MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Methanosalsum zhilinae DSM 4017 chromosome

Total Repeats: 5582

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015676	GAAT	2	8	258	265	50 %	25 %	25 %	0 %	336475960
2	NC_015676	GGAG	2	8	301	308	25 %	0 %	75 %	0 %	336475960
3	NC_015676	ATCT	2	8	310	317	25 %	50 %	0 %	25 %	336475960
4	NC_015676	ATAA	2	8	383	390	75 %	25 %	0 %	0 %	336475960
5	NC_015676	ATTT	2	8	1506	1513	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015676	TACC	2	8	1973	1980	25 %	25 %	0 %	50 %	336475961
7	NC_015676	TGAT	2	8	2362	2369	25 %	50 %	25 %	0 %	336475962
8	NC_015676	GGCA	2	8	3652	3659	25 %	0 %	50 %	25 %	336475962
9	NC_015676	TGCA	2	8	3985	3992	25 %	25 %	25 %	25 %	336475963
10	NC_015676	AATC	2	8	4320	4327	50 %	25 %	0 %	25 %	336475963
11	NC_015676	ATAG	2	8	4819	4826	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015676	ATGA	2	8	5582	5589	50 %	25 %	25 %	0 %	336475964
13	NC_015676	AGGT	2	8	5679	5686	25 %	25 %	50 %	0 %	336475964
14	NC_015676	AAGA	2	8	5854	5861	75 %	0 %	25 %	0 %	336475964
15	NC_015676	GCAG	2	8	6713	6720	25 %	0 %	50 %	25 %	336475965
16	NC_015676	ATCG	2	8	6850	6857	25 %	25 %	25 %	25 %	336475965
17	NC_015676	CAGG	2	8	7185	7192	25 %	0 %	50 %	25 %	336475965
18	NC_015676	AGGC	2	8	7384	7391	25 %	0 %	50 %	25 %	336475965
19	NC_015676	GGGC	2	8	7554	7561	0 %	0 %	75 %	25 %	336475965
20	NC_015676	CCAA	2	8	8219	8226	50 %	0 %	0 %	50 %	336475966
21	NC_015676	TTTC	2	8	8293	8300	0 %	75 %	0 %	25 %	336475966
22	NC_015676	GTTT	2	8	8535	8542	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015676	TTTC	2	8	8640	8647	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_015676	ATTC	2	8	8925	8932	25 %	50 %	0 %	25 %	336475967
25	NC_015676	TGAT	2	8	9428	9435	25 %	50 %	25 %	0 %	336475967
26	NC_015676	TCAG	2	8	10035	10042	25 %	25 %	25 %	25 %	336475968
27	NC_015676	TTTC	2	8	10361	10368	0 %	75 %	0 %	25 %	336475968
28	NC_015676	CCTG	2	8	10502	10509	0 %	25 %	25 %	50 %	336475968
29	NC_015676	CGTC	2	8	10824	10831	0 %	25 %	25 %	50 %	336475968
30	NC_015676	TAAT	2	8	11260	11267	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015676	CAGG	2	8	11755	11762	25 %	0 %	50 %	25 %	336475969
32	NC_015676	ATTA	2	8	12450	12457	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015676	CCTG	2	8	12691	12698	0 %	25 %	25 %	50 %	336475970
34	NC_015676	ATGA	2	8	12805	12812	50 %	25 %	25 %	0 %	336475970
35	NC_015676	TCTT	2	8	12813	12820	0 %	75 %	0 %	25 %	336475970
36	NC_015676	TTCT	2	8	13113	13120	0 %	75 %	0 %	25 %	336475970
37	NC_015676	GCTG	2	8	14047	14054	0 %	25 %	50 %	25 %	336475971
38	NC_015676	TGCC	2	8	14269	14276	0 %	25 %	25 %	50 %	336475971
39	NC_015676	AGCA	2	8	15131	15138	50 %	0 %	25 %	25 %	336475972
40	NC_015676	ATTC	2	8	15217	15224	25 %	50 %	0 %	25 %	336475972
41	NC_015676	GTAT	2	8	15511	15518	25 %	50 %	25 %	0 %	336475972
42	NC_015676	AACT	2	8	15821	15828	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_015676	TACC	2	8	15897	15904	25 %	25 %	0 %	50 %	336475973
44	NC_015676	CAGG	2	8	16596	16603	25 %	0 %	50 %	25 %	336475973
45	NC_015676	TAAA	2	8	16627	16634	75 %	25 %	0 %	0 %	336475973
46	NC_015676	GAAA	2	8	16678	16685	75 %	0 %	25 %	0 %	336475974
47	NC_015676	AAAG	2	8	16719	16726	75 %	0 %	25 %	0 %	336475974
48	NC_015676	TCAA	2	8	16781	16788	50 %	25 %	0 %	25 %	336475974
