MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Helicobacter bizzozeronii CIII-1 plasmid phbz1

Total Repeats: 119

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015670	GT	3	6	898	903	0 %	50 %	50 %	0 %	336319059
2	NC_015670	AG	3	6	1324	1329	50 %	0 %	50 %	0 %	336319060
3	NC_015670	AG	3	6	1345	1350	50 %	0 %	50 %	0 %	336319060
4	NC_015670	AC	3	6	1361	1366	50 %	0 %	0 %	50 %	336319060
5	NC_015670	AG	3	6	1409	1414	50 %	0 %	50 %	0 %	336319060
6	NC_015670	GT	3	6	1724	1729	0 %	50 %	50 %	0 %	336319061
7	NC_015670	CA	3	6	3415	3420	50 %	0 %	0 %	50 %	336319065
8	NC_015670	CA	3	6	5687	5692	50 %	0 %	0 %	50 %	336319066
9	NC_015670	CA	3	6	5722	5727	50 %	0 %	0 %	50 %	336319066
10	NC_015670	AG	3	6	6256	6261	50 %	0 %	50 %	0 %	336319067
11	NC_015670	AG	3	6	7198	7203	50 %	0 %	50 %	0 %	336319069
12	NC_015670	CA	3	6	7588	7593	50 %	0 %	0 %	50 %	336319069
13	NC_015670	CA	3	6	8409	8414	50 %	0 %	0 %	50 %	336319070
14	NC_015670	AG	3	6	8875	8880	50 %	0 %	50 %	0 %	336319070
15	NC_015670	GC	3	6	9717	9722	0 %	0 %	50 %	50 %	336319070
16	NC_015670	GC	3	6	9754	9759	0 %	0 %	50 %	50 %	336319070
17	NC_015670	GT	3	6	9954	9959	0 %	50 %	50 %	0 %	336319071
18	NC_015670	CA	3	6	11000	11005	50 %	0 %	0 %	50 %	336319072
19	NC_015670	CA	3	6	11589	11594	50 %	0 %	0 %	50 %	336319073
20	NC_015670	TG	3	6	11650	11655	0 %	50 %	50 %	0 %	336319073
21	NC_015670	CA	3	6	11669	11674	50 %	0 %	0 %	50 %	336319073
22	NC_015670	GC	4	8	12352	12359	0 %	0 %	50 %	50 %	336319076
23	NC_015670	GC	3	6	12423	12428	0 %	0 %	50 %	50 %	336319076
24	NC_015670	CA	3	6	13267	13272	50 %	0 %	0 %	50 %	336319076
25	NC_015670	AG	4	8	13355	13362	50 %	0 %	50 %	0 %	336319076
26	NC_015670	TC	3	6	13461	13466	0 %	50 %	0 %	50 %	336319077
27	NC_015670	CT	3	6	13863	13868	0 %	50 %	0 %	50 %	336319077
28	NC_015670	CT	3	6	13933	13938	0 %	50 %	0 %	50 %	336319077
29	NC_015670	GT	3	6	14021	14026	0 %	50 %	50 %	0 %	336319077
30	NC_015670	CA	3	6	15214	15219	50 %	0 %	0 %	50 %	336319080
31	NC_015670	GT	3	6	15766	15771	0 %	50 %	50 %	0 %	336319081
32	NC_015670	CT	3	6	16816	16821	0 %	50 %	0 %	50 %	336319083
33	NC_015670	CA	3	6	17829	17834	50 %	0 %	0 %	50 %	336319085
34	NC_015670	CA	3	6	17876	17881	50 %	0 %	0 %	50 %	336319085
35	NC_015670	CT	3	6	17886	17891	0 %	50 %	0 %	50 %	336319085
36	NC_015670	AG	3	6	18827	18832	50 %	0 %	50 %	0 %	336319087
37	NC_015670	CT	3	6	19562	19567	0 %	50 %	0 %	50 %	336319087
38	NC_015670	GC	3	6	19841	19846	0 %	0 %	50 %	50 %	336319087
