MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Helicobacter bizzozeronii CIII-1 plasmid phbz1

Total Repeats: 129

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015670	GCAA	2	8	413	420	50 %	0 %	25 %	25 %	336319057
2	NC_015670	TAAT	2	8	1058	1065	50 %	50 %	0 %	0 %	336319059
3	NC_015670	ACAG	2	8	1308	1315	50 %	0 %	25 %	25 %	336319060
4	NC_015670	TTAC	2	8	2206	2213	25 %	50 %	0 %	25 %	336319063
5	NC_015670	GTTC	2	8	2487	2494	0 %	50 %	25 %	25 %	336319063
6	NC_015670	TTGC	2	8	2523	2530	0 %	50 %	25 %	25 %	336319063
7	NC_015670	GTTG	2	8	3369	3376	0 %	50 %	50 %	0 %	336319065
8	NC_015670	TTTG	2	8	3404	3411	0 %	75 %	25 %	0 %	336319065
9	NC_015670	AATG	2	8	4110	4117	50 %	25 %	25 %	0 %	336319066
10	NC_015670	AAAG	2	8	4250	4257	75 %	0 %	25 %	0 %	336319066
11	NC_015670	TGAG	2	8	4606	4613	25 %	25 %	50 %	0 %	336319066
12	NC_015670	TGAT	2	8	5551	5558	25 %	50 %	25 %	0 %	336319066
13	NC_015670	GAAT	2	8	5597	5604	50 %	25 %	25 %	0 %	336319066
14	NC_015670	ATCT	2	8	5605	5612	25 %	50 %	0 %	25 %	336319066
15	NC_015670	GATG	2	8	6373	6380	25 %	25 %	50 %	0 %	336319067
16	NC_015670	TTGC	2	8	6714	6721	0 %	50 %	25 %	25 %	336319067
17	NC_015670	CAAA	2	8	7287	7294	75 %	0 %	0 %	25 %	336319069
18	NC_015670	AGCA	2	8	7461	7468	50 %	0 %	25 %	25 %	336319069
19	NC_015670	CAAG	2	8	7519	7526	50 %	0 %	25 %	25 %	336319069
20	NC_015670	ATTA	2	8	7819	7826	50 %	50 %	0 %	0 %	336319070
21	NC_015670	GCAA	2	8	8090	8097	50 %	0 %	25 %	25 %	336319070
22	NC_015670	AAGA	2	8	8323	8330	75 %	0 %	25 %	0 %	336319070
23	NC_015670	CAAA	3	12	8497	8508	75 %	0 %	0 %	25 %	336319070
24	NC_015670	GCAG	2	8	8589	8596	25 %	0 %	50 %	25 %	336319070
25	NC_015670	TAGA	2	8	8618	8625	50 %	25 %	25 %	0 %	336319070
26	NC_015670	AAAG	2	8	8742	8749	75 %	0 %	25 %	0 %	336319070
27	NC_015670	CACT	2	8	8933	8940	25 %	25 %	0 %	50 %	336319070
28	NC_015670	ATTG	2	8	9030	9037	25 %	50 %	25 %	0 %	336319070
29	NC_015670	AAGC	2	8	9190	9197	50 %	0 %	25 %	25 %	336319070
30	NC_015670	CAGA	2	8	9364	9371	50 %	0 %	25 %	25 %	336319070
31	NC_015670	GCCC	2	8	9453	9460	0 %	0 %	25 %	75 %	336319070
32	NC_015670	TTCG	3	12	10120	10131	0 %	50 %	25 %	25 %	336319071
33	NC_015670	TTGG	2	8	10217	10224	0 %	50 %	50 %	0 %	336319071
34	NC_015670	TAAT	2	8	11686	11693	50 %	50 %	0 %	0 %	336319073
35	NC_015670	GGGC	2	8	12525	12532	0 %	0 %	75 %	25 %	336319076
36	NC_015670	ACTC	2	8	12774	12781	25 %	25 %	0 %	50 %	336319076
37	NC_015670	TGCT	2	8	14148	14155	0 %	50 %	25 %	25 %	336319077
38	NC_015670	CACT	2	8	14731	14738	25 %	25 %	0 %	50 %	336319079
39	NC_015670	GTTG	2	8	15139	15146	0 %	50 %	50 %	0 %	336319080
40	NC_015670	CAAG	2	8	15519	15526	50 %	0 %	25 %	25 %	336319081
41	NC_015670	GGGC	2	8	15925	15932	0 %	0 %	75 %	25 %	336319081
42	NC_015670	GTTT	2	8	16746	16753	0 %	75 %	25 %	0 %	336319083
