MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Halopiger xanaduensis SH-6 chromosome

Total Repeats: 11734

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015666	TCGA	2	8	6	13	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_015666	ACGG	2	8	52	59	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3	NC_015666	GCCG	2	8	420	427	0 %	0 %	50 %	50 %	336252098
4	NC_015666	CGCT	2	8	571	578	0 %	25 %	25 %	50 %	336252098
5	NC_015666	GCGA	2	8	850	857	25 %	0 %	50 %	25 %	336252098
6	NC_015666	GCCG	2	8	900	907	0 %	0 %	50 %	50 %	336252098
7	NC_015666	CGAT	2	8	1238	1245	25 %	25 %	25 %	25 %	336252098
8	NC_015666	TCGC	2	8	1285	1292	0 %	25 %	25 %	50 %	336252098
9	NC_015666	CGCC	2	8	1451	1458	0 %	0 %	25 %	75 %	336252098
10	NC_015666	CGCC	2	8	1820	1827	0 %	0 %	25 %	75 %	336252098
11	NC_015666	GCCG	2	8	2653	2660	0 %	0 %	50 %	50 %	336252100
12	NC_015666	GACG	2	8	2858	2865	25 %	0 %	50 %	25 %	336252100
13	NC_015666	GGGA	2	8	3169	3176	25 %	0 %	75 %	0 %	336252101
14	NC_015666	GGGC	2	8	3230	3237	0 %	0 %	75 %	25 %	336252101
15	NC_015666	TCGA	2	8	3571	3578	25 %	25 %	25 %	25 %	336252101
16	NC_015666	CGGA	2	8	3800	3807	25 %	0 %	50 %	25 %	336252101
17	NC_015666	CCGC	2	8	3871	3878	0 %	0 %	25 %	75 %	336252101
18	NC_015666	GCCG	2	8	4064	4071	0 %	0 %	50 %	50 %	336252102
19	NC_015666	TCGG	2	8	4185	4192	0 %	25 %	50 %	25 %	336252102
20	NC_015666	ACGT	2	8	4254	4261	25 %	25 %	25 %	25 %	336252102
21	NC_015666	CGGG	2	8	4389	4396	0 %	0 %	75 %	25 %	336252102
22	NC_015666	GGGC	2	8	4616	4623	0 %	0 %	75 %	25 %	336252102
23	NC_015666	CGAT	2	8	4771	4778	25 %	25 %	25 %	25 %	336252102
24	NC_015666	TCGT	2	8	5433	5440	0 %	50 %	25 %	25 %	336252103
25	NC_015666	TCGG	2	8	5962	5969	0 %	25 %	50 %	25 %	336252104
26	NC_015666	AGCG	2	8	6370	6377	25 %	0 %	50 %	25 %	336252104
27	NC_015666	TCCT	2	8	6526	6533	0 %	50 %	0 %	50 %	336252104
28	NC_015666	GATC	2	8	6627	6634	25 %	25 %	25 %	25 %	336252104
29	NC_015666	CGAG	2	8	6641	6648	25 %	0 %	50 %	25 %	336252104
30	NC_015666	TCGA	2	8	6862	6869	25 %	25 %	25 %	25 %	336252104
31	NC_015666	CGGC	2	8	6948	6955	0 %	0 %	50 %	50 %	336252104
32	NC_015666	CGAC	2	8	7244	7251	25 %	0 %	25 %	50 %	336252104
33	NC_015666	CGAG	2	8	7283	7290	25 %	0 %	50 %	25 %	336252104
34	NC_015666	TCGA	2	8	7375	7382	25 %	25 %	25 %	25 %	336252104
35	NC_015666	ATCA	2	8	7579	7586	50 %	25 %	0 %	25 %	336252104
36	NC_015666	CTCG	2	8	7667	7674	0 %	25 %	25 %	50 %	336252104
37	NC_015666	CGAC	2	8	8237	8244	25 %	0 %	25 %	50 %	336252104
38	NC_015666	ACGG	2	8	10076	10083	25 %	0 %	50 %	25 %	336252106
39	NC_015666	TCGG	2	8	10591	10598	0 %	25 %	50 %	25 %	336252106
40	NC_015666	GCCG	2	8	10699	10706	0 %	0 %	50 %	50 %	336252106
41	NC_015666	GCGG	2	8	10717	10724	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
42	NC_015666	AGTC	2	8	10838	10845	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_015666	CGCC	2	8	11364	11371	0 %	0 %	25 %	75 %	336252108
44	NC_015666	CGGC	2	8	11421	11428	0 %	0 %	50 %	50 %	336252108
45	NC_015666	CGGG	2	8	11577	11584	0 %	0 %	75 %	25 %	336252108
46	NC_015666	GCCC	2	8	11847	11854	0 %	0 %	25 %	75 %	336252108
