MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Buchnera aphidicola (Cinara tujafilina) chromosome

Total Repeats: 417

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015662	CGTTT	2	10	575	584	0 %	60 %	20 %	20 %	336233114
2	NC_015662	GGATT	2	10	904	913	20 %	40 %	40 %	0 %	336233114
3	NC_015662	AAATA	2	10	1643	1652	80 %	20 %	0 %	0 %	336233114
4	NC_015662	TATTT	2	10	1877	1886	20 %	80 %	0 %	0 %	336233114
5	NC_015662	TATAT	2	10	1922	1931	40 %	60 %	0 %	0 %	336233114
6	NC_015662	TATTT	2	10	2558	2567	20 %	80 %	0 %	0 %	336233115
7	NC_015662	ATTTT	2	10	2694	2703	20 %	80 %	0 %	0 %	336233115
8	NC_015662	TGTTT	2	10	2769	2778	0 %	80 %	20 %	0 %	336233115
9	NC_015662	TATTT	2	10	2780	2789	20 %	80 %	0 %	0 %	336233115
10	NC_015662	ATTTT	2	10	3576	3585	20 %	80 %	0 %	0 %	336233115
11	NC_015662	TTTAA	2	10	3882	3891	40 %	60 %	0 %	0 %	336233115
12	NC_015662	TAAAA	2	10	4707	4716	80 %	20 %	0 %	0 %	336233116
13	NC_015662	ATAAA	2	10	5049	5058	80 %	20 %	0 %	0 %	336233116
14	NC_015662	TAAAA	2	10	6570	6579	80 %	20 %	0 %	0 %	336233117
15	NC_015662	AAAAT	2	10	8514	8523	80 %	20 %	0 %	0 %	336233120
16	NC_015662	TTTTA	2	10	8575	8584	20 %	80 %	0 %	0 %	336233120
17	NC_015662	AATTA	2	10	11074	11083	60 %	40 %	0 %	0 %	336233121
18	NC_015662	TGAAA	2	10	13215	13224	60 %	20 %	20 %	0 %	336233123
19	NC_015662	GATAT	2	10	13513	13522	40 %	40 %	20 %	0 %	336233123
20	NC_015662	AATTC	2	10	16572	16581	40 %	40 %	0 %	20 %	336233127
21	NC_015662	GATTC	2	10	16827	16836	20 %	40 %	20 %	20 %	336233127
22	NC_015662	CATCA	2	10	19936	19945	40 %	20 %	0 %	40 %	336233129
23	NC_015662	ATCAC	2	10	21847	21856	40 %	20 %	0 %	40 %	336233130
24	NC_015662	ATATC	2	10	22213	22222	40 %	40 %	0 %	20 %	336233130
25	NC_015662	AAATG	2	10	23704	23713	60 %	20 %	20 %	0 %	336233130
26	NC_015662	TTAAT	2	10	24812	24821	40 %	60 %	0 %	0 %	336233130
27	NC_015662	CTTTG	2	10	25193	25202	0 %	60 %	20 %	20 %	336233130
28	NC_015662	ATTTA	2	10	26669	26678	40 %	60 %	0 %	0 %	336233131
29	NC_015662	TTTGA	2	10	27295	27304	20 %	60 %	20 %	0 %	336233131
30	NC_015662	TTTGC	2	10	28694	28703	0 %	60 %	20 %	20 %	336233131
31	NC_015662	TTGGT	2	10	30967	30976	0 %	60 %	40 %	0 %	336233134
32	NC_015662	TTTTG	2	10	31246	31255	0 %	80 %	20 %	0 %	336233134
33	NC_015662	ATTTT	2	10	31694	31703	20 %	80 %	0 %	0 %	336233135
34	NC_015662	ATTTT	2	10	32940	32949	20 %	80 %	0 %	0 %	336233137
35	NC_015662	TAATA	2	10	32984	32993	60 %	40 %	0 %	0 %	336233137
36	NC_015662	TTTAA	2	10	34457	34466	40 %	60 %	0 %	0 %	336233138
37	NC_015662	AATTA	2	10	36554	36563	60 %	40 %	0 %	0 %	336233139
38	NC_015662	AAAAT	2	10	37151	37160	80 %	20 %	0 %	0 %	336233139
39	NC_015662	ATTTT	2	10	38166	38175	20 %	80 %	0 %	0 %	336233140
40	NC_015662	GTTTC	2	10	38603	38612	0 %	60 %	20 %	20 %	336233140
41	NC_015662	ATTTA	2	10	39761	39770	40 %	60 %	0 %	0 %	336233141
42	NC_015662	TAATA	2	10	40462	40471	60 %	40 %	0 %	0 %	336233141
43	NC_015662	AATAT	2	10	41953	41962	60 %	40 %	0 %	0 %	336233142
44	NC_015662	TAAGA	2	10	42082	42091	60 %	20 %	20 %	0 %	336233142
45	NC_015662	ATATT	2	10	42224	42233	40 %	60 %	0 %	0 %	336233142
