MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Halopiger xanaduensis SH-6 plasmid pHALXA02

Total Repeats: 581

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015667	GCAT	2	8	133	140	25 %	25 %	25 %	25 %	336251561
2	NC_015667	GGCA	2	8	653	660	25 %	0 %	50 %	25 %	336251562
3	NC_015667	CGTC	2	8	1542	1549	0 %	25 %	25 %	50 %	336251563
4	NC_015667	CGGA	2	8	1582	1589	25 %	0 %	50 %	25 %	336251563
5	NC_015667	CGGA	2	8	1606	1613	25 %	0 %	50 %	25 %	336251563
6	NC_015667	CCAA	2	8	2012	2019	50 %	0 %	0 %	50 %	336251563
7	NC_015667	CGAT	2	8	2357	2364	25 %	25 %	25 %	25 %	336251563
8	NC_015667	TGGC	2	8	2502	2509	0 %	25 %	50 %	25 %	336251563
9	NC_015667	GCTG	2	8	2670	2677	0 %	25 %	50 %	25 %	336251564
10	NC_015667	TTCG	2	8	3288	3295	0 %	50 %	25 %	25 %	336251564
11	NC_015667	AGTG	2	8	3444	3451	25 %	25 %	50 %	0 %	336251564
12	NC_015667	ACGA	2	8	3763	3770	50 %	0 %	25 %	25 %	336251565
13	NC_015667	TCGC	2	8	4682	4689	0 %	25 %	25 %	50 %	336251566
14	NC_015667	CGTT	2	8	4695	4702	0 %	50 %	25 %	25 %	336251566
15	NC_015667	CGTT	2	8	5379	5386	0 %	50 %	25 %	25 %	336251566
16	NC_015667	ATTC	2	8	5473	5480	25 %	50 %	0 %	25 %	336251566
17	NC_015667	TCGT	2	8	5589	5596	0 %	50 %	25 %	25 %	336251566
18	NC_015667	ACGA	2	8	7848	7855	50 %	0 %	25 %	25 %	336251567
19	NC_015667	AACG	2	8	8568	8575	50 %	0 %	25 %	25 %	336251568
20	NC_015667	GATC	2	8	8622	8629	25 %	25 %	25 %	25 %	336251568
21	NC_015667	ACCG	2	8	8649	8656	25 %	0 %	25 %	50 %	336251568
22	NC_015667	TCAC	2	8	9853	9860	25 %	25 %	0 %	50 %	336251568
23	NC_015667	CTCA	2	8	10975	10982	25 %	25 %	0 %	50 %	336251568
24	NC_015667	GAGC	2	8	12087	12094	25 %	0 %	50 %	25 %	336251569
25	NC_015667	ACCA	2	8	12672	12679	50 %	0 %	0 %	50 %	336251570
26	NC_015667	AAGG	2	8	14415	14422	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015667	CCGA	2	8	14691	14698	25 %	0 %	25 %	50 %	336251571
28	NC_015667	GTCG	2	8	14711	14718	0 %	25 %	50 %	25 %	336251571
29	NC_015667	CACG	2	8	14750	14757	25 %	0 %	25 %	50 %	336251571
30	NC_015667	CCGA	2	8	14863	14870	25 %	0 %	25 %	50 %	336251571
31	NC_015667	CAGC	2	8	14977	14984	25 %	0 %	25 %	50 %	336251571
32	NC_015667	CACC	2	8	15116	15123	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
33	NC_015667	GAGT	2	8	15136	15143	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015667	GAGC	2	8	15247	15254	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
35	NC_015667	AGCG	2	8	15536	15543	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
36	NC_015667	CGGC	2	8	15601	15608	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_015667	CTGA	2	8	15756	15763	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_015667	CGGC	2	8	16093	16100	0 %	0 %	50 %	50 %	336251572
39	NC_015667	TCAC	2	8	16218	16225	25 %	25 %	0 %	50 %	336251573
40	NC_015667	CGCT	2	8	16381	16388	0 %	25 %	25 %	50 %	336251573
41	NC_015667	CTCG	2	8	16613	16620	0 %	25 %	25 %	50 %	336251574
42	NC_015667	GACG	2	8	16849	16856	25 %	0 %	50 %	25 %	336251574
43	NC_015667	TCGC	2	8	17192	17199	0 %	25 %	25 %	50 %	336251575
44	NC_015667	CGAC	2	8	17495	17502	25 %	0 %	25 %	50 %	336251575
45	NC_015667	AGCG	2	8	17535	17542	25 %	0 %	50 %	25 %	336251575
46	NC_015667	GTTG	2	8	18296	18303	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015667	CGAG	2	8	18484	18491	25 %	0 %	50 %	25 %	336251576
48	NC_015667	CACT	2	8	18717	18724	25 %	25 %	0 %	50 %	336251576
49	NC_015667	GACA	2	8	19253	19260	50 %	0 %	25 %	25 %	336251577
50	NC_015667	GAAA	2	8	19733	19740	75 %	0 %	25 %	0 %	336251578