43	NC_015670	GCTT	2	8	16893	16900	0 %	50 %	25 %	25 %	336319084
44	NC_015670	GCGT	2	8	17401	17408	0 %	25 %	50 %	25 %	336319085
45	NC_015670	ATTG	2	8	17498	17505	25 %	50 %	25 %	0 %	336319085
46	NC_015670	CGCC	2	8	17520	17527	0 %	0 %	25 %	75 %	336319085
47	NC_015670	GCTT	2	8	17680	17687	0 %	50 %	25 %	25 %	336319085
48	NC_015670	TCCC	2	8	17916	17923	0 %	25 %	0 %	75 %	336319085
49	NC_015670	CTGT	2	8	18121	18128	0 %	50 %	25 %	25 %	336319085
50	NC_015670	CCTC	2	8	18213	18220	0 %	25 %	0 %	75 %	336319086
51	NC_015670	ACCA	2	8	19586	19593	50 %	0 %	0 %	50 %	336319087
52	NC_015670	TGCT	2	8	19970	19977	0 %	50 %	25 %	25 %	336319087
53	NC_015670	CGCA	2	8	20261	20268	25 %	0 %	25 %	50 %	336319088
54	NC_015670	CTTT	2	8	21570	21577	0 %	75 %	0 %	25 %	336319088
55	NC_015670	TGCA	2	8	21808	21815	25 %	25 %	25 %	25 %	336319088
56	NC_015670	TCCA	2	8	22037	22044	25 %	25 %	0 %	50 %	336319088
57	NC_015670	CACC	2	8	23185	23192	25 %	0 %	0 %	75 %	336319089
58	NC_015670	CAGA	2	8	23319	23326	50 %	0 %	25 %	25 %	336319089
59	NC_015670	CAAG	2	8	23384	23391	50 %	0 %	25 %	25 %	336319089
60	NC_015670	TATC	2	8	23508	23515	25 %	50 %	0 %	25 %	336319089
61	NC_015670	CACC	2	8	24513	24520	25 %	0 %	0 %	75 %	336319091
62	NC_015670	GCTT	2	8	24557	24564	0 %	50 %	25 %	25 %	336319091
63	NC_015670	AATC	2	8	24717	24724	50 %	25 %	0 %	25 %	336319091
64	NC_015670	TAAA	2	8	24838	24845	75 %	25 %	0 %	0 %	336319091
65	NC_015670	TGTC	2	8	25512	25519	0 %	50 %	25 %	25 %	336319091
66	NC_015670	CTTG	2	8	25758	25765	0 %	50 %	25 %	25 %	336319091
67	NC_015670	GCTT	2	8	25971	25978	0 %	50 %	25 %	25 %	336319091
68	NC_015670	TTGG	2	8	26515	26522	0 %	50 %	50 %	0 %	336319091
69	NC_015670	TCAA	2	8	27314	27321	50 %	25 %	0 %	25 %	336319092
70	NC_015670	AAAC	2	8	27474	27481	75 %	0 %	0 %	25 %	336319092
71	NC_015670	TCCT	2	8	27558	27565	0 %	50 %	0 %	50 %	336319092
72	NC_015670	GCTG	2	8	28186	28193	0 %	25 %	50 %	25 %	336319093
73	NC_015670	TGGC	2	8	28674	28681	0 %	25 %	50 %	25 %	336319093
74	NC_015670	TAGC	2	8	28726	28733	25 %	25 %	25 %	25 %	336319093
75	NC_015670	TGTC	2	8	28815	28822	0 %	50 %	25 %	25 %	336319094
76	NC_015670	TTTG	2	8	28977	28984	0 %	75 %	25 %	0 %	336319094
77	NC_015670	GCGA	2	8	29296	29303	25 %	0 %	50 %	25 %	336319094
78	NC_015670	TTTG	2	8	29657	29664	0 %	75 %	25 %	0 %	336319094
79	NC_015670	TTGT	2	8	30016	30023	0 %	75 %	25 %	0 %	336319094
80	NC_015670	CTGG	2	8	30175	30182	0 %	25 %	50 %	25 %	336319094
81	NC_015670	CAAG	2	8	30546	30553	50 %	0 %	25 %	25 %	336319094
82	NC_015670	GAAC	2	8	31045	31052	50 %	0 %	25 %	25 %	336319096
83	NC_015670	TGAT	3	12	31405	31416	25 %	50 %	25 %	0 %	336319097
84	NC_015670	GCAC	2	8	33042	33049	25 %	0 %	25 %	50 %	336319102
85	NC_015670	AGGG	2	8	33722	33729	25 %	0 %	75 %	0 %	336319103
86	NC_015670	AAGC	2	8	34150	34157	50 %	0 %	25 %	25 %	336319103
