MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Methanosalsum zhilinae DSM 4017 chromosome

Total Repeats: 27146

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015676	TAA	2	6	69	74	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015676	TGC	2	6	178	183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_015676	CAG	2	6	191	196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_015676	ATG	2	6	199	204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015676	TAA	2	6	229	234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015676	AAG	2	6	327	332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336475960
7	NC_015676	CCT	2	6	342	347	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336475960
8	NC_015676	TGA	2	6	373	378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336475960
9	NC_015676	CTT	2	6	584	589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336475960
10	NC_015676	GTT	2	6	692	697	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336475960
11	NC_015676	ATT	2	6	698	703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336475960
12	NC_015676	TGA	2	6	739	744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336475960
13	NC_015676	GAG	2	6	869	874	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336475960
14	NC_015676	ATG	2	6	894	899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336475960
15	NC_015676	AAG	2	6	1018	1023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336475960
16	NC_015676	GTT	2	6	1133	1138	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336475960
17	NC_015676	ACA	2	6	1223	1228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336475960
18	NC_015676	ATA	2	6	1263	1268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336475960
19	NC_015676	TGT	3	9	1345	1353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336475960
20	NC_015676	GAT	2	6	1430	1435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336475960
21	NC_015676	CTC	2	6	1581	1586	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336475961
22	NC_015676	CTG	2	6	1617	1622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336475961
23	NC_015676	AGG	2	6	1683	1688	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336475961
24	NC_015676	TCC	2	6	1689	1694	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336475961
25	NC_015676	CTT	2	6	1712	1717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336475961
26	NC_015676	TAT	2	6	1740	1745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336475961
27	NC_015676	AAC	2	6	1920	1925	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336475961
28	NC_015676	TAA	2	6	2110	2115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015676	TAT	3	9	2145	2153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015676	ATA	2	6	2192	2197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015676	ATG	2	6	2230	2235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336475962
32	NC_015676	TTG	2	6	2248	2253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336475962
33	NC_015676	GAT	2	6	2288	2293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336475962
34	NC_015676	TGA	2	6	2345	2350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336475962
35	NC_015676	ATG	2	6	2428	2433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336475962
36	NC_015676	AAG	2	6	2633	2638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336475962
37	NC_015676	TAT	2	6	2720	2725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336475962
38	NC_015676	ACA	3	9	2748	2756	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336475962
39	NC_015676	GGA	2	6	2780	2785	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336475962
40	NC_015676	TCT	2	6	3113	3118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336475962
41	NC_015676	ATG	2	6	3271	3276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336475962
42	NC_015676	TTG	2	6	3349	3354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336475962
43	NC_015676	TGA	2	6	3416	3421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336475962
44	NC_015676	TGG	2	6	3424	3429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336475962
45	NC_015676	CAA	2	6	3460	3465	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336475962
46	NC_015676	ATG	2	6	3480	3485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336475962
47	NC_015676	GGC	2	6	3490	3495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336475962
48	NC_015676	GAA	2	6	3539	3544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336475962
49	NC_015676	TGG	2	6	3715	3720	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336475962
50	NC_015676	CAG	2	6	3893	3898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336475963
51	NC_015676	TCA	2	6	3978	3983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336475963
52	NC_015676	ATG	2	6	4006	4011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336475963
53	NC_015676	TGC	2	6	4191	4196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336475963
54	NC_015676	TTG	2	6	4244	4249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336475963
55	NC_015676	ATC	2	6	4395	4400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336475963
56	NC_015676	GAA	2	6	4442	4447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336475963
57	NC_015676	TCT	2	6	4521	4526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336475963
58	NC_015676	TTG	2	6	4547	4552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336475963
59	NC_015676	ATG	2	6	4619	4624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336475963
60	NC_015676	ATA	2	6	4672	4677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336475963
61	NC_015676	GAT	2	6	4678	4683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336475963
62	NC_015676	ATT	2	6	4859	4864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015676	CAT	2	6	4936	4941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_015676	AAC	2	6	4995	5000	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336475964
65	NC_015676	AAG	2	6	5009	5014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336475964
66	NC_015676	CCA	2	6	5048	5053	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336475964
67	NC_015676	TGT	2	6	5071	5076	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336475964