39	NC_015670	AT	3	6	20617	20622	50 %	50 %	0 %	0 %	336319088
40	NC_015670	AT	3	6	20827	20832	50 %	50 %	0 %	0 %	336319088
41	NC_015670	AC	3	6	21134	21139	50 %	0 %	0 %	50 %	336319088
42	NC_015670	TG	3	6	21348	21353	0 %	50 %	50 %	0 %	336319088
43	NC_015670	CA	3	6	21539	21544	50 %	0 %	0 %	50 %	336319088
44	NC_015670	GC	3	6	21677	21682	0 %	0 %	50 %	50 %	336319088
45	NC_015670	CA	3	6	22043	22048	50 %	0 %	0 %	50 %	336319088
46	NC_015670	TG	3	6	22847	22852	0 %	50 %	50 %	0 %	336319089
47	NC_015670	CG	3	6	23006	23011	0 %	0 %	50 %	50 %	336319089
48	NC_015670	CT	3	6	23161	23166	0 %	50 %	0 %	50 %	336319089
49	NC_015670	CG	3	6	24792	24797	0 %	0 %	50 %	50 %	336319091
50	NC_015670	TG	4	8	25016	25023	0 %	50 %	50 %	0 %	336319091
51	NC_015670	CT	3	6	25112	25117	0 %	50 %	0 %	50 %	336319091
52	NC_015670	TG	4	8	25746	25753	0 %	50 %	50 %	0 %	336319091
53	NC_015670	CA	3	6	26420	26425	50 %	0 %	0 %	50 %	336319091
54	NC_015670	CT	3	6	26459	26464	0 %	50 %	0 %	50 %	336319091
55	NC_015670	GC	3	6	26664	26669	0 %	0 %	50 %	50 %	336319091
56	NC_015670	CA	4	8	26709	26716	50 %	0 %	0 %	50 %	336319091
57	NC_015670	TG	3	6	27359	27364	0 %	50 %	50 %	0 %	336319092
58	NC_015670	TG	3	6	27930	27935	0 %	50 %	50 %	0 %	336319093
59	NC_015670	GC	3	6	28004	28009	0 %	0 %	50 %	50 %	336319093
60	NC_015670	TC	3	6	28502	28507	0 %	50 %	0 %	50 %	336319093
61	NC_015670	TG	3	6	28775	28780	0 %	50 %	50 %	0 %	336319094
62	NC_015670	CT	3	6	29098	29103	0 %	50 %	0 %	50 %	336319094
63	NC_015670	GT	3	6	29438	29443	0 %	50 %	50 %	0 %	336319094
64	NC_015670	AC	3	6	29745	29750	50 %	0 %	0 %	50 %	336319094
65	NC_015670	GT	3	6	29805	29810	0 %	50 %	50 %	0 %	336319094
66	NC_015670	GC	3	6	29833	29838	0 %	0 %	50 %	50 %	336319094
67	NC_015670	CT	3	6	30765	30770	0 %	50 %	0 %	50 %	336319095
68	NC_015670	TG	3	6	30777	30782	0 %	50 %	50 %	0 %	336319095
69	NC_015670	TG	3	6	30865	30870	0 %	50 %	50 %	0 %	336319095
70	NC_015670	TG	3	6	31113	31118	0 %	50 %	50 %	0 %	336319096
71	NC_015670	TG	3	6	32994	32999	0 %	50 %	50 %	0 %	336319102
72	NC_015670	AG	3	6	33969	33974	50 %	0 %	50 %	0 %	336319103
73	NC_015670	TC	3	6	34199	34204	0 %	50 %	0 %	50 %	336319103
74	NC_015670	AG	3	6	34384	34389	50 %	0 %	50 %	0 %	336319104
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77	NC_015670	TG	3	6	35683	35688	0 %	50 %	50 %	0 %	336319105
78	NC_015670	AG	3	6	36152	36157	50 %	0 %	50 %	0 %	336319106
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81	NC_015670	AC	3	6	37811	37816	50 %	0 %	0 %	50 %	336319109
