MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Geobacillus thermoglucosidasius C56-YS93 plasmid pGEOTH01

Total Repeats: 288

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015665	AGAA	2	8	99	106	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015665	TCAT	2	8	272	279	25 %	50 %	0 %	25 %	336233475
3	NC_015665	TTAT	2	8	309	316	25 %	75 %	0 %	0 %	336233475
4	NC_015665	ATCT	2	8	350	357	25 %	50 %	0 %	25 %	336233475
5	NC_015665	CATA	2	8	559	566	50 %	25 %	0 %	25 %	336233475
6	NC_015665	TGAT	2	8	623	630	25 %	50 %	25 %	0 %	336233475
7	NC_015665	TCAT	2	8	832	839	25 %	50 %	0 %	25 %	336233475
8	NC_015665	AAGT	2	8	861	868	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015665	TCTT	2	8	1126	1133	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_015665	GCTG	2	8	2187	2194	0 %	25 %	50 %	25 %	336233476
11	NC_015665	AGAA	2	8	2303	2310	75 %	0 %	25 %	0 %	336233476
12	NC_015665	ATGG	2	8	3219	3226	25 %	25 %	50 %	0 %	336233477
13	NC_015665	CATA	2	8	3571	3578	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_015665	TTGA	2	8	3868	3875	25 %	50 %	25 %	0 %	336233478
15	NC_015665	ATGG	2	8	4243	4250	25 %	25 %	50 %	0 %	336233478
16	NC_015665	CTTC	2	8	4565	4572	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_015665	GATA	2	8	4607	4614	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015665	TTTA	2	8	4720	4727	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015665	TCGT	2	8	4917	4924	0 %	50 %	25 %	25 %	336233479
20	NC_015665	CATA	2	8	5309	5316	50 %	25 %	0 %	25 %	336233479
21	NC_015665	CTTC	2	8	5499	5506	0 %	50 %	0 %	50 %	336233479
22	NC_015665	AGCC	2	8	5630	5637	25 %	0 %	25 %	50 %	336233479
23	NC_015665	TAGG	2	8	5907	5914	25 %	25 %	50 %	0 %	336233479
24	NC_015665	TCAT	2	8	6541	6548	25 %	50 %	0 %	25 %	336233480
25	NC_015665	AGCA	2	8	6602	6609	50 %	0 %	25 %	25 %	336233480
26	NC_015665	TAAC	2	8	6997	7004	50 %	25 %	0 %	25 %	336233480
27	NC_015665	GCGG	2	8	7304	7311	0 %	0 %	75 %	25 %	336233480
28	NC_015665	GAAA	2	8	7376	7383	75 %	0 %	25 %	0 %	336233480
29	NC_015665	CGCC	2	8	7415	7422	0 %	0 %	25 %	75 %	336233480
30	NC_015665	TGGG	2	8	7749	7756	0 %	25 %	75 %	0 %	336233480
31	NC_015665	ATTT	2	8	7824	7831	25 %	75 %	0 %	0 %	336233480
32	NC_015665	GATT	2	8	8138	8145	25 %	50 %	25 %	0 %	336233480
33	NC_015665	AATG	2	8	8502	8509	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015665	CGAA	2	8	8753	8760	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_015665	TTGT	2	8	9232	9239	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015665	TTGG	2	8	9635	9642	0 %	50 %	50 %	0 %	336233481
37	NC_015665	CGGC	2	8	9781	9788	0 %	0 %	50 %	50 %	336233481
38	NC_015665	TCAT	2	8	10369	10376	25 %	50 %	0 %	25 %	336233481
39	NC_015665	ACAA	2	8	10874	10881	75 %	0 %	0 %	25 %	336233481
40	NC_015665	TAAA	2	8	11113	11120	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015665	ATTA	2	8	11402	11409	50 %	50 %	0 %	0 %	336233482
42	NC_015665	TTCA	2	8	11632	11639	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_015665	CCTG	2	8	12052	12059	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
44	NC_015665	AAGC	2	8	12137	12144	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_015665	TTGC	2	8	12274	12281	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_015665	CATG	2	8	12657	12664	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_015665	TAAA	2	8	12818	12825	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015665	GAAA	2	8	12989	12996	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015665	TTAG	2	8	13092	13099	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015665	ATGG	2	8	13848	13855	25 %	25 %	50 %	0 %	336233484
