MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Ramlibacter tataouinensis TTB310 chromosome

Total Repeats: 328

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015677	CAGGC	2	10	10986	10995	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
2	NC_015677	CAGTC	2	10	11156	11165	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3	NC_015677	AGCGC	2	10	19915	19924	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
4	NC_015677	CAGGC	2	10	21738	21747	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
5	NC_015677	GCGCC	2	10	30273	30282	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
6	NC_015677	ACGCC	2	10	43170	43179	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
7	NC_015677	GGCCG	2	10	50245	50254	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
8	NC_015677	CGCGC	2	10	52858	52867	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
9	NC_015677	GGGCG	2	10	56479	56488	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
10	NC_015677	TGCCG	2	10	56699	56708	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
11	NC_015677	CCGGA	2	10	70559	70568	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
12	NC_015677	GCGTC	2	10	80326	80335	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
13	NC_015677	CCGGG	2	10	81434	81443	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
14	NC_015677	GCGCC	2	10	87313	87322	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
15	NC_015677	CCGAG	2	10	99617	99626	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
16	NC_015677	CCCTG	2	10	101071	101080	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
17	NC_015677	GCAGT	2	10	104652	104661	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
18	NC_015677	AAAAG	2	10	124803	124812	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015677	CGCGC	2	10	136515	136524	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
20	NC_015677	GGGCC	2	10	155397	155406	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
21	NC_015677	TCGCG	2	10	158319	158328	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
22	NC_015677	ATCGG	2	10	165789	165798	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
23	NC_015677	AAATA	2	10	171322	171331	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015677	TGCGC	2	10	193302	193311	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
25	NC_015677	CCGGG	2	10	216475	216484	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
26	NC_015677	CCCGG	2	10	225991	226000	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
27	NC_015677	CAGCG	2	10	230614	230623	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
28	NC_015677	AACGC	2	10	269973	269982	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
29	NC_015677	CAAAG	2	10	293044	293053	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
30	NC_015677	GCGCC	2	10	293054	293063	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
31	NC_015677	CTCGC	2	10	295010	295019	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
32	NC_015677	CCAGC	2	10	295172	295181	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
33	NC_015677	GTCGT	2	10	298273	298282	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
34	NC_015677	GCAGC	2	10	300509	300518	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
35	NC_015677	GTGTT	2	10	352865	352874	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015677	CCCGG	2	10	352905	352914	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
37	NC_015677	GCAGG	2	10	356197	356206	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
38	NC_015677	CTTCC	3	15	357741	357755	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
39	NC_015677	GCCGT	2	10	380134	380143	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
40	NC_015677	GGCGG	2	10	384445	384454	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
41	NC_015677	GGGGA	2	10	385950	385959	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015677	CCATC	2	10	411592	411601	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
43	NC_015677	ACGCA	2	10	419025	419034	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
44	NC_015677	CGCGC	2	10	453506	453515	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
45	NC_015677	CGGGC	2	10	458229	458238	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
46	NC_015677	TGGCC	2	10	468960	468969	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
47	NC_015677	CGATG	2	10	477283	477292	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
48	NC_015677	GCGGT	2	10	479527	479536	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
49	NC_015677	CCGTG	2	10	484168	484177	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
50	NC_015677	CTCCC	2	10	484274	484283	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
51	NC_015677	TCCCT	2	10	494614	494623	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
52	NC_015677	TTCAG	2	10	538449	538458	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
53	NC_015677	CGGGC	2	10	545410	545419	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
54	NC_015677	GCCGC	2	10	552250	552259	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
55	NC_015677	CGATG	2	10	565892	565901	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
56	NC_015677	TCGTG	2	10	567145	567154	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
57	NC_015677	ACTTC	2	10	568055	568064	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
58	NC_015677	GCGAA	2	10	568328	568337	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
59	NC_015677	AACGG	2	10	568446	568455	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
60	NC_015677	GGGAG	2	10	568645	568654	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015677	ACCAA	2	10	569047	569056	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
62	NC_015677	CTCAT	2	10	570643	570652	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
63	NC_015677	CTATC	2	10	579618	579627	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
64	NC_015677	CGCGG	2	10	606214	606223	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
65	NC_015677	GGGCA	2	10	607166	607175	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
66	NC_015677	CGGCA	2	10	609667	609676	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
67	NC_015677	CGCGG	2	10	611184	611193	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
68	NC_015677	TGCCG	2	10	619184	619193	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
