MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Methanosalsum zhilinae DSM 4017 chromosome

Total Repeats: 23631

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015676	AAG	2	6	327	332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336475960
2	NC_015676	CCT	2	6	342	347	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336475960
3	NC_015676	TGA	2	6	373	378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336475960
4	NC_015676	CTT	2	6	584	589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336475960
5	NC_015676	GTT	2	6	692	697	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336475960
6	NC_015676	ATT	2	6	698	703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336475960
7	NC_015676	TGA	2	6	739	744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336475960
8	NC_015676	GAG	2	6	869	874	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336475960
9	NC_015676	ATG	2	6	894	899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336475960
10	NC_015676	AAG	2	6	1018	1023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336475960
11	NC_015676	GTT	2	6	1133	1138	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336475960
12	NC_015676	ACA	2	6	1223	1228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336475960
13	NC_015676	ATA	2	6	1263	1268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336475960
14	NC_015676	TGT	3	9	1345	1353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336475960
15	NC_015676	GAT	2	6	1430	1435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336475960
16	NC_015676	CTC	2	6	1581	1586	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336475961
17	NC_015676	CTG	2	6	1617	1622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336475961
18	NC_015676	AGG	2	6	1683	1688	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336475961
19	NC_015676	TCC	2	6	1689	1694	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336475961
20	NC_015676	CTT	2	6	1712	1717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336475961
21	NC_015676	TAT	2	6	1740	1745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336475961
22	NC_015676	AAC	2	6	1920	1925	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336475961
23	NC_015676	ATG	2	6	2230	2235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336475962
24	NC_015676	TTG	2	6	2248	2253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336475962
25	NC_015676	GAT	2	6	2288	2293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336475962
26	NC_015676	TGA	2	6	2345	2350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336475962
27	NC_015676	ATG	2	6	2428	2433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336475962
28	NC_015676	AAG	2	6	2633	2638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336475962
29	NC_015676	TAT	2	6	2720	2725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336475962
30	NC_015676	ACA	3	9	2748	2756	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336475962
31	NC_015676	GGA	2	6	2780	2785	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336475962
32	NC_015676	TCT	2	6	3113	3118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336475962
33	NC_015676	ATG	2	6	3271	3276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336475962
34	NC_015676	TTG	2	6	3349	3354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336475962
35	NC_015676	TGA	2	6	3416	3421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336475962
36	NC_015676	TGG	2	6	3424	3429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336475962
37	NC_015676	CAA	2	6	3460	3465	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336475962
38	NC_015676	ATG	2	6	3480	3485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336475962
39	NC_015676	GGC	2	6	3490	3495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336475962
40	NC_015676	GAA	2	6	3539	3544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336475962
41	NC_015676	TGG	2	6	3715	3720	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336475962
42	NC_015676	CAG	2	6	3893	3898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336475963
43	NC_015676	TCA	2	6	3978	3983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336475963
44	NC_015676	ATG	2	6	4006	4011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336475963
45	NC_015676	TGC	2	6	4191	4196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336475963
46	NC_015676	TTG	2	6	4244	4249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336475963
47	NC_015676	ATC	2	6	4395	4400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336475963
48	NC_015676	GAA	2	6	4442	4447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336475963
49	NC_015676	TCT	2	6	4521	4526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336475963
50	NC_015676	TTG	2	6	4547	4552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336475963
51	NC_015676	ATG	2	6	4619	4624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336475963
52	NC_015676	ATA	2	6	4672	4677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336475963
53	NC_015676	GAT	2	6	4678	4683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336475963
54	NC_015676	AAC	2	6	4995	5000	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336475964
55	NC_015676	AAG	2	6	5009	5014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336475964
56	NC_015676	CCA	2	6	5048	5053	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336475964
57	NC_015676	TGT	2	6	5071	5076	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336475964
58	NC_015676	AAG	2	6	5131	5136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336475964
59	NC_015676	AAT	2	6	5206	5211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336475964
60	NC_015676	ACA	2	6	5261	5266	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336475964
61	NC_015676	ATT	2	6	5288	5293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336475964
62	NC_015676	TTG	2	6	5412	5417	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336475964
63	NC_015676	AGG	2	6	5476	5481	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336475964
64	NC_015676	CAG	2	6	5501	5506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336475964
65	NC_015676	AAG	2	6	5537	5542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336475964
66	NC_015676	GCT	2	6	5552	5557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336475964
67	NC_015676	AGG	2	6	5608	5613	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336475964
68	NC_015676	GAA	2	6	5630	5635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336475964
69	NC_015676	CAT	2	6	5657	5662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336475964
70	NC_015676	TGA	2	6	5707	5712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336475964
71	NC_015676	GAA	2	6	5774	5779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336475964
72	NC_015676	AGC	2	6	5830	5835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336475964
73	NC_015676	AAG	2	6	5954	5959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336475964
74	NC_015676	GAA	2	6	6134	6139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336475964
75	NC_015676	GGA	2	6	6164	6169	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336475964
76	NC_015676	TTC	2	6	6339	6344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336475965
77	NC_015676	CTG	2	6	6368	6373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336475965
78	NC_015676	AGA	2	6	6401	6406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336475965
79	NC_015676	AAT	2	6	6450	6455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336475965
80	NC_015676	TGG	2	6	6543	6548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336475965