68	NC_015676	AAG	2	6	5131	5136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336475964
69	NC_015676	AAT	2	6	5206	5211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336475964
70	NC_015676	ACA	2	6	5261	5266	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336475964
71	NC_015676	ATT	2	6	5288	5293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336475964
72	NC_015676	TTG	2	6	5412	5417	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336475964
73	NC_015676	AGG	2	6	5476	5481	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336475964
74	NC_015676	CAG	2	6	5501	5506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336475964
75	NC_015676	AAG	2	6	5537	5542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336475964
76	NC_015676	GCT	2	6	5552	5557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336475964
77	NC_015676	AGG	2	6	5608	5613	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336475964
78	NC_015676	GAA	2	6	5630	5635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336475964
79	NC_015676	CAT	2	6	5657	5662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336475964
80	NC_015676	TGA	2	6	5707	5712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336475964
81	NC_015676	GAA	2	6	5774	5779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336475964
82	NC_015676	AGC	2	6	5830	5835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336475964
83	NC_015676	AAG	2	6	5954	5959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336475964
84	NC_015676	GAA	2	6	6134	6139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336475964
85	NC_015676	GGA	2	6	6164	6169	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336475964
86	NC_015676	TTC	2	6	6339	6344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336475965
87	NC_015676	CTG	2	6	6368	6373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336475965
88	NC_015676	AGA	2	6	6401	6406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336475965
89	NC_015676	AAT	2	6	6450	6455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336475965
90	NC_015676	TGG	2	6	6543	6548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336475965
91	NC_015676	ATG	2	6	6677	6682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336475965
92	NC_015676	ATT	2	6	6692	6697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336475965
93	NC_015676	GAA	2	6	6768	6773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336475965
94	NC_015676	TTG	2	6	6869	6874	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336475965
95	NC_015676	ATT	2	6	7024	7029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336475965
96	NC_015676	ACC	2	6	7150	7155	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336475965
97	NC_015676	TCC	2	6	7237	7242	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336475965
98	NC_015676	ATC	2	6	7264	7269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336475965
99	NC_015676	AGA	2	6	7336	7341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336475965
100	NC_015676	CAG	2	6	7355	7360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336475965
101	NC_015676	CTG	2	6	7366	7371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336475965
102	NC_015676	AGA	2	6	7611	7616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336475965
103	NC_015676	AGA	2	6	7824	7829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336475965
104	NC_015676	ATA	2	6	7982	7987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336475966
105	NC_015676	CTG	2	6	8033	8038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336475966
106	NC_015676	ATC	2	6	8113	8118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336475966
107	NC_015676	ATA	2	6	8125	8130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336475966
108	NC_015676	TCT	2	6	8180	8185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336475966
109	NC_015676	CGA	2	6	8199	8204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336475966
110	NC_015676	CTG	2	6	8230	8235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336475966
111	NC_015676	ATT	2	6	8312	8317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336475966
112	NC_015676	GTT	2	6	8359	8364	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336475966
113	NC_015676	CCA	2	6	8420	8425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336475966
114	NC_015676	ATT	2	6	8428	8433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336475966
115	NC_015676	ATC	2	6	8440	8445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336475966
116	NC_015676	GCG	2	6	8452	8457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336475966
117	NC_015676	ATC	2	6	8474	8479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336475966
118	NC_015676	GAT	2	6	8495	8500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015676	TAT	2	6	8543	8548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015676	ACT	2	6	8628	8633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_015676	ATT	2	6	8634	8639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015676	TTG	2	6	8664	8669	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015676	TAA	2	6	8703	8708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336475967
124	NC_015676	AAT	2	6	8774	8779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336475967
125	NC_015676	GCA	2	6	8869	8874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336475967
126	NC_015676	CAT	2	6	8913	8918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336475967
127	NC_015676	TAT	2	6	9024	9029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336475967
128	NC_015676	TGT	2	6	9058	9063	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336475967
129	NC_015676	TGC	2	6	9078	9083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336475967
130	NC_015676	TGT	2	6	9191	9196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336475967
131	NC_015676	TCT	2	6	9235	9240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336475967
132	NC_015676	CTT	2	6	9275	9280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336475967
133	NC_015676	ATT	2	6	9328	9333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336475967
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253	NC_015676	CAT	2	6	20394	20399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336475978
