MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Corynebacterium resistens DSM 45100 chromosome

Total Repeats: 82

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015673	TGTATA	2	12	67876	67887	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015673	TGCGGG	2	12	73023	73034	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_015673	CCTCAC	2	12	113635	113646	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_015673	TTCGCT	2	12	114620	114631	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_015673	TCACAA	2	12	115391	115402	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_015673	AGGCAA	2	12	117733	117744	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_015673	AGAAAA	2	12	127081	127092	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015673	AAAGCG	2	12	301447	301458	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_015673	ATAAAA	2	12	303509	303520	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015673	GATGCA	2	12	305190	305201	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_015673	TGTTTG	2	12	371180	371191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015673	GAATTG	2	12	402039	402050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015673	CAAAAA	2	12	410502	410513	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_015673	AAACAA	2	12	436848	436859	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_015673	AAGGCG	2	12	535028	535039	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_015673	TGGCGG	2	12	538136	538147	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_015673	CATGAC	2	12	556853	556864	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_015673	GGTGTG	2	12	604902	604913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015673	AGCGAA	2	12	607981	607992	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_015673	TAATCT	2	12	623053	623064	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_015673	CGGAAT	2	12	757967	757978	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_015673	AGGGGA	2	12	766730	766741	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015673	TTGCCG	2	12	939694	939705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_015673	ACCCAC	2	12	971262	971273	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_015673	CTCAAC	2	12	972633	972644	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_015673	CCTTAG	2	12	1120683	1120694	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_015673	GGTGTG	2	12	1170180	1170191	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015673	AGCGAA	2	12	1173231	1173242	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_015673	ACAAGG	2	12	1191003	1191014	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_015673	TGCAGG	2	12	1195260	1195271	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_015673	GAAGCC	2	12	1230324	1230335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_015673	GTCACC	2	12	1249639	1249650	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
33	NC_015673	AGAACA	2	12	1275831	1275842	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_015673	GTCCCG	2	12	1283274	1283285	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
35	NC_015673	CGACCG	2	12	1404098	1404109	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
36	NC_015673	TCAGGC	2	12	1497657	1497668	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_015673	TACCGT	2	12	1497960	1497971	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_015673	ACGCCC	2	12	1530701	1530712	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_015673	GTTTCA	2	12	1545613	1545624	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_015673	CAATAA	2	12	1583778	1583789	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_015673	ACCTGA	2	12	1621873	1621884	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_015673	CGCCGG	2	12	1630746	1630757	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_015673	GTCAGC	2	12	1641391	1641402	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_015673	GACCAC	2	12	1666435	1666446	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
45	NC_015673	ATGGTG	2	12	1739074	1739085	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015673	TTGAAT	2	12	1817348	1817359	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015673	CCGTCG	2	12	1832076	1832087	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
48	NC_015673	CGTTTT	2	12	1861754	1861765	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_015673	ACCTCC	2	12	1902260	1902271	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_015673	AGCTTC	2	12	1948100	1948111	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_015673	CCCCCG	2	12	1966993	1967004	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
52	NC_015673	TTCTCT	2	12	1990586	1990597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_015673	GCAACA	2	12	2004481	2004492	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_015673	CGGGGC	2	12	2067147	2067158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_015673	CGCCAC	2	12	2068199	2068210	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_015673	TTTCGA	2	12	2075168	2075179	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_015673	TTCCCT	2	12	2079720	2079731	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_015673	CCCCTA	2	12	2151017	2151028	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_015673	CCCTTC	2	12	2158104	2158115	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_015673	TCTTTT	2	12	2191034	2191045	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_015673	CGGGTG	2	12	2242362	2242373	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_015673	ACAATC	2	12	2255976	2255987	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_015673	GCAACT	2	12	2298463	2298474	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_015673	AAACTA	2	12	2300357	2300368	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_015673	ATCCAC	2	12	2315846	2315857	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_015673	CCTCAT	2	12	2371239	2371250	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_015673	TGTTTT	2	12	2386463	2386474	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015673	GCCTGT	2	12	2395588	2395599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_015673	GGTTGG	2	12	2457171	2457182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015673	CGACCC	2	12	2459762	2459773	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_015673	TTCTGG	2	12	2459844	2459855	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_015673	TGATTT	2	12	2460087	2460098	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015673	ACCCGT	2	12	2475991	2476002	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
74	NC_015673	ACCCGT	2	12	2476046	2476057	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
75	NC_015673	TGGCGG	2	12	2488646	2488657	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_015673	AAAAAC	2	12	2541414	2541425	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_015673	GGCGAC	2	12	2545528	2545539	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_015673	TTACTA	2	12	2545639	2545650	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_015673	GCCCAT	2	12	2559946	2559957	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
80	NC_015673	CAACAG	2	12	2597230	2597241	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_015673	CCAAAG	2	12	2598072	2598083	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_015673	CGATCA	2	12	2600051	2600062	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.