47	NC_015666	GCAC	2	8	13432	13439	25 %	0 %	25 %	50 %	336252109
48	NC_015666	CGTC	2	8	13777	13784	0 %	25 %	25 %	50 %	336252109
49	NC_015666	GATA	2	8	14499	14506	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015666	GCCG	2	8	14623	14630	0 %	0 %	50 %	50 %	336252111
51	NC_015666	GGCC	2	8	15130	15137	0 %	0 %	50 %	50 %	336252111
52	NC_015666	TCCA	2	8	15266	15273	25 %	25 %	0 %	50 %	336252111
53	NC_015666	GGCG	2	8	15315	15322	0 %	0 %	75 %	25 %	336252111
54	NC_015666	GAGG	2	8	16378	16385	25 %	0 %	75 %	0 %	336252111
55	NC_015666	TCGG	2	8	16874	16881	0 %	25 %	50 %	25 %	336252111
56	NC_015666	TAGT	2	8	17330	17337	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015666	TTTC	2	8	17357	17364	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_015666	TCAC	2	8	17471	17478	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_015666	AGTC	2	8	17547	17554	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_015666	TCGC	2	8	18088	18095	0 %	25 %	25 %	50 %	336252112
61	NC_015666	CGGT	2	8	18134	18141	0 %	25 %	50 %	25 %	336252112
62	NC_015666	GACG	2	8	18189	18196	25 %	0 %	50 %	25 %	336252112
63	NC_015666	CGGC	2	8	18248	18255	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_015666	GTCG	2	8	18334	18341	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
65	NC_015666	GCTC	2	8	18796	18803	0 %	25 %	25 %	50 %	336252113
66	NC_015666	CCGA	2	8	18868	18875	25 %	0 %	25 %	50 %	336252113
67	NC_015666	TCGG	2	8	19174	19181	0 %	25 %	50 %	25 %	336252113
68	NC_015666	CCGA	2	8	19278	19285	25 %	0 %	25 %	50 %	336252113
69	NC_015666	GGAA	2	8	19467	19474	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015666	GCCG	2	8	20121	20128	0 %	0 %	50 %	50 %	336252114
71	NC_015666	GGCC	2	8	20225	20232	0 %	0 %	50 %	50 %	336252114
72	NC_015666	CCGG	2	8	20640	20647	0 %	0 %	50 %	50 %	336252114
73	NC_015666	GAGT	2	8	20947	20954	25 %	25 %	50 %	0 %	336252114
74	NC_015666	CCGG	2	8	21131	21138	0 %	0 %	50 %	50 %	336252114
75	NC_015666	GCGA	2	8	21368	21375	25 %	0 %	50 %	25 %	336252115
76	NC_015666	CGAT	2	8	21560	21567	25 %	25 %	25 %	25 %	336252115
77	NC_015666	CGGA	2	8	21724	21731	25 %	0 %	50 %	25 %	336252115
78	NC_015666	ATCG	2	8	21769	21776	25 %	25 %	25 %	25 %	336252115
79	NC_015666	CGCA	2	8	22123	22130	25 %	0 %	25 %	50 %	336252116
80	NC_015666	GTTC	2	8	22154	22161	0 %	50 %	25 %	25 %	336252116
81	NC_015666	TCCG	2	8	22188	22195	0 %	25 %	25 %	50 %	336252116
82	NC_015666	TCGA	2	8	22249	22256	25 %	25 %	25 %	25 %	336252116
83	NC_015666	CGAC	2	8	22369	22376	25 %	0 %	25 %	50 %	336252116
84	NC_015666	GCCG	2	8	23566	23573	0 %	0 %	50 %	50 %	336252117
85	NC_015666	GCCG	2	8	23833	23840	0 %	0 %	50 %	50 %	336252117
86	NC_015666	CGAG	2	8	23950	23957	25 %	0 %	50 %	25 %	336252117
87	NC_015666	CGGC	2	8	24124	24131	0 %	0 %	50 %	50 %	336252117
88	NC_015666	GCGG	2	8	24188	24195	0 %	0 %	75 %	25 %	336252117
89	NC_015666	CGAC	2	8	24214	24221	25 %	0 %	25 %	50 %	336252117
90	NC_015666	AGCG	2	8	24432	24439	25 %	0 %	50 %	25 %	336252117
91	NC_015666	CGGC	2	8	24484	24491	0 %	0 %	50 %	50 %	336252117
92	NC_015666	AGCC	2	8	24669	24676	25 %	0 %	25 %	50 %	336252117
