MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Helicobacter bizzozeronii CIII-1 plasmid phbz1

Total Repeats: 364

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015670	TGG	3	9	272	280	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336319057
2	NC_015670	TAC	2	6	430	435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336319057
3	NC_015670	AAG	2	6	518	523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336319058
4	NC_015670	GAG	2	6	759	764	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336319058
5	NC_015670	GGT	2	6	876	881	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336319059
6	NC_015670	TTG	2	6	944	949	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336319059
7	NC_015670	TGG	2	6	958	963	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336319059
8	NC_015670	AAT	2	6	1075	1080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336319059
9	NC_015670	AAT	2	6	1083	1088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336319059
10	NC_015670	TGA	2	6	1139	1144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336319060
11	NC_015670	CAA	2	6	1425	1430	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336319060
12	NC_015670	CAA	2	6	1508	1513	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336319060
13	NC_015670	CAA	2	6	1731	1736	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336319061
14	NC_015670	GAA	2	6	2237	2242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336319063
15	NC_015670	CTT	2	6	2262	2267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336319063
16	NC_015670	CAT	2	6	2399	2404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336319063
17	NC_015670	CCG	2	6	2472	2477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336319063
18	NC_015670	TTA	2	6	2559	2564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336319063
19	NC_015670	TGA	2	6	2628	2633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336319063
20	NC_015670	ACA	2	6	3107	3112	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336319064
21	NC_015670	CAA	2	6	4213	4218	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336319066
22	NC_015670	TAA	2	6	4223	4228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336319066
23	NC_015670	CAA	2	6	4344	4349	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336319066
24	NC_015670	AAG	2	6	4396	4401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336319066
25	NC_015670	AAG	2	6	4408	4413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336319066
26	NC_015670	GAT	2	6	4500	4505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336319066
27	NC_015670	CAT	2	6	4670	4675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336319066
28	NC_015670	CAA	2	6	4763	4768	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336319066
29	NC_015670	TGA	3	9	4805	4813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336319066
30	NC_015670	AAG	2	6	4823	4828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336319066
31	NC_015670	ATT	2	6	5015	5020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336319066
32	NC_015670	AAC	2	6	5079	5084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336319066
33	NC_015670	CCA	2	6	5161	5166	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336319066
34	NC_015670	ATC	2	6	5301	5306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336319066
35	NC_015670	AAG	2	6	5428	5433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336319066
36	NC_015670	GAT	2	6	5540	5545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336319066
37	NC_015670	TGA	2	6	5630	5635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336319066
38	NC_015670	ACT	3	9	5694	5702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336319066
39	NC_015670	CCA	2	6	5957	5962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336319066
40	NC_015670	ATT	2	6	6022	6027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336319066
41	NC_015670	GTT	2	6	6277	6282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336319067
42	NC_015670	GAC	2	6	6340	6345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336319067
43	NC_015670	GAT	2	6	6424	6429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336319067
44	NC_015670	ATC	2	6	6510	6515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336319067
45	NC_015670	AAT	2	6	6592	6597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336319067
46	NC_015670	CAC	2	6	6653	6658	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336319067
47	NC_015670	CAT	2	6	6661	6666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336319067
48	NC_015670	GTT	2	6	6694	6699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336319067
49	NC_015670	TCT	2	6	6753	6758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336319067
50	NC_015670	ATG	2	6	6791	6796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336319067
51	NC_015670	GTT	2	6	6826	6831	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336319067
52	NC_015670	GGA	2	6	7189	7194	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336319069
53	NC_015670	ATT	2	6	7220	7225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336319069
54	NC_015670	TGG	2	6	7802	7807	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336319070
55	NC_015670	GGT	2	6	7884	7889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336319070
56	NC_015670	GAT	3	9	8005	8013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336319070
57	NC_015670	CAC	2	6	8032	8037	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336319070
58	NC_015670	ATG	2	6	8177	8182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336319070
59	NC_015670	TGA	2	6	8258	8263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336319070
60	NC_015670	CAA	2	6	8519	8524	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336319070
61	NC_015670	ATA	2	6	8653	8658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336319070
62	NC_015670	CAG	2	6	8713	8718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336319070
63	NC_015670	GTT	2	6	8730	8735	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336319070
64	NC_015670	CAA	2	6	9130	9135	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336319070
65	NC_015670	CAA	2	6	9148	9153	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336319070
66	NC_015670	ATA	2	6	9353	9358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336319070
67	NC_015670	GAT	2	6	9481	9486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336319070
