MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Halopiger xanaduensis SH-6 plasmid pHALXA02

Total Repeats: 34

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015667	ACCCA	2	10	14190	14199	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
2	NC_015667	GTAGA	2	10	24851	24860	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015667	CCACC	2	10	26508	26517	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
4	NC_015667	CTCCG	2	10	26518	26527	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
5	NC_015667	CTCCG	2	10	28001	28010	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
6	NC_015667	CAGCT	2	10	31835	31844	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
7	NC_015667	CTATA	2	10	37051	37060	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_015667	GCATG	2	10	42693	42702	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
9	NC_015667	GGTGA	2	10	42807	42816	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015667	TGTCT	2	10	43760	43769	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_015667	GGCGG	2	10	47981	47990	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
12	NC_015667	CTGAG	2	10	55352	55361	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
13	NC_015667	CGATA	2	10	55382	55391	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
14	NC_015667	ACCGC	2	10	55438	55447	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
15	NC_015667	ACGCT	2	10	63395	63404	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
16	NC_015667	TGTTT	2	10	69727	69736	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015667	GGATG	2	10	73658	73667	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015667	AGTTG	2	10	79630	79639	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015667	TTTCG	2	10	81271	81280	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
20	NC_015667	ATCGT	2	10	89790	89799	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
21	NC_015667	CTATT	2	10	101796	101805	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_015667	CGCAG	2	10	114155	114164	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
23	NC_015667	GAGTC	2	10	118949	118958	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
24	NC_015667	ACCGA	2	10	119000	119009	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
25	NC_015667	CTGAT	2	10	120537	120546	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_015667	TCGAG	2	10	124687	124696	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
27	NC_015667	CGTCT	2	10	151173	151182	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
28	NC_015667	GACGT	2	10	157498	157507	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
29	NC_015667	CACCG	2	10	164488	164497	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
30	NC_015667	GTCGC	2	10	170839	170848	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
31	NC_015667	ACCGT	2	10	170924	170933	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
32	NC_015667	GGTGC	2	10	171397	171406	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
33	NC_015667	TTCAA	2	10	171475	171484	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_015667	ATTGA	2	10	177685	177694	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.