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257	NC_015676	ACA	2	6	20717	20722	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336475978
258	NC_015676	GTG	2	6	20734	20739	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336475978
259	NC_015676	ATG	2	6	20768	20773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336475978
260	NC_015676	CAA	2	6	20814	20819	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336475978
261	NC_015676	TAA	2	6	20832	20837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336475978
262	NC_015676	CAA	2	6	20841	20846	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336475978
263	NC_015676	TGT	2	6	20850	20855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336475978
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265	NC_015676	TCA	2	6	21062	21067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336475978
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330	NC_015676	ATT	2	6	25195	25200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
331	NC_015676	AAT	2	6	25203	25208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
332	NC_015676	TAT	2	6	25211	25216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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352	NC_015676	GTG	2	6	27352	27357	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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354	NC_015676	AAT	2	6	27574	27579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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384	NC_015676	TCC	2	6	30060	30065	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336475988
385	NC_015676	TTA	2	6	30146	30151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336475988
386	NC_015676	TCA	2	6	30187	30192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336475988
387	NC_015676	CAA	2	6	30584	30589	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336475988
388	NC_015676	TGC	2	6	30605	30610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336475988
389	NC_015676	GGC	2	6	30626	30631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336475988
390	NC_015676	TGA	2	6	30788	30793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336475988
391	NC_015676	CTG	2	6	30795	30800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336475988
392	NC_015676	AGG	2	6	30867	30872	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336475988
393	NC_015676	ATC	2	6	30946	30951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336475988
394	NC_015676	AGT	2	6	31015	31020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336475988
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397	NC_015676	CTG	2	6	31454	31459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336475988
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399	NC_015676	CAT	2	6	31536	31541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336475988
400	NC_015676	AGG	2	6	31575	31580	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336475988
401	NC_015676	TGG	2	6	31588	31593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336475988
402	NC_015676	ATC	2	6	31611	31616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336475988
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405	NC_015676	AAC	2	6	31923	31928	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336475989
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443	NC_015676	AAT	2	6	34824	34829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336475991
444	NC_015676	CAG	2	6	34843	34848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336475991
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452	NC_015676	CGG	2	6	35613	35618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336475991
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457	NC_015676	ATG	2	6	36017	36022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336475991
458	NC_015676	ATT	2	6	36059	36064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336475991
459	NC_015676	ATG	2	6	36171	36176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
460	NC_015676	ACC	2	6	36346	36351	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336475992
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462	NC_015676	ATC	2	6	36577	36582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336475992
463	NC_015676	CAT	2	6	36597	36602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336475992
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466	NC_015676	TCA	2	6	36910	36915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336475993
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480	NC_015676	ATG	2	6	37926	37931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336475994
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484	NC_015676	CAA	2	6	38278	38283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336475994
485	NC_015676	TTG	2	6	38290	38295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336475994
486	NC_015676	AGA	2	6	38667	38672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336475994
487	NC_015676	CTT	2	6	38770	38775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336475994
488	NC_015676	CAG	2	6	38917	38922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336475994
489	NC_015676	GGT	2	6	39077	39082	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
490	NC_015676	ATC	2	6	39163	39168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
491	NC_015676	GTT	2	6	39324	39329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
492	NC_015676	TGG	2	6	39456	39461	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
493	NC_015676	TAT	2	6	39465	39470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
494	NC_015676	CCA	2	6	39551	39556	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
495	NC_015676	TAA	2	6	39563	39568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
496	NC_015676	CAA	2	6	39589	39594	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
497	NC_015676	TTC	2	6	39672	39677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
498	NC_015676	GTA	2	6	39837	39842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
499	NC_015676	CGA	2	6	39866	39871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
500	NC_015676	GCA	2	6	39940	39945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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