MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Geobacillus thermoglucosidasius C56-YS93 plasmid pGEOTH01

Total Repeats: 33

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015665	TAATT	2	10	398	407	40 %	60 %	0 %	0 %	336233475
2	NC_015665	TTGTT	2	10	582	591	0 %	80 %	20 %	0 %	336233475
3	NC_015665	ATGAA	2	10	2076	2085	60 %	20 %	20 %	0 %	336233476
4	NC_015665	GTTTT	2	10	6657	6666	0 %	80 %	20 %	0 %	336233480
5	NC_015665	AACGA	2	10	7389	7398	60 %	0 %	20 %	20 %	336233480
6	NC_015665	ATTAA	2	10	15726	15735	60 %	40 %	0 %	0 %	336233485
7	NC_015665	CTTTT	2	10	21234	21243	0 %	80 %	0 %	20 %	336233488
8	NC_015665	ACCAC	2	10	23782	23791	40 %	0 %	0 %	60 %	336233491
9	NC_015665	ACCGG	2	10	25891	25900	20 %	0 %	40 %	40 %	336233492
10	NC_015665	TTCGT	2	10	26517	26526	0 %	60 %	20 %	20 %	336233492
11	NC_015665	CAGAC	2	10	28840	28849	40 %	0 %	20 %	40 %	336233494
12	NC_015665	GCTTG	2	10	33594	33603	0 %	40 %	40 %	20 %	336233496
13	NC_015665	AGGAT	2	10	33955	33964	40 %	20 %	40 %	0 %	336233496
14	NC_015665	GGAAA	2	10	35309	35318	60 %	0 %	40 %	0 %	336233498
15	NC_015665	TGTCC	2	10	35346	35355	0 %	40 %	20 %	40 %	336233498
16	NC_015665	TCCTT	2	10	35786	35795	0 %	60 %	0 %	40 %	336233500
17	NC_015665	GGCGC	2	10	36014	36023	0 %	0 %	60 %	40 %	336233501
18	NC_015665	TTGCT	2	10	39483	39492	0 %	60 %	20 %	20 %	336233504
19	NC_015665	CCAAT	2	10	39516	39525	40 %	20 %	0 %	40 %	336233504
20	NC_015665	AGCGC	2	10	41502	41511	20 %	0 %	40 %	40 %	336233505
21	NC_015665	CAAAT	2	10	42443	42452	60 %	20 %	0 %	20 %	336233506
22	NC_015665	TTCTT	2	10	44942	44951	0 %	80 %	0 %	20 %	336233507
23	NC_015665	TTTTC	2	10	47423	47432	0 %	80 %	0 %	20 %	336233511
24	NC_015665	ATAAA	2	10	47885	47894	80 %	20 %	0 %	0 %	336233511
25	NC_015665	AGCGC	2	10	51082	51091	20 %	0 %	40 %	40 %	336233514
26	NC_015665	CGGGA	2	10	51401	51410	20 %	0 %	60 %	20 %	336233514
27	NC_015665	CTTTT	2	10	52025	52034	0 %	80 %	0 %	20 %	336233514
28	NC_015665	GTAAA	2	10	53182	53191	60 %	20 %	20 %	0 %	336233515
29	NC_015665	CGGTA	2	10	58128	58137	20 %	20 %	40 %	20 %	336233520
30	NC_015665	GCTTA	2	10	60675	60684	20 %	40 %	20 %	20 %	336233522
31	NC_015665	GAAAA	2	10	63186	63195	80 %	0 %	20 %	0 %	336233523
32	NC_015665	ACTTT	2	10	64372	64381	20 %	60 %	0 %	20 %	336233524
33	NC_015665	ATCCT	2	10	66044	66053	20 %	40 %	0 %	40 %	336233526

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.