51	NC_015667	CGGC	2	8	19748	19755	0 %	0 %	50 %	50 %	336251578
52	NC_015667	TCGA	2	8	19810	19817	25 %	25 %	25 %	25 %	336251578
53	NC_015667	CTAC	2	8	20976	20983	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_015667	CACC	2	8	21061	21068	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
55	NC_015667	CGTC	2	8	21071	21078	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
56	NC_015667	ACCC	2	8	21092	21099	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
57	NC_015667	ACGA	2	8	21355	21362	50 %	0 %	25 %	25 %	336251582
58	NC_015667	CATC	2	8	21826	21833	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_015667	TTAT	2	8	21970	21977	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015667	GAGT	2	8	22531	22538	25 %	25 %	50 %	0 %	336251583
61	NC_015667	CGGA	2	8	22758	22765	25 %	0 %	50 %	25 %	336251583
62	NC_015667	CCGA	2	8	22860	22867	25 %	0 %	25 %	50 %	336251583
63	NC_015667	CCAT	2	8	23115	23122	25 %	25 %	0 %	50 %	336251583
64	NC_015667	ACGA	2	8	23177	23184	50 %	0 %	25 %	25 %	336251583
65	NC_015667	CTGG	2	8	23208	23215	0 %	25 %	50 %	25 %	336251583
66	NC_015667	CAGC	2	8	23430	23437	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
67	NC_015667	ATCT	2	8	23489	23496	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_015667	TGAG	2	8	24212	24219	25 %	25 %	50 %	0 %	336251584
69	NC_015667	CGGA	2	8	24244	24251	25 %	0 %	50 %	25 %	336251584
70	NC_015667	CCGG	2	8	24330	24337	0 %	0 %	50 %	50 %	336251584
71	NC_015667	GCCA	2	8	24370	24377	25 %	0 %	25 %	50 %	336251584
72	NC_015667	TGAG	2	8	24434	24441	25 %	25 %	50 %	0 %	336251584
73	NC_015667	GGTC	2	8	24838	24845	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
74	NC_015667	CAGC	2	8	25053	25060	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
75	NC_015667	TTCG	2	8	25141	25148	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_015667	CGAC	2	8	25157	25164	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
77	NC_015667	CTGC	3	12	25174	25185	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
78	NC_015667	CGGG	2	8	25191	25198	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
79	NC_015667	CGCT	2	8	25395	25402	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
80	NC_015667	CTCA	2	8	25439	25446	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_015667	TCGC	2	8	25456	25463	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
82	NC_015667	GCGA	2	8	25488	25495	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
83	NC_015667	GTCG	2	8	25514	25521	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
84	NC_015667	GCAA	2	8	25738	25745	50 %	0 %	25 %	25 %	336251585
85	NC_015667	TCAA	2	8	26001	26008	50 %	25 %	0 %	25 %	336251585
86	NC_015667	CCTG	2	8	26234	26241	0 %	25 %	25 %	50 %	336251585
87	NC_015667	GACC	2	8	26491	26498	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
88	NC_015667	GCTC	2	8	26529	26536	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
89	NC_015667	ACCG	2	8	27194	27201	25 %	0 %	25 %	50 %	336251586
90	NC_015667	ATCA	2	8	27340	27347	50 %	25 %	0 %	25 %	336251586
91	NC_015667	GAGC	2	8	27546	27553	25 %	0 %	50 %	25 %	336251586
92	NC_015667	CGGT	2	8	27867	27874	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
93	NC_015667	GCTC	2	8	28012	28019	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
94	NC_015667	CCGT	2	8	28652	28659	0 %	25 %	25 %	50 %	336251587
95	NC_015667	TCGG	2	8	28686	28693	0 %	25 %	50 %	25 %	336251587
96	NC_015667	CGTC	2	8	29007	29014	0 %	25 %	25 %	50 %	336251587