49	NC_015676	TTCA	2	8	17009	17016	25 %	50 %	0 %	25 %	336475974
50	NC_015676	GATT	2	8	17366	17373	25 %	50 %	25 %	0 %	336475975
51	NC_015676	TGGA	2	8	17539	17546	25 %	25 %	50 %	0 %	336475975
52	NC_015676	GTTC	2	8	17750	17757	0 %	50 %	25 %	25 %	336475975
53	NC_015676	CTTC	2	8	18148	18155	0 %	50 %	0 %	50 %	336475975
54	NC_015676	GATG	2	8	18270	18277	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015676	TTTA	2	8	18501	18508	25 %	75 %	0 %	0 %	336475976
56	NC_015676	ACTG	2	8	18592	18599	25 %	25 %	25 %	25 %	336475976
57	NC_015676	CTTT	2	8	18864	18871	0 %	75 %	0 %	25 %	336475976
58	NC_015676	TTTA	2	8	19409	19416	25 %	75 %	0 %	0 %	336475976
59	NC_015676	ATTT	2	8	19483	19490	25 %	75 %	0 %	0 %	336475977
60	NC_015676	GCAG	2	8	20068	20075	25 %	0 %	50 %	25 %	336475977
61	NC_015676	CCTG	2	8	21002	21009	0 %	25 %	25 %	50 %	336475978
62	NC_015676	TTCC	2	8	21915	21922	0 %	50 %	0 %	50 %	336475979
63	NC_015676	ATTC	2	8	22247	22254	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_015676	GATC	2	8	23474	23481	25 %	25 %	25 %	25 %	336475981
65	NC_015676	CTTC	2	8	25621	25628	0 %	50 %	0 %	50 %	336475983
66	NC_015676	ATTG	2	8	25935	25942	25 %	50 %	25 %	0 %	336475984
67	NC_015676	GCAG	2	8	26140	26147	25 %	0 %	50 %	25 %	336475984
68	NC_015676	CAGG	2	8	26354	26361	25 %	0 %	50 %	25 %	336475984
69	NC_015676	CTTT	2	8	26560	26567	0 %	75 %	0 %	25 %	336475984
70	NC_015676	CGTA	2	8	27391	27398	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_015676	AAAT	2	8	27650	27657	75 %	25 %	0 %	0 %	336475985
72	NC_015676	TTCC	2	8	27827	27834	0 %	50 %	0 %	50 %	336475985
73	NC_015676	AAGG	2	8	28139	28146	50 %	0 %	50 %	0 %	336475985
74	NC_015676	AAAG	2	8	28481	28488	75 %	0 %	25 %	0 %	336475985
75	NC_015676	CAGA	2	8	28498	28505	50 %	0 %	25 %	25 %	336475985
76	NC_015676	ATTC	2	8	29475	29482	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_015676	ATTT	2	8	29498	29505	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015676	CACT	2	8	29781	29788	25 %	25 %	0 %	50 %	336475987
79	NC_015676	GAAG	2	8	30214	30221	50 %	0 %	50 %	0 %	336475988
80	NC_015676	TGCA	2	8	31199	31206	25 %	25 %	25 %	25 %	336475988
81	NC_015676	TCTT	2	8	31751	31758	0 %	75 %	0 %	25 %	336475988
82	NC_015676	CATA	2	8	32422	32429	50 %	25 %	0 %	25 %	336475989
83	NC_015676	TGCG	2	8	32638	32645	0 %	25 %	50 %	25 %	336475989
84	NC_015676	CTTT	2	8	32798	32805	0 %	75 %	0 %	25 %	336475989
85	NC_015676	CGGT	2	8	33349	33356	0 %	25 %	50 %	25 %	336475990
86	NC_015676	CTGG	2	8	33377	33384	0 %	25 %	50 %	25 %	336475990
87	NC_015676	AAGA	2	8	33750	33757	75 %	0 %	25 %	0 %	336475990
88	NC_015676	TGAT	2	8	34313	34320	25 %	50 %	25 %	0 %	336475990
89	NC_015676	ATTG	2	8	34345	34352	25 %	50 %	25 %	0 %	336475990
90	NC_015676	ATAC	2	8	34573	34580	50 %	25 %	0 %	25 %	336475991
91	NC_015676	TTTC	2	8	34956	34963	0 %	75 %	0 %	25 %	336475991
92	NC_015676	ATGC	2	8	35209	35216	25 %	25 %	25 %	25 %	336475991
93	NC_015676	TCTG	2	8	36240	36247	0 %	50 %	25 %	25 %	336475992
94	NC_015676	ATTC	2	8	36748	36755	25 %	50 %	0 %	25 %	336475992
95	NC_015676	AGGT	2	8	36785	36792	25 %	25 %	50 %	0 %	336475992
96	NC_015676	CTGT	2	8	37003	37010	0 %	50 %	25 %	25 %	336475993
97	NC_015676	ATCT	2	8	37269	37276	25 %	50 %	0 %	25 %	336475993
98	NC_015676	TATC	2	8	37390	37397	25 %	50 %	0 %	25 %	336475993
