MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Geobacillus thermoglucosidasius C56-YS93 plasmid pGEOTH01

Total Repeats: 63

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015665	ACGTT	2	10	31	40	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_015665	TCAAG	2	10	245	254	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3	NC_015665	TAATT	2	10	398	407	40 %	60 %	0 %	0 %	336233475
4	NC_015665	TTGTT	2	10	582	591	0 %	80 %	20 %	0 %	336233475
5	NC_015665	ACACA	2	10	1885	1894	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
6	NC_015665	ATGAA	2	10	2076	2085	60 %	20 %	20 %	0 %	336233476
7	NC_015665	TGTAA	2	10	4597	4606	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015665	GTTTT	2	10	6657	6666	0 %	80 %	20 %	0 %	336233480
9	NC_015665	AACGA	2	10	7389	7398	60 %	0 %	20 %	20 %	336233480
10	NC_015665	TTATT	2	10	9122	9131	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015665	TCAAG	2	10	9286	9295	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_015665	AAAAT	2	10	10992	11001	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015665	AAAAG	2	10	11971	11980	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015665	ATTAA	2	10	15726	15735	60 %	40 %	0 %	0 %	336233485
15	NC_015665	ACTTC	2	10	18923	18932	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
16	NC_015665	CTTTT	2	10	21234	21243	0 %	80 %	0 %	20 %	336233488
17	NC_015665	TTAAA	2	10	21631	21640	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015665	ACCAC	2	10	23782	23791	40 %	0 %	0 %	60 %	336233491
19	NC_015665	ACCGG	2	10	25891	25900	20 %	0 %	40 %	40 %	336233492
20	NC_015665	TTCGT	2	10	26517	26526	0 %	60 %	20 %	20 %	336233492
21	NC_015665	CAGAC	2	10	28840	28849	40 %	0 %	20 %	40 %	336233494
22	NC_015665	ATCAG	2	10	30594	30603	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
23	NC_015665	ATTTG	2	10	32308	32317	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015665	GCTTG	2	10	33594	33603	0 %	40 %	40 %	20 %	336233496
25	NC_015665	AGGAT	2	10	33955	33964	40 %	20 %	40 %	0 %	336233496
26	NC_015665	CAAAA	2	10	34398	34407	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_015665	ATTTT	2	10	34504	34513	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015665	GGAAA	2	10	35309	35318	60 %	0 %	40 %	0 %	336233498
29	NC_015665	TGTCC	2	10	35346	35355	0 %	40 %	20 %	40 %	336233498
30	NC_015665	TCCTT	2	10	35786	35795	0 %	60 %	0 %	40 %	336233500
31	NC_015665	GGCGC	2	10	36014	36023	0 %	0 %	60 %	40 %	336233501
32	NC_015665	TTGCT	2	10	39483	39492	0 %	60 %	20 %	20 %	336233504
33	NC_015665	CCAAT	2	10	39516	39525	40 %	20 %	0 %	40 %	336233504
34	NC_015665	AGCGC	2	10	41502	41511	20 %	0 %	40 %	40 %	336233505
35	NC_015665	CAAAT	2	10	42443	42452	60 %	20 %	0 %	20 %	336233506
36	NC_015665	TTCTT	2	10	44942	44951	0 %	80 %	0 %	20 %	336233507
37	NC_015665	CGTTT	2	10	46348	46357	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
38	NC_015665	TTTTC	2	10	47423	47432	0 %	80 %	0 %	20 %	336233511
39	NC_015665	ATAAA	2	10	47885	47894	80 %	20 %	0 %	0 %	336233511
40	NC_015665	TAAAA	2	10	49649	49658	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015665	TATAA	2	10	50311	50320	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015665	AGCGC	2	10	51082	51091	20 %	0 %	40 %	40 %	336233514
43	NC_015665	CGGGA	2	10	51401	51410	20 %	0 %	60 %	20 %	336233514
44	NC_015665	CTTTT	2	10	52025	52034	0 %	80 %	0 %	20 %	336233514
45	NC_015665	GTAAA	2	10	53182	53191	60 %	20 %	20 %	0 %	336233515
46	NC_015665	TTTTA	2	10	57659	57668	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015665	CGGTA	2	10	58128	58137	20 %	20 %	40 %	20 %	336233520
48	NC_015665	GCTTA	2	10	60675	60684	20 %	40 %	20 %	20 %	336233522
49	NC_015665	AATGG	2	10	62156	62165	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015665	GAAAA	2	10	63186	63195	80 %	0 %	20 %	0 %	336233523
51	NC_015665	ACTTT	2	10	64372	64381	20 %	60 %	0 %	20 %	336233524
52	NC_015665	ATCCT	2	10	66044	66053	20 %	40 %	0 %	40 %	336233526
53	NC_015665	TGTAA	2	10	67971	67980	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015665	TATTT	2	10	72628	72637	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015665	GCTTT	2	10	72734	72743	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
56	NC_015665	TCGCT	2	10	73298	73307	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
57	NC_015665	TAGCT	2	10	74501	74510	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
58	NC_015665	TTGTT	2	10	74727	74736	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015665	TTTTG	2	10	75345	75354	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015665	AAGAC	2	10	75404	75413	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
61	NC_015665	CTCCC	2	10	75917	75926	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
62	NC_015665	AAAGA	2	10	76175	76184	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015665	CGAGG	2	10	77130	77139	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.