MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Halopiger xanaduensis SH-6 plasmid pHALXA02

Total Repeats: 543

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015667	CTA	2	6	843	848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_015667	TTC	2	6	14082	14087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_015667	AGA	2	6	14088	14093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015667	GGA	2	6	14166	14171	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015667	GTC	2	6	14206	14211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_015667	CAC	2	6	14272	14277	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_015667	TCG	2	6	14319	14324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_015667	GAT	2	6	14592	14597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015667	ACG	2	6	14607	14612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_015667	AGC	2	6	14625	14630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_015667	CTC	2	6	15202	15207	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_015667	GTC	3	9	15221	15229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_015667	GAG	2	6	15230	15235	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015667	CGA	2	6	15351	15356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_015667	CGG	2	6	15370	15375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_015667	CGC	2	6	15427	15432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_015667	CGG	2	6	15433	15438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_015667	ACG	2	6	15498	15503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_015667	GAA	2	6	15544	15549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015667	GAC	2	6	15557	15562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_015667	CTC	2	6	15563	15568	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_015667	TGG	2	6	15630	15635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015667	GCA	2	6	15655	15660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_015667	CGA	2	6	15718	15723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_015667	TGC	2	6	15821	15826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_015667	ACC	2	6	16505	16510	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_015667	ACC	2	6	17662	17667	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_015667	GAC	2	6	17792	17797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_015667	TCG	2	6	17810	17815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_015667	GTG	2	6	17844	17849	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015667	ACT	2	6	18036	18041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_015667	GAC	2	6	18090	18095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_015667	CGG	2	6	18203	18208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_015667	AGT	2	6	18281	18286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015667	TGG	2	6	18323	18328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015667	AGA	2	6	18379	18384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015667	CAA	2	6	19969	19974	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_015667	TGT	2	6	20052	20057	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015667	TGA	2	6	20071	20076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015667	CAC	2	6	20123	20128	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_015667	TAC	3	9	20157	20165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_015667	TCC	2	6	20865	20870	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_015667	CCA	2	6	20926	20931	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_015667	AGG	2	6	20995	21000	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015667	CGC	2	6	21023	21028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_015667	GAT	2	6	21030	21035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015667	ATC	2	6	21040	21045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_015667	CAC	2	6	21100	21105	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_015667	ACC	2	6	21114	21119	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_015667	TGC	2	6	21146	21151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_015667	TCC	2	6	21749	21754	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_015667	ACC	2	6	21796	21801	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_015667	GGT	2	6	21815	21820	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015667	TCG	2	6	21851	21856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_015667	CTG	2	6	21937	21942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_015667	TAC	2	6	21946	21951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_015667	TAG	2	6	21978	21983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015667	GTA	2	6	21994	21999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015667	TCA	2	6	23515	23520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_015667	GTA	2	6	23594	23599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015667	TCG	2	6	24884	24889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_015667	CTC	2	6	24972	24977	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_015667	CGG	2	6	24998	25003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_015667	CCA	2	6	25035	25040	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_015667	CGC	2	6	25106	25111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_015667	GCC	2	6	25113	25118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_015667	GCC	2	6	25288	25293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_015667	CCG	2	6	25354	25359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_015667	GTC	2	6	25524	25529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_015667	GGC	2	6	25559	25564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_015667	ACA	2	6	26672	26677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_015667	ACT	2	6	27646	27651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_015667	TAC	2	6	27695	27700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_015667	GAA	2	6	27852	27857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015667	GGT	2	6	27893	27898	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015667	GGT	2	6	27926	27931	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015667	GTC	3	9	27943	27951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_015667	CGC	2	6	27988	27993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_015667	TAG	2	6	28074	28079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015667	GCT	2	6	28091	28096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_015667	TTA	2	6	28125	28130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015667	AAT	2	6	28158	28163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015667	CGG	2	6	28398	28403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_015667	GAT	2	6	28424	28429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015667	ACG	2	6	28488	28493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_015667	AGT	2	6	28516	28521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015667	CGC	2	6	31396	31401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_015667	AGT	2	6	31437	31442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015667	GTA	2	6	31455	31460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015667	CCT	2	6	31543	31548	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_015667	TGG	2	6	31860	31865	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015667	ACA	2	6	31871	31876	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_015667	CAT	2	6	31916	31921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_015667	TAA	2	6	31922	31927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015667	ATG	2	6	31972	31977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015667	CAC	2	6	31987	31992	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_015667	ACT	2	6	32023	32028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_015667	TAG	2	6	32107	32112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015667	TGG	2	6	33273	33278	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015667	TCT	2	6	34489	34494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_015667	TGT	2	6	36084	36089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015667	GCA	2	6	36145	36150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_015667	CGA	2	6	36274	36279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_015667	AGC	2	6	37068	37073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_015667	ACC	2	6	37370	37375	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_015667	ACC	2	6	37797	37802	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_015667	TCG	2	6	38984	38989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_015667	CTT	2	6	39207	39212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_015667	GAC	2	6	39295	39300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_015667	TAC	2	6	39850	39855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_015667	CTA	2	6	41895	41900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_015667	AGA	2	6	41937	41942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015667	TTA	2	6	42570	42575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015667	TCT	2	6	43668	43673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_015667	GAT	2	6	43674	43679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015667	GTG	2	6	43727	43732	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015667	TCC	2	6	43840	43845	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_015667	GCA	2	6	43856	43861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_015667	GAA	2	6	43963	43968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015667	TGT	2	6	44143	44148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015667	GTC	2	6	44290	44295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_015667	TCG	2	6	44361	44366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_015667	CAG	2	6	44412	44417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_015667	TGG	2	6	44431	44436	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015667	GTC	2	6	44439	44444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_015667	CAA	2	6	44448	44453	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_015667	CAG	2	6	44461	44466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_015667	CCG	2	6	44471	44476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_015667	TCT	3	9	44482	44490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_015667	GAA	2	6	46391	46396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015667	TTG	2	6	47962	47967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015667	GAG	2	6	47971	47976	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015667	TCG	2	6	48004	48009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_015667	GTC	2	6	49009	49014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_015667	GCA	2	6	49058	49063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_015667	CGA	2	6	49072	49077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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138	NC_015667	CCA	2	6	50388	50393	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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