MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Buchnera aphidicola (Cinara tujafilina) chromosome

Total Repeats: 1146

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015662	GTTC	2	8	277	284	0 %	50 %	25 %	25 %	336233114
2	NC_015662	AAAT	2	8	555	562	75 %	25 %	0 %	0 %	336233114
3	NC_015662	ATCA	2	8	703	710	50 %	25 %	0 %	25 %	336233114
4	NC_015662	GTTC	2	8	766	773	0 %	50 %	25 %	25 %	336233114
5	NC_015662	AGTT	2	8	2600	2607	25 %	50 %	25 %	0 %	336233115
6	NC_015662	CTTT	2	8	2760	2767	0 %	75 %	0 %	25 %	336233115
7	NC_015662	AATT	2	8	2819	2826	50 %	50 %	0 %	0 %	336233115
8	NC_015662	TAAT	2	8	3094	3101	50 %	50 %	0 %	0 %	336233115
9	NC_015662	AAAT	2	8	3611	3618	75 %	25 %	0 %	0 %	336233115
10	NC_015662	ATTT	2	8	3955	3962	25 %	75 %	0 %	0 %	336233115
11	NC_015662	ATGT	2	8	4247	4254	25 %	50 %	25 %	0 %	336233115
12	NC_015662	ATAC	2	8	4418	4425	50 %	25 %	0 %	25 %	336233115
13	NC_015662	TGCT	2	8	4727	4734	0 %	50 %	25 %	25 %	336233116
14	NC_015662	TTAA	2	8	4975	4982	50 %	50 %	0 %	0 %	336233116
15	NC_015662	TGAT	2	8	5068	5075	25 %	50 %	25 %	0 %	336233116
16	NC_015662	ATTT	2	8	5172	5179	25 %	75 %	0 %	0 %	336233116
17	NC_015662	ATAA	2	8	5225	5232	75 %	25 %	0 %	0 %	336233116
18	NC_015662	TAAA	2	8	5403	5410	75 %	25 %	0 %	0 %	336233116
19	NC_015662	TTTC	2	8	6199	6206	0 %	75 %	0 %	25 %	336233117
20	NC_015662	ATAA	2	8	6540	6547	75 %	25 %	0 %	0 %	336233117
21	NC_015662	AAAT	2	8	6991	6998	75 %	25 %	0 %	0 %	336233117
22	NC_015662	ATTT	3	12	7748	7759	25 %	75 %	0 %	0 %	336233119
23	NC_015662	ATTT	2	8	7991	7998	25 %	75 %	0 %	0 %	336233119
24	NC_015662	AATT	2	8	8262	8269	50 %	50 %	0 %	0 %	336233120
25	NC_015662	TAAA	2	8	8493	8500	75 %	25 %	0 %	0 %	336233120
26	NC_015662	GTTT	2	8	8528	8535	0 %	75 %	25 %	0 %	336233120
27	NC_015662	GTTT	2	8	8715	8722	0 %	75 %	25 %	0 %	336233120
28	NC_015662	GGAT	2	8	8834	8841	25 %	25 %	50 %	0 %	336233120
29	NC_015662	TCAT	2	8	8974	8981	25 %	50 %	0 %	25 %	336233120
30	NC_015662	ATGG	2	8	9072	9079	25 %	25 %	50 %	0 %	336233120
31	NC_015662	ATTA	2	8	10102	10109	50 %	50 %	0 %	0 %	336233121
32	NC_015662	GAGC	2	8	10145	10152	25 %	0 %	50 %	25 %	336233121
33	NC_015662	TATT	2	8	10303	10310	25 %	75 %	0 %	0 %	336233121
34	NC_015662	AATT	2	8	10608	10615	50 %	50 %	0 %	0 %	336233121
35	NC_015662	TAAA	2	8	10776	10783	75 %	25 %	0 %	0 %	336233121
36	NC_015662	AAAT	2	8	10855	10862	75 %	25 %	0 %	0 %	336233121
37	NC_015662	GATT	2	8	11038	11045	25 %	50 %	25 %	0 %	336233121
38	NC_015662	AAAT	2	8	11168	11175	75 %	25 %	0 %	0 %	336233121
39	NC_015662	TCAA	2	8	12342	12349	50 %	25 %	0 %	25 %	336233123
40	NC_015662	AGGT	2	8	12524	12531	25 %	25 %	50 %	0 %	336233123
41	NC_015662	TTAT	2	8	12648	12655	25 %	75 %	0 %	0 %	336233123
42	NC_015662	TTTA	2	8	14369	14376	25 %	75 %	0 %	0 %	336233124
43	NC_015662	TCTA	2	8	14659	14666	25 %	50 %	0 %	25 %	336233125
44	NC_015662	AATT	2	8	14758	14765	50 %	50 %	0 %	0 %	336233125
45	NC_015662	ATAA	2	8	15666	15673	75 %	25 %	0 %	0 %	336233126
46	NC_015662	AATT	2	8	15829	15836	50 %	50 %	0 %	0 %	336233126
