MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Mesorhizobium opportunistum WSM2075 chromosome

Total Repeats: 5424

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015675	CCGGC	2	10	134	143	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
2	NC_015675	GTTTG	2	10	395	404	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015675	ACCAC	2	10	2107	2116	40 %	0 %	0 %	60 %	337264538
4	NC_015675	TGCAC	2	10	3937	3946	20 %	20 %	20 %	40 %	337264540
5	NC_015675	GCCTT	2	10	11638	11647	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
6	NC_015675	CGCGA	2	10	12848	12857	20 %	0 %	40 %	40 %	337264550
7	NC_015675	CGATC	2	10	13796	13805	20 %	20 %	20 %	40 %	337264551
8	NC_015675	CAGGC	2	10	14229	14238	20 %	0 %	40 %	40 %	337264551
9	NC_015675	GCGCG	2	10	14886	14895	0 %	0 %	60 %	40 %	337264552
10	NC_015675	ACCGA	2	10	15661	15670	40 %	0 %	20 %	40 %	337264552
11	NC_015675	TCGAT	2	10	21267	21276	20 %	40 %	20 %	20 %	337264557
12	NC_015675	TGCGC	2	10	21741	21750	0 %	20 %	40 %	40 %	337264557
13	NC_015675	CGGCG	2	10	22191	22200	0 %	0 %	60 %	40 %	337264557
14	NC_015675	GCGAG	2	10	23902	23911	20 %	0 %	60 %	20 %	337264559
15	NC_015675	TCGCC	2	10	24409	24418	0 %	20 %	20 %	60 %	337264559
16	NC_015675	GATCG	2	10	25350	25359	20 %	20 %	40 %	20 %	337264560
17	NC_015675	CACGA	2	10	25912	25921	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
18	NC_015675	GCGCA	2	10	27055	27064	20 %	0 %	40 %	40 %	337264563
19	NC_015675	GTCCG	2	10	27337	27346	0 %	20 %	40 %	40 %	337264563
20	NC_015675	CCTGG	2	10	28492	28501	0 %	20 %	40 %	40 %	337264564
21	NC_015675	TGGCG	2	10	29296	29305	0 %	20 %	60 %	20 %	337264565
22	NC_015675	GCGCC	2	10	29839	29848	0 %	0 %	40 %	60 %	337264565
23	NC_015675	ACCAG	2	10	30319	30328	40 %	0 %	20 %	40 %	337264565
24	NC_015675	CGCGG	2	10	31130	31139	0 %	0 %	60 %	40 %	337264567
25	NC_015675	CGTTG	2	10	31952	31961	0 %	40 %	40 %	20 %	337264567
26	NC_015675	CGGGC	2	10	34195	34204	0 %	0 %	60 %	40 %	337264570
27	NC_015675	GATCG	2	10	35372	35381	20 %	20 %	40 %	20 %	337264571
28	NC_015675	AAGGA	2	10	36565	36574	60 %	0 %	40 %	0 %	337264572
29	NC_015675	GCTTC	2	10	37333	37342	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
30	NC_015675	CGGCC	2	10	37883	37892	0 %	0 %	40 %	60 %	337264574
31	NC_015675	CCCAT	2	10	37972	37981	20 %	20 %	0 %	60 %	337264574
32	NC_015675	CCGCG	2	10	39318	39327	0 %	0 %	40 %	60 %	337264575
33	NC_015675	TGGTC	2	10	42114	42123	0 %	40 %	40 %	20 %	337264579
34	NC_015675	AAGCC	2	10	43916	43925	40 %	0 %	20 %	40 %	337264580
35	NC_015675	CCGGC	2	10	43974	43983	0 %	0 %	40 %	60 %	337264580
36	NC_015675	CCGGC	2	10	44862	44871	0 %	0 %	40 %	60 %	337264580
37	NC_015675	TTCAG	2	10	45377	45386	20 %	40 %	20 %	20 %	337264581
38	NC_015675	CATGC	2	10	45962	45971	20 %	20 %	20 %	40 %	337264581
39	NC_015675	TCGGT	2	10	47778	47787	0 %	40 %	40 %	20 %	337264582
40	NC_015675	GCCAG	2	10	48600	48609	20 %	0 %	40 %	40 %	337264583
41	NC_015675	CGGCT	2	10	48832	48841	0 %	20 %	40 %	40 %	337264583
42	NC_015675	GCGAC	2	10	51500	51509	20 %	0 %	40 %	40 %	337264584
43	NC_015675	ACGTG	2	10	52120	52129	20 %	20 %	40 %	20 %	337264584