46	NC_015662	TCTTG	2	10	43865	43874	0 %	60 %	20 %	20 %	336233144
47	NC_015662	TAATT	2	10	45081	45090	40 %	60 %	0 %	0 %	336233145
48	NC_015662	TATAC	2	10	46781	46790	40 %	40 %	0 %	20 %	336233146
49	NC_015662	TACAT	2	10	47796	47805	40 %	40 %	0 %	20 %	336233146
50	NC_015662	TTTGT	2	10	48000	48009	0 %	80 %	20 %	0 %	336233146
51	NC_015662	ATATT	2	10	48197	48206	40 %	60 %	0 %	0 %	336233146
52	NC_015662	TTAAA	2	10	48452	48461	60 %	40 %	0 %	0 %	336233146
53	NC_015662	TAAAA	2	10	48699	48708	80 %	20 %	0 %	0 %	336233146
54	NC_015662	CATTT	2	10	50418	50427	20 %	60 %	0 %	20 %	336233147
55	NC_015662	AAAAT	2	10	51410	51419	80 %	20 %	0 %	0 %	336233148
56	NC_015662	TTATC	2	10	51610	51619	20 %	60 %	0 %	20 %	336233148
57	NC_015662	ATAAA	2	10	54247	54256	80 %	20 %	0 %	0 %	336233150
58	NC_015662	TAAAT	2	10	54535	54544	60 %	40 %	0 %	0 %	336233151
59	NC_015662	TTATA	2	10	54592	54601	40 %	60 %	0 %	0 %	336233151
60	NC_015662	TTTTG	2	10	54656	54665	0 %	80 %	20 %	0 %	336233151
61	NC_015662	CATTA	2	10	55120	55129	40 %	40 %	0 %	20 %	336233151
62	NC_015662	TATAG	2	10	55733	55742	40 %	40 %	20 %	0 %	336233151
63	NC_015662	ATTAA	2	10	58341	58350	60 %	40 %	0 %	0 %	336233155
64	NC_015662	TTATA	2	10	59476	59485	40 %	60 %	0 %	0 %	336233157
65	NC_015662	ATTTT	2	10	60002	60011	20 %	80 %	0 %	0 %	336233157
66	NC_015662	TTTCT	2	10	60612	60621	0 %	80 %	0 %	20 %	336233159
67	NC_015662	AAATT	2	10	62369	62378	60 %	40 %	0 %	0 %	336233161
68	NC_015662	TATAT	2	10	65595	65604	40 %	60 %	0 %	0 %	336233162
69	NC_015662	TTAGT	2	10	65752	65761	20 %	60 %	20 %	0 %	336233162
70	NC_015662	GATAT	2	10	66083	66092	40 %	40 %	20 %	0 %	336233163
71	NC_015662	AAATT	2	10	66647	66656	60 %	40 %	0 %	0 %	336233163
72	NC_015662	TTTTA	2	10	67065	67074	20 %	80 %	0 %	0 %	336233164
73	NC_015662	AATTG	2	10	73093	73102	40 %	40 %	20 %	0 %	336233168
74	NC_015662	ATAAA	2	10	74817	74826	80 %	20 %	0 %	0 %	336233170
75	NC_015662	AATAC	2	10	75233	75242	60 %	20 %	0 %	20 %	336233170
76	NC_015662	GTTAT	2	10	75443	75452	20 %	60 %	20 %	0 %	336233170
77	NC_015662	TTATT	2	10	75485	75494	20 %	80 %	0 %	0 %	336233170
78	NC_015662	TTTAC	2	10	77802	77811	20 %	60 %	0 %	20 %	336233172
79	NC_015662	AATTA	2	10	78407	78416	60 %	40 %	0 %	0 %	336233173
80	NC_015662	ATTTT	2	10	78512	78521	20 %	80 %	0 %	0 %	336233173
81	NC_015662	TAATT	2	10	82259	82268	40 %	60 %	0 %	0 %	336233177
82	NC_015662	TAAAA	2	10	82461	82470	80 %	20 %	0 %	0 %	336233178
83	NC_015662	CAATT	2	10	82952	82961	40 %	40 %	0 %	20 %	336233178
84	NC_015662	TATTT	2	10	84357	84366	20 %	80 %	0 %	0 %	336233179
85	NC_015662	AAATT	2	10	84443	84452	60 %	40 %	0 %	0 %	336233179
86	NC_015662	ATATA	2	10	84582	84591	60 %	40 %	0 %	0 %	336233179
87	NC_015662	GATCA	2	10	87043	87052	40 %	20 %	20 %	20 %	336233181
88	NC_015662	AAAGT	2	10	87809	87818	60 %	20 %	20 %	0 %	336233182
89	NC_015662	TAAAA	2	10	89977	89986	80 %	20 %	0 %	0 %	336233183
90	NC_015662	ATTAA	2	10	91154	91163	60 %	40 %	0 %	0 %	336233184
91	NC_015662	TAAAT	2	10	93687	93696	60 %	40 %	0 %	0 %	336233188
92	NC_015662	ATATT	2	10	93824	93833	40 %	60 %	0 %	0 %	336233188
