MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Helicobacter bizzozeronii CIII-1 plasmid phbz1

Total Repeats: 156

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015670	TTAG	2	8	217	224	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015670	GCAA	2	8	413	420	50 %	0 %	25 %	25 %	336319057
3	NC_015670	TAAT	2	8	1058	1065	50 %	50 %	0 %	0 %	336319059
4	NC_015670	ACAG	2	8	1308	1315	50 %	0 %	25 %	25 %	336319060
5	NC_015670	CTAT	2	8	1530	1537	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_015670	AACC	2	8	1573	1580	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_015670	TTAC	2	8	2206	2213	25 %	50 %	0 %	25 %	336319063
8	NC_015670	GTTC	2	8	2487	2494	0 %	50 %	25 %	25 %	336319063
9	NC_015670	TTGC	2	8	2523	2530	0 %	50 %	25 %	25 %	336319063
10	NC_015670	TAAA	2	8	2735	2742	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015670	GTTG	2	8	3369	3376	0 %	50 %	50 %	0 %	336319065
12	NC_015670	TTTG	2	8	3404	3411	0 %	75 %	25 %	0 %	336319065
13	NC_015670	AATG	2	8	4110	4117	50 %	25 %	25 %	0 %	336319066
14	NC_015670	AAAG	2	8	4250	4257	75 %	0 %	25 %	0 %	336319066
15	NC_015670	TGAG	2	8	4606	4613	25 %	25 %	50 %	0 %	336319066
16	NC_015670	TGAT	2	8	5551	5558	25 %	50 %	25 %	0 %	336319066
17	NC_015670	GAAT	2	8	5597	5604	50 %	25 %	25 %	0 %	336319066
18	NC_015670	ATCT	2	8	5605	5612	25 %	50 %	0 %	25 %	336319066
19	NC_015670	TTGT	2	8	6091	6098	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015670	TTCA	2	8	6155	6162	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_015670	GATG	2	8	6373	6380	25 %	25 %	50 %	0 %	336319067
22	NC_015670	TTGC	2	8	6714	6721	0 %	50 %	25 %	25 %	336319067
23	NC_015670	CAAA	2	8	7287	7294	75 %	0 %	0 %	25 %	336319069
24	NC_015670	AGCA	2	8	7461	7468	50 %	0 %	25 %	25 %	336319069
25	NC_015670	CAAG	2	8	7519	7526	50 %	0 %	25 %	25 %	336319069
26	NC_015670	ATTA	2	8	7819	7826	50 %	50 %	0 %	0 %	336319070
27	NC_015670	GCAA	2	8	8090	8097	50 %	0 %	25 %	25 %	336319070
28	NC_015670	AAGA	2	8	8323	8330	75 %	0 %	25 %	0 %	336319070
29	NC_015670	CAAA	3	12	8497	8508	75 %	0 %	0 %	25 %	336319070
30	NC_015670	GCAG	2	8	8589	8596	25 %	0 %	50 %	25 %	336319070
31	NC_015670	TAGA	2	8	8618	8625	50 %	25 %	25 %	0 %	336319070
32	NC_015670	AAAG	2	8	8742	8749	75 %	0 %	25 %	0 %	336319070
33	NC_015670	CACT	2	8	8933	8940	25 %	25 %	0 %	50 %	336319070
34	NC_015670	ATTG	2	8	9030	9037	25 %	50 %	25 %	0 %	336319070
35	NC_015670	AAGC	2	8	9190	9197	50 %	0 %	25 %	25 %	336319070
36	NC_015670	CAGA	2	8	9364	9371	50 %	0 %	25 %	25 %	336319070
37	NC_015670	GCCC	2	8	9453	9460	0 %	0 %	25 %	75 %	336319070
38	NC_015670	TTCG	3	12	10120	10131	0 %	50 %	25 %	25 %	336319071
39	NC_015670	TTGG	2	8	10217	10224	0 %	50 %	50 %	0 %	336319071
40	NC_015670	AACA	2	8	10886	10893	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_015670	AAAC	2	8	11186	11193	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_015670	TAAT	2	8	11686	11693	50 %	50 %	0 %	0 %	336319073
43	NC_015670	GGGC	2	8	12525	12532	0 %	0 %	75 %	25 %	336319076
44	NC_015670	ACTC	2	8	12774	12781	25 %	25 %	0 %	50 %	336319076
45	NC_015670	TGCT	2	8	14148	14155	0 %	50 %	25 %	25 %	336319077
46	NC_015670	CACT	2	8	14731	14738	25 %	25 %	0 %	50 %	336319079
47	NC_015670	CTTC	2	8	15015	15022	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_015670	GTTG	2	8	15139	15146	0 %	50 %	50 %	0 %	336319080
49	NC_015670	AGTT	2	8	15230	15237	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015670	CAAG	2	8	15519	15526	50 %	0 %	25 %	25 %	336319081
51	NC_015670	GGGC	2	8	15925	15932	0 %	0 %	75 %	25 %	336319081