51	NC_015665	TACG	2	8	14139	14146	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_015665	AATT	2	8	14651	14658	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015665	AGGT	2	8	15691	15698	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015665	AAAG	2	8	16331	16338	75 %	0 %	25 %	0 %	336233485
55	NC_015665	CTTT	2	8	16947	16954	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_015665	TATT	2	8	17259	17266	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015665	TGAT	2	8	17743	17750	25 %	50 %	25 %	0 %	336233486
58	NC_015665	ACCA	3	12	17980	17991	50 %	0 %	0 %	50 %	336233486
59	NC_015665	GGTT	2	8	18058	18065	0 %	50 %	50 %	0 %	336233486
60	NC_015665	AAAG	2	8	18206	18213	75 %	0 %	25 %	0 %	336233486
61	NC_015665	AAAG	2	8	18263	18270	75 %	0 %	25 %	0 %	336233486
62	NC_015665	TTAC	2	8	18975	18982	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_015665	AAAC	2	8	19746	19753	75 %	0 %	0 %	25 %	336233487
64	NC_015665	TTAA	2	8	19961	19968	50 %	50 %	0 %	0 %	336233488
65	NC_015665	TTGC	2	8	19988	19995	0 %	50 %	25 %	25 %	336233488
66	NC_015665	GTTG	2	8	20311	20318	0 %	50 %	50 %	0 %	336233488
67	NC_015665	CAAC	2	8	20722	20729	50 %	0 %	0 %	50 %	336233488
68	NC_015665	AAAT	2	8	20750	20757	75 %	25 %	0 %	0 %	336233488
69	NC_015665	GAAG	2	8	20830	20837	50 %	0 %	50 %	0 %	336233488
70	NC_015665	TCGG	2	8	20886	20893	0 %	25 %	50 %	25 %	336233488
71	NC_015665	AATC	2	8	21095	21102	50 %	25 %	0 %	25 %	336233488
72	NC_015665	CTTC	2	8	21125	21132	0 %	50 %	0 %	50 %	336233488
73	NC_015665	TGTT	2	8	21295	21302	0 %	75 %	25 %	0 %	336233488
74	NC_015665	GTTT	2	8	21455	21462	0 %	75 %	25 %	0 %	336233488
75	NC_015665	GTTT	2	8	21590	21597	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015665	TAAA	2	8	21610	21617	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015665	ATCA	2	8	22088	22095	50 %	25 %	0 %	25 %	336233489
78	NC_015665	TCTT	2	8	22338	22345	0 %	75 %	0 %	25 %	336233489
79	NC_015665	ATCA	2	8	22412	22419	50 %	25 %	0 %	25 %	336233489
80	NC_015665	CGGC	2	8	23294	23301	0 %	0 %	50 %	50 %	336233491
81	NC_015665	GGAA	2	8	23473	23480	50 %	0 %	50 %	0 %	336233491
82	NC_015665	TCCA	2	8	23691	23698	25 %	25 %	0 %	50 %	336233491
83	NC_015665	CGTA	2	8	24009	24016	25 %	25 %	25 %	25 %	336233491
84	NC_015665	TGGT	2	8	24396	24403	0 %	50 %	50 %	0 %	336233491
85	NC_015665	TTTG	2	8	24522	24529	0 %	75 %	25 %	0 %	336233491
86	NC_015665	GCAT	2	8	25600	25607	25 %	25 %	25 %	25 %	336233492
87	NC_015665	GCTT	2	8	25777	25784	0 %	50 %	25 %	25 %	336233492
88	NC_015665	ATTG	2	8	26202	26209	25 %	50 %	25 %	0 %	336233492
89	NC_015665	TATT	2	8	26263	26270	25 %	75 %	0 %	0 %	336233492
90	NC_015665	TAAT	2	8	26720	26727	50 %	50 %	0 %	0 %	336233492
91	NC_015665	ATGA	2	8	26781	26788	50 %	25 %	25 %	0 %	336233492
92	NC_015665	CCAT	2	8	27974	27981	25 %	25 %	0 %	50 %	336233494
93	NC_015665	TCCT	2	8	28350	28357	0 %	50 %	0 %	50 %	336233494
94	NC_015665	TAGA	2	8	28617	28624	50 %	25 %	25 %	0 %	336233494
95	NC_015665	ATCA	2	8	28824	28831	50 %	25 %	0 %	25 %	336233494
96	NC_015665	TTCA	2	8	28902	28909	25 %	50 %	0 %	25 %	336233494
97	NC_015665	ATCC	2	8	29197	29204	25 %	25 %	0 %	50 %	336233495
98	NC_015665	ACTC	2	8	29830	29837	25 %	25 %	0 %	50 %	336233495
99	NC_015665	CAAA	2	8	29851	29858	75 %	0 %	0 %	25 %	336233495
