MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Mesorhizobium opportunistum WSM2075 chromosome

Total Repeats: 279

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015675	ATGAGG	2	12	148567	148578	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015675	CGAAAG	2	12	332903	332914	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_015675	CCTTTG	2	12	333475	333486	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_015675	TTCCGA	2	12	343816	343827	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_015675	CCAAAG	2	12	409976	409987	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_015675	GCGAAA	2	12	479539	479550	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_015675	GGAGCG	2	12	569697	569708	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_015675	GAAACG	2	12	586188	586199	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_015675	CGCGGC	2	12	654395	654406	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_015675	CCGTCA	2	12	727796	727807	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
11	NC_015675	GCGCCA	2	12	762949	762960	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
12	NC_015675	TTTTGA	2	12	774085	774096	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015675	GCGGAA	2	12	785962	785973	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_015675	CCCTGT	2	12	863826	863837	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
15	NC_015675	GCAAGC	2	12	885673	885684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_015675	GCTGCG	2	12	891045	891056	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_015675	CGGCCA	2	12	902378	902389	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
18	NC_015675	GCGGGA	2	12	902774	902785	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_015675	CCTTTT	2	12	914945	914956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_015675	GGAGCG	2	12	919266	919277	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_015675	CTTGGC	2	12	949220	949231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_015675	GATGGT	2	12	999107	999118	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015675	GGTTCG	2	12	1030576	1030587	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_015675	AAGCAA	2	12	1030621	1030632	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_015675	CCAAAA	2	12	1030636	1030647	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_015675	GCCGGA	2	12	1084280	1084291	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_015675	GCTGGT	2	12	1084304	1084315	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_015675	TGCGCT	2	12	1096640	1096651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_015675	AAGGTC	2	12	1133560	1133571	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_015675	ACCTCA	2	12	1133690	1133701	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_015675	AACGCC	2	12	1222862	1222873	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
32	NC_015675	CGAGGC	2	12	1233005	1233016	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_015675	GTCCGG	2	12	1284210	1284221	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_015675	GCCAGG	2	12	1284269	1284280	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_015675	GAACGC	2	12	1285184	1285195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_015675	GGCGAA	2	12	1307532	1307543	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_015675	CGGTCG	2	12	1309381	1309392	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_015675	TGCCGC	2	12	1346701	1346712	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
39	NC_015675	CGTGTT	2	12	1407826	1407837	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_015675	AATTGA	2	12	1415654	1415665	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015675	GGGCGG	2	12	1434005	1434016	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_015675	TTAGCG	2	12	1466704	1466715	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_015675	AAGTGG	2	12	1473301	1473312	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015675	GCCGGC	2	12	1482896	1482907	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_015675	TTTTGG	2	12	1523856	1523867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015675	TTCGCA	2	12	1525585	1525596	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_015675	ATGCTT	2	12	1564376	1564387	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_015675	GTCCGC	2	12	1702590	1702601	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
49	NC_015675	TCCGGG	2	12	1732702	1732713	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_015675	TCCGGG	2	12	1740461	1740472	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_015675	TCGTTT	2	12	1876756	1876767	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_015675	CTCCCG	2	12	1912318	1912329	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_015675	TGCCCG	2	12	1914725	1914736	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
54	NC_015675	GTACGT	2	12	1938282	1938293	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_015675	ACGAGG	2	12	1988936	1988947	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_015675	TAAAGT	2	12	1994542	1994553	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015675	GAGCCC	2	12	2052844	2052855	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
58	NC_015675	TCATCG	2	12	2059171	2059182	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_015675	CAAAAA	2	12	2145341	2145352	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_015675	CAAGAT	2	12	2168619	2168630	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_015675	CAAATG	2	12	2172156	2172167	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_015675	GCGACA	2	12	2263904	2263915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_015675	GTCGCG	2	12	2266322	2266333	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_015675	GGTTCG	2	12	2296603	2296614	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_015675	ATGCGG	2	12	2372580	2372591	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_015675	CCACGG	2	12	2405552	2405563	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