69	NC_015677	TGGAA	2	10	635005	635014	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015677	ACGCA	2	10	644183	644192	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
71	NC_015677	TGCGG	2	10	645991	646000	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
72	NC_015677	CCCTT	2	10	651302	651311	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
73	NC_015677	GTTGA	2	10	667589	667598	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015677	GGAAG	2	10	678006	678015	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015677	CTGCG	2	10	680014	680023	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
76	NC_015677	GGGCG	3	15	686883	686897	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
77	NC_015677	CAGGA	2	10	688673	688682	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
78	NC_015677	GCCGC	2	10	705768	705777	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
79	NC_015677	GCGCC	2	10	723227	723236	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
80	NC_015677	GCCCC	2	10	736253	736262	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
81	NC_015677	CGGCC	2	10	767256	767265	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
82	NC_015677	CGCCA	2	10	802899	802908	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
83	NC_015677	GCGCG	2	10	814020	814029	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
84	NC_015677	GACGG	2	10	815326	815335	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
85	NC_015677	GCGCC	2	10	815347	815356	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
86	NC_015677	CCGGG	2	10	817341	817350	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
87	NC_015677	CGGGC	2	10	817870	817879	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
88	NC_015677	TTGCC	2	10	876110	876119	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
89	NC_015677	AGGAG	2	10	898032	898041	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015677	AGCTC	2	10	910335	910344	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
91	NC_015677	CTTGG	2	10	925690	925699	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
92	NC_015677	CCCCA	2	10	951032	951041	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
93	NC_015677	GGCGC	2	10	1014333	1014342	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
94	NC_015677	CAGCC	2	10	1014521	1014530	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
95	NC_015677	GCCGC	2	10	1027856	1027865	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
96	NC_015677	GGGCC	2	10	1053742	1053751	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
97	NC_015677	GCATG	2	10	1109812	1109821	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
98	NC_015677	GCCAC	2	10	1149367	1149376	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
99	NC_015677	GATGC	2	10	1157874	1157883	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
100	NC_015677	GAAGT	2	10	1222454	1222463	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015677	GCGCT	2	10	1232953	1232962	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
102	NC_015677	CGGGG	2	10	1235143	1235152	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
103	NC_015677	CGAGC	2	10	1237629	1237638	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
104	NC_015677	CCCAT	2	10	1237648	1237657	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
105	NC_015677	CGCCC	2	10	1240481	1240490	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
106	NC_015677	AGCCG	2	10	1271592	1271601	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
107	NC_015677	GGGGA	2	10	1288025	1288034	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015677	CTCTC	2	10	1298063	1298072	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
109	NC_015677	GGGGA	2	10	1311555	1311564	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015677	AGGGG	2	10	1314935	1314944	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015677	GTGTT	2	10	1317398	1317407	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015677	GGAAA	2	10	1330599	1330608	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015677	GCGCA	3	15	1333259	1333273	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
114	NC_015677	GCGCC	2	10	1347016	1347025	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
115	NC_015677	CCGGC	2	10	1348155	1348164	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
116	NC_015677	GCAGG	2	10	1352821	1352830	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
117	NC_015677	GGGGC	2	10	1362493	1362502	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
118	NC_015677	GGTCC	2	10	1382241	1382250	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
119	NC_015677	TGCGC	2	10	1382388	1382397	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
120	NC_015677	GTACG	2	10	1401291	1401300	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
121	NC_015677	CGGCG	2	10	1427379	1427388	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
122	NC_015677	TGGGC	2	10	1434546	1434555	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
123	NC_015677	GCGGG	2	10	1442495	1442504	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
124	NC_015677	TAAAC	2	10	1451861	1451870	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_015677	GCCTG	2	10	1488799	1488808	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
126	NC_015677	CAGCT	2	10	1491493	1491502	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
127	NC_015677	GCACG	2	10	1497327	1497336	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
128	NC_015677	CGAAT	2	10	1500816	1500825	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
129	NC_015677	CGGGG	2	10	1516807	1516816	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
130	NC_015677	GCTCG	2	10	1527222	1527231	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
131	NC_015677	GCCGC	2	10	1531504	1531513	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
132	NC_015677	GCCGG	2	10	1533156	1533165	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
133	NC_015677	CGGGC	2	10	1533168	1533177	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
134	NC_015677	GCGGG	2	10	1546762	1546771	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
135	NC_015677	TCTCC	2	10	1567662	1567671	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
136	NC_015677	GGAAA	2	10	1589586	1589595	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015677	GGCAG	2	10	1656183	1656192	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