44	NC_015675	CCGGC	2	10	53647	53656	0 %	0 %	40 %	60 %	337264587
45	NC_015675	GCGCA	2	10	55569	55578	20 %	0 %	40 %	40 %	337264589
46	NC_015675	GCCGG	2	10	55832	55841	0 %	0 %	60 %	40 %	337264589
47	NC_015675	TCACT	2	10	61460	61469	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
48	NC_015675	TTGCC	2	10	62400	62409	0 %	40 %	20 %	40 %	337264595
49	NC_015675	ACGAG	2	10	62693	62702	40 %	0 %	40 %	20 %	337264596
50	NC_015675	GCGCG	2	10	63072	63081	0 %	0 %	60 %	40 %	337264596
51	NC_015675	CATGA	2	10	64778	64787	40 %	20 %	20 %	20 %	337264597
52	NC_015675	CGAGC	2	10	65124	65133	20 %	0 %	40 %	40 %	337264598
53	NC_015675	GCTGG	2	10	66355	66364	0 %	20 %	60 %	20 %	337264599
54	NC_015675	GCTCG	2	10	69776	69785	0 %	20 %	40 %	40 %	337264603
55	NC_015675	GCAAG	2	10	70250	70259	40 %	0 %	40 %	20 %	337264603
56	NC_015675	AAAGC	2	10	72591	72600	60 %	0 %	20 %	20 %	337264604
57	NC_015675	GCGCA	2	10	75235	75244	20 %	0 %	40 %	40 %	337264606
58	NC_015675	GACCG	2	10	76076	76085	20 %	0 %	40 %	40 %	337264607
59	NC_015675	GCCGC	2	10	77453	77462	0 %	0 %	40 %	60 %	337264608
60	NC_015675	GCGCC	2	10	78762	78771	0 %	0 %	40 %	60 %	337264610
61	NC_015675	GCACG	2	10	78783	78792	20 %	0 %	40 %	40 %	337264610
62	NC_015675	GCCTT	2	10	79528	79537	0 %	40 %	20 %	40 %	337264611
63	NC_015675	CGATC	2	10	80853	80862	20 %	20 %	20 %	40 %	337264612
64	NC_015675	GTCGG	2	10	83365	83374	0 %	20 %	60 %	20 %	337264614
65	NC_015675	GCGTC	2	10	83711	83720	0 %	20 %	40 %	40 %	337264614
66	NC_015675	GCGCG	2	10	83757	83766	0 %	0 %	60 %	40 %	337264614
67	NC_015675	CGCTC	2	10	84479	84488	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
68	NC_015675	CGCGC	2	10	85883	85892	0 %	0 %	40 %	60 %	337264617
69	NC_015675	AGGCA	2	10	86378	86387	40 %	0 %	40 %	20 %	337264619
70	NC_015675	CGCCA	2	10	87049	87058	20 %	0 %	20 %	60 %	337264620
71	NC_015675	CGAAG	2	10	87107	87116	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
72	NC_015675	ACGGC	2	10	88558	88567	20 %	0 %	40 %	40 %	337264622
73	NC_015675	CGCGC	2	10	89172	89181	0 %	0 %	40 %	60 %	337264623
74	NC_015675	GGCCG	2	10	90590	90599	0 %	0 %	60 %	40 %	337264624
75	NC_015675	GCCGA	2	10	94851	94860	20 %	0 %	40 %	40 %	337264625
76	NC_015675	TGCGC	2	10	97323	97332	0 %	20 %	40 %	40 %	337264626
77	NC_015675	CGCGG	2	10	99007	99016	0 %	0 %	60 %	40 %	337264627
78	NC_015675	CGGAT	2	10	99381	99390	20 %	20 %	40 %	20 %	337264627
79	NC_015675	GGCGC	2	10	100459	100468	0 %	0 %	60 %	40 %	337264629
80	NC_015675	GTCCA	2	10	100756	100765	20 %	20 %	20 %	40 %	337264629
81	NC_015675	CGGGC	2	10	102393	102402	0 %	0 %	60 %	40 %	337264630
82	NC_015675	AGCGC	2	10	103130	103139	20 %	0 %	40 %	40 %	337264631
83	NC_015675	CGATC	2	10	106559	106568	20 %	20 %	20 %	40 %	337264633
84	NC_015675	GACCT	2	10	107037	107046	20 %	20 %	20 %	40 %	337264633
85	NC_015675	TCGCC	2	10	109024	109033	0 %	20 %	20 %	60 %	337264635
86	NC_015675	CTCGC	2	10	109089	109098	0 %	20 %	20 %	60 %	337264635
87	NC_015675	CGGCG	2	10	115986	115995	0 %	0 %	60 %	40 %	337264642
88	NC_015675	GGCCG	2	10	118418	118427	0 %	0 %	60 %	40 %	337264645