47	NC_015662	ATTT	2	8	16111	16118	25 %	75 %	0 %	0 %	336233126
48	NC_015662	GGTT	2	8	17911	17918	0 %	50 %	50 %	0 %	336233128
49	NC_015662	GGTG	2	8	18974	18981	0 %	25 %	75 %	0 %	336233129
50	NC_015662	ATTT	2	8	19606	19613	25 %	75 %	0 %	0 %	336233129
51	NC_015662	TAAT	2	8	19660	19667	50 %	50 %	0 %	0 %	336233129
52	NC_015662	GTTC	2	8	20034	20041	0 %	50 %	25 %	25 %	336233129
53	NC_015662	TACC	2	8	20077	20084	25 %	25 %	0 %	50 %	336233129
54	NC_015662	ATTC	2	8	20876	20883	25 %	50 %	0 %	25 %	336233129
55	NC_015662	AAAT	2	8	21518	21525	75 %	25 %	0 %	0 %	336233130
56	NC_015662	AAAT	2	8	22041	22048	75 %	25 %	0 %	0 %	336233130
57	NC_015662	ATTG	2	8	22708	22715	25 %	50 %	25 %	0 %	336233130
58	NC_015662	ATCC	2	8	23219	23226	25 %	25 %	0 %	50 %	336233130
59	NC_015662	TGTT	2	8	23325	23332	0 %	75 %	25 %	0 %	336233130
60	NC_015662	ATTA	2	8	23352	23359	50 %	50 %	0 %	0 %	336233130
61	NC_015662	TTGT	2	8	24016	24023	0 %	75 %	25 %	0 %	336233130
62	NC_015662	TTTC	2	8	25472	25479	0 %	75 %	0 %	25 %	336233130
63	NC_015662	GCAT	2	8	25842	25849	25 %	25 %	25 %	25 %	336233131
64	NC_015662	ATTT	2	8	26503	26510	25 %	75 %	0 %	0 %	336233131
65	NC_015662	AGAA	2	8	26990	26997	75 %	0 %	25 %	0 %	336233131
66	NC_015662	TATT	2	8	27312	27319	25 %	75 %	0 %	0 %	336233131
67	NC_015662	TATT	2	8	27352	27359	25 %	75 %	0 %	0 %	336233131
68	NC_015662	GATA	2	8	27759	27766	50 %	25 %	25 %	0 %	336233131
69	NC_015662	TTAA	2	8	27861	27868	50 %	50 %	0 %	0 %	336233131
70	NC_015662	TCTT	2	8	28145	28152	0 %	75 %	0 %	25 %	336233131
71	NC_015662	ATTT	2	8	28312	28319	25 %	75 %	0 %	0 %	336233131
72	NC_015662	CGAC	2	8	28374	28381	25 %	0 %	25 %	50 %	336233131
73	NC_015662	AAAT	2	8	28424	28431	75 %	25 %	0 %	0 %	336233131
74	NC_015662	AAAT	2	8	28537	28544	75 %	25 %	0 %	0 %	336233131
75	NC_015662	AAAT	2	8	28994	29001	75 %	25 %	0 %	0 %	336233131
76	NC_015662	ATTA	2	8	29162	29169	50 %	50 %	0 %	0 %	336233131
77	NC_015662	ATAA	2	8	29264	29271	75 %	25 %	0 %	0 %	336233131
78	NC_015662	TTCT	2	8	29327	29334	0 %	75 %	0 %	25 %	336233131
79	NC_015662	AGAA	2	8	29492	29499	75 %	0 %	25 %	0 %	336233131
80	NC_015662	ATTA	2	8	30468	30475	50 %	50 %	0 %	0 %	336233133
81	NC_015662	TCAT	2	8	30571	30578	25 %	50 %	0 %	25 %	336233133
82	NC_015662	ATTT	2	8	31039	31046	25 %	75 %	0 %	0 %	336233134
83	NC_015662	ATGA	2	8	31060	31067	50 %	25 %	25 %	0 %	336233134
84	NC_015662	ATTT	2	8	31993	32000	25 %	75 %	0 %	0 %	336233135
85	NC_015662	TATT	2	8	32333	32340	25 %	75 %	0 %	0 %	336233136
86	NC_015662	TCAT	2	8	32431	32438	25 %	50 %	0 %	25 %	336233136
87	NC_015662	ATTG	2	8	32584	32591	25 %	50 %	25 %	0 %	336233136
88	NC_015662	CTAT	2	8	32656	32663	25 %	50 %	0 %	25 %	336233137
89	NC_015662	ATTG	2	8	36537	36544	25 %	50 %	25 %	0 %	336233139
90	NC_015662	TAAA	2	8	36983	36990	75 %	25 %	0 %	0 %	336233139
91	NC_015662	ACAA	2	8	37685	37692	75 %	0 %	0 %	25 %	336233140
92	NC_015662	TAAT	2	8	38085	38092	50 %	50 %	0 %	0 %	336233140
93	NC_015662	TAAA	2	8	38661	38668	75 %	25 %	0 %	0 %	336233140