138	NC_015677	TGTTT	2	10	1661100	1661109	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015677	CGGCT	2	10	1700954	1700963	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
140	NC_015677	CCACC	2	10	1712321	1712330	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
141	NC_015677	ACCGG	2	10	1718809	1718818	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
142	NC_015677	GGGAT	2	10	1743536	1743545	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015677	CGACC	2	10	1743593	1743602	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
144	NC_015677	AGAGA	2	10	1768931	1768940	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
145	NC_015677	TCGAC	2	10	1775966	1775975	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
146	NC_015677	CGCCT	2	10	1776065	1776074	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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258	NC_015677	TGCCC	2	10	3107565	3107574	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
259	NC_015677	CGGCG	2	10	3110509	3110518	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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262	NC_015677	AGGTC	2	10	3162341	3162350	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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264	NC_015677	TGCTC	2	10	3177878	3177887	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
265	NC_015677	TCGCA	2	10	3181587	3181596	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
266	NC_015677	CAGTA	2	10	3204248	3204257	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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269	NC_015677	CGGAC	2	10	3289622	3289631	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
270	NC_015677	ATCGC	2	10	3305204	3305213	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
271	NC_015677	CCAGC	2	10	3311200	3311209	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
272	NC_015677	TGGGG	2	10	3338322	3338331	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
273	NC_015677	CTGCA	2	10	3364884	3364893	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
274	NC_015677	TCATC	2	10	3412855	3412864	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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280	NC_015677	GGCGC	2	10	3483908	3483917	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
281	NC_015677	CCGCG	2	10	3508680	3508689	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
282	NC_015677	AGCCA	2	10	3528459	3528468	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
283	NC_015677	ACCCA	2	10	3529665	3529674	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
284	NC_015677	GGCCG	2	10	3580951	3580960	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
285	NC_015677	GGCCG	2	10	3607641	3607650	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
286	NC_015677	AGGCA	2	10	3643488	3643497	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
287	NC_015677	CGGGA	2	10	3646597	3646606	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
288	NC_015677	AGTTG	2	10	3679865	3679874	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
289	NC_015677	AATTG	2	10	3699443	3699452	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
290	NC_015677	GCCAT	2	10	3702162	3702171	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
291	NC_015677	TCCGG	2	10	3702900	3702909	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
292	NC_015677	CCGCG	2	10	3702982	3702991	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
293	NC_015677	CCCCA	2	10	3703974	3703983	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
294	NC_015677	GCGTC	2	10	3704313	3704322	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
295	NC_015677	GTACG	2	10	3704502	3704511	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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297	NC_015677	GCCCG	2	10	3741354	3741363	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
298	NC_015677	GAAGA	2	10	3759257	3759266	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
299	NC_015677	GCCAG	2	10	3763277	3763286	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
300	NC_015677	TGCGT	2	10	3764825	3764834	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
301	NC_015677	TGTGA	2	10	3782956	3782965	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
302	NC_015677	GCCCC	2	10	3789942	3789951	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
303	NC_015677	ATCCG	2	10	3793149	3793158	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
304	NC_015677	CCGAA	2	10	3795016	3795025	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
305	NC_015677	TCGCT	2	10	3798479	3798488	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
306	NC_015677	CCACC	2	10	3798611	3798620	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
307	NC_015677	TGCCG	2	10	3818684	3818693	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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309	NC_015677	CGGCA	2	10	3839454	3839463	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
310	NC_015677	GCGCC	2	10	3843027	3843036	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
311	NC_015677	CTTTC	2	10	3844052	3844061	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
312	NC_015677	GCCTC	2	10	3852735	3852744	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
313	NC_015677	CGAGT	2	10	3892176	3892185	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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319	NC_015677	CGCGG	2	10	4008406	4008415	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
320	NC_015677	CTGGC	2	10	4019040	4019049	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
321	NC_015677	GTGGC	2	10	4019102	4019111	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
322	NC_015677	AGAGG	2	10	4019278	4019287	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
323	NC_015677	TGCCG	2	10	4027516	4027525	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
324	NC_015677	GCCGG	2	10	4029927	4029936	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
325	NC_015677	CCACG	2	10	4044804	4044813	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
326	NC_015677	GCCGC	2	10	4053624	4053633	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
327	NC_015677	CCGCG	2	10	4067454	4067463	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
328	NC_015677	GCAAG	2	10	4070114	4070123	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.