MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Helicobacter bizzozeronii CIII-1 plasmid phbz1

Total Repeats: 36

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015670	AAAGC	2	10	320	329	60 %	0 %	20 %	20 %	336319057
2	NC_015670	ACCCC	2	10	5340	5349	20 %	0 %	0 %	80 %	336319066
3	NC_015670	GCGAT	2	10	5452	5461	20 %	20 %	40 %	20 %	336319066
4	NC_015670	AGAAA	2	10	5966	5975	80 %	0 %	20 %	0 %	336319066
5	NC_015670	CAAAA	2	10	8416	8425	80 %	0 %	0 %	20 %	336319070
6	NC_015670	CAAAA	2	10	8453	8462	80 %	0 %	0 %	20 %	336319070
7	NC_015670	GCTTG	2	10	8563	8572	0 %	40 %	40 %	20 %	336319070
8	NC_015670	GATTG	2	10	8674	8683	20 %	40 %	40 %	0 %	336319070
9	NC_015670	GATCA	2	10	9199	9208	40 %	20 %	20 %	20 %	336319070
10	NC_015670	AGAGC	2	10	9549	9558	40 %	0 %	40 %	20 %	336319070
11	NC_015670	AAATC	2	10	12229	12238	60 %	20 %	0 %	20 %	336319075
12	NC_015670	CCTTG	2	10	12861	12870	0 %	40 %	20 %	40 %	336319076
13	NC_015670	CACTC	2	10	14062	14071	20 %	20 %	0 %	60 %	336319077
14	NC_015670	CTTGC	2	10	15065	15074	0 %	40 %	20 %	40 %	336319080
15	NC_015670	AAACT	2	10	23407	23416	60 %	20 %	0 %	20 %	336319089
16	NC_015670	ATCTT	2	10	25901	25910	20 %	60 %	0 %	20 %	336319091
17	NC_015670	CTTTT	2	10	28163	28172	0 %	80 %	0 %	20 %	336319093
18	NC_015670	TGGGT	2	10	28764	28773	0 %	40 %	60 %	0 %	336319094
19	NC_015670	CACCC	2	10	28828	28837	20 %	0 %	0 %	80 %	336319094
20	NC_015670	CTTTG	2	10	30853	30862	0 %	60 %	20 %	20 %	336319095
21	NC_015670	GAACA	2	10	31282	31291	60 %	0 %	20 %	20 %	336319097
22	NC_015670	GGCGT	2	10	34873	34882	0 %	20 %	60 %	20 %	336319105
23	NC_015670	TCAAA	2	10	36137	36146	60 %	20 %	0 %	20 %	336319106
24	NC_015670	GGCAC	2	10	36918	36927	20 %	0 %	40 %	40 %	336319108
25	NC_015670	TGCTT	2	10	37094	37103	0 %	60 %	20 %	20 %	336319108
26	NC_015670	AAAAG	2	10	38074	38083	80 %	0 %	20 %	0 %	336319109
27	NC_015670	TTGGG	2	10	38380	38389	0 %	40 %	60 %	0 %	336319110
28	NC_015670	CAACG	2	10	38979	38988	40 %	0 %	20 %	40 %	336319110
29	NC_015670	CAAAT	2	10	39552	39561	60 %	20 %	0 %	20 %	336319111
30	NC_015670	GTGTA	2	10	41562	41571	20 %	40 %	40 %	0 %	336319114
31	NC_015670	AATGC	2	10	42470	42479	40 %	20 %	20 %	20 %	336319115
32	NC_015670	CTGTT	2	10	43221	43230	0 %	60 %	20 %	20 %	336319118
33	NC_015670	TGCAA	2	10	44125	44134	40 %	20 %	20 %	20 %	336319120
34	NC_015670	CAAGC	2	10	44683	44692	40 %	0 %	20 %	40 %	336319121
35	NC_015670	GATCG	2	10	46859	46868	20 %	20 %	40 %	20 %	336319122
36	NC_015670	ACCAA	2	10	48289	48298	60 %	0 %	0 %	40 %	336319124

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.