MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Halopiger xanaduensis SH-6 chromosome

Total Repeats: 265

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015666	C	6	6	18439	18444	0 %	0 %	0 %	100 %	336252113
2	NC_015666	G	6	6	25590	25595	0 %	0 %	100 %	0 %	336252118
3	NC_015666	C	6	6	30810	30815	0 %	0 %	0 %	100 %	336252122
4	NC_015666	C	6	6	77396	77401	0 %	0 %	0 %	100 %	336252176
5	NC_015666	G	6	6	87457	87462	0 %	0 %	100 %	0 %	336252184
6	NC_015666	G	6	6	92628	92633	0 %	0 %	100 %	0 %	336252188
7	NC_015666	C	6	6	107475	107480	0 %	0 %	0 %	100 %	336252208
8	NC_015666	G	6	6	135330	135335	0 %	0 %	100 %	0 %	336252237
9	NC_015666	C	6	6	145902	145907	0 %	0 %	0 %	100 %	336252250
10	NC_015666	G	6	6	146731	146736	0 %	0 %	100 %	0 %	336252251
11	NC_015666	G	6	6	165911	165916	0 %	0 %	100 %	0 %	336252270
12	NC_015666	A	6	6	211741	211746	100 %	0 %	0 %	0 %	336252317
13	NC_015666	C	6	6	215282	215287	0 %	0 %	0 %	100 %	336252321
14	NC_015666	C	6	6	221155	221160	0 %	0 %	0 %	100 %	336252326
15	NC_015666	C	6	6	234419	234424	0 %	0 %	0 %	100 %	336252336
16	NC_015666	T	6	6	238125	238130	0 %	100 %	0 %	0 %	336252340
17	NC_015666	C	7	7	246800	246806	0 %	0 %	0 %	100 %	336252346
18	NC_015666	G	6	6	257115	257120	0 %	0 %	100 %	0 %	336252351
19	NC_015666	G	6	6	257243	257248	0 %	0 %	100 %	0 %	336252352
20	NC_015666	G	6	6	265705	265710	0 %	0 %	100 %	0 %	336252357
21	NC_015666	G	6	6	288656	288661	0 %	0 %	100 %	0 %	336252383
22	NC_015666	C	6	6	294367	294372	0 %	0 %	0 %	100 %	336252387
23	NC_015666	A	6	6	298626	298631	100 %	0 %	0 %	0 %	336252389
24	NC_015666	C	6	6	311926	311931	0 %	0 %	0 %	100 %	336252401
25	NC_015666	T	6	6	330858	330863	0 %	100 %	0 %	0 %	336252417
26	NC_015666	T	6	6	332826	332831	0 %	100 %	0 %	0 %	336252418
27	NC_015666	G	6	6	345249	345254	0 %	0 %	100 %	0 %	336252441
28	NC_015666	T	6	6	352272	352277	0 %	100 %	0 %	0 %	336252450
29	NC_015666	G	6	6	363393	363398	0 %	0 %	100 %	0 %	336252462
30	NC_015666	C	6	6	374182	374187	0 %	0 %	0 %	100 %	336252473
31	NC_015666	G	6	6	385986	385991	0 %	0 %	100 %	0 %	336252482
32	NC_015666	T	6	6	387055	387060	0 %	100 %	0 %	0 %	336252483
33	NC_015666	G	6	6	388808	388813	0 %	0 %	100 %	0 %	336252485
34	NC_015666	C	6	6	405016	405021	0 %	0 %	0 %	100 %	336252501
35	NC_015666	G	6	6	409208	409213	0 %	0 %	100 %	0 %	336252505
36	NC_015666	G	6	6	442742	442747	0 %	0 %	100 %	0 %	336252533
37	NC_015666	G	6	6	461738	461743	0 %	0 %	100 %	0 %	336252551
38	NC_015666	A	6	6	490484	490489	100 %	0 %	0 %	0 %	336252575
39	NC_015666	C	6	6	534587	534592	0 %	0 %	0 %	100 %	336252618
40	NC_015666	C	6	6	558222	558227	0 %	0 %	0 %	100 %	336252640
41	NC_015666	G	6	6	559305	559310	0 %	0 %	100 %	0 %	336252641
42	NC_015666	G	7	7	571224	571230	0 %	0 %	100 %	0 %	336252653
43	NC_015666	C	6	6	583799	583804	0 %	0 %	0 %	100 %	336252666
44	NC_015666	A	6	6	584301	584306	100 %	0 %	0 %	0 %	336252667
45	NC_015666	G	6	6	593538	593543	0 %	0 %	100 %	0 %	336252675
46	NC_015666	G	6	6	607696	607701	0 %	0 %	100 %	0 %	336252690
