MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter bizzozeronii CIII-1

Total Repeats: 64

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015674	CCCCAA	2	12	14755	14766	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_015674	GTTTTG	2	12	44535	44546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015674	CCCCTA	2	12	52902	52913	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_015674	CGCCCT	2	12	64094	64105	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_015674	ACTTAA	2	12	64148	64159	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_015674	CCCCAA	2	12	71201	71212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_015674	ATCTTT	2	12	74015	74026	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_015674	GAAAAT	2	12	74278	74289	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015674	CCCCAA	2	12	126500	126511	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_015674	CAAAAA	2	12	176941	176952	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_015674	TAAAAA	2	12	187939	187950	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015674	TTGGGG	2	12	200830	200841	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015674	AGCCAA	2	12	220549	220560	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_015674	TTGGTT	2	12	236479	236490	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015674	TTGGGG	2	12	269342	269353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015674	TTTAAA	2	12	307723	307734	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015674	TAAAAT	2	12	342934	342945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015674	CTTTTG	2	12	348606	348617	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_015674	ATTTGG	2	12	349328	349339	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015674	CCCCAA	2	12	363981	363992	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_015674	TTGGGG	2	12	367140	367151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015674	TTGGGG	2	12	372407	372418	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015674	GCATGT	2	12	378388	378399	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_015674	AAAGAC	2	12	388250	388261	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_015674	TTGGGG	2	12	497138	497149	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015674	CCCCAA	2	12	707577	707588	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_015674	ACCCCT	2	12	729369	729380	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_015674	CCGCCC	2	12	729383	729394	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
29	NC_015674	CCCCAA	2	12	749139	749150	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_015674	CCCCAA	2	12	861389	861400	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_015674	GCACAT	2	12	889948	889959	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_015674	CCCCAA	2	12	928175	928186	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_015674	CCCCAA	2	12	932492	932503	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_015674	CAATCC	2	12	948121	948132	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_015674	TGTTTT	2	12	983429	983440	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015674	TGCCTT	2	12	986749	986760	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_015674	GCTTTT	2	12	1019288	1019299	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_015674	TCTAGG	2	12	1022882	1022893	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_015674	TTTAGG	2	12	1130183	1130194	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015674	TTGGGG	2	12	1136442	1136453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015674	AATTAT	2	12	1228460	1228471	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015674	CCTAGA	2	12	1229794	1229805	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_015674	GGGATT	2	12	1235870	1235881	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015674	CAAAAA	2	12	1293690	1293701	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_015674	GTGTGG	2	12	1373469	1373480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015674	CCTTGC	2	12	1392332	1392343	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
47	NC_015674	CCCCAA	2	12	1399680	1399691	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_015674	TTTTTG	2	12	1421935	1421946	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015674	CAAAAA	2	12	1469479	1469490	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_015674	TAATTT	2	12	1472503	1472514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015674	CCACAC	2	12	1476202	1476213	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_015674	GGGTTT	2	12	1503724	1503735	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015674	TAGGGG	2	12	1545509	1545520	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015674	TAATTT	2	12	1545942	1545953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015674	AAACCA	2	12	1569634	1569645	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_015674	TTGGGG	2	12	1582979	1582990	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015674	TTTTCT	2	12	1615085	1615096	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_015674	CTATGG	2	12	1615422	1615433	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_015674	AAGGTT	2	12	1615564	1615575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015674	GCCCAA	2	12	1637612	1637623	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
61	NC_015674	GGCATT	2	12	1637684	1637695	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_015674	CCACGC	2	12	1660560	1660571	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_015674	TTGGGG	2	12	1669437	1669448	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015674	ATCTGT	2	12	1676412	1676423	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.