93	NC_015666	GGGC	2	8	25011	25018	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
94	NC_015666	CTGG	2	8	25029	25036	0 %	25 %	50 %	25 %	336252118
95	NC_015666	GTCG	2	8	25085	25092	0 %	25 %	50 %	25 %	336252118
96	NC_015666	GTTC	2	8	25214	25221	0 %	50 %	25 %	25 %	336252118
97	NC_015666	GCCG	2	8	26404	26411	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
98	NC_015666	CGTC	2	8	26426	26433	0 %	25 %	25 %	50 %	336252119
99	NC_015666	CGAA	2	8	26902	26909	50 %	0 %	25 %	25 %	336252119
100	NC_015666	TCGA	2	8	26952	26959	25 %	25 %	25 %	25 %	336252119
101	NC_015666	CGAC	2	8	27662	27669	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
102	NC_015666	TCGA	2	8	28039	28046	25 %	25 %	25 %	25 %	336252121
103	NC_015666	GACA	2	8	28401	28408	50 %	0 %	25 %	25 %	336252121
104	NC_015666	TCGC	2	8	28418	28425	0 %	25 %	25 %	50 %	336252121
105	NC_015666	ATCG	2	8	28465	28472	25 %	25 %	25 %	25 %	336252121
106	NC_015666	CCGA	2	8	29476	29483	25 %	0 %	25 %	50 %	336252121
107	NC_015666	CGAG	2	8	29544	29551	25 %	0 %	50 %	25 %	336252122
108	NC_015666	GCCG	2	8	29885	29892	0 %	0 %	50 %	50 %	336252122
109	NC_015666	ATCG	2	8	30003	30010	25 %	25 %	25 %	25 %	336252122
110	NC_015666	CTCG	2	8	30310	30317	0 %	25 %	25 %	50 %	336252122
111	NC_015666	CGCT	2	8	30630	30637	0 %	25 %	25 %	50 %	336252122
112	NC_015666	GCCC	2	8	30690	30697	0 %	0 %	25 %	75 %	336252122
113	NC_015666	CGAG	2	8	30847	30854	25 %	0 %	50 %	25 %	336252122
114	NC_015666	TCCG	2	8	31014	31021	0 %	25 %	25 %	50 %	336252122
115	NC_015666	CGGG	2	8	31249	31256	0 %	0 %	75 %	25 %	336252122
116	NC_015666	GGCG	2	8	31358	31365	0 %	0 %	75 %	25 %	336252122
117	NC_015666	GCGA	2	8	32256	32263	25 %	0 %	50 %	25 %	336252122
118	NC_015666	GCCG	2	8	32357	32364	0 %	0 %	50 %	50 %	336252122
119	NC_015666	GTCG	2	8	32387	32394	0 %	25 %	50 %	25 %	336252122
120	NC_015666	CCTC	2	8	32499	32506	0 %	25 %	0 %	75 %	336252122
121	NC_015666	GATC	2	8	32534	32541	25 %	25 %	25 %	25 %	336252122
122	NC_015666	CATC	2	8	32595	32602	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_015666	TCGG	2	8	32659	32666	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
124	NC_015666	GAAA	2	8	32723	32730	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015666	TCCG	2	8	33713	33720	0 %	25 %	25 %	50 %	336252124
126	NC_015666	CCGA	2	8	34410	34417	25 %	0 %	25 %	50 %	336252125
127	NC_015666	GGTC	2	8	34466	34473	0 %	25 %	50 %	25 %	336252125
128	NC_015666	CTTT	2	8	35592	35599	0 %	75 %	0 %	25 %	336252128
129	NC_015666	CGCC	2	8	35940	35947	0 %	0 %	25 %	75 %	336252129
130	NC_015666	CCGC	2	8	36056	36063	0 %	0 %	25 %	75 %	336252129
131	NC_015666	GCCG	2	8	36144	36151	0 %	0 %	50 %	50 %	336252129
132	NC_015666	CCGT	2	8	36235	36242	0 %	25 %	25 %	50 %	336252129
133	NC_015666	AACG	2	8	36476	36483	50 %	0 %	25 %	25 %	336252130
134	NC_015666	CCGG	2	8	36837	36844	0 %	0 %	50 %	50 %	336252130
135	NC_015666	CGAC	2	8	36910	36917	25 %	0 %	25 %	50 %	336252130
136	NC_015666	CCAC	2	8	36981	36988	25 %	0 %	0 %	75 %	336252130
137	NC_015666	CCGA	2	8	36995	37002	25 %	0 %	25 %	50 %	336252130
