	12	2352013	2352024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015677	CCAGGG	2	12	2433138	2433149	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_015677	GCTGAG	2	12	2472652	2472663	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_015677	CGTGGC	2	12	2507469	2507480	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_015677	CCAGGC	2	12	2592754	2592765	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
85	NC_015677	CTGGCG	2	12	2605777	2605788	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_015677	AACGTC	2	12	2617281	2617292	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_015677	TTTGTG	2	12	2622896	2622907	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015677	GCCCAG	2	12	2672410	2672421	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
89	NC_015677	CAGCCG	2	12	2710473	2710484	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
90	NC_015677	CGTGTC	2	12	2726829	2726840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_015677	CCCGGC	2	12	2726953	2726964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_015677	TTCGTC	2	12	2748411	2748422	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_015677	CGTGCG	2	12	2826975	2826986	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_015677	GGCACA	2	12	2828289	2828300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_015677	TGCGGC	2	12	2910553	2910564	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_015677	TCGGGC	2	12	2937110	2937121	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_015677	CGCGGC	2	12	2991342	2991353	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
98	NC_015677	GTGGAC	2	12	3112162	3112173	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_015677	CAGCTC	2	12	3135029	3135040	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
100	NC_015677	CGCGAG	2	12	3141146	3141157	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_015677	ACCGCC	2	12	3141195	3141206	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_015677	CTTCCT	2	12	3146951	3146962	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_015677	CAGCAA	2	12	3199878	3199889	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_015677	CGCTGG	2	12	3202989	3203000	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_015677	CCCGGC	2	12	3225342	3225353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_015677	CGACCG	2	12	3225488	3225499	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
107	NC_015677	CGCCAC	2	12	3274293	3274304	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_015677	GGCGCC	2	12	3311056	3311067	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
109	NC_015677	GCCGGC	2	12	3323504	3323515	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
110	NC_015677	CAGGCG	2	12	3507455	3507466	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_015677	CGGCCT	2	12	3525044	3525055	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
112	NC_015677	CGCCCG	2	12	3581716	3581727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_015677	GCGCCG	2	12	3592357	3592368	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114	NC_015677	CCTGAT	2	12	3599023	3599034	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_015677	GGTTCG	2	12	3630657	3630668	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_015677	AGGTGG	2	12	3682482	3682493	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015677	CGGGAG	2	12	3703038	3703049	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_015677	CCGAGC	2	12	3703703	3703714	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
119	NC_015677	GCGGCC	2	12	3733592	3733603	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120	NC_015677	CGTGCC	2	12	3789573	3789584	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
121	NC_015677	CCACGG	2	12	3789592	3789603	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
122	NC_015677	GCGCCT	2	12	3819018	3819029	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
123	NC_015677	GCTTCC	2	12	3819053	3819064	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
124	NC_015677	GCCAGG	2	12	3826761	3826772	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_015677	GGCTGG	2	12	3837467	3837478	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_015677	AGCTGG	2	12	3839689	3839700	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_015677	CTGTGC	2	12	3846819	3846830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_015677	CAGGAG	2	12	3869045	3869056	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_015677	GCTCGC	2	12	3887881	3887892	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
130	NC_015677	GCCCGG	2	12	3902113	3902124	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131	NC_015677	CTGCGT	2	12	3933746	3933757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_015677	GGTCCG	2	12	3940590	3940601	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.