MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Halopiger xanaduensis SH-6 chromosome

Total Repeats: 9662

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015666	GCCG	2	8	420	427	0 %	0 %	50 %	50 %	336252098
2	NC_015666	CGCT	2	8	571	578	0 %	25 %	25 %	50 %	336252098
3	NC_015666	GCGA	2	8	850	857	25 %	0 %	50 %	25 %	336252098
4	NC_015666	GCCG	2	8	900	907	0 %	0 %	50 %	50 %	336252098
5	NC_015666	CGAT	2	8	1238	1245	25 %	25 %	25 %	25 %	336252098
6	NC_015666	TCGC	2	8	1285	1292	0 %	25 %	25 %	50 %	336252098
7	NC_015666	CGCC	2	8	1451	1458	0 %	0 %	25 %	75 %	336252098
8	NC_015666	CGCC	2	8	1820	1827	0 %	0 %	25 %	75 %	336252098
9	NC_015666	GCCG	2	8	2653	2660	0 %	0 %	50 %	50 %	336252100
10	NC_015666	GACG	2	8	2858	2865	25 %	0 %	50 %	25 %	336252100
11	NC_015666	GGGA	2	8	3169	3176	25 %	0 %	75 %	0 %	336252101
12	NC_015666	GGGC	2	8	3230	3237	0 %	0 %	75 %	25 %	336252101
13	NC_015666	TCGA	2	8	3571	3578	25 %	25 %	25 %	25 %	336252101
14	NC_015666	CGGA	2	8	3800	3807	25 %	0 %	50 %	25 %	336252101
15	NC_015666	CCGC	2	8	3871	3878	0 %	0 %	25 %	75 %	336252101
16	NC_015666	GCCG	2	8	4064	4071	0 %	0 %	50 %	50 %	336252102
17	NC_015666	TCGG	2	8	4185	4192	0 %	25 %	50 %	25 %	336252102
18	NC_015666	ACGT	2	8	4254	4261	25 %	25 %	25 %	25 %	336252102
19	NC_015666	CGGG	2	8	4389	4396	0 %	0 %	75 %	25 %	336252102
20	NC_015666	GGGC	2	8	4616	4623	0 %	0 %	75 %	25 %	336252102
21	NC_015666	CGAT	2	8	4771	4778	25 %	25 %	25 %	25 %	336252102
22	NC_015666	TCGT	2	8	5433	5440	0 %	50 %	25 %	25 %	336252103
23	NC_015666	TCGG	2	8	5962	5969	0 %	25 %	50 %	25 %	336252104
24	NC_015666	AGCG	2	8	6370	6377	25 %	0 %	50 %	25 %	336252104
25	NC_015666	TCCT	2	8	6526	6533	0 %	50 %	0 %	50 %	336252104
26	NC_015666	GATC	2	8	6627	6634	25 %	25 %	25 %	25 %	336252104
27	NC_015666	CGAG	2	8	6641	6648	25 %	0 %	50 %	25 %	336252104
28	NC_015666	TCGA	2	8	6862	6869	25 %	25 %	25 %	25 %	336252104
29	NC_015666	CGGC	2	8	6948	6955	0 %	0 %	50 %	50 %	336252104
30	NC_015666	CGAC	2	8	7244	7251	25 %	0 %	25 %	50 %	336252104
31	NC_015666	CGAG	2	8	7283	7290	25 %	0 %	50 %	25 %	336252104
32	NC_015666	TCGA	2	8	7375	7382	25 %	25 %	25 %	25 %	336252104
33	NC_015666	ATCA	2	8	7579	7586	50 %	25 %	0 %	25 %	336252104
34	NC_015666	CTCG	2	8	7667	7674	0 %	25 %	25 %	50 %	336252104
35	NC_015666	CGAC	2	8	8237	8244	25 %	0 %	25 %	50 %	336252104
36	NC_015666	ACGG	2	8	10076	10083	25 %	0 %	50 %	25 %	336252106
37	NC_015666	TCGG	2	8	10591	10598	0 %	25 %	50 %	25 %	336252106
38	NC_015666	GCCG	2	8	10699	10706	0 %	0 %	50 %	50 %	336252106
39	NC_015666	CGCC	2	8	11364	11371	0 %	0 %	25 %	75 %	336252108
40	NC_015666	CGGC	2	8	11421	11428	0 %	0 %	50 %	50 %	336252108
41	NC_015666	CGGG	2	8	11577	11584	0 %	0 %	75 %	25 %	336252108
42	NC_015666	GCCC	2	8	11847	11854	0 %	0 %	25 %	75 %	336252108
43	NC_015666	GCAC	2	8	13432	13439	25 %	0 %	25 %	50 %	336252109
44	NC_015666	CGTC	2	8	13777	13784	0 %	25 %	25 %	50 %	336252109
45	NC_015666	GCCG	2	8	14623	14630	0 %	0 %	50 %	50 %	336252111
46	NC_015666	GGCC	2	8	15130	15137	0 %	0 %	50 %	50 %	336252111