52	NC_015670	GGGC	2	8	16281	16288	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
53	NC_015670	GTTT	2	8	16746	16753	0 %	75 %	25 %	0 %	336319083
54	NC_015670	GCTT	2	8	16893	16900	0 %	50 %	25 %	25 %	336319084
55	NC_015670	TTTG	2	8	17200	17207	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015670	GCGT	2	8	17401	17408	0 %	25 %	50 %	25 %	336319085
57	NC_015670	ATTG	2	8	17498	17505	25 %	50 %	25 %	0 %	336319085
58	NC_015670	CGCC	2	8	17520	17527	0 %	0 %	25 %	75 %	336319085
59	NC_015670	GCTT	2	8	17680	17687	0 %	50 %	25 %	25 %	336319085
60	NC_015670	TCCC	2	8	17916	17923	0 %	25 %	0 %	75 %	336319085
61	NC_015670	CTGT	2	8	18121	18128	0 %	50 %	25 %	25 %	336319085
62	NC_015670	CCTC	2	8	18213	18220	0 %	25 %	0 %	75 %	336319086
63	NC_015670	ATTG	2	8	18450	18457	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015670	ACCA	2	8	19586	19593	50 %	0 %	0 %	50 %	336319087
65	NC_015670	TGCT	2	8	19970	19977	0 %	50 %	25 %	25 %	336319087
66	NC_015670	CGCA	2	8	20261	20268	25 %	0 %	25 %	50 %	336319088
67	NC_015670	CTTT	2	8	21570	21577	0 %	75 %	0 %	25 %	336319088
68	NC_015670	TGCA	2	8	21808	21815	25 %	25 %	25 %	25 %	336319088
69	NC_015670	TCCA	2	8	22037	22044	25 %	25 %	0 %	50 %	336319088
70	NC_015670	CACC	2	8	23185	23192	25 %	0 %	0 %	75 %	336319089
71	NC_015670	CAGA	2	8	23319	23326	50 %	0 %	25 %	25 %	336319089
72	NC_015670	CAAG	2	8	23384	23391	50 %	0 %	25 %	25 %	336319089
73	NC_015670	TATC	2	8	23508	23515	25 %	50 %	0 %	25 %	336319089
74	NC_015670	CCAA	2	8	23814	23821	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_015670	GCTT	2	8	23832	23839	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_015670	AGTT	2	8	24009	24016	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015670	GTTT	2	8	24044	24051	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015670	TCGG	2	8	24055	24062	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
79	NC_015670	CACC	2	8	24513	24520	25 %	0 %	0 %	75 %	336319091
80	NC_015670	GCTT	2	8	24557	24564	0 %	50 %	25 %	25 %	336319091
81	NC_015670	AATC	2	8	24717	24724	50 %	25 %	0 %	25 %	336319091
82	NC_015670	TAAA	2	8	24838	24845	75 %	25 %	0 %	0 %	336319091
83	NC_015670	TGTC	2	8	25512	25519	0 %	50 %	25 %	25 %	336319091
84	NC_015670	CTTG	2	8	25758	25765	0 %	50 %	25 %	25 %	336319091
85	NC_015670	GCTT	2	8	25971	25978	0 %	50 %	25 %	25 %	336319091
86	NC_015670	TTGG	2	8	26515	26522	0 %	50 %	50 %	0 %	336319091
87	NC_015670	TCAA	2	8	27314	27321	50 %	25 %	0 %	25 %	336319092
88	NC_015670	AAAC	2	8	27474	27481	75 %	0 %	0 %	25 %	336319092
89	NC_015670	TCCT	2	8	27558	27565	0 %	50 %	0 %	50 %	336319092
90	NC_015670	GCTG	2	8	28186	28193	0 %	25 %	50 %	25 %	336319093
91	NC_015670	TGGC	2	8	28674	28681	0 %	25 %	50 %	25 %	336319093
92	NC_015670	TAGC	2	8	28726	28733	25 %	25 %	25 %	25 %	336319093
93	NC_015670	TGTC	2	8	28815	28822	0 %	50 %	25 %	25 %	336319094
94	NC_015670	TTTG	2	8	28977	28984	0 %	75 %	25 %	0 %	336319094
95	NC_015670	GCGA	2	8	29296	29303	25 %	0 %	50 %	25 %	336319094
96	NC_015670	TTTG	2	8	29657	29664	0 %	75 %	25 %	0 %	336319094
97	NC_015670	TTGT	2	8	30016	30023	0 %	75 %	25 %	0 %	336319094
98	NC_015670	CTGG	2	8	30175	30182	0 %	25 %	50 %	25 %	336319094
99	NC_015670	CAAG	2	8	30546	30553	50 %	0 %	25 %	25 %	336319094
100	NC_015670	GAAC	2	8	31045	31052	50 %	0 %	25 %	25 %	336319096
101	NC_015670	TGAT	3	12	31405	31416	25 %	50 %	25 %	0 %	336319097
102	NC_015670	GCAC	2	8	33042	33049	25 %	0 %	25 %	50 %	336319102
103	NC_015670	GGGT	2	8	33393	33400	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015670	AGCA	2	8	33447	33454	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_015670	AGGG	2	8	33722	33729	25 %	0 %	75 %	0 %	336319103