67	NC_015675	GAGAAG	2	12	2429335	2429346	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015675	ATGTCG	2	12	2448658	2448669	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_015675	GCCACC	2	12	2486880	2486891	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_015675	TCATGG	2	12	2536422	2536433	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_015675	TTCAGT	2	12	2536689	2536700	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_015675	ACCCGC	2	12	2539375	2539386	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_015675	GTTCGC	2	12	2546789	2546800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_015675	CCGCGC	2	12	2559805	2559816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_015675	CCAATA	2	12	2566733	2566744	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_015675	CTTTCC	2	12	2570156	2570167	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_015675	AGGCAT	2	12	2579828	2579839	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_015675	GATGGC	2	12	2639596	2639607	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_015675	GCCGCT	2	12	2663172	2663183	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
80	NC_015675	TTCGGC	2	12	2757694	2757705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_015675	TCTCGA	2	12	2847678	2847689	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_015675	GCGTTC	2	12	2847782	2847793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_015675	AGCCGC	2	12	2850513	2850524	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
84	NC_015675	CACCGA	2	12	2861566	2861577	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
85	NC_015675	GCGTCG	2	12	2863326	2863337	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_015675	GTTCCT	2	12	2878049	2878060	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_015675	TTATCC	2	12	2910783	2910794	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_015675	CAGCAC	2	12	2959413	2959424	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
89	NC_015675	GGTGCG	2	12	3062625	3062636	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_015675	TGGATC	2	12	3096388	3096399	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_015675	CATTTC	2	12	3102158	3102169	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_015675	CCCCGT	2	12	3106690	3106701	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_015675	TCCCCC	2	12	3210982	3210993	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
94	NC_015675	AGGAAC	2	12	3264281	3264292	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_015675	GCCAGT	2	12	3269242	3269253	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_015675	TCTCGT	2	12	3269643	3269654	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_015675	CTTTTG	2	12	3273001	3273012	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_015675	GCGCCG	2	12	3333545	3333556	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
99	NC_015675	TCGCAG	2	12	3348728	3348739	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_015675	CCAGCA	2	12	3348804	3348815	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
101	NC_015675	TGGGAT	2	12	3375996	3376007	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015675	CAGTTC	2	12	3404203	3404214	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_015675	TTCAAA	2	12	3419978	3419989	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_015675	CGCGGG	2	12	3447402	3447413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_015675	TGGCTT	2	12	3450201	3450212	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_015675	GCCGGT	2	12	3602073	3602084	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_015675	AACGTG	2	12	3632076	3632087	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_015675	TGCATC	2	12	3765163	3765174	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_015675	ACGCGC	2	12	3839600	3839611	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
110	NC_015675	GCGACG	2	12	3840593	3840604	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_015675	TCGGTG	2	12	3841195	3841206	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_015675	TGGAGT	2	12	3892020	3892031	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015675	TCGACA	2	12	3892340	3892351	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_015675	CGAAGC	2	12	3929657	3929668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_015675	ACATGT	2	12	4077142	4077153	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_015675	GAAGGC	2	12	4154405	4154416	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_015675	GCGCTA	2	12	4241891	4241902	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_015675	CGGCTG	2	12	4241941	4241952	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_015675	ATGCCG	2	12	4247613	4247624	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_015675	CGCCGG	2	12	4249953	4249964	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
121	NC_015675	GAGTTC	2	12	4270759	4270770	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_015675	CTTGGA	2	12	4320139	4320150	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_015675	AAAACG	2	12	4326367	4326378	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_015675	GGCAAA	2	12	4391195	4391206	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_015675	GCCAGA	2	12	4411528	4411539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_015675	AAACCG	2	12	4414408	4414419	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_015675	AAACCG	2	12	4414431	4414442	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_015675	AAACCG	2	12	4414454	4414465	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_015675	TCCGCG	2	12	4452201	4452212	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
