MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Helicobacter bizzozeronii CIII-1 plasmid phbz1

Total Repeats: 425

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015670	TGG	3	9	272	280	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336319057
2	NC_015670	TAC	2	6	430	435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336319057
3	NC_015670	AAG	2	6	518	523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336319058
4	NC_015670	GAG	2	6	759	764	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336319058
5	NC_015670	AGT	2	6	818	823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015670	GGT	2	6	876	881	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336319059
7	NC_015670	TTG	2	6	944	949	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336319059
8	NC_015670	TGG	2	6	958	963	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336319059
9	NC_015670	AAT	2	6	1075	1080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336319059
10	NC_015670	AAT	2	6	1083	1088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336319059
11	NC_015670	TGA	2	6	1139	1144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336319060
12	NC_015670	CAA	2	6	1425	1430	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336319060
13	NC_015670	CAA	2	6	1508	1513	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336319060
14	NC_015670	CAA	2	6	1731	1736	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336319061
15	NC_015670	GCA	2	6	2126	2131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_015670	GAA	2	6	2237	2242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336319063
17	NC_015670	CTT	2	6	2262	2267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336319063
18	NC_015670	CAT	2	6	2399	2404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336319063
19	NC_015670	CCG	2	6	2472	2477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336319063
20	NC_015670	TTA	2	6	2559	2564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336319063
21	NC_015670	TGA	2	6	2628	2633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336319063
22	NC_015670	TCC	2	6	2743	2748	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_015670	GTG	2	6	2787	2792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015670	ATT	2	6	2860	2865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015670	CAT	2	6	2980	2985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_015670	ACA	2	6	3107	3112	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336319064
27	NC_015670	CCT	2	6	3192	3197	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_015670	ACA	2	6	3472	3477	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_015670	TGG	2	6	3574	3579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015670	CAT	2	6	3685	3690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_015670	CAA	2	6	4213	4218	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336319066
32	NC_015670	TAA	2	6	4223	4228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336319066
33	NC_015670	CAA	2	6	4344	4349	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336319066
34	NC_015670	AAG	2	6	4396	4401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336319066
35	NC_015670	AAG	2	6	4408	4413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336319066
36	NC_015670	GAT	2	6	4500	4505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336319066
37	NC_015670	CAT	2	6	4670	4675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336319066
38	NC_015670	CAA	2	6	4763	4768	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336319066
39	NC_015670	TGA	3	9	4805	4813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336319066
40	NC_015670	AAG	2	6	4823	4828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336319066
41	NC_015670	ATT	2	6	5015	5020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336319066
42	NC_015670	AAC	2	6	5079	5084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336319066
43	NC_015670	CCA	2	6	5161	5166	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336319066
44	NC_015670	ATC	2	6	5301	5306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336319066
45	NC_015670	AAG	2	6	5428	5433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336319066
46	NC_015670	GAT	2	6	5540	5545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336319066
47	NC_015670	TGA	2	6	5630	5635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336319066
48	NC_015670	ACT	3	9	5694	5702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336319066
49	NC_015670	CCA	2	6	5957	5962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336319066
50	NC_015670	ATT	2	6	6022	6027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336319066
51	NC_015670	ACT	2	6	6103	6108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_015670	GTT	2	6	6277	6282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336319067
53	NC_015670	GAC	2	6	6340	6345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336319067
54	NC_015670	GAT	2	6	6424	6429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336319067
55	NC_015670	ATC	2	6	6510	6515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336319067
56	NC_015670	AAT	2	6	6592	6597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336319067
57	NC_015670	CAC	2	6	6653	6658	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336319067
58	NC_015670	CAT	2	6	6661	6666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336319067
59	NC_015670	GTT	2	6	6694	6699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336319067
60	NC_015670	TCT	2	6	6753	6758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336319067
61	NC_015670	ATG	2	6	6791	6796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336319067
62	NC_015670	GTT	2	6	6826	6831	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336319067
63	NC_015670	GGA	2	6	7189	7194	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336319069
64	NC_015670	ATT	2	6	7220	7225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336319069
65	NC_015670	TGG	2	6	7802	7807	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336319070
66	NC_015670	GGT	2	6	7884	7889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336319070
67	NC_015670	GAT	3	9	8005	8013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336319070
68	NC_015670	CAC	2	6	8032	8037	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336319070
69	NC_015670	ATG	2	6	8177	8182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336319070
70	NC_015670	TGA	2	6	8258	8263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336319070
71	NC_015670	CAA	2	6	8519	8524	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336319070
72	NC_015670	ATA	2	6	8653	8658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336319070
73	NC_015670	CAG	2	6	8713	8718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336319070
74	NC_015670	GTT	2	6	8730	8735	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336319070
75	NC_015670	CAA	2	6	9130	9135	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336319070
76	NC_015670	CAA	2	6	9148	9153	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336319070
77	NC_015670	ATA	2	6	9353	9358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336319070
78	NC_015670	GAT	2	6	9481	9486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336319070
79	NC_015670	CTC	2	6	9969	9974	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336319071
80	NC_015670	CTT	3	9	10136	10144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336319071
81	NC_015670	TCT	2	6	10159	10164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336319071
82	NC_015670	GTT	2	6	10193	10198	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336319071
83	NC_015670	CAT	2	6	10446	10451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336319071
84	NC_015670	TGC	2	6	10464	10469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336319071
85	NC_015670	ATA	2	6	10572	10577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015670	TAA	3	9	10813	10821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015670	TGG	2	6	10844	10849	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015670	ATG	2	6	11197	11202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015670	TGT	2	6	11249	11254	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015670	TGG	2	6	11893	11898	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336319074
