MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Geobacillus thermoglucosidasius C56-YS93 plasmid pGEOTH01

Total Repeats: 143

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015665	GA	3	6	745	750	50 %	0 %	50 %	0 %	336233475
2	NC_015665	AT	3	6	838	843	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015665	AC	4	8	1875	1882	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_015665	GC	3	6	2409	2414	0 %	0 %	50 %	50 %	336233476
5	NC_015665	GA	3	6	3606	3611	50 %	0 %	50 %	0 %	336233478
6	NC_015665	TC	3	6	4177	4182	0 %	50 %	0 %	50 %	336233478
7	NC_015665	CA	3	6	4662	4667	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_015665	TG	3	6	4690	4695	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015665	TC	3	6	7147	7152	0 %	50 %	0 %	50 %	336233480
10	NC_015665	TG	3	6	8171	8176	0 %	50 %	50 %	0 %	336233480
11	NC_015665	CT	3	6	8227	8232	0 %	50 %	0 %	50 %	336233480
12	NC_015665	GT	3	6	9670	9675	0 %	50 %	50 %	0 %	336233481
13	NC_015665	AT	3	6	9692	9697	50 %	50 %	0 %	0 %	336233481
14	NC_015665	TA	3	6	10099	10104	50 %	50 %	0 %	0 %	336233481
15	NC_015665	GT	3	6	10132	10137	0 %	50 %	50 %	0 %	336233481
16	NC_015665	GA	3	6	10240	10245	50 %	0 %	50 %	0 %	336233481
17	NC_015665	TC	3	6	10460	10465	0 %	50 %	0 %	50 %	336233481
18	NC_015665	TA	3	6	10882	10887	50 %	50 %	0 %	0 %	336233481
19	NC_015665	GC	3	6	15005	15010	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_015665	CT	3	6	15067	15072	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_015665	GA	3	6	15187	15192	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015665	AT	4	8	15645	15652	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015665	CT	3	6	15891	15896	0 %	50 %	0 %	50 %	336233485
24	NC_015665	GC	3	6	17010	17015	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_015665	GA	3	6	20975	20980	50 %	0 %	50 %	0 %	336233488
26	NC_015665	GC	3	6	21075	21080	0 %	0 %	50 %	50 %	336233488
27	NC_015665	TG	3	6	21215	21220	0 %	50 %	50 %	0 %	336233488
28	NC_015665	GT	3	6	21875	21880	0 %	50 %	50 %	0 %	336233489
29	NC_015665	TC	3	6	22190	22195	0 %	50 %	0 %	50 %	336233489
30	NC_015665	AT	3	6	22736	22741	50 %	50 %	0 %	0 %	336233489
31	NC_015665	TC	3	6	23160	23165	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_015665	AC	3	6	24430	24435	50 %	0 %	0 %	50 %	336233491
33	NC_015665	AG	3	6	27042	27047	50 %	0 %	50 %	0 %	336233493
34	NC_015665	GA	3	6	27455	27460	50 %	0 %	50 %	0 %	336233493
35	NC_015665	AG	3	6	28765	28770	50 %	0 %	50 %	0 %	336233494
36	NC_015665	CT	3	6	29080	29085	0 %	50 %	0 %	50 %	336233494
37	NC_015665	TC	3	6	29427	29432	0 %	50 %	0 %	50 %	336233495
38	NC_015665	TA	3	6	30031	30036	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015665	TA	3	6	30127	30132	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015665	TA	3	6	30320	30325	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015665	TA	4	8	30770	30777	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015665	GC	3	6	31227	31232	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_015665	AT	4	8	32563	32570	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015665	GC	3	6	33144	33149	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_015665	CG	3	6	33393	33398	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_015665	GA	3	6	33405	33410	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015665	CG	3	6	33804	33809	0 %	0 %	50 %	50 %	336233496
48	NC_015665	GA	3	6	34116	34121	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015665	CT	3	6	34271	34276	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_015665	TC	3	6	34799	34804	0 %	50 %	0 %	50 %	336233497
51	NC_015665	GC	3	6	34969	34974	0 %	0 %	50 %	50 %	336233497
52	NC_015665	GC	3	6	35101	35106	0 %	0 %	50 %	50 %	336233497
53	NC_015665	CG	3	6	35437	35442	0 %	0 %	50 %	50 %	336233499
54	NC_015665	GC	3	6	35980	35985	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_015665	AT	3	6	36585	36590	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015665	CG	3	6	36633	36638	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_015665	GC	3	6	38482	38487	0 %	0 %	50 %	50 %	336233503
58	NC_015665	CT	3	6	38840	38845	0 %	50 %	0 %	50 %	336233503
59	NC_015665	TC	3	6	39443	39448	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_015665	AT	3	6	41066	41071	50 %	50 %	0 %	0 %	336233505
61	NC_015665	GC	3	6	41604	41609	0 %	0 %	50 %	50 %	336233505
62	NC_015665	CA	3	6	41917	41922	50 %	0 %	0 %	50 %	336233505
63	NC_015665	AT	3	6	42533	42538	50 %	50 %	0 %	0 %	336233506
64	NC_015665	AT	3	6	42640	42645	50 %	50 %	0 %	0 %	336233506
65	NC_015665	TC	3	6	42758	42763	0 %	50 %	0 %	50 %	336233506
66	NC_015665	CG	3	6	43311	43316	0 %	0 %	50 %	50 %	336233506
67	NC_015665	AT	3	6	43461	43466	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015665	GA	3	6	43737	43742	50 %	0 %	50 %	0 %	336233507
69	NC_015665	AT	3	6	43866	43871	50 %	50 %	0 %	0 %	336233507
70	NC_015665	CT	3	6	44176	44181	0 %	50 %	0 %	50 %	336233507
71	NC_015665	AT	3	6	44751	44756	50 %	50 %	0 %	0 %	336233507
72	NC_015665	CT	3	6	44953	44958	0 %	50 %	0 %	50 %	336233507