68	NC_015670	CTC	2	6	9969	9974	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336319071
69	NC_015670	CTT	3	9	10136	10144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336319071
70	NC_015670	TCT	2	6	10159	10164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336319071
71	NC_015670	GTT	2	6	10193	10198	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336319071
72	NC_015670	CAT	2	6	10446	10451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336319071
73	NC_015670	TGC	2	6	10464	10469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336319071
74	NC_015670	TGG	2	6	11893	11898	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336319074
75	NC_015670	GTT	2	6	11900	11905	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336319074
76	NC_015670	ACA	2	6	12171	12176	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336319075
77	NC_015670	AGC	2	6	12430	12435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336319076
78	NC_015670	TGG	2	6	12462	12467	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336319076
79	NC_015670	CAA	2	6	12562	12567	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336319076
80	NC_015670	ATT	2	6	12583	12588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336319076
81	NC_015670	CTC	2	6	12721	12726	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336319076
82	NC_015670	TTC	2	6	12745	12750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336319076
83	NC_015670	CAC	2	6	13078	13083	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336319076
84	NC_015670	CTC	2	6	13174	13179	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336319076
85	NC_015670	CGG	2	6	13187	13192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336319076
86	NC_015670	GTT	2	6	13411	13416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336319076
87	NC_015670	ATG	2	6	13474	13479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336319077
88	NC_015670	GGT	2	6	13662	13667	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336319077
89	NC_015670	CAA	2	6	13671	13676	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336319077
90	NC_015670	CCA	2	6	13679	13684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336319077
91	NC_015670	GTA	2	6	14046	14051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336319077
92	NC_015670	TTG	2	6	14665	14670	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336319078
93	NC_015670	ATG	2	6	14870	14875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336319079
94	NC_015670	CCT	2	6	15106	15111	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336319080
95	NC_015670	AAC	2	6	15527	15532	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336319081
96	NC_015670	TAG	2	6	15683	15688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336319081
97	NC_015670	TGA	2	6	15725	15730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336319081
98	NC_015670	AAC	2	6	15802	15807	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336319081
99	NC_015670	GAT	2	6	15864	15869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336319081
100	NC_015670	GGC	2	6	15894	15899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336319081
101	NC_015670	CAA	2	6	15945	15950	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336319081
102	NC_015670	CGG	2	6	16206	16211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336319082
103	NC_015670	TTG	2	6	16636	16641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336319083
104	NC_015670	TTG	2	6	16761	16766	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336319083
105	NC_015670	TGT	2	6	16986	16991	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336319084
106	NC_015670	ACC	2	6	17260	17265	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336319085
107	NC_015670	CAC	2	6	17292	17297	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336319085
108	NC_015670	CAA	2	6	17411	17416	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336319085
109	NC_015670	ATA	2	6	17451	17456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336319085
110	NC_015670	ATA	2	6	17478	17483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336319085
111	NC_015670	TCC	2	6	17492	17497	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336319085
112	NC_015670	TTA	2	6	17572	17577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336319085
113	NC_015670	AAT	2	6	17619	17624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336319085
114	NC_015670	CTT	2	6	17747	17752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336319085
115	NC_015670	TAA	2	6	17933	17938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336319085
116	NC_015670	AAT	2	6	17943	17948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336319085
117	NC_015670	TGT	2	6	17991	17996	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336319085
118	NC_015670	CCA	2	6	18040	18045	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336319085
119	NC_015670	ATA	2	6	18323	18328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336319086
120	NC_015670	CTC	2	6	18620	18625	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336319087
121	NC_015670	CTT	2	6	18736	18741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336319087
122	NC_015670	TAG	2	6	18774	18779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336319087
123	NC_015670	CGC	2	6	18872	18877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336319087
124	NC_015670	CAA	2	6	19374	19379	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336319087
125	NC_015670	AAC	2	6	19536	19541	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336319087
126	NC_015670	TTA	2	6	19578	19583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336319087
127	NC_015670	CCA	2	6	19762	19767	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336319087
128	NC_015670	CAA	2	6	19771	19776	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336319087
129	NC_015670	AAC	2	6	19896	19901	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336319087
130	NC_015670	TCC	2	6	19944	19949	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336319087
131	NC_015670	ACA	2	6	20053	20058	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336319087
132	NC_015670	TGA	2	6	20182	20187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336319088
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135	NC_015670	TCA	2	6	20724	20729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336319088
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.