89	NC_015675	CGGCG	2	10	120746	120755	0 %	0 %	60 %	40 %	337264647
90	NC_015675	GCGCC	2	10	122041	122050	0 %	0 %	40 %	60 %	337264648
91	NC_015675	CGGCC	2	10	123922	123931	0 %	0 %	40 %	60 %	337264650
92	NC_015675	GACGC	2	10	125173	125182	20 %	0 %	40 %	40 %	337264652
93	NC_015675	GAAAG	2	10	128127	128136	60 %	0 %	40 %	0 %	337264654
94	NC_015675	CCGGG	2	10	130704	130713	0 %	0 %	60 %	40 %	337264655
95	NC_015675	TTTCG	2	10	130809	130818	0 %	60 %	20 %	20 %	337264655
96	NC_015675	GGCGA	2	10	131316	131325	20 %	0 %	60 %	20 %	337264656
97	NC_015675	GGACG	2	10	133557	133566	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
98	NC_015675	TCCGG	2	10	133607	133616	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
99	NC_015675	CGTCG	2	10	135460	135469	0 %	20 %	40 %	40 %	337264659
100	NC_015675	CGGTC	2	10	136983	136992	0 %	20 %	40 %	40 %	337264661
101	NC_015675	CGGTC	2	10	138179	138188	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
102	NC_015675	CGCAT	2	10	138204	138213	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
103	NC_015675	CGATG	2	10	138216	138225	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
104	NC_015675	ACGGC	2	10	140463	140472	20 %	0 %	40 %	40 %	337264663
105	NC_015675	GGTCT	2	10	140960	140969	0 %	40 %	40 %	20 %	337264663
106	NC_015675	TCAGG	2	10	141683	141692	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
107	NC_015675	CGGAG	2	10	141722	141731	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
108	NC_015675	CCGGC	2	10	141981	141990	0 %	0 %	40 %	60 %	337264664
109	NC_015675	TCGCG	2	10	144259	144268	0 %	20 %	40 %	40 %	337264666
110	NC_015675	GAATG	2	10	146366	146375	40 %	20 %	40 %	0 %	337264667
111	NC_015675	AGGAT	2	10	148594	148603	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015675	CCAGC	2	10	150665	150674	20 %	0 %	20 %	60 %	337264672
113	NC_015675	GCTAG	2	10	151738	151747	20 %	20 %	40 %	20 %	337264673
114	NC_015675	ATCGC	2	10	151963	151972	20 %	20 %	20 %	40 %	337264674
115	NC_015675	GCGTG	2	10	153260	153269	0 %	20 %	60 %	20 %	337264675
116	NC_015675	AATCC	2	10	154511	154520	40 %	20 %	0 %	40 %	337264676
117	NC_015675	TGCGC	2	10	154716	154725	0 %	20 %	40 %	40 %	337264676
118	NC_015675	GCCGG	2	10	157595	157604	0 %	0 %	60 %	40 %	337264677
119	NC_015675	GCCGG	2	10	159022	159031	0 %	0 %	60 %	40 %	337264679
120	NC_015675	TGCGC	2	10	159549	159558	0 %	20 %	40 %	40 %	337264679
121	NC_015675	CGCAG	2	10	159574	159583	20 %	0 %	40 %	40 %	337264679
122	NC_015675	ACTTC	2	10	159748	159757	20 %	40 %	0 %	40 %	337264679
123	NC_015675	CAGGC	2	10	160137	160146	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
124	NC_015675	TCGGT	2	10	160314	160323	0 %	40 %	40 %	20 %	337264680
125	NC_015675	TGTCG	2	10	161407	161416	0 %	40 %	40 %	20 %	337264682
126	NC_015675	GCCCA	2	10	161871	161880	20 %	0 %	20 %	60 %	337264683
127	NC_015675	GTGGC	2	10	163551	163560	0 %	20 %	60 %	20 %	337264684
128	NC_015675	CTCTT	2	10	163860	163869	0 %	60 %	0 %	40 %	337264684
129	NC_015675	AGGCC	2	10	164968	164977	20 %	0 %	40 %	40 %	337264686
130	NC_015675	GGGTG	2	10	166254	166263	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015675	TGGCC	2	10	167432	167441	0 %	20 %	40 %	40 %	337264688