138	NC_015666	GCCT	2	8	37013	37020	0 %	25 %	25 %	50 %	336252130
139	NC_015666	CCGA	2	8	37095	37102	25 %	0 %	25 %	50 %	336252130
140	NC_015666	ACGC	2	8	37212	37219	25 %	0 %	25 %	50 %	336252130
141	NC_015666	TCCG	2	8	37499	37506	0 %	25 %	25 %	50 %	336252130
142	NC_015666	GTGC	2	8	38062	38069	0 %	25 %	50 %	25 %	336252130
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144	NC_015666	GGAA	2	8	38520	38527	50 %	0 %	50 %	0 %	336252130
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146	NC_015666	GAAC	2	8	38853	38860	50 %	0 %	25 %	25 %	336252131
147	NC_015666	TCGG	2	8	38980	38987	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
148	NC_015666	CGAC	2	8	39394	39401	25 %	0 %	25 %	50 %	336252132
149	NC_015666	GGCG	2	8	39986	39993	0 %	0 %	75 %	25 %	336252133
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151	NC_015666	TCGC	2	8	41317	41324	0 %	25 %	25 %	50 %	336252134
152	NC_015666	CGGC	2	8	42175	42182	0 %	0 %	50 %	50 %	336252135
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158	NC_015666	TCGT	2	8	44763	44770	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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185	NC_015666	GGCT	2	8	52274	52281	0 %	25 %	50 %	25 %	336252145
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255	NC_015666	GCCG	2	8	73613	73620	0 %	0 %	50 %	50 %	336252172
256	NC_015666	GCCG	2	8	73770	73777	0 %	0 %	50 %	50 %	336252172
257	NC_015666	ACCG	2	8	73868	73875	25 %	0 %	25 %	50 %	336252172
258	NC_015666	CGAG	2	8	74122	74129	25 %	0 %	50 %	25 %	336252172
259	NC_015666	CGAC	2	8	74293	74300	25 %	0 %	25 %	50 %	336252172
260	NC_015666	ACGT	2	8	74877	74884	25 %	25 %	25 %	25 %	336252173
261	NC_015666	ACGG	2	8	75160	75167	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
262	NC_015666	TCGA	2	8	75207	75214	25 %	25 %	25 %	25 %	336252174
263	NC_015666	GTCG	2	8	75531	75538	0 %	25 %	50 %	25 %	336252174
264	NC_015666	TCGT	2	8	76153	76160	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
265	NC_015666	GCCA	2	8	76499	76506	25 %	0 %	25 %	50 %	336252176
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267	NC_015666	CGGC	2	8	77970	77977	0 %	0 %	50 %	50 %	336252176
268	NC_015666	AACT	2	8	78734	78741	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
269	NC_015666	CCGG	2	8	79319	79326	0 %	0 %	50 %	50 %	336252178
270	NC_015666	AGCG	2	8	79434	79441	25 %	0 %	50 %	25 %	336252178
271	NC_015666	CCGG	2	8	79632	79639	0 %	0 %	50 %	50 %	336252178
272	NC_015666	GCTG	2	8	79679	79686	0 %	25 %	50 %	25 %	336252178
273	NC_015666	ATCG	2	8	79811	79818	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
274	NC_015666	CCGA	2	8	79912	79919	25 %	0 %	25 %	50 %	336252179
275	NC_015666	GATC	2	8	79950	79957	25 %	25 %	25 %	25 %	336252179
276	NC_015666	GCCG	2	8	80235	80242	0 %	0 %	50 %	50 %	336252179
277	NC_015666	GTCG	2	8	80502	80509	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
278	NC_015666	CAGC	2	8	80730	80737	25 %	0 %	25 %	50 %	336252180
279	NC_015666	GAAC	2	8	80745	80752	50 %	0 %	25 %	25 %	336252180
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