93	NC_015662	TATAG	2	10	94876	94885	40 %	40 %	20 %	0 %	336233189
94	NC_015662	ATTTA	2	10	96648	96657	40 %	60 %	0 %	0 %	336233189
95	NC_015662	TTTTC	2	10	97548	97557	0 %	80 %	0 %	20 %	336233191
96	NC_015662	CTAAA	2	10	98150	98159	60 %	20 %	0 %	20 %	336233191
97	NC_015662	TATCA	2	10	99420	99429	40 %	40 %	0 %	20 %	336233191
98	NC_015662	ATCGT	2	10	99638	99647	20 %	40 %	20 %	20 %	336233192
99	NC_015662	TCCAT	2	10	100048	100057	20 %	40 %	0 %	40 %	336233192
100	NC_015662	GATAT	2	10	101213	101222	40 %	40 %	20 %	0 %	336233193
101	NC_015662	TAAAT	2	10	101891	101900	60 %	40 %	0 %	0 %	336233194
102	NC_015662	TTTAT	2	10	102457	102466	20 %	80 %	0 %	0 %	336233195
103	NC_015662	TATTT	2	10	102723	102732	20 %	80 %	0 %	0 %	336233195
104	NC_015662	TTATA	2	10	104499	104508	40 %	60 %	0 %	0 %	336233197
105	NC_015662	ATTTT	2	10	106222	106231	20 %	80 %	0 %	0 %	336233198
106	NC_015662	TTTAA	2	10	107179	107188	40 %	60 %	0 %	0 %	336233198
107	NC_015662	TAGTT	2	10	107586	107595	20 %	60 %	20 %	0 %	336233198
108	NC_015662	TAATT	2	10	108775	108784	40 %	60 %	0 %	0 %	336233199
109	NC_015662	TAATT	2	10	109108	109117	40 %	60 %	0 %	0 %	336233199
110	NC_015662	ATTTT	2	10	109368	109377	20 %	80 %	0 %	0 %	336233199
111	NC_015662	TATTT	2	10	109842	109851	20 %	80 %	0 %	0 %	336233200
112	NC_015662	ATTTT	2	10	110061	110070	20 %	80 %	0 %	0 %	336233200
113	NC_015662	TGATC	2	10	112073	112082	20 %	40 %	20 %	20 %	336233201
114	NC_015662	TTTAG	2	10	112661	112670	20 %	60 %	20 %	0 %	336233201
115	NC_015662	TAATA	2	10	113554	113563	60 %	40 %	0 %	0 %	336233201
116	NC_015662	AGTTA	2	10	114616	114625	40 %	40 %	20 %	0 %	336233203
117	NC_015662	TAAAT	2	10	116401	116410	60 %	40 %	0 %	0 %	336233204
118	NC_015662	TATTT	2	10	118358	118367	20 %	80 %	0 %	0 %	336233205
119	NC_015662	GAAAA	2	10	119257	119266	80 %	0 %	20 %	0 %	336233206
120	NC_015662	GAAAA	2	10	119496	119505	80 %	0 %	20 %	0 %	336233207
121	NC_015662	GATTA	2	10	120036	120045	40 %	40 %	20 %	0 %	336233207
122	NC_015662	TGATT	2	10	120442	120451	20 %	60 %	20 %	0 %	336233207
123	NC_015662	AATTA	2	10	122948	122957	60 %	40 %	0 %	0 %	336233209
124	NC_015662	TAATT	2	10	123726	123735	40 %	60 %	0 %	0 %	336233210
125	NC_015662	ATTTT	2	10	125135	125144	20 %	80 %	0 %	0 %	336233210
126	NC_015662	ATTAA	2	10	126105	126114	60 %	40 %	0 %	0 %	336233211
127	NC_015662	TTTCT	2	10	126178	126187	0 %	80 %	0 %	20 %	336233211
128	NC_015662	ATGTT	2	10	126799	126808	20 %	60 %	20 %	0 %	336233211
129	NC_015662	ATTTA	2	10	127288	127297	40 %	60 %	0 %	0 %	336233212
130	NC_015662	TGTAT	2	10	127455	127464	20 %	60 %	20 %	0 %	336233213
131	NC_015662	ATTTA	2	10	127533	127542	40 %	60 %	0 %	0 %	336233213
132	NC_015662	ATTTT	2	10	127775	127784	20 %	80 %	0 %	0 %	336233213
133	NC_015662	AATAT	2	10	127794	127803	60 %	40 %	0 %	0 %	336233213
134	NC_015662	TTTTA	2	10	128026	128035	20 %	80 %	0 %	0 %	336233214
135	NC_015662	AATTT	2	10	128296	128305	40 %	60 %	0 %	0 %	336233214
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137	NC_015662	ATTAT	2	10	128894	128903	40 %	60 %	0 %	0 %	336233215
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.