106	NC_015670	AAGC	2	8	34150	34157	50 %	0 %	25 %	25 %	336319103
107	NC_015670	CAAG	2	8	34616	34623	50 %	0 %	25 %	25 %	336319104
108	NC_015670	ACCC	2	8	34961	34968	25 %	0 %	0 %	75 %	336319105
109	NC_015670	GCTT	2	8	35158	35165	0 %	50 %	25 %	25 %	336319105
110	NC_015670	TCTT	2	8	35271	35278	0 %	75 %	0 %	25 %	336319105
111	NC_015670	TAGG	2	8	35664	35671	25 %	25 %	50 %	0 %	336319105
112	NC_015670	CCTC	2	8	35701	35708	0 %	25 %	0 %	75 %	336319105
113	NC_015670	ACAA	2	8	36017	36024	75 %	0 %	0 %	25 %	336319105
114	NC_015670	CGTG	2	8	36172	36179	0 %	25 %	50 %	25 %	336319106
115	NC_015670	CCCA	2	8	37348	37355	25 %	0 %	0 %	75 %	336319109
116	NC_015670	ACTT	2	8	37472	37479	25 %	50 %	0 %	25 %	336319109
117	NC_015670	CAAG	2	8	37837	37844	50 %	0 %	25 %	25 %	336319109
118	NC_015670	ATTA	2	8	37907	37914	50 %	50 %	0 %	0 %	336319109
119	NC_015670	TCTG	2	8	38661	38668	0 %	50 %	25 %	25 %	336319110
120	NC_015670	GCAC	2	8	38803	38810	25 %	0 %	25 %	50 %	336319110
121	NC_015670	GCTT	2	8	39621	39628	0 %	50 %	25 %	25 %	336319111
122	NC_015670	TTTG	2	8	40122	40129	0 %	75 %	25 %	0 %	336319111
123	NC_015670	TAGA	2	8	40179	40186	50 %	25 %	25 %	0 %	336319111
124	NC_015670	CACC	2	8	40998	41005	25 %	0 %	0 %	75 %	336319113
125	NC_015670	CAAA	2	8	41118	41125	75 %	0 %	0 %	25 %	336319113
126	NC_015670	ATTC	2	8	41326	41333	25 %	50 %	0 %	25 %	336319113
127	NC_015670	AGAA	2	8	42559	42566	75 %	0 %	25 %	0 %	336319115
128	NC_015670	GGTT	2	8	43482	43489	0 %	50 %	50 %	0 %	336319118
129	NC_015670	TGCG	2	8	43531	43538	0 %	25 %	50 %	25 %	336319118
130	NC_015670	CAAG	2	8	45042	45049	50 %	0 %	25 %	25 %	336319121
131	NC_015670	ACAG	2	8	45754	45761	50 %	0 %	25 %	25 %	336319121
132	NC_015670	TACA	2	8	46192	46199	50 %	25 %	0 %	25 %	336319121
133	NC_015670	CACG	2	8	46495	46502	25 %	0 %	25 %	50 %	336319122
134	NC_015670	GGAT	2	8	46763	46770	25 %	25 %	50 %	0 %	336319122
135	NC_015670	TCTA	2	8	47028	47035	25 %	50 %	0 %	25 %	336319122
136	NC_015670	TGTC	2	8	47325	47332	0 %	50 %	25 %	25 %	336319122
137	NC_015670	CCAA	2	8	47535	47542	50 %	0 %	0 %	50 %	336319123
138	NC_015670	TTGA	2	8	47637	47644	25 %	50 %	25 %	0 %	336319124
139	NC_015670	CATG	2	8	47705	47712	25 %	25 %	25 %	25 %	336319124
140	NC_015670	TCAG	2	8	47716	47723	25 %	25 %	25 %	25 %	336319124
141	NC_015670	CAAG	2	8	47967	47974	50 %	0 %	25 %	25 %	336319124
142	NC_015670	GTTG	2	8	48568	48575	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015670	CTGT	2	8	48665	48672	0 %	50 %	25 %	25 %	336319127
144	NC_015670	GTCT	2	8	48706	48713	0 %	50 %	25 %	25 %	336319127
145	NC_015670	GGCT	2	8	48725	48732	0 %	25 %	50 %	25 %	336319127
146	NC_015670	TGGC	2	8	49082	49089	0 %	25 %	50 %	25 %	336319127
147	NC_015670	ATTA	2	8	49125	49132	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_015670	ATTA	2	8	49150	49157	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_015670	TATT	2	8	49188	49195	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_015670	ATTA	2	8	49206	49213	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_015670	TTCT	2	8	49557	49564	0 %	75 %	0 %	25 %	336319129
152	NC_015670	ATTT	2	8	50320	50327	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_015670	AGCA	2	8	50532	50539	50 %	0 %	25 %	25 %	336319132
154	NC_015670	GGGT	2	8	51056	51063	0 %	25 %	75 %	0 %	336319133
155	NC_015670	ATGA	2	8	51214	51221	50 %	25 %	25 %	0 %	336319133
156	NC_015670	TGAG	2	8	51825	51832	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.