MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Halopiger xanaduensis SH-6 plasmid pHALXA02

Total Repeats: 205

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015667	CT	3	6	215	220	0 %	50 %	0 %	50 %	336251561
2	NC_015667	TC	3	6	1518	1523	0 %	50 %	0 %	50 %	336251563
3	NC_015667	CG	3	6	1907	1912	0 %	0 %	50 %	50 %	336251563
4	NC_015667	CT	3	6	2963	2968	0 %	50 %	0 %	50 %	336251564
5	NC_015667	TA	3	6	3194	3199	50 %	50 %	0 %	0 %	336251564
6	NC_015667	AC	3	6	3718	3723	50 %	0 %	0 %	50 %	336251565
7	NC_015667	TC	3	6	3964	3969	0 %	50 %	0 %	50 %	336251565
8	NC_015667	GA	3	6	4002	4007	50 %	0 %	50 %	0 %	336251565
9	NC_015667	GC	3	6	4182	4187	0 %	0 %	50 %	50 %	336251565
10	NC_015667	TC	3	6	4229	4234	0 %	50 %	0 %	50 %	336251565
11	NC_015667	CT	3	6	4245	4250	0 %	50 %	0 %	50 %	336251565
12	NC_015667	TC	3	6	4740	4745	0 %	50 %	0 %	50 %	336251566
13	NC_015667	AT	3	6	4789	4794	50 %	50 %	0 %	0 %	336251566
14	NC_015667	CG	3	6	6545	6550	0 %	0 %	50 %	50 %	336251567
15	NC_015667	AC	3	6	9349	9354	50 %	0 %	0 %	50 %	336251568
16	NC_015667	GC	3	6	10314	10319	0 %	0 %	50 %	50 %	336251568
17	NC_015667	CT	3	6	10567	10572	0 %	50 %	0 %	50 %	336251568
18	NC_015667	GC	3	6	11281	11286	0 %	0 %	50 %	50 %	336251568
19	NC_015667	AG	3	6	11865	11870	50 %	0 %	50 %	0 %	336251569
20	NC_015667	AG	3	6	12488	12493	50 %	0 %	50 %	0 %	336251569
21	NC_015667	GT	3	6	13499	13504	0 %	50 %	50 %	0 %	336251570
22	NC_015667	GA	3	6	14970	14975	50 %	0 %	50 %	0 %	336251571
23	NC_015667	CG	3	6	16419	16424	0 %	0 %	50 %	50 %	336251573
24	NC_015667	GA	3	6	23902	23907	50 %	0 %	50 %	0 %	336251584
25	NC_015667	TG	3	6	24404	24409	0 %	50 %	50 %	0 %	336251584
26	NC_015667	GA	3	6	24503	24508	50 %	0 %	50 %	0 %	336251584
27	NC_015667	AC	3	6	25950	25955	50 %	0 %	0 %	50 %	336251585
28	NC_015667	AC	3	6	26046	26051	50 %	0 %	0 %	50 %	336251585
29	NC_015667	AG	3	6	26844	26849	50 %	0 %	50 %	0 %	336251586
30	NC_015667	CG	3	6	28988	28993	0 %	0 %	50 %	50 %	336251587
31	NC_015667	GC	3	6	29142	29147	0 %	0 %	50 %	50 %	336251587
32	NC_015667	GC	3	6	29151	29156	0 %	0 %	50 %	50 %	336251587
33	NC_015667	CG	3	6	34000	34005	0 %	0 %	50 %	50 %	336251591
34	NC_015667	GA	3	6	34798	34803	50 %	0 %	50 %	0 %	336251592
35	NC_015667	GA	3	6	35533	35538	50 %	0 %	50 %	0 %	336251592
36	NC_015667	CA	3	6	37647	37652	50 %	0 %	0 %	50 %	336251594
37	NC_015667	AG	3	6	38041	38046	50 %	0 %	50 %	0 %	336251595
38	NC_015667	AG	3	6	38280	38285	50 %	0 %	50 %	0 %	336251595
39	NC_015667	GA	3	6	38673	38678	50 %	0 %	50 %	0 %	336251595
40	NC_015667	CG	3	6	40120	40125	0 %	0 %	50 %	50 %	336251598
41	NC_015667	CA	3	6	40154	40159	50 %	0 %	0 %	50 %	336251598
42	NC_015667	GA	3	6	41049	41054	50 %	0 %	50 %	0 %	336251599
43	NC_015667	AT	4	8	41702	41709	50 %	50 %	0 %	0 %	336251600
44	NC_015667	AT	3	6	42232	42237	50 %	50 %	0 %	0 %	336251601
45	NC_015667	CA	3	6	42262	42267	50 %	0 %	0 %	50 %	336251601
46	NC_015667	CT	3	6	42832	42837	0 %	50 %	0 %	50 %	336251602
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48	NC_015667	CG	3	6	46189	46194	0 %	0 %	50 %	50 %	336251604
49	NC_015667	TC	3	6	46240	46245	0 %	50 %	0 %	50 %	336251604
50	NC_015667	CG	3	6	47034	47039	0 %	0 %	50 %	50 %	336251605
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52	NC_015667	GC	3	6	48433	48438	0 %	0 %	50 %	50 %	336251606
53	NC_015667	GC	3	6	48485	48490	0 %	0 %	50 %	50 %	336251606
54	NC_015667	CA	3	6	48916	48921	50 %	0 %	0 %	50 %	336251606
55	NC_015667	TC	3	6	49124	49129	0 %	50 %	0 %	50 %	336251607
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62	NC_015667	GA	3	6	56638	56643	50 %	0 %	50 %	0 %	336251612
63	NC_015667	AC	4	8	59183	59190	50 %	0 %	0 %	50 %	336251614
64	NC_015667	GA	3	6	60726	60731	50 %	0 %	50 %	0 %	336251617
65	NC_015667	AC	3	6	62296	62301	50 %	0 %	0 %	50 %	336251620
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67	NC_015667	CG	3	6	63189	63194	0 %	0 %	50 %	50 %	336251620
68	NC_015667	GA	3	6	63325	63330	50 %	0 %	50 %	0 %	336251620
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72	NC_015667	CG	3	6	65733	65738	0 %	0 %	50 %	50 %	336251623
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93	NC_015667	CG	3	6	88654	88659	0 %	0 %	50 %	50 %	336251646
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110	NC_015667	CG	3	6	98838	98843	0 %	0 %	50 %	50 %	336251658
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113	NC_015667	CG	3	6	102283	102288	0 %	0 %	50 %	50 %	336251662
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.