MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Methanosalsum zhilinae DSM 4017 chromosome

Total Repeats: 3515

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015676	TAA	2	6	69	74	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015676	TGC	2	6	178	183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_015676	CAG	2	6	191	196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_015676	ATG	2	6	199	204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015676	TAA	2	6	229	234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015676	TAA	2	6	2110	2115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015676	TAT	3	9	2145	2153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015676	ATA	2	6	2192	2197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015676	ATT	2	6	4859	4864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015676	CAT	2	6	4936	4941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_015676	GAT	2	6	8495	8500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015676	TAT	2	6	8543	8548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015676	ACT	2	6	8628	8633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_015676	ATT	2	6	8634	8639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015676	TTG	2	6	8664	8669	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015676	TCC	2	6	10026	10031	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_015676	TAA	2	6	11294	11299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015676	GGA	2	6	11366	11371	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015676	TAA	2	6	13532	13537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015676	AAT	2	6	14679	14684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015676	GTT	2	6	15734	15739	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015676	AAT	2	6	15811	15816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015676	AAT	2	6	18214	18219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015676	TCC	2	6	21186	21191	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_015676	ATA	2	6	22262	22267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015676	TAA	2	6	23086	23091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015676	ACT	2	6	23783	23788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_015676	ATA	2	6	23804	23809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015676	CTT	2	6	23836	23841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_015676	TGT	2	6	23867	23872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015676	CTG	2	6	25063	25068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_015676	CAT	2	6	25083	25088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_015676	ATG	2	6	25117	25122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015676	ATT	2	6	25195	25200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015676	AAT	2	6	25203	25208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015676	TAT	2	6	25211	25216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015676	ATT	2	6	27004	27009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015676	TTA	2	6	27034	27039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015676	TAA	2	6	27094	27099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015676	ATA	2	6	27111	27116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015676	ACA	2	6	27180	27185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_015676	TAA	2	6	27205	27210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015676	AGT	2	6	27342	27347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015676	GTG	2	6	27352	27357	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015676	CTG	2	6	27479	27484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_015676	AAT	2	6	27574	27579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015676	ATT	2	6	29014	29019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015676	ATC	2	6	29021	29026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_015676	TAA	2	6	29032	29037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015676	GGA	2	6	29068	29073	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015676	TAA	2	6	29087	29092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015676	AAC	2	6	29128	29133	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_015676	ATG	2	6	31900	31905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015676	ATG	2	6	36171	36176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015676	GGT	2	6	39077	39082	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015676	ATC	2	6	39163	39168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_015676	GTT	2	6	39324	39329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015676	TGG	2	6	39456	39461	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015676	TAT	2	6	39465	39470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015676	CCA	2	6	39551	39556	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_015676	TAA	2	6	39563	39568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015676	CAA	2	6	39589	39594	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_015676	TTC	2	6	39672	39677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_015676	GTA	2	6	39837	39842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015676	CGA	2	6	39866	39871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_015676	GCA	2	6	39940	39945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_015676	GCC	2	6	40068	40073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_015676	CGG	2	6	40084	40089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_015676	GTG	2	6	40095	40100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015676	TAT	2	6	40106	40111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015676	ACC	2	6	40263	40268	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_015676	GAG	2	6	40591	40596	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015676	CGT	2	6	40606	40611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_015676	TTC	2	6	40682	40687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_015676	ATG	2	6	40691	40696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015676	CCG	2	6	40712	40717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_015676	GGA	2	6	40728	40733	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015676	GTA	2	6	40898	40903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015676	ACC	2	6	40964	40969	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_015676	CCT	2	6	41080	41085	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_015676	CCA	2	6	41097	41102	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_015676	AGG	2	6	41164	41169	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015676	GAA	2	6	41439	41444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015676	TAG	2	6	41578	41583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015676	TAG	2	6	41880	41885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015676	TTG	2	6	42016	42021	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015676	GAA	2	6	42044	42049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015676	GGA	2	6	42233	42238	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015676	CGT	2	6	42436	42441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_015676	ACT	2	6	42462	42467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_015676	AGC	2	6	42589	42594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_015676	ACC	2	6	42667	42672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_015676	CCG	2	6	42809	42814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_015676	AAC	2	6	42927	42932	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_015676	AGC	2	6	42958	42963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_015676	GTC	2	6	42964	42969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_015676	CTG	2	6	43194	43199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_015676	CAG	2	6	43206	43211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_015676	TAA	2	6	43241	43246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015676	AAG	2	6	43333	43338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015676	CGG	2	6	43349	43354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_015676	GTA	2	6	43382	43387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015676	CCA	2	6	43607	43612	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_015676	GAG	2	6	43653	43658	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015676	CCG	2	6	43750	43755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_015676	GCA	3	9	43968	43976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_015676	GTT	2	6	43989	43994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015676	CGT	2	6	44030	44035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_015676	CTA	2	6	44055	44060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_015676	AAG	2	6	44068	44073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015676	AGC	2	6	44156	44161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_015676	CTG	2	6	44319	44324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_015676	GGC	2	6	44587	44592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_015676	AGA	2	6	44631	44636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015676	GAT	2	6	44764	44769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015676	AAT	2	6	44770	44775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015676	ATT	2	6	44905	44910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015676	ACA	2	6	46361	46366	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_015676	TTA	2	6	46382	46387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015676	ATT	2	6	47385	47390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015676	ATC	2	6	47789	47794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_015676	TCA	2	6	48136	48141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_015676	ATA	2	6	49433	49438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015676	TAT	2	6	50745	50750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015676	CAG	2	6	52648	52653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_015676	ACG	2	6	52697	52702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_015676	AGA	2	6	56301	56306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015676	AAT	2	6	59867	59872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015676	CCA	2	6	59892	59897	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_015676	CTG	2	6	62226	62231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_015676	ATT	2	6	62234	62239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015676	CTG	2	6	62926	62931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_015676	AAT	2	6	63690	63695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015676	ATA	2	6	63702	63707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015676	AAT	2	6	64299	64304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015676	ATT	2	6	66469	66474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015676	TAA	2	6	68222	68227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015676	ATA	2	6	68242	68247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015676	AGT	2	6	75273	75278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015676	TGA	2	6	75339	75344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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