132	NC_015675	GCCGC	2	10	167709	167718	0 %	0 %	40 %	60 %	337264689
133	NC_015675	GCGGT	2	10	168073	168082	0 %	20 %	60 %	20 %	337264689
134	NC_015675	GTGCG	2	10	169694	169703	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
135	NC_015675	TGCCC	2	10	169848	169857	0 %	20 %	20 %	60 %	337264691
136	NC_015675	GCAAG	2	10	170819	170828	40 %	0 %	40 %	20 %	337264692
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138	NC_015675	CGGCA	2	10	171713	171722	20 %	0 %	40 %	40 %	337264692
139	NC_015675	CTGGA	2	10	172224	172233	20 %	20 %	40 %	20 %	337264692
140	NC_015675	GGCAT	2	10	172684	172693	20 %	20 %	40 %	20 %	337264692
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151	NC_015675	CGGGC	2	10	179746	179755	0 %	0 %	60 %	40 %	337264698
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154	NC_015675	CGATG	2	10	183610	183619	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
155	NC_015675	TCGGC	2	10	184251	184260	0 %	20 %	40 %	40 %	337264701
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159	NC_015675	CGGTT	2	10	187077	187086	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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244	NC_015675	TGGGT	2	10	299204	299213	0 %	40 %	60 %	0 %	337264806
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247	NC_015675	CGGTC	2	10	303424	303433	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
248	NC_015675	AGCGC	2	10	303831	303840	20 %	0 %	40 %	40 %	337264811
249	NC_015675	GGCCG	2	10	305924	305933	0 %	0 %	60 %	40 %	337264812
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252	NC_015675	GGCCG	2	10	313573	313582	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
253	NC_015675	CTGGC	2	10	313911	313920	0 %	20 %	40 %	40 %	337264819
254	NC_015675	CGGGC	2	10	315411	315420	0 %	0 %	60 %	40 %	337264820
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257	NC_015675	CATGG	2	10	320917	320926	20 %	20 %	40 %	20 %	337264827
258	NC_015675	TCTTT	2	10	322001	322010	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
259	NC_015675	CCTGT	2	10	322131	322140	0 %	40 %	20 %	40 %	337264828
260	NC_015675	AAGCC	2	10	324805	324814	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
261	NC_015675	GCGCC	2	10	325111	325120	0 %	0 %	40 %	60 %	337264830
262	NC_015675	ACCGG	2	10	325974	325983	20 %	0 %	40 %	40 %	337264830
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264	NC_015675	TGACG	2	10	326314	326323	20 %	20 %	40 %	20 %	337264830
265	NC_015675	CTTCC	2	10	326452	326461	0 %	40 %	0 %	60 %	337264831
266	NC_015675	CGAGG	2	10	326816	326825	20 %	0 %	60 %	20 %	337264831
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392	NC_015675	TTCGG	2	10	497593	497602	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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396	NC_015675	CGAGG	2	10	504578	504587	20 %	0 %	60 %	20 %	337264995
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500	NC_015675	TGCCG	2	10	645133	645142	0 %	20 %	40 %	40 %	337265136

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