MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Halopiger xanaduensis SH-6 chromosome

Total Repeats: 6705

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015666	CG	3	6	1338	1343	0 %	0 %	50 %	50 %	336252098
2	NC_015666	GC	3	6	1832	1837	0 %	0 %	50 %	50 %	336252098
3	NC_015666	GC	3	6	1913	1918	0 %	0 %	50 %	50 %	336252098
4	NC_015666	GA	3	6	2391	2396	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015666	GA	3	6	2408	2413	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015666	CG	3	6	3245	3250	0 %	0 %	50 %	50 %	336252101
7	NC_015666	CG	3	6	4237	4242	0 %	0 %	50 %	50 %	336252102
8	NC_015666	CG	3	6	5705	5710	0 %	0 %	50 %	50 %	336252103
9	NC_015666	CG	3	6	6045	6050	0 %	0 %	50 %	50 %	336252104
10	NC_015666	CG	3	6	6424	6429	0 %	0 %	50 %	50 %	336252104
11	NC_015666	GC	3	6	8126	8131	0 %	0 %	50 %	50 %	336252104
12	NC_015666	GC	3	6	8225	8230	0 %	0 %	50 %	50 %	336252104
13	NC_015666	GC	3	6	9325	9330	0 %	0 %	50 %	50 %	336252106
14	NC_015666	CG	3	6	9418	9423	0 %	0 %	50 %	50 %	336252106
15	NC_015666	GC	3	6	9889	9894	0 %	0 %	50 %	50 %	336252106
16	NC_015666	AC	3	6	10162	10167	50 %	0 %	0 %	50 %	336252106
17	NC_015666	CG	3	6	10172	10177	0 %	0 %	50 %	50 %	336252106
18	NC_015666	CG	4	8	10629	10636	0 %	0 %	50 %	50 %	336252106
19	NC_015666	CG	3	6	10973	10978	0 %	0 %	50 %	50 %	336252107
20	NC_015666	GA	3	6	12068	12073	50 %	0 %	50 %	0 %	336252108
21	NC_015666	GA	3	6	12762	12767	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015666	CG	3	6	13521	13526	0 %	0 %	50 %	50 %	336252109
23	NC_015666	CG	3	6	14815	14820	0 %	0 %	50 %	50 %	336252111
24	NC_015666	AG	3	6	14914	14919	50 %	0 %	50 %	0 %	336252111
25	NC_015666	CG	3	6	15091	15096	0 %	0 %	50 %	50 %	336252111
26	NC_015666	CT	3	6	15209	15214	0 %	50 %	0 %	50 %	336252111
27	NC_015666	GA	3	6	15935	15940	50 %	0 %	50 %	0 %	336252111
28	NC_015666	GC	3	6	16004	16009	0 %	0 %	50 %	50 %	336252111
29	NC_015666	GT	3	6	16073	16078	0 %	50 %	50 %	0 %	336252111
30	NC_015666	GC	3	6	16687	16692	0 %	0 %	50 %	50 %	336252111
31	NC_015666	CG	3	6	16837	16842	0 %	0 %	50 %	50 %	336252111
32	NC_015666	CG	3	6	17078	17083	0 %	0 %	50 %	50 %	336252111
33	NC_015666	GC	3	6	17244	17249	0 %	0 %	50 %	50 %	336252111
34	NC_015666	CG	3	6	18500	18505	0 %	0 %	50 %	50 %	336252113
35	NC_015666	GC	3	6	18523	18528	0 %	0 %	50 %	50 %	336252113
36	NC_015666	CG	3	6	18585	18590	0 %	0 %	50 %	50 %	336252113
37	NC_015666	CG	3	6	19088	19093	0 %	0 %	50 %	50 %	336252113
38	NC_015666	CG	3	6	20605	20610	0 %	0 %	50 %	50 %	336252114
39	NC_015666	CG	3	6	21157	21162	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_015666	CG	3	6	21230	21235	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_015666	GC	3	6	22112	22117	0 %	0 %	50 %	50 %	336252116
42	NC_015666	GC	3	6	22577	22582	0 %	0 %	50 %	50 %	336252116
43	NC_015666	GC	4	8	23299	23306	0 %	0 %	50 %	50 %	336252117
44	NC_015666	GC	3	6	23323	23328	0 %	0 %	50 %	50 %	336252117
45	NC_015666	CG	3	6	24161	24166	0 %	0 %	50 %	50 %	336252117
46	NC_015666	CG	3	6	24362	24367	0 %	0 %	50 %	50 %	336252117
47	NC_015666	CG	3	6	24764	24769	0 %	0 %	50 %	50 %	336252117