130	NC_015675	TCATTA	2	12	4464024	4464035	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_015675	ACCCGG	2	12	4501714	4501725	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
132	NC_015675	GCCCGA	2	12	4509661	4509672	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
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134	NC_015675	TTGGTG	2	12	4527578	4527589	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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154	NC_015675	GAAAAA	2	12	4978887	4978898	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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231	NC_015675	CGGCGT	2	12	6468945	6468956	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
232	NC_015675	CTCAGA	2	12	6473474	6473485	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
233	NC_015675	GCTTTG	2	12	6478764	6478775	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
234	NC_015675	TGGCCA	2	12	6478996	6479007	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
235	NC_015675	TGAATG	2	12	6479022	6479033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
236	NC_015675	CGACCA	2	12	6479057	6479068	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
237	NC_015675	GATAAT	2	12	6483394	6483405	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
238	NC_015675	CTTTTT	2	12	6505258	6505269	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
239	NC_015675	ATTCGG	2	12	6505377	6505388	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
240	NC_015675	GCTCGA	2	12	6510614	6510625	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
241	NC_015675	CTTCCG	2	12	6510845	6510856	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
242	NC_015675	CAAAGC	2	12	6526659	6526670	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
243	NC_015675	GCCATC	2	12	6528661	6528672	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
244	NC_015675	CCGAGG	2	12	6534503	6534514	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
245	NC_015675	GTCTTC	2	12	6538315	6538326	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
246	NC_015675	CAAGGA	2	12	6539559	6539570	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
247	NC_015675	TGGCGC	2	12	6540877	6540888	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
248	NC_015675	CGATGG	2	12	6541923	6541934	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
249	NC_015675	ACGCCG	2	12	6545290	6545301	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
250	NC_015675	GGCTGG	2	12	6551054	6551065	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
251	NC_015675	CTTACC	2	12	6554806	6554817	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
252	NC_015675	TGACCC	2	12	6559795	6559806	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
253	NC_015675	TTGCGC	2	12	6596635	6596646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
254	NC_015675	CTCGAT	2	12	6600467	6600478	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
255	NC_015675	GATCGG	2	12	6600535	6600546	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
256	NC_015675	CGATCG	2	12	6601200	6601211	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
257	NC_015675	CTGCCG	2	12	6628101	6628112	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
258	NC_015675	GAGCCA	2	12	6642473	6642484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
259	NC_015675	GCTCAA	2	12	6646950	6646961	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
260	NC_015675	GTTGCC	2	12	6661902	6661913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
261	NC_015675	AAGCCG	2	12	6662444	6662455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
262	NC_015675	AGGAGA	2	12	6667639	6667650	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
263	NC_015675	CAAGCA	2	12	6671910	6671921	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
264	NC_015675	ATCACC	2	12	6679471	6679482	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
265	NC_015675	CGAGCG	2	12	6687719	6687730	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
266	NC_015675	GCGTTC	2	12	6687930	6687941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
267	NC_015675	ATCGAT	2	12	6688089	6688100	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
268	NC_015675	CCGATG	2	12	6688422	6688433	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
269	NC_015675	CTGCAA	2	12	6756726	6756737	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
270	NC_015675	AGGTTG	2	12	6760509	6760520	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
271	NC_015675	AAAGCC	2	12	6762115	6762126	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
272	NC_015675	CGAGGC	2	12	6765469	6765480	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
273	NC_015675	CGCAGT	12	72	6775692	6775763	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
274	NC_015675	GGGGTG	2	12	6783966	6783977	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
275	NC_015675	TCCGGT	2	12	6835403	6835414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
276	NC_015675	AGGGGG	2	12	6844678	6844689	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
277	NC_015675	TTTACG	2	12	6847393	6847404	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
278	NC_015675	AAGGGC	2	12	6877662	6877673	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
279	NC_015675	GCCGTT	2	12	6880746	6880757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.