82	NC_015670	AG	3	6	38068	38073	50 %	0 %	50 %	0 %	336319109
83	NC_015670	CT	3	6	38229	38234	0 %	50 %	0 %	50 %	336319110
84	NC_015670	TG	3	6	38948	38953	0 %	50 %	50 %	0 %	336319110
85	NC_015670	CA	3	6	38972	38977	50 %	0 %	0 %	50 %	336319110
86	NC_015670	CA	3	6	39231	39236	50 %	0 %	0 %	50 %	336319110
87	NC_015670	AG	3	6	39683	39688	50 %	0 %	50 %	0 %	336319111
88	NC_015670	GT	3	6	42155	42160	0 %	50 %	50 %	0 %	336319115
89	NC_015670	AC	3	6	42243	42248	50 %	0 %	0 %	50 %	336319115
90	NC_015670	AC	3	6	42357	42362	50 %	0 %	0 %	50 %	336319115
91	NC_015670	TG	3	6	42393	42398	0 %	50 %	50 %	0 %	336319115
92	NC_015670	GA	3	6	43279	43284	50 %	0 %	50 %	0 %	336319118
93	NC_015670	CA	3	6	44982	44987	50 %	0 %	0 %	50 %	336319121
94	NC_015670	AC	3	6	45122	45127	50 %	0 %	0 %	50 %	336319121
95	NC_015670	AG	3	6	45636	45641	50 %	0 %	50 %	0 %	336319121
96	NC_015670	TG	3	6	45876	45881	0 %	50 %	50 %	0 %	336319121
97	NC_015670	CA	3	6	46207	46212	50 %	0 %	0 %	50 %	336319121
98	NC_015670	CA	3	6	46227	46232	50 %	0 %	0 %	50 %	336319121
99	NC_015670	CA	3	6	46455	46460	50 %	0 %	0 %	50 %	336319122
100	NC_015670	TG	3	6	46615	46620	0 %	50 %	50 %	0 %	336319122
101	NC_015670	TC	3	6	46841	46846	0 %	50 %	0 %	50 %	336319122
102	NC_015670	CA	3	6	47779	47784	50 %	0 %	0 %	50 %	336319124
103	NC_015670	GA	4	8	47807	47814	50 %	0 %	50 %	0 %	336319124
104	NC_015670	AG	4	8	48143	48150	50 %	0 %	50 %	0 %	336319124
105	NC_015670	CT	3	6	48177	48182	0 %	50 %	0 %	50 %	336319124
106	NC_015670	TG	3	6	48520	48525	0 %	50 %	50 %	0 %	336319126
107	NC_015670	CT	3	6	48584	48589	0 %	50 %	0 %	50 %	336319127
108	NC_015670	AG	3	6	48630	48635	50 %	0 %	50 %	0 %	336319127
109	NC_015670	GT	4	8	48678	48685	0 %	50 %	50 %	0 %	336319127
110	NC_015670	TG	3	6	48760	48765	0 %	50 %	50 %	0 %	336319127
111	NC_015670	TG	3	6	48775	48780	0 %	50 %	50 %	0 %	336319127
112	NC_015670	TG	3	6	48802	48807	0 %	50 %	50 %	0 %	336319127
113	NC_015670	TG	3	6	49912	49917	0 %	50 %	50 %	0 %	336319130
114	NC_015670	TG	3	6	49997	50002	0 %	50 %	50 %	0 %	336319131
115	NC_015670	TC	3	6	50588	50593	0 %	50 %	0 %	50 %	336319132
116	NC_015670	AC	3	6	50672	50677	50 %	0 %	0 %	50 %	336319132
117	NC_015670	AT	3	6	50742	50747	50 %	50 %	0 %	0 %	336319133
118	NC_015670	AG	3	6	50844	50849	50 %	0 %	50 %	0 %	336319133
119	NC_015670	GC	3	6	50987	50992	0 %	0 %	50 %	50 %	336319133

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.