99	NC_015676	GTAT	2	8	38241	38248	25 %	50 %	25 %	0 %	336475994
100	NC_015676	ACAT	2	8	38710	38717	50 %	25 %	0 %	25 %	336475994
101	NC_015676	TGTA	2	8	38792	38799	25 %	50 %	25 %	0 %	336475994
102	NC_015676	GTAT	2	8	38829	38836	25 %	50 %	25 %	0 %	336475994
103	NC_015676	ATTT	2	8	39211	39218	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015676	ATGC	2	8	39356	39363	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_015676	TCAT	2	8	39385	39392	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_015676	GCTG	2	8	40008	40015	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
107	NC_015676	CGAG	2	8	40649	40656	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
108	NC_015676	CATT	2	8	41239	41246	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_015676	AATC	2	8	41597	41604	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_015676	TTCC	2	8	42320	42327	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_015676	GTAG	2	8	43564	43571	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015676	GTGG	2	8	43597	43604	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015676	CATC	2	8	44534	44541	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_015676	TACA	2	8	44560	44567	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_015676	TTTG	2	8	46339	46346	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015676	GATA	2	8	46577	46584	50 %	25 %	25 %	0 %	336475996
117	NC_015676	CTCA	2	8	46708	46715	25 %	25 %	0 %	50 %	336475996
118	NC_015676	TGTT	2	8	47203	47210	0 %	75 %	25 %	0 %	336475996
119	NC_015676	TTAT	2	8	47431	47438	25 %	75 %	0 %	0 %	336475997
120	NC_015676	TTAT	2	8	47803	47810	25 %	75 %	0 %	0 %	336475998
121	NC_015676	ATCA	2	8	47861	47868	50 %	25 %	0 %	25 %	336475998
122	NC_015676	CTGT	2	8	48488	48495	0 %	50 %	25 %	25 %	336475999
123	NC_015676	CATC	2	8	48615	48622	25 %	25 %	0 %	50 %	336475999
124	NC_015676	ATGT	2	8	48678	48685	25 %	50 %	25 %	0 %	336475999
125	NC_015676	TTCT	2	8	49410	49417	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_015676	CTAT	2	8	49982	49989	25 %	50 %	0 %	25 %	336476000
127	NC_015676	ATTC	2	8	50002	50009	25 %	50 %	0 %	25 %	336476000
128	NC_015676	CCTG	2	8	50261	50268	0 %	25 %	25 %	50 %	336476000
129	NC_015676	ATGA	2	8	50809	50816	50 %	25 %	25 %	0 %	336476002
130	NC_015676	CAAA	2	8	50957	50964	75 %	0 %	0 %	25 %	336476002
131	NC_015676	TGTC	2	8	51272	51279	0 %	50 %	25 %	25 %	336476002
132	NC_015676	TTTC	2	8	52966	52973	0 %	75 %	0 %	25 %	336476003
133	NC_015676	ATTG	2	8	53751	53758	25 %	50 %	25 %	0 %	336476003
134	NC_015676	CATG	2	8	53877	53884	25 %	25 %	25 %	25 %	336476003
135	NC_015676	CTGG	2	8	53931	53938	0 %	25 %	50 %	25 %	336476003
136	NC_015676	GGCA	2	8	53964	53971	25 %	0 %	50 %	25 %	336476003
137	NC_015676	TCAT	2	8	54157	54164	25 %	50 %	0 %	25 %	336476004
138	NC_015676	ATAG	2	8	54356	54363	50 %	25 %	25 %	0 %	336476004
139	NC_015676	TGAT	2	8	54932	54939	25 %	50 %	25 %	0 %	336476005
140	NC_015676	CATG	2	8	55200	55207	25 %	25 %	25 %	25 %	336476006
141	NC_015676	TTCA	2	8	55535	55542	25 %	50 %	0 %	25 %	336476006
142	NC_015676	ATGA	2	8	55617	55624	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015676	TAAA	2	8	55627	55634	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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