91	NC_015670	GTT	2	6	11900	11905	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336319074
92	NC_015670	ACA	2	6	12171	12176	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336319075
93	NC_015670	AGA	2	6	12252	12257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015670	AGC	2	6	12430	12435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336319076
95	NC_015670	TGG	2	6	12462	12467	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336319076
96	NC_015670	CAA	2	6	12562	12567	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336319076
97	NC_015670	ATT	2	6	12583	12588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336319076
98	NC_015670	CTC	2	6	12721	12726	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336319076
99	NC_015670	TTC	2	6	12745	12750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336319076
100	NC_015670	CAC	2	6	13078	13083	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336319076
101	NC_015670	CTC	2	6	13174	13179	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336319076
102	NC_015670	CGG	2	6	13187	13192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336319076
103	NC_015670	GTT	2	6	13411	13416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336319076
104	NC_015670	ATG	2	6	13474	13479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336319077
105	NC_015670	GGT	2	6	13662	13667	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336319077
106	NC_015670	CAA	2	6	13671	13676	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336319077
107	NC_015670	CCA	2	6	13679	13684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336319077
108	NC_015670	GTA	2	6	14046	14051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336319077
109	NC_015670	TTG	2	6	14665	14670	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336319078
110	NC_015670	ATG	2	6	14870	14875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336319079
111	NC_015670	AAC	2	6	14922	14927	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_015670	TAT	2	6	14947	14952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015670	CCT	2	6	15106	15111	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336319080
114	NC_015670	TTA	2	6	15352	15357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015670	AAC	2	6	15527	15532	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336319081
116	NC_015670	TAG	2	6	15683	15688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336319081
117	NC_015670	TGA	2	6	15725	15730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336319081
118	NC_015670	AAC	2	6	15802	15807	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336319081
119	NC_015670	GAT	2	6	15864	15869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336319081
120	NC_015670	GGC	2	6	15894	15899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336319081
121	NC_015670	CAA	2	6	15945	15950	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336319081
122	NC_015670	CGG	2	6	16206	16211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336319082
123	NC_015670	CAA	2	6	16300	16305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_015670	ACT	2	6	16319	16324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_015670	CAA	3	9	16400	16408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_015670	TTG	2	6	16636	16641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336319083
127	NC_015670	TTG	2	6	16761	16766	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336319083
128	NC_015670	TGT	2	6	16986	16991	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336319084
129	NC_015670	ACC	2	6	17260	17265	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336319085
130	NC_015670	CAC	2	6	17292	17297	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336319085
131	NC_015670	CAA	2	6	17411	17416	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336319085
132	NC_015670	ATA	2	6	17451	17456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336319085
133	NC_015670	ATA	2	6	17478	17483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336319085
134	NC_015670	TCC	2	6	17492	17497	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336319085
135	NC_015670	TTA	2	6	17572	17577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336319085
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138	NC_015670	TAA	2	6	17933	17938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336319085
139	NC_015670	AAT	2	6	17943	17948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336319085
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142	NC_015670	ATA	2	6	18323	18328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336319086
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148	NC_015670	AAC	2	6	19536	19541	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336319087
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153	NC_015670	TCC	2	6	19944	19949	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336319087
154	NC_015670	ACA	2	6	20053	20058	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336319087
155	NC_015670	TCT	2	6	20061	20066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
156	NC_015670	TGA	2	6	20182	20187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336319088
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239	NC_015670	TAA	2	6	30586	30591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336319094
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242	NC_015670	CAT	2	6	31099	31104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336319096
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244	NC_015670	ACC	2	6	31255	31260	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336319097
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247	NC_015670	ACC	2	6	31696	31701	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336319098
248	NC_015670	CAT	2	6	31736	31741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
249	NC_015670	TCT	2	6	32124	32129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336319099
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255	NC_015670	GTT	2	6	32954	32959	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336319102
256	NC_015670	TCC	2	6	32973	32978	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336319102
257	NC_015670	TAA	2	6	33229	33234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336319102
258	NC_015670	TCA	2	6	33252	33257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336319102
259	NC_015670	AAG	2	6	33371	33376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
260	NC_015670	TCA	2	6	33441	33446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
261	NC_015670	TGT	2	6	33504	33509	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
262	NC_015670	TAT	2	6	33620	33625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
263	NC_015670	ATC	2	6	33700	33705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336319103
264	NC_015670	TGG	2	6	33791	33796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336319103
265	NC_015670	ATT	3	9	33937	33945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336319103
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283	NC_015670	CAC	2	6	35619	35624	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336319105
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289	NC_015670	TAC	2	6	36382	36387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336319107
290	NC_015670	TAT	2	6	36656	36661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
291	NC_015670	CTA	2	6	36944	36949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336319108
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386	NC_015670	CTT	2	6	47077	47082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336319122
387	NC_015670	AAG	2	6	47152	47157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336319122
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402	NC_015670	TAA	2	6	49229	49234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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423	NC_015670	TTG	2	6	51694	51699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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425	NC_015670	GTT	2	6	51837	51842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.