100	NC_015665	CTTT	2	8	30253	30260	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_015665	AAAT	2	8	30340	30347	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015665	AACA	3	12	30503	30514	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_015665	CAGG	2	8	30740	30747	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
104	NC_015665	TATC	2	8	30799	30806	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_015665	GTTT	2	8	30999	31006	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015665	GAAA	2	8	31090	31097	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015665	AGAA	2	8	31105	31112	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015665	ATCC	2	8	31398	31405	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_015665	TGAT	2	8	31417	31424	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015665	GAAA	2	8	31606	31613	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015665	GCTT	2	8	31668	31675	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_015665	GTCG	2	8	31828	31835	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
113	NC_015665	AAAG	2	8	32015	32022	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015665	TGTC	2	8	32386	32393	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_015665	TTGC	2	8	32583	32590	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
116	NC_015665	GAAA	2	8	33002	33009	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015665	TTTA	2	8	33266	33273	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015665	ATTT	2	8	33293	33300	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015665	ATTG	2	8	33301	33308	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015665	ATTT	2	8	33325	33332	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015665	GTTT	2	8	33341	33348	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015665	CTTG	2	8	33643	33650	0 %	50 %	25 %	25 %	336233496
123	NC_015665	GATC	2	8	35530	35537	25 %	25 %	25 %	25 %	336233499
124	NC_015665	CTTC	2	8	36507	36514	0 %	50 %	0 %	50 %	336233501
125	NC_015665	GCCG	2	8	36692	36699	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
126	NC_015665	AGAA	2	8	36759	36766	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015665	GGAC	2	8	37050	37057	25 %	0 %	50 %	25 %	336233502
128	NC_015665	ATCG	2	8	37151	37158	25 %	25 %	25 %	25 %	336233502
129	NC_015665	GAAT	2	8	37479	37486	50 %	25 %	25 %	0 %	336233502
130	NC_015665	TGTC	2	8	37498	37505	0 %	50 %	25 %	25 %	336233502
131	NC_015665	TGTT	2	8	37573	37580	0 %	75 %	25 %	0 %	336233502
132	NC_015665	GCTG	2	8	38020	38027	0 %	25 %	50 %	25 %	336233502
133	NC_015665	GGCG	2	8	38072	38079	0 %	0 %	75 %	25 %	336233502
134	NC_015665	GCAA	2	8	38588	38595	50 %	0 %	25 %	25 %	336233503
135	NC_015665	TAAA	2	8	39013	39020	75 %	25 %	0 %	0 %	336233503
136	NC_015665	GTTT	2	8	39470	39477	0 %	75 %	25 %	0 %	336233504
137	NC_015665	ATCC	2	8	39834	39841	25 %	25 %	0 %	50 %	336233504
138	NC_015665	AATC	2	8	39868	39875	50 %	25 %	0 %	25 %	336233504
139	NC_015665	AGCC	2	8	39957	39964	25 %	0 %	25 %	50 %	336233504
140	NC_015665	ACAA	2	8	40338	40345	75 %	0 %	0 %	25 %	336233504
141	NC_015665	ATCC	2	8	41044	41051	25 %	25 %	0 %	50 %	336233505
142	NC_015665	ACGC	2	8	41326	41333	25 %	0 %	25 %	50 %	336233505
143	NC_015665	AAAT	2	8	41549	41556	75 %	25 %	0 %	0 %	336233505
144	NC_015665	TTCT	2	8	42267	42274	0 %	75 %	0 %	25 %	336233506
145	NC_015665	AATA	2	8	42491	42498	75 %	25 %	0 %	0 %	336233506
146	NC_015665	CTTC	2	8	42545	42552	0 %	50 %	0 %	50 %	336233506
147	NC_015665	GCTT	2	8	42833	42840	0 %	50 %	25 %	25 %	336233506
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.