87	NC_015670	CAAG	2	8	34616	34623	50 %	0 %	25 %	25 %	336319104
88	NC_015670	ACCC	2	8	34961	34968	25 %	0 %	0 %	75 %	336319105
89	NC_015670	GCTT	2	8	35158	35165	0 %	50 %	25 %	25 %	336319105
90	NC_015670	TCTT	2	8	35271	35278	0 %	75 %	0 %	25 %	336319105
91	NC_015670	TAGG	2	8	35664	35671	25 %	25 %	50 %	0 %	336319105
92	NC_015670	CCTC	2	8	35701	35708	0 %	25 %	0 %	75 %	336319105
93	NC_015670	ACAA	2	8	36017	36024	75 %	0 %	0 %	25 %	336319105
94	NC_015670	CGTG	2	8	36172	36179	0 %	25 %	50 %	25 %	336319106
95	NC_015670	CCCA	2	8	37348	37355	25 %	0 %	0 %	75 %	336319109
96	NC_015670	ACTT	2	8	37472	37479	25 %	50 %	0 %	25 %	336319109
97	NC_015670	CAAG	2	8	37837	37844	50 %	0 %	25 %	25 %	336319109
98	NC_015670	ATTA	2	8	37907	37914	50 %	50 %	0 %	0 %	336319109
99	NC_015670	TCTG	2	8	38661	38668	0 %	50 %	25 %	25 %	336319110
100	NC_015670	GCAC	2	8	38803	38810	25 %	0 %	25 %	50 %	336319110
101	NC_015670	GCTT	2	8	39621	39628	0 %	50 %	25 %	25 %	336319111
102	NC_015670	TTTG	2	8	40122	40129	0 %	75 %	25 %	0 %	336319111
103	NC_015670	TAGA	2	8	40179	40186	50 %	25 %	25 %	0 %	336319111
104	NC_015670	CACC	2	8	40998	41005	25 %	0 %	0 %	75 %	336319113
105	NC_015670	CAAA	2	8	41118	41125	75 %	0 %	0 %	25 %	336319113
106	NC_015670	ATTC	2	8	41326	41333	25 %	50 %	0 %	25 %	336319113
107	NC_015670	AGAA	2	8	42559	42566	75 %	0 %	25 %	0 %	336319115
108	NC_015670	GGTT	2	8	43482	43489	0 %	50 %	50 %	0 %	336319118
109	NC_015670	TGCG	2	8	43531	43538	0 %	25 %	50 %	25 %	336319118
110	NC_015670	CAAG	2	8	45042	45049	50 %	0 %	25 %	25 %	336319121
111	NC_015670	ACAG	2	8	45754	45761	50 %	0 %	25 %	25 %	336319121
112	NC_015670	TACA	2	8	46192	46199	50 %	25 %	0 %	25 %	336319121
113	NC_015670	CACG	2	8	46495	46502	25 %	0 %	25 %	50 %	336319122
114	NC_015670	GGAT	2	8	46763	46770	25 %	25 %	50 %	0 %	336319122
115	NC_015670	TCTA	2	8	47028	47035	25 %	50 %	0 %	25 %	336319122
116	NC_015670	TGTC	2	8	47325	47332	0 %	50 %	25 %	25 %	336319122
117	NC_015670	CCAA	2	8	47535	47542	50 %	0 %	0 %	50 %	336319123
118	NC_015670	TTGA	2	8	47637	47644	25 %	50 %	25 %	0 %	336319124
119	NC_015670	CATG	2	8	47705	47712	25 %	25 %	25 %	25 %	336319124
120	NC_015670	TCAG	2	8	47716	47723	25 %	25 %	25 %	25 %	336319124
121	NC_015670	CAAG	2	8	47967	47974	50 %	0 %	25 %	25 %	336319124
122	NC_015670	CTGT	2	8	48665	48672	0 %	50 %	25 %	25 %	336319127
123	NC_015670	GTCT	2	8	48706	48713	0 %	50 %	25 %	25 %	336319127
124	NC_015670	GGCT	2	8	48725	48732	0 %	25 %	50 %	25 %	336319127
125	NC_015670	TGGC	2	8	49082	49089	0 %	25 %	50 %	25 %	336319127
126	NC_015670	TTCT	2	8	49557	49564	0 %	75 %	0 %	25 %	336319129
127	NC_015670	AGCA	2	8	50532	50539	50 %	0 %	25 %	25 %	336319132
128	NC_015670	GGGT	2	8	51056	51063	0 %	25 %	75 %	0 %	336319133
129	NC_015670	ATGA	2	8	51214	51221	50 %	25 %	25 %	0 %	336319133

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.