MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter bizzozeronii CIII-1

Total Repeats: 117

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015674	CTTTA	2	10	5919	5928	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_015674	CCCCT	2	10	14875	14884	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
3	NC_015674	AAAGC	2	10	16166	16175	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
4	NC_015674	TTCAA	2	10	17403	17412	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_015674	CTCAT	2	10	17635	17644	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
6	NC_015674	GGAGC	2	10	63885	63894	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
7	NC_015674	CTTAA	2	10	64359	64368	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_015674	TTTAG	2	10	64471	64480	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015674	CAAAA	2	10	74624	74633	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_015674	TCTAT	2	10	74777	74786	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_015674	GGTGT	2	10	77255	77264	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015674	TTGTT	2	10	81581	81590	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015674	CAGAG	2	10	82030	82039	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
14	NC_015674	AAAAG	2	10	83954	83963	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015674	TTTAA	2	10	100197	100206	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015674	GCACT	2	10	100224	100233	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
17	NC_015674	GCAGG	2	10	132420	132429	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
18	NC_015674	TAAAC	2	10	137490	137499	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_015674	CACGA	2	10	175792	175801	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
20	NC_015674	AGTTA	2	10	176833	176842	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015674	ACAAT	2	10	209625	209634	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_015674	TGGTG	2	10	220361	220370	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015674	TCAAG	2	10	221084	221093	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
24	NC_015674	AGATG	2	10	230591	230600	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015674	TTGAA	2	10	230824	230833	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015674	GCTTT	2	10	232059	232068	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
27	NC_015674	GCTTT	2	10	232927	232936	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
28	NC_015674	ACAAG	2	10	278348	278357	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
29	NC_015674	ATTGC	2	10	327225	327234	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
30	NC_015674	ATTGT	2	10	350104	350113	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015674	AAAAT	2	10	360702	360711	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015674	TTAAG	2	10	366299	366308	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015674	AGCGT	2	10	387928	387937	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
34	NC_015674	GCTAG	2	10	387985	387994	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
35	NC_015674	AAAAG	2	10	398899	398908	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015674	ATTTA	2	10	399999	400008	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015674	TTATA	2	10	478400	478409	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015674	CTTTA	2	10	484781	484790	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_015674	TGTGG	2	10	496666	496675	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015674	TATAA	2	10	524318	524327	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015674	CCCCA	2	10	531402	531411	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
42	NC_015674	TTTTA	2	10	550828	550837	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015674	AGTAT	2	10	562195	562204	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015674	TTTTA	2	10	619312	619321	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015674	TGAAT	2	10	646082	646091	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015674	AGCAG	2	10	696720	696729	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
47	NC_015674	TGCTA	2	10	714087	714096	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
48	NC_015674	TTGGC	2	10	748764	748773	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
49	NC_015674	GGATA	2	10	755562	755571	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015674	TTGTT	2	10	771114	771123	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015674	ATGCC	2	10	775681	775690	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
52	NC_015674	TTGCT	2	10	823548	823557	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
53	NC_015674	GCTTG	2	10	841686	841695	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
54	NC_015674	ATCGT	2	10	861443	861452	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
55	NC_015674	ATCAA	2	10	868470	868479	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_015674	GTTGG	2	10	898955	898964	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015674	GTTTA	2	10	909916	909925	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015674	GGGAT	2	10	932651	932660	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015674	TGGCA	2	10	932710	932719	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
60	NC_015674	TAATC	2	10	939199	939208	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_015674	ACAGC	2	10	956275	956284	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
62	NC_015674	GCGGG	2	10	980950	980959	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
63	NC_015674	CAATA	2	10	997432	997441	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_015674	TCCAC	2	10	1006747	1006756	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
65	NC_015674	TATAA	2	10	1009924	1009933	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015674	ATTTT	2	10	1015745	1015754	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015674	TAAAA	2	10	1021213	1021222	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015674	AACTA	2	10	1032594	1032603	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_015674	AGCTA	2	10	1062618	1062627	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
70	NC_015674	TTAAC	2	10	1101959	1101968	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_015674	GGAAA	2	10	1107329	1107338	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015674	TGTTA	2	10	1124854	1124863	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015674	GTGTT	2	10	1215800	1215809	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015674	TGGCA	2	10	1224439	1224448	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
75	NC_015674	AAAAG	2	10	1250998	1251007	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015674	ACAGC	2	10	1260730	1260739	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
77	NC_015674	ATTTT	2	10	1268785	1268794	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015674	GAAGT	2	10	1369013	1369022	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015674	AAAGT	2	10	1370226	1370235	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015674	TATGG	2	10	1370278	1370287	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015674	TTTTA	2	10	1399873	1399882	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015674	TTCTT	2	10	1400846	1400855	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_015674	TAACT	2	10	1422045	1422054	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_015674	TCGTG	2	10	1423087	1423096	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
85	NC_015674	CAAAT	2	10	1444373	1444382	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_015674	AAAAG	2	10	1469712	1469721	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015674	TTAAA	2	10	1476019	1476028	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015674	TTAAG	2	10	1477023	1477032	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015674	GCTGT	2	10	1481332	1481341	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
90	NC_015674	CAAAA	2	10	1481462	1481471	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_015674	GGGCT	2	10	1497911	1497920	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
92	NC_015674	GCGGG	2	10	1497987	1497996	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
93	NC_015674	GGGCT	2	10	1509557	1509566	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
94	NC_015674	AATAA	2	10	1557098	1557107	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015674	ACTCT	2	10	1557305	1557314	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
96	NC_015674	TTTTA	2	10	1566978	1566987	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015674	AAGAT	2	10	1567510	1567519	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015674	TGGCA	2	10	1567699	1567708	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
99	NC_015674	GCAGA	2	10	1577043	1577052	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
100	NC_015674	AGGGG	2	10	1600895	1600904	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015674	TATAT	2	10	1607880	1607889	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015674	GTATA	2	10	1607947	1607956	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015674	TAAAT	2	10	1609371	1609380	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015674	CTTGC	2	10	1614166	1614175	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
105	NC_015674	TGCCA	2	10	1614333	1614342	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
106	NC_015674	ATTTA	3	15	1615788	1615802	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015674	TTTAA	3	15	1615803	1615817	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015674	AATCT	2	10	1616127	1616136	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_015674	ACAGC	2	10	1626178	1626187	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
110	NC_015674	TTTTC	2	10	1637629	1637638	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_015674	AAAAG	2	10	1647957	1647966	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015674	GTCAA	2	10	1648319	1648328	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
113	NC_015674	ATTAA	2	10	1651132	1651141	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015674	GAGTG	2	10	1672831	1672840	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015674	TGGCG	2	10	1673694	1673703	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
116	NC_015674	GAAGC	2	10	1675197	1675206	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
117	NC_015674	AAGAT	2	10	1681012	1681021	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.