48	NC_015666	GA	4	8	24878	24885	50 %	0 %	50 %	0 %	336252117
49	NC_015666	GC	3	6	24886	24891	0 %	0 %	50 %	50 %	336252117
50	NC_015666	CG	3	6	27162	27167	0 %	0 %	50 %	50 %	336252119
51	NC_015666	CG	3	6	28848	28853	0 %	0 %	50 %	50 %	336252121
52	NC_015666	CG	3	6	29461	29466	0 %	0 %	50 %	50 %	336252121
53	NC_015666	GA	3	6	29721	29726	50 %	0 %	50 %	0 %	336252122
54	NC_015666	CG	3	6	30402	30407	0 %	0 %	50 %	50 %	336252122
55	NC_015666	CG	3	6	31020	31025	0 %	0 %	50 %	50 %	336252122
56	NC_015666	CG	3	6	31416	31421	0 %	0 %	50 %	50 %	336252122
57	NC_015666	CG	3	6	31862	31867	0 %	0 %	50 %	50 %	336252122
58	NC_015666	GA	3	6	32214	32219	50 %	0 %	50 %	0 %	336252122
59	NC_015666	GC	3	6	32290	32295	0 %	0 %	50 %	50 %	336252122
60	NC_015666	GC	3	6	32368	32373	0 %	0 %	50 %	50 %	336252122
61	NC_015666	CG	3	6	32404	32409	0 %	0 %	50 %	50 %	336252122
62	NC_015666	GC	3	6	32922	32927	0 %	0 %	50 %	50 %	336252123
63	NC_015666	CG	4	8	34697	34704	0 %	0 %	50 %	50 %	336252125
64	NC_015666	CG	3	6	34942	34947	0 %	0 %	50 %	50 %	336252126
65	NC_015666	AG	3	6	36275	36280	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015666	CG	4	8	36468	36475	0 %	0 %	50 %	50 %	336252130
67	NC_015666	TC	3	6	37413	37418	0 %	50 %	0 %	50 %	336252130
68	NC_015666	CG	3	6	37610	37615	0 %	0 %	50 %	50 %	336252130
69	NC_015666	CG	3	6	37627	37632	0 %	0 %	50 %	50 %	336252130
70	NC_015666	CG	3	6	37786	37791	0 %	0 %	50 %	50 %	336252130
71	NC_015666	CG	3	6	37820	37825	0 %	0 %	50 %	50 %	336252130
72	NC_015666	GC	3	6	38027	38032	0 %	0 %	50 %	50 %	336252130
73	NC_015666	CG	3	6	38034	38039	0 %	0 %	50 %	50 %	336252130
74	NC_015666	GC	3	6	38143	38148	0 %	0 %	50 %	50 %	336252130
75	NC_015666	GC	4	8	38614	38621	0 %	0 %	50 %	50 %	336252130
76	NC_015666	GC	3	6	40264	40269	0 %	0 %	50 %	50 %	336252133
77	NC_015666	GC	3	6	40805	40810	0 %	0 %	50 %	50 %	336252134
78	NC_015666	CG	3	6	41187	41192	0 %	0 %	50 %	50 %	336252134
79	NC_015666	GC	3	6	42548	42553	0 %	0 %	50 %	50 %	336252136
80	NC_015666	CG	3	6	43323	43328	0 %	0 %	50 %	50 %	336252136
81	NC_015666	CG	3	6	43580	43585	0 %	0 %	50 %	50 %	336252136
82	NC_015666	CG	3	6	43781	43786	0 %	0 %	50 %	50 %	336252136
83	NC_015666	GC	3	6	44202	44207	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84	NC_015666	CG	3	6	44884	44889	0 %	0 %	50 %	50 %	336252138
85	NC_015666	CG	3	6	45188	45193	0 %	0 %	50 %	50 %	336252138
86	NC_015666	CG	3	6	45422	45427	0 %	0 %	50 %	50 %	336252138
87	NC_015666	CG	4	8	46303	46310	0 %	0 %	50 %	50 %	336252139
88	NC_015666	CG	3	6	46536	46541	0 %	0 %	50 %	50 %	336252139
89	NC_015666	CG	3	6	48971	48976	0 %	0 %	50 %	50 %	336252141
90	NC_015666	CG	3	6	49767	49772	0 %	0 %	50 %	50 %	336252142
91	NC_015666	CG	3	6	50701	50706	0 %	0 %	50 %	50 %	336252143
92	NC_015666	CG	3	6	51072	51077	0 %	0 %	50 %	50 %	336252143
93	NC_015666	GC	3	6	51833	51838	0 %	0 %	50 %	50 %	336252145
94	NC_015666	CG	3	6	53502	53507	0 %	0 %	50 %	50 %	336252146
95	NC_015666	GC	3	6	53975	53980	0 %	0 %	50 %	50 %	336252149
96	NC_015666	CG	3	6	54510	54515	0 %	0 %	50 %	50 %	336252150
97	NC_015666	GC	4	8	54699	54706	0 %	0 %	50 %	50 %	336252150