94	NC_015662	ACAG	2	8	38797	38804	50 %	0 %	25 %	25 %	336233140
95	NC_015662	TAAA	2	8	38835	38842	75 %	25 %	0 %	0 %	336233140
96	NC_015662	CTTG	2	8	39810	39817	0 %	50 %	25 %	25 %	336233141
97	NC_015662	TTTA	2	8	40064	40071	25 %	75 %	0 %	0 %	336233141
98	NC_015662	TGCT	2	8	40079	40086	0 %	50 %	25 %	25 %	336233141
99	NC_015662	TAAG	2	8	41082	41089	50 %	25 %	25 %	0 %	336233141
100	NC_015662	AATT	2	8	41551	41558	50 %	50 %	0 %	0 %	336233142
101	NC_015662	TAAT	2	8	41697	41704	50 %	50 %	0 %	0 %	336233142
102	NC_015662	ATTA	2	8	41860	41867	50 %	50 %	0 %	0 %	336233142
103	NC_015662	TAAA	2	8	41940	41947	75 %	25 %	0 %	0 %	336233142
104	NC_015662	AGTT	2	8	42105	42112	25 %	50 %	25 %	0 %	336233142
105	NC_015662	AATT	2	8	42189	42196	50 %	50 %	0 %	0 %	336233142
106	NC_015662	ATTA	2	8	42487	42494	50 %	50 %	0 %	0 %	336233142
107	NC_015662	ATAA	2	8	42598	42605	75 %	25 %	0 %	0 %	336233142
108	NC_015662	TGTA	2	8	42703	42710	25 %	50 %	25 %	0 %	336233142
109	NC_015662	ATTT	2	8	43923	43930	25 %	75 %	0 %	0 %	336233144
110	NC_015662	TTCC	2	8	43956	43963	0 %	50 %	0 %	50 %	336233144
111	NC_015662	AAAC	2	8	44258	44265	75 %	0 %	0 %	25 %	336233144
112	NC_015662	ATTT	2	8	45092	45099	25 %	75 %	0 %	0 %	336233145
113	NC_015662	ATTT	2	8	45281	45288	25 %	75 %	0 %	0 %	336233145
114	NC_015662	GAAA	2	8	45303	45310	75 %	0 %	25 %	0 %	336233145
115	NC_015662	TACG	2	8	45323	45330	25 %	25 %	25 %	25 %	336233145
116	NC_015662	ATTT	2	8	45383	45390	25 %	75 %	0 %	0 %	336233145
117	NC_015662	CAAC	2	8	45712	45719	50 %	0 %	0 %	50 %	336233145
118	NC_015662	TTTA	3	12	45784	45795	25 %	75 %	0 %	0 %	336233145
119	NC_015662	ATAA	2	8	47818	47825	75 %	25 %	0 %	0 %	336233146
120	NC_015662	AATT	2	8	47826	47833	50 %	50 %	0 %	0 %	336233146
121	NC_015662	ATGT	2	8	47952	47959	25 %	50 %	25 %	0 %	336233146
122	NC_015662	ATTT	2	8	48261	48268	25 %	75 %	0 %	0 %	336233146
123	NC_015662	TCTA	2	8	48294	48301	25 %	50 %	0 %	25 %	336233146
124	NC_015662	ATTA	2	8	48334	48341	50 %	50 %	0 %	0 %	336233146
125	NC_015662	GAAA	2	8	49785	49792	75 %	0 %	25 %	0 %	336233147
126	NC_015662	AGGA	2	8	49839	49846	50 %	0 %	50 %	0 %	336233147
127	NC_015662	ATTT	2	8	49935	49942	25 %	75 %	0 %	0 %	336233147
128	NC_015662	CTTA	2	8	50251	50258	25 %	50 %	0 %	25 %	336233147
129	NC_015662	TTTA	2	8	50492	50499	25 %	75 %	0 %	0 %	336233147
130	NC_015662	ATAA	2	8	50500	50507	75 %	25 %	0 %	0 %	336233147
131	NC_015662	TTAT	2	8	51198	51205	25 %	75 %	0 %	0 %	336233148
132	NC_015662	AATT	2	8	51285	51292	50 %	50 %	0 %	0 %	336233148
133	NC_015662	TAAA	2	8	51455	51462	75 %	25 %	0 %	0 %	336233148
134	NC_015662	TAAA	2	8	51815	51822	75 %	25 %	0 %	0 %	336233148
135	NC_015662	TAAA	2	8	52142	52149	75 %	25 %	0 %	0 %	336233148
136	NC_015662	AAAT	2	8	53520	53527	75 %	25 %	0 %	0 %	336233149
137	NC_015662	TTTG	2	8	53533	53540	0 %	75 %	25 %	0 %	336233149
138	NC_015662	TAAT	2	8	53553	53560	50 %	50 %	0 %	0 %	336233149
139	NC_015662	TAAT	2	8	53646	53653	50 %	50 %	0 %	0 %	336233149
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