81	NC_015676	ATG	2	6	6677	6682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336475965
82	NC_015676	ATT	2	6	6692	6697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336475965
83	NC_015676	GAA	2	6	6768	6773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336475965
84	NC_015676	TTG	2	6	6869	6874	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336475965
85	NC_015676	ATT	2	6	7024	7029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336475965
86	NC_015676	ACC	2	6	7150	7155	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336475965
87	NC_015676	TCC	2	6	7237	7242	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336475965
88	NC_015676	ATC	2	6	7264	7269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336475965
89	NC_015676	AGA	2	6	7336	7341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336475965
90	NC_015676	CAG	2	6	7355	7360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336475965
91	NC_015676	CTG	2	6	7366	7371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336475965
92	NC_015676	AGA	2	6	7611	7616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336475965
93	NC_015676	AGA	2	6	7824	7829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336475965
94	NC_015676	ATA	2	6	7982	7987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336475966
95	NC_015676	CTG	2	6	8033	8038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336475966
96	NC_015676	ATC	2	6	8113	8118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336475966
97	NC_015676	ATA	2	6	8125	8130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336475966
98	NC_015676	TCT	2	6	8180	8185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336475966
99	NC_015676	CGA	2	6	8199	8204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336475966
100	NC_015676	CTG	2	6	8230	8235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336475966
101	NC_015676	ATT	2	6	8312	8317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336475966
102	NC_015676	GTT	2	6	8359	8364	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336475966
103	NC_015676	CCA	2	6	8420	8425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336475966
104	NC_015676	ATT	2	6	8428	8433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336475966
105	NC_015676	ATC	2	6	8440	8445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336475966
106	NC_015676	GCG	2	6	8452	8457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336475966
107	NC_015676	ATC	2	6	8474	8479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336475966
108	NC_015676	TAA	2	6	8703	8708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336475967
109	NC_015676	AAT	2	6	8774	8779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336475967
110	NC_015676	GCA	2	6	8869	8874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336475967
111	NC_015676	CAT	2	6	8913	8918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336475967
112	NC_015676	TAT	2	6	9024	9029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336475967
113	NC_015676	TGT	2	6	9058	9063	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336475967
114	NC_015676	TGC	2	6	9078	9083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336475967
115	NC_015676	TGT	2	6	9191	9196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336475967
116	NC_015676	TCT	2	6	9235	9240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336475967
117	NC_015676	CTT	2	6	9275	9280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336475967
118	NC_015676	ATT	2	6	9328	9333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336475967
119	NC_015676	CAC	2	6	9405	9410	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336475967
120	NC_015676	CCA	2	6	9463	9468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336475967
121	NC_015676	TGT	2	6	9543	9548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336475967
122	NC_015676	ATC	2	6	9550	9555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336475967
123	NC_015676	ACC	3	9	9603	9611	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336475967
124	NC_015676	CAG	2	6	9827	9832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336475967
125	NC_015676	ATT	2	6	9858	9863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336475967
126	NC_015676	TTC	2	6	10131	10136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336475968
127	NC_015676	ATG	2	6	10183	10188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336475968
128	NC_015676	TGG	2	6	10277	10282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336475968
129	NC_015676	AAT	2	6	10466	10471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336475968
130	NC_015676	CAG	2	6	10604	10609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336475968
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255	NC_015676	ATT	2	6	21995	22000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336475979
256	NC_015676	GTG	3	9	22001	22009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336475979
257	NC_015676	ACA	2	6	22022	22027	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336475979
258	NC_015676	TGC	2	6	22113	22118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336475979
259	NC_015676	TCT	2	6	22190	22195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336475979
260	NC_015676	CAA	2	6	22330	22335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336475980
261	NC_015676	TAT	2	6	22369	22374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336475980
262	NC_015676	CCT	2	6	22396	22401	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336475980
263	NC_015676	AGG	2	6	22415	22420	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336475980
264	NC_015676	TAT	2	6	22523	22528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336475980
265	NC_015676	TAC	2	6	22571	22576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336475980
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271	NC_015676	ATA	2	6	23046	23051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336475980
272	NC_015676	CAT	2	6	23157	23162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336475981
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275	NC_015676	CTT	2	6	23365	23370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336475981
276	NC_015676	TAA	2	6	23429	23434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336475981
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279	NC_015676	CAT	2	6	23640	23645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336475981
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283	NC_015676	CAA	2	6	24195	24200	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336475982
284	NC_015676	GTT	2	6	24301	24306	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336475982
285	NC_015676	TCT	2	6	24354	24359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336475982
286	NC_015676	CTG	2	6	24407	24412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336475982
287	NC_015676	TCA	2	6	24572	24577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336475982
288	NC_015676	TTA	2	6	24593	24598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336475982
289	NC_015676	CTT	2	6	24630	24635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336475982
290	NC_015676	ATC	2	6	24703	24708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336475982
291	NC_015676	CAT	2	6	24777	24782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336475982
292	NC_015676	CTG	2	6	24797	24802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336475982
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