97	NC_015667	CCGG	2	8	29513	29520	0 %	0 %	50 %	50 %	336251587
98	NC_015667	TCGC	2	8	29871	29878	0 %	25 %	25 %	50 %	336251587
99	NC_015667	CGCT	2	8	30514	30521	0 %	25 %	25 %	50 %	336251588
100	NC_015667	GGGC	2	8	31478	31485	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
101	NC_015667	AACC	2	8	31594	31601	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_015667	ACTA	2	8	32121	32128	50 %	25 %	0 %	25 %	336251590
103	NC_015667	CTCG	2	8	33113	33120	0 %	25 %	25 %	50 %	336251590
104	NC_015667	AATT	2	8	33334	33341	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015667	GATT	2	8	33697	33704	25 %	50 %	25 %	0 %	336251591
106	NC_015667	TCCA	2	8	34064	34071	25 %	25 %	0 %	50 %	336251591
107	NC_015667	TCGC	2	8	34163	34170	0 %	25 %	25 %	50 %	336251591
108	NC_015667	TGCT	2	8	34344	34351	0 %	50 %	25 %	25 %	336251591
109	NC_015667	CGAA	2	8	34601	34608	50 %	0 %	25 %	25 %	336251592
110	NC_015667	AGCC	2	8	34656	34663	25 %	0 %	25 %	50 %	336251592
111	NC_015667	CAAA	2	8	35139	35146	75 %	0 %	0 %	25 %	336251592
112	NC_015667	GATG	2	8	35483	35490	25 %	25 %	50 %	0 %	336251592
113	NC_015667	TCGA	2	8	35765	35772	25 %	25 %	25 %	25 %	336251592
114	NC_015667	AGTG	2	8	36385	36392	25 %	25 %	50 %	0 %	336251593
115	NC_015667	GGCC	2	8	36456	36463	0 %	0 %	50 %	50 %	336251593
116	NC_015667	TGCC	2	8	36585	36592	0 %	25 %	25 %	50 %	336251593
117	NC_015667	CAAC	2	8	37702	37709	50 %	0 %	0 %	50 %	336251594
118	NC_015667	GAAC	2	8	37887	37894	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
119	NC_015667	ACGC	2	8	37914	37921	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
120	NC_015667	TTTC	2	8	38880	38887	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_015667	GGCG	2	8	39098	39105	0 %	0 %	75 %	25 %	336251596
122	NC_015667	GACG	2	8	39153	39160	25 %	0 %	50 %	25 %	336251596
123	NC_015667	CATC	2	8	39910	39917	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_015667	AGAA	2	8	40294	40301	75 %	0 %	25 %	0 %	336251598
125	NC_015667	CTCC	2	8	40509	40516	0 %	25 %	0 %	75 %	336251599
126	NC_015667	CGAT	2	8	41220	41227	25 %	25 %	25 %	25 %	336251600
127	NC_015667	AACA	2	8	41913	41920	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_015667	ATGA	2	8	41946	41953	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015667	GCTG	2	8	42075	42082	0 %	25 %	50 %	25 %	336251601
130	NC_015667	CCAT	2	8	42207	42214	25 %	25 %	0 %	50 %	336251601
131	NC_015667	AAGG	2	8	43321	43328	50 %	0 %	50 %	0 %	336251602
132	NC_015667	GTGG	2	8	43696	43703	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015667	ACGA	2	8	43817	43824	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_015667	TCAG	2	8	44012	44019	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_015667	TTAA	2	8	44201	44208	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015667	TCCG	2	8	44600	44607	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
137	NC_015667	GACC	2	8	44631	44638	25 %	0 %	25 %	50 %	336251603
138	NC_015667	TCGA	2	8	44934	44941	25 %	25 %	25 %	25 %	336251603
139	NC_015667	TCCG	2	8	45687	45694	0 %	25 %	25 %	50 %	336251604
140	NC_015667	CGCC	2	8	45748	45755	0 %	0 %	25 %	75 %	336251604
141	NC_015667	GATC	2	8	45874	45881	25 %	25 %	25 %	25 %	336251604
142	NC_015667	GCCG	2	8	46537	46544	0 %	0 %	50 %	50 %	336251605
143	NC_015667	CGGG	2	8	46658	46665	0 %	0 %	75 %	25 %	336251605
144	NC_015667	TAGA	2	8	47879	47886	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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