47	NC_015666	A	6	6	620515	620520	100 %	0 %	0 %	0 %	336252707
48	NC_015666	G	6	6	636926	636931	0 %	0 %	100 %	0 %	336252725
49	NC_015666	G	6	6	688880	688885	0 %	0 %	100 %	0 %	336252786
50	NC_015666	G	6	6	694851	694856	0 %	0 %	100 %	0 %	336252792
51	NC_015666	G	6	6	704470	704475	0 %	0 %	100 %	0 %	336252797
52	NC_015666	A	6	6	762128	762133	100 %	0 %	0 %	0 %	336252858
53	NC_015666	C	6	6	778225	778230	0 %	0 %	0 %	100 %	336252875
54	NC_015666	G	6	6	780121	780126	0 %	0 %	100 %	0 %	336252876
55	NC_015666	C	6	6	787878	787883	0 %	0 %	0 %	100 %	336252885
56	NC_015666	C	6	6	788231	788236	0 %	0 %	0 %	100 %	336252885
57	NC_015666	G	6	6	805030	805035	0 %	0 %	100 %	0 %	336252900
58	NC_015666	G	6	6	811783	811788	0 %	0 %	100 %	0 %	336252904
59	NC_015666	C	6	6	818163	818168	0 %	0 %	0 %	100 %	336252913
60	NC_015666	G	6	6	863529	863534	0 %	0 %	100 %	0 %	336252958
61	NC_015666	G	6	6	871146	871151	0 %	0 %	100 %	0 %	336252966
62	NC_015666	C	6	6	872463	872468	0 %	0 %	0 %	100 %	336252968
63	NC_015666	G	6	6	891731	891736	0 %	0 %	100 %	0 %	336252986
64	NC_015666	G	6	6	926885	926890	0 %	0 %	100 %	0 %	336253016
65	NC_015666	C	6	6	945408	945413	0 %	0 %	0 %	100 %	336253033
66	NC_015666	C	6	6	945622	945627	0 %	0 %	0 %	100 %	336253033
67	NC_015666	G	6	6	947326	947331	0 %	0 %	100 %	0 %	336253035
68	NC_015666	C	6	6	947336	947341	0 %	0 %	0 %	100 %	336253035
69	NC_015666	G	6	6	953784	953789	0 %	0 %	100 %	0 %	336253043
70	NC_015666	T	6	6	961778	961783	0 %	100 %	0 %	0 %	336253051
71	NC_015666	C	6	6	974217	974222	0 %	0 %	0 %	100 %	336253060
72	NC_015666	C	6	6	978918	978923	0 %	0 %	0 %	100 %	336253065
73	NC_015666	G	6	6	980361	980366	0 %	0 %	100 %	0 %	336253066
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80	NC_015666	G	6	6	1096554	1096559	0 %	0 %	100 %	0 %	336253183
81	NC_015666	G	6	6	1097888	1097893	0 %	0 %	100 %	0 %	336253183
82	NC_015666	C	6	6	1128657	1128662	0 %	0 %	0 %	100 %	336253216
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84	NC_015666	C	6	6	1212592	1212597	0 %	0 %	0 %	100 %	336253292
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91	NC_015666	C	6	6	1356769	1356774	0 %	0 %	0 %	100 %	336253431
92	NC_015666	G	6	6	1359928	1359933	0 %	0 %	100 %	0 %	336253435
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100	NC_015666	G	6	6	1459246	1459251	0 %	0 %	100 %	0 %	336253529
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102	NC_015666	T	6	6	1508666	1508671	0 %	100 %	0 %	0 %	336253577
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106	NC_015666	G	6	6	1634859	1634864	0 %	0 %	100 %	0 %	336253717
107	NC_015666	A	6	6	1636172	1636177	100 %	0 %	0 %	0 %	336253718
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109	NC_015666	T	6	6	1637687	1637692	0 %	100 %	0 %	0 %	336253720
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135	NC_015666	G	6	6	1961680	1961685	0 %	0 %	100 %	0 %	336254025
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.