73	NC_015665	TA	4	8	45066	45073	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015665	TC	3	6	47558	47563	0 %	50 %	0 %	50 %	336233511
75	NC_015665	GA	4	8	49322	49329	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015665	AT	3	6	49406	49411	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015665	GA	3	6	49667	49672	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015665	GC	3	6	51096	51101	0 %	0 %	50 %	50 %	336233514
79	NC_015665	CG	3	6	51510	51515	0 %	0 %	50 %	50 %	336233514
80	NC_015665	CG	3	6	51933	51938	0 %	0 %	50 %	50 %	336233514
81	NC_015665	GC	3	6	52629	52634	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_015665	GA	3	6	52916	52921	50 %	0 %	50 %	0 %	336233515
83	NC_015665	GC	3	6	52973	52978	0 %	0 %	50 %	50 %	336233515
84	NC_015665	TA	3	6	53881	53886	50 %	50 %	0 %	0 %	336233516
85	NC_015665	CG	3	6	54115	54120	0 %	0 %	50 %	50 %	336233516
86	NC_015665	CG	3	6	55131	55136	0 %	0 %	50 %	50 %	336233517
87	NC_015665	GC	3	6	58205	58210	0 %	0 %	50 %	50 %	336233520
88	NC_015665	AT	3	6	58673	58678	50 %	50 %	0 %	0 %	336233520
89	NC_015665	CG	3	6	58859	58864	0 %	0 %	50 %	50 %	336233520
90	NC_015665	GC	3	6	59518	59523	0 %	0 %	50 %	50 %	336233521
91	NC_015665	CG	3	6	60027	60032	0 %	0 %	50 %	50 %	336233521
92	NC_015665	GC	3	6	60548	60553	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_015665	GC	3	6	60631	60636	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
94	NC_015665	GC	3	6	60735	60740	0 %	0 %	50 %	50 %	336233522
95	NC_015665	CG	3	6	60777	60782	0 %	0 %	50 %	50 %	336233522
96	NC_015665	TC	3	6	61788	61793	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_015665	AG	3	6	62339	62344	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015665	AT	3	6	63420	63425	50 %	50 %	0 %	0 %	336233523
99	NC_015665	TA	3	6	63813	63818	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015665	GC	3	6	63884	63889	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
101	NC_015665	TA	3	6	63929	63934	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015665	AG	3	6	64142	64147	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015665	TA	3	6	64847	64852	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015665	AT	3	6	65228	65233	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015665	CT	3	6	65264	65269	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_015665	GC	4	8	65493	65500	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
107	NC_015665	GA	3	6	65595	65600	50 %	0 %	50 %	0 %	336233526
108	NC_015665	GA	3	6	66061	66066	50 %	0 %	50 %	0 %	336233526
109	NC_015665	CA	3	6	66915	66920	50 %	0 %	0 %	50 %	336233527
110	NC_015665	AT	3	6	67210	67215	50 %	50 %	0 %	0 %	336233527
111	NC_015665	AT	3	6	67416	67421	50 %	50 %	0 %	0 %	336233527
112	NC_015665	AC	3	6	67636	67641	50 %	0 %	0 %	50 %	336233527
113	NC_015665	AC	3	6	67989	67994	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_015665	AT	3	6	68060	68065	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015665	AT	3	6	68320	68325	50 %	50 %	0 %	0 %	336233528
116	NC_015665	CG	3	6	68355	68360	0 %	0 %	50 %	50 %	336233528
117	NC_015665	AT	3	6	68459	68464	50 %	50 %	0 %	0 %	336233528
118	NC_015665	TA	3	6	68533	68538	50 %	50 %	0 %	0 %	336233528
119	NC_015665	AC	3	6	68897	68902	50 %	0 %	0 %	50 %	336233529
120	NC_015665	AT	3	6	68937	68942	50 %	50 %	0 %	0 %	336233529
121	NC_015665	GA	3	6	69395	69400	50 %	0 %	50 %	0 %	336233529
122	NC_015665	AG	3	6	70492	70497	50 %	0 %	50 %	0 %	336233530
123	NC_015665	TA	3	6	71224	71229	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015665	AT	4	8	71245	71252	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015665	CT	3	6	71819	71824	0 %	50 %	0 %	50 %	336233531
126	NC_015665	AT	3	6	72003	72008	50 %	50 %	0 %	0 %	336233531
127	NC_015665	TA	3	6	72901	72906	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015665	TA	3	6	73015	73020	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015665	CT	3	6	73352	73357	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_015665	GT	3	6	73818	73823	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015665	AT	3	6	75452	75457	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015665	AT	3	6	76155	76160	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015665	AT	4	8	76267	76274	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015665	CG	3	6	77746	77751	0 %	0 %	50 %	50 %	336233533
135	NC_015665	CG	3	6	77926	77931	0 %	0 %	50 %	50 %	336233533
136	NC_015665	TG	3	6	78326	78331	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015665	AT	3	6	78449	78454	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015665	AT	3	6	79198	79203	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015665	TA	4	8	79229	79236	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015665	AC	3	6	79551	79556	50 %	0 %	0 %	50 %	336233534
141	NC_015665	TA	3	6	79695	79700	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015665	CG	3	6	80482	80487	0 %	0 %	50 %	50 %	336233536
143	NC_015665	AT	3	6	80575	80580	50 %	50 %	0 %	0 %	336233536

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.