47	NC_015666	TCCA	2	8	15266	15273	25 %	25 %	0 %	50 %	336252111
48	NC_015666	GGCG	2	8	15315	15322	0 %	0 %	75 %	25 %	336252111
49	NC_015666	GAGG	2	8	16378	16385	25 %	0 %	75 %	0 %	336252111
50	NC_015666	TCGG	2	8	16874	16881	0 %	25 %	50 %	25 %	336252111
51	NC_015666	TCGC	2	8	18088	18095	0 %	25 %	25 %	50 %	336252112
52	NC_015666	CGGT	2	8	18134	18141	0 %	25 %	50 %	25 %	336252112
53	NC_015666	GACG	2	8	18189	18196	25 %	0 %	50 %	25 %	336252112
54	NC_015666	GCTC	2	8	18796	18803	0 %	25 %	25 %	50 %	336252113
55	NC_015666	CCGA	2	8	18868	18875	25 %	0 %	25 %	50 %	336252113
56	NC_015666	TCGG	2	8	19174	19181	0 %	25 %	50 %	25 %	336252113
57	NC_015666	CCGA	2	8	19278	19285	25 %	0 %	25 %	50 %	336252113
58	NC_015666	GCCG	2	8	20121	20128	0 %	0 %	50 %	50 %	336252114
59	NC_015666	GGCC	2	8	20225	20232	0 %	0 %	50 %	50 %	336252114
60	NC_015666	CCGG	2	8	20640	20647	0 %	0 %	50 %	50 %	336252114
61	NC_015666	GAGT	2	8	20947	20954	25 %	25 %	50 %	0 %	336252114
62	NC_015666	CCGG	2	8	21131	21138	0 %	0 %	50 %	50 %	336252114
63	NC_015666	GCGA	2	8	21368	21375	25 %	0 %	50 %	25 %	336252115
64	NC_015666	CGAT	2	8	21560	21567	25 %	25 %	25 %	25 %	336252115
65	NC_015666	CGGA	2	8	21724	21731	25 %	0 %	50 %	25 %	336252115
66	NC_015666	ATCG	2	8	21769	21776	25 %	25 %	25 %	25 %	336252115
67	NC_015666	CGCA	2	8	22123	22130	25 %	0 %	25 %	50 %	336252116
68	NC_015666	GTTC	2	8	22154	22161	0 %	50 %	25 %	25 %	336252116
69	NC_015666	TCCG	2	8	22188	22195	0 %	25 %	25 %	50 %	336252116
70	NC_015666	TCGA	2	8	22249	22256	25 %	25 %	25 %	25 %	336252116
71	NC_015666	CGAC	2	8	22369	22376	25 %	0 %	25 %	50 %	336252116
72	NC_015666	GCCG	2	8	23566	23573	0 %	0 %	50 %	50 %	336252117
73	NC_015666	GCCG	2	8	23833	23840	0 %	0 %	50 %	50 %	336252117
74	NC_015666	CGAG	2	8	23950	23957	25 %	0 %	50 %	25 %	336252117
75	NC_015666	CGGC	2	8	24124	24131	0 %	0 %	50 %	50 %	336252117
76	NC_015666	GCGG	2	8	24188	24195	0 %	0 %	75 %	25 %	336252117
77	NC_015666	CGAC	2	8	24214	24221	25 %	0 %	25 %	50 %	336252117
78	NC_015666	AGCG	2	8	24432	24439	25 %	0 %	50 %	25 %	336252117
79	NC_015666	CGGC	2	8	24484	24491	0 %	0 %	50 %	50 %	336252117
80	NC_015666	AGCC	2	8	24669	24676	25 %	0 %	25 %	50 %	336252117
81	NC_015666	CTGG	2	8	25029	25036	0 %	25 %	50 %	25 %	336252118
82	NC_015666	GTCG	2	8	25085	25092	0 %	25 %	50 %	25 %	336252118
83	NC_015666	GTTC	2	8	25214	25221	0 %	50 %	25 %	25 %	336252118
84	NC_015666	CGTC	2	8	26426	26433	0 %	25 %	25 %	50 %	336252119
85	NC_015666	CGAA	2	8	26902	26909	50 %	0 %	25 %	25 %	336252119
86	NC_015666	TCGA	2	8	26952	26959	25 %	25 %	25 %	25 %	336252119
87	NC_015666	TCGA	2	8	28039	28046	25 %	25 %	25 %	25 %	336252121
88	NC_015666	GACA	2	8	28401	28408	50 %	0 %	25 %	25 %	336252121
89	NC_015666	TCGC	2	8	28418	28425	0 %	25 %	25 %	50 %	336252121
90	NC_015666	ATCG	2	8	28465	28472	25 %	25 %	25 %	25 %	336252121
91	NC_015666	CCGA	2	8	29476	29483	25 %	0 %	25 %	50 %	336252121
92	NC_015666	CGAG	2	8	29544	29551	25 %	0 %	50 %	25 %	336252122
93	NC_015666	GCCG	2	8	29885	29892	0 %	0 %	50 %	50 %	336252122
94	NC_015666	ATCG	2	8	30003	30010	25 %	25 %	25 %	25 %	336252122