98	NC_015666	GA	3	6	55324	55329	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015666	GC	3	6	55623	55628	0 %	0 %	50 %	50 %	336252152
100	NC_015666	CG	3	6	56237	56242	0 %	0 %	50 %	50 %	336252152
101	NC_015666	GC	3	6	56370	56375	0 %	0 %	50 %	50 %	336252153
102	NC_015666	GC	3	6	56440	56445	0 %	0 %	50 %	50 %	336252153
103	NC_015666	GC	3	6	56458	56463	0 %	0 %	50 %	50 %	336252153
104	NC_015666	TG	3	6	57791	57796	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015666	CG	4	8	59085	59092	0 %	0 %	50 %	50 %	336252156
106	NC_015666	GC	3	6	59960	59965	0 %	0 %	50 %	50 %	336252157
107	NC_015666	CG	3	6	60028	60033	0 %	0 %	50 %	50 %	336252157
108	NC_015666	CG	4	8	60063	60070	0 %	0 %	50 %	50 %	336252157
109	NC_015666	CG	3	6	60538	60543	0 %	0 %	50 %	50 %	336252157
110	NC_015666	CG	3	6	60612	60617	0 %	0 %	50 %	50 %	336252157
111	NC_015666	GC	3	6	60770	60775	0 %	0 %	50 %	50 %	336252157
112	NC_015666	CG	3	6	60993	60998	0 %	0 %	50 %	50 %	336252157
113	NC_015666	CG	3	6	61173	61178	0 %	0 %	50 %	50 %	336252157
114	NC_015666	GC	3	6	61435	61440	0 %	0 %	50 %	50 %	336252158
115	NC_015666	GA	3	6	62588	62593	50 %	0 %	50 %	0 %	336252159
116	NC_015666	TC	3	6	63685	63690	0 %	50 %	0 %	50 %	336252160
117	NC_015666	CG	3	6	63859	63864	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
118	NC_015666	GC	3	6	64519	64524	0 %	0 %	50 %	50 %	336252162
119	NC_015666	CG	3	6	64868	64873	0 %	0 %	50 %	50 %	336252162
120	NC_015666	CG	3	6	65055	65060	0 %	0 %	50 %	50 %	336252162
121	NC_015666	GC	3	6	65345	65350	0 %	0 %	50 %	50 %	336252162
122	NC_015666	CG	3	6	65905	65910	0 %	0 %	50 %	50 %	336252163
123	NC_015666	CG	3	6	66511	66516	0 %	0 %	50 %	50 %	336252163
124	NC_015666	GC	3	6	66606	66611	0 %	0 %	50 %	50 %	336252163
125	NC_015666	GC	3	6	66958	66963	0 %	0 %	50 %	50 %	336252164
126	NC_015666	CG	3	6	67487	67492	0 %	0 %	50 %	50 %	336252165
127	NC_015666	GT	3	6	67849	67854	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015666	CG	3	6	68311	68316	0 %	0 %	50 %	50 %	336252166
129	NC_015666	TC	3	6	68540	68545	0 %	50 %	0 %	50 %	336252167
130	NC_015666	CG	3	6	68566	68571	0 %	0 %	50 %	50 %	336252167
131	NC_015666	GC	3	6	68827	68832	0 %	0 %	50 %	50 %	336252167
132	NC_015666	CG	3	6	68974	68979	0 %	0 %	50 %	50 %	336252167
133	NC_015666	CG	3	6	69103	69108	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
134	NC_015666	TA	3	6	69175	69180	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015666	GC	3	6	70247	70252	0 %	0 %	50 %	50 %	336252169
136	NC_015666	GC	3	6	70300	70305	0 %	0 %	50 %	50 %	336252169
137	NC_015666	CG	3	6	70936	70941	0 %	0 %	50 %	50 %	336252169
138	NC_015666	CG	3	6	71643	71648	0 %	0 %	50 %	50 %	336252170
139	NC_015666	GC	3	6	74143	74148	0 %	0 %	50 %	50 %	336252172
140	NC_015666	TC	3	6	74390	74395	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_015666	GA	3	6	74465	74470	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015666	GA	3	6	75827	75832	50 %	0 %	50 %	0 %	336252175
143	NC_015666	CG	3	6	76302	76307	0 %	0 %	50 %	50 %	336252176
144	NC_015666	TC	4	8	77171	77178	0 %	50 %	0 %	50 %	336252176
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