95	NC_015666	CTCG	2	8	30310	30317	0 %	25 %	25 %	50 %	336252122
96	NC_015666	CGCT	2	8	30630	30637	0 %	25 %	25 %	50 %	336252122
97	NC_015666	GCCC	2	8	30690	30697	0 %	0 %	25 %	75 %	336252122
98	NC_015666	CGAG	2	8	30847	30854	25 %	0 %	50 %	25 %	336252122
99	NC_015666	TCCG	2	8	31014	31021	0 %	25 %	25 %	50 %	336252122
100	NC_015666	CGGG	2	8	31249	31256	0 %	0 %	75 %	25 %	336252122
101	NC_015666	GGCG	2	8	31358	31365	0 %	0 %	75 %	25 %	336252122
102	NC_015666	GCGA	2	8	32256	32263	25 %	0 %	50 %	25 %	336252122
103	NC_015666	GCCG	2	8	32357	32364	0 %	0 %	50 %	50 %	336252122
104	NC_015666	GTCG	2	8	32387	32394	0 %	25 %	50 %	25 %	336252122
105	NC_015666	CCTC	2	8	32499	32506	0 %	25 %	0 %	75 %	336252122
106	NC_015666	GATC	2	8	32534	32541	25 %	25 %	25 %	25 %	336252122
107	NC_015666	TCCG	2	8	33713	33720	0 %	25 %	25 %	50 %	336252124
108	NC_015666	CCGA	2	8	34410	34417	25 %	0 %	25 %	50 %	336252125
109	NC_015666	GGTC	2	8	34466	34473	0 %	25 %	50 %	25 %	336252125
110	NC_015666	CTTT	2	8	35592	35599	0 %	75 %	0 %	25 %	336252128
111	NC_015666	CGCC	2	8	35940	35947	0 %	0 %	25 %	75 %	336252129
112	NC_015666	CCGC	2	8	36056	36063	0 %	0 %	25 %	75 %	336252129
113	NC_015666	GCCG	2	8	36144	36151	0 %	0 %	50 %	50 %	336252129
114	NC_015666	CCGT	2	8	36235	36242	0 %	25 %	25 %	50 %	336252129
115	NC_015666	AACG	2	8	36476	36483	50 %	0 %	25 %	25 %	336252130
116	NC_015666	CCGG	2	8	36837	36844	0 %	0 %	50 %	50 %	336252130
117	NC_015666	CGAC	2	8	36910	36917	25 %	0 %	25 %	50 %	336252130
118	NC_015666	CCAC	2	8	36981	36988	25 %	0 %	0 %	75 %	336252130
119	NC_015666	CCGA	2	8	36995	37002	25 %	0 %	25 %	50 %	336252130
120	NC_015666	GCCT	2	8	37013	37020	0 %	25 %	25 %	50 %	336252130
121	NC_015666	CCGA	2	8	37095	37102	25 %	0 %	25 %	50 %	336252130
122	NC_015666	ACGC	2	8	37212	37219	25 %	0 %	25 %	50 %	336252130
123	NC_015666	TCCG	2	8	37499	37506	0 %	25 %	25 %	50 %	336252130
124	NC_015666	GTGC	2	8	38062	38069	0 %	25 %	50 %	25 %	336252130
125	NC_015666	CGCC	2	8	38275	38282	0 %	0 %	25 %	75 %	336252130
126	NC_015666	GGAA	2	8	38520	38527	50 %	0 %	50 %	0 %	336252130
127	NC_015666	GTTC	2	8	38845	38852	0 %	50 %	25 %	25 %	336252131
128	NC_015666	GAAC	2	8	38853	38860	50 %	0 %	25 %	25 %	336252131
129	NC_015666	CGAC	2	8	39394	39401	25 %	0 %	25 %	50 %	336252132
130	NC_015666	GGCG	2	8	39986	39993	0 %	0 %	75 %	25 %	336252133
131	NC_015666	TCGC	2	8	41317	41324	0 %	25 %	25 %	50 %	336252134
132	NC_015666	CGGC	2	8	42175	42182	0 %	0 %	50 %	50 %	336252135
133	NC_015666	TCGA	2	8	42472	42479	25 %	25 %	25 %	25 %	336252136
134	NC_015666	GCGG	2	8	42842	42849	0 %	0 %	75 %	25 %	336252136
135	NC_015666	AACC	2	8	43733	43740	50 %	0 %	0 %	50 %	336252136
136	NC_015666	GCGG	2	8	44019	44026	0 %	0 %	75 %	25 %	336252136
137	NC_015666	GATC	2	8	44376	44383	25 %	25 %	25 %	25 %	336252137
138	NC_015666	TCGC	2	8	44830	44837	0 %	25 %	25 %	50 %	336252138
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140	NC_015666	GCCG	2	8	45749	45756	0